; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi08G006270 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi08G006270
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionchlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic
Genome locationchr08:14612812..14619274
RNA-Seq ExpressionLsi08G006270
SyntenyLsi08G006270
Gene Ontology termsGO:0015996 - chlorophyll catabolic process (biological process)
GO:0034256 - chlorophyll(ide) b reductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR020904 - Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A0A0KE83 Uncharacterized protein7.3e-16891.32Show/hide
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A0A6J1BXF3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic1.0e-16189.88Show/hide
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A0A6J1FGR3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic9.0e-16691.39Show/hide
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A0A6J1JWB8 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic6.9e-16691.69Show/hide
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D2WKD9 Farnesol dehydrogenase4.2e-1932.47Show/hide
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Q5N800 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic5.8e-5344.01Show/hide
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Q84ST4 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic3.0e-12684.03Show/hide
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Q8LEU3 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic4.3e-13384.29Show/hide
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Query:  NLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRM
        NLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+M
Subjt:  NLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRM

Query:  QDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFS
        QDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIRFLTG+KAY++IFS
Subjt:  QDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFS

Q93ZA0 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic6.6e-4943.6Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALAR+FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E  E VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10310.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein6.4e-1531.19Show/hide
Query:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP
        +V    VLITG +KG+G ALA +  K G  V+ C+RS E++ +    L       H+  T  DV+    V+ +   + +     DI +NNAG+   + K 
Subjt:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP

Query:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL
        + E S ED   V+ TN  G+    R  I +ML + +G  +    G G  G      A Y A+K ++  L++++  E+    V+ + V  L+PG++ T+LL
Subjt:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL

Query:  MS
         S
Subjt:  MS

AT1G24360.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein7.1e-1427.43Show/hide
Query:  TNGVVISNSVSTKAEESQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFV
        +  VV + + +T+    +  + +  P  V+ITG+++GIG A+A    KAG  V++  +RSA+  E   + + E  G+   +G   DV +  DV  ++   
Subjt:  TNGVVISNSVSTKAEESQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFV

Query:  QKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSL
              ID+ +NNAG    +   L+        EV+  N  G+ +C + A+K+M+ + R G I NI       G+ G+     A Y A K  V+  +K+ 
Subjt:  QKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSL

Query:  QAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDL
          E      +N+ V+ + PG + +D+
Subjt:  QAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDL

AT4G13250.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein4.7e-5043.6Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALAR+FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E  E VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNG

AT4G13250.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein2.2e-4742.8Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITG  +G+G ALAR+FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E  E VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNG

AT5G04900.1 NYC1-like3.1e-13484.29Show/hide
Query:  NGVVISNSVSTKAEESQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQK
        N  V  +S + +A  S +REPM PPYN+LITGSTKGIGYALAR+FLKAGDNVVICSRSAERVE++VQSL+EEFGE HVWGTKCDV EG+DV+ LVA+ QK
Subjt:  NGVVISNSVSTKAEESQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQK

Query:  NLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRM
        NLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+M
Subjt:  NLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRM

Query:  QDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFS
        QDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIRFLTG+KAY++IFS
Subjt:  QDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCAGCATCTTCTTCCTCCTTCCTCTTTCCGTCTCTGTTCATCTCCCATAATCATGGCTTCTTCTTCTCTCCTCCTTCCCAAATCTGCCTATCACTCTACAAATT
GAAGAGTTTCAGTCGTTCCGTAGCTCGTTCACGCCACATATCCAACATTCCGACGAATGGCGTCGTGATTTCGAATTCCGTATCGACAAAGGCCGAAGAATCTCAGCAGA
GGGAGCCTATGGTTCCTCCTTACAATGTTTTGATCACTGGCTCCACTAAAGGAATAGGATATGCATTGGCCAGACAGTTTCTGAAAGCAGGTGACAATGTCGTTATCTGT
TCACGATCAGCTGAGAGGGTTGAGTCTTCTGTTCAAAGCCTGAGGGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGACGTGCGAGAAGGAGAGGATGTAAA
GAATTTAGTTGCATTTGTGCAGAAAAATCTTAAATATATTGACATATGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGCCTTTGGTCGAGGCTTCAGATGAAG
ATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGGGGTCATATTTTCAACATTGAT
GGGGCTGGTTCTGATGGACGACCCACTCCTAGGTTTGCTGCATACGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTCCATTTAACAAAGTCGTTACAGGCCGAATTGCGGATGCAGGA
CGTGAAAAATGTTGTGGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACAAAGCAGGCGAAATTTTTCATCAATGTTTTGGCGG
AACCAGCCGAAGTGGTCGCAGAATACCTTGTACCAAACATAAGATCTATCCCAACCAATGGTTCAACAAGGCCCACATACATCCGTTTCCTCACTGGACTGAAAGCTTAT
TCCCAGATTTTCTCAGTTAAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATTAACTAATTTCATAAAAAGAATCATTGATGATTACCAACTTGACGTTGCTTGAAGAAAAACGAGAAACAAAAAAGTTTTATCCATAAGTGTAATCAATCTGGAAATT
TCTACCGCGTGAAATGGCTTCAGCATCTTCTTCCTCCTTCCTCTTTCCGTCTCTGTTCATCTCCCATAATCATGGCTTCTTCTTCTCTCCTCCTTCCCAAATCTGCCTAT
CACTCTACAAATTGAAGAGTTTCAGTCGTTCCGTAGCTCGTTCACGCCACATATCCAACATTCCGACGAATGGCGTCGTGATTTCGAATTCCGTATCGACAAAGGCCGAA
GAATCTCAGCAGAGGGAGCCTATGGTTCCTCCTTACAATGTTTTGATCACTGGCTCCACTAAAGGAATAGGATATGCATTGGCCAGACAGTTTCTGAAAGCAGGTGACAA
TGTCGTTATCTGTTCACGATCAGCTGAGAGGGTTGAGTCTTCTGTTCAAAGCCTGAGGGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGACGTGCGAGAAG
GAGAGGATGTAAAGAATTTAGTTGCATTTGTGCAGAAAAATCTTAAATATATTGACATATGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGCCTTTGGTCGAG
GCTTCAGATGAAGATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGGGGTCATAT
TTTCAACATTGATGGGGCTGGTTCTGATGGACGACCCACTCCTAGGTTTGCTGCATACGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTCCATTTAACAAAGTCGTTACAGGCCGAAT
TGCGGATGCAGGACGTGAAAAATGTTGTGGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACAAAGCAGGCGAAATTTTTCATC
AATGTTTTGGCGGAACCAGCCGAAGTGGTCGCAGAATACCTTGTACCAAACATAAGATCTATCCCAACCAATGGTTCAACAAGGCCCACATACATCCGTTTCCTCACTGG
ACTGAAAGCTTATTCCCAGATTTTCTCAGTTAAGAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASASSSSFLFPSLFISHNHGFFFSPPSQICLSLYKLKSFSRSVARSRHISNIPTNGVVISNSVSTKAEESQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKAGDNVVIC
SRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNID
GAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPAEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAY
SQIFSVKK