; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi08G003160 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi08G003160
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionSignal peptide peptidase-like
Genome locationchr08:8295112..8298125
RNA-Seq ExpressionLsi08G003160
SyntenyLsi08G003160
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0010008 - endosome membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004190 - aspartic-type endopeptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007369 - Peptidase A22B, signal peptide peptidase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011656474.1 signal peptide peptidase-like 5 isoform X2 [Cucumis sativus]3.8e-3891.67Show/hide
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XP_038886604.1 signal peptide peptidase-like 5 isoform X1 [Benincasa hispida]2.5e-3791.67Show/hide
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A0A1S3CLP1 signal peptide peptidase-like 5 isoform X11.2e-3790.48Show/hide
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A0A1S3CMS6 signal peptide peptidase-like 5 isoform X21.2e-3790.48Show/hide
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A0A6J1ENS8 signal peptide peptidase-like 31.8e-3383.53Show/hide
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A0A6J1JYL1 signal peptide peptidase-like 51.8e-3383.53Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0DWA9 Signal peptide peptidase-like 42.7e-1553.52Show/hide
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        +D A KK+  + YF W +  YG+GL  TY+ L  M+GHGQPALLY+VP TLG  + LG  RGEL+ LW  G
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Q4V3B8 Signal peptide peptidase-like 31.9e-2462.2Show/hide
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Q53P98 Signal peptide peptidase-like 28.8e-2263.64Show/hide
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Q5Z413 Signal peptide peptidase-like 58.0e-1554.93Show/hide
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        +D A KKS    YF W +  YG+GL  TY+ L  M+GHGQPALLY+VP TLG  + LG  RGEL  LW  G
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Q9MA44 Signal peptide peptidase-like 52.2e-2867.44Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G01650.1 SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 45.9e-1352.94Show/hide
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AT1G01650.2 SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 45.9e-1352.94Show/hide
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AT1G05820.1 SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 51.5e-2967.44Show/hide
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AT1G05820.2 SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 52.5e-1971.43Show/hide
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AT2G43070.1 SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 31.3e-2562.2Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGACAGAAAATCCCTTGCAAAGGGAACCTTCTGGAGAAGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAATATTCGACAAAGCACACAAGAAAAGCAAGTGTAATGCATATTTTCCATGGTTGCTTGCTGGTTACGGAACTGGTCTCTTCTTTACGTATTTGGGCTTATATTT
TATGAATGGACATGGTCAACCTGCACTCCTTTATCTTGTCCCATGCACCTTAGGTGTTACTGTTGTTTTGGGTTTGATCAGAGGTGAACTTAAGCAACTTTGGTGTTATG
GGACAGAAAATCCCTTGCAAAGGGAACCTTCTGGAGAAGCTTAAAGTTTTAGGTTCCTTCAAAATGTAAGCTTTTTTTCTTTTTTCATTCTGTGGCGAGAAGGGCACTTG
CTATTATGGTAAGGGGGTCTTCTTATAATTGTAACATCTTTTGCCTGTATTGTCAACACTTGATGTATTTAAGAGGAATTTATTTCTATATTTTTCATCATTCTTGAAGC
TATGTGGACGTGATTTTAAATTTGTTATACGTAATATATATAATATATAAATTTATATTTTTAAAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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