CuGenDBv2

Gene ID	Lsi08G006290
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Nuclear pore complex protein NUP1-like
Genome location	chr08:14639558..14647276
RNA-Seq Expression	Lsi08G006290
Synteny	Lsi08G006290
Gene Ontology terms	GO:0016973 - poly(A)+ mRNA export from nucleus (biological process) GO:0071763 - nuclear membrane organization (biological process) GO:0005635 - nuclear envelope (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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XP_008456625.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo]

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        KSKSRKK
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XP_011656578.1 nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus]

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XP_038884353.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 [Benincasa hispida]

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        NITNQNSSIKPSFNAA SNSEPVTTTSLP SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIE+K+KQETTFGNLSGIPPSD SAVKVSSTGSSV
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Query:  VKVKSKSRKK
        VKVKSKSRKK
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        ER+EK +SLVAVSKPNNTEA+TVDKPQASIEAKPP  SAMNK+NDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPT S PSITANVIGPES +RPEKIASSEVPKAATTPI
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        FGFGEKFPSQKEAVS APTFAF NK+TTS NEQNAIPVVTSEGNV+PT+QASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN GS   FASPLVNEKEGAK G
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        GSASVFKAESSSSSI SFGVPKESMSEK+GDKSS AG AVGTSG+L  SSVSTS STPT  LFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS FPTPATTFSNNITN
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        QNSSIKPSFNAA SNSEPVTTTSLP SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIE+K+KQETTFGNLSGIPPSD SAVKVSSTGSSVFQFG
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        AAST SDSNKRP NSTF PSNVP FGA  SP SSGLASSTQSTPVLQF+SSSTSFGLTGNTGLASG SLFGSSAPASNLF +G TFGLASSSSS NNS+S
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        SSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPT GFSFGLSSSSAASNSAP+LFGSSSTG+ TPSMFSFTSAATATT QPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQA+M
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        EDSMAEDTVQTV SPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP PLGA+PFQFGGSQQNVPTPQ NPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVK
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        SKSRKK
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XP_038884355.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X3 [Benincasa hispida]

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        ADPP TQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQ PSTPVISYGKQ+G PKFPAQSQDGVSPHMV 
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        THV    VLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMASHSQKFGD F+ GNPSKS TLSL+PRSPGNFD VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
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        PSIKNSVATTDAYRA TSSSSQSAWGQGRLLGS+QGALKRR+SVLDDEMGSVGPIRRIR KSNHLF KGLSLPSSSTSIPVSGIG E++QHLQSTKVHPF
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        SSTGGK LYSSE KRNLSKMS+ESEN M PSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP+KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
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        ENVEGIRSNDA DLTS+K DKFEESS LKFKVPNDKSISTG+GVGSSVP K TVSGSG QVS+VGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADIS+
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Query:  ERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPI
        ER+EK +SLVAVSKPNNTEA+TVDKPQASIEAKPP  SAMNK+NDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPT S PSITANVIGPES +RPEKIASSEVPKAATTPI
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        FGFGEKFPSQKEAVS APTFAF NK+TTS NEQNAIPVVTSEGNV+PT+QASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN GS   FASPLVNEKEGAK G
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        GSASVFKAESSSS    SI SFGVPKESMSEK+GDKSS AG AVGTSG+L  SSVSTS STPT  LFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS FPTPATTFSN
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        NITNQNSSIKPSFNAA SNSEPVTTTSLP SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIE+K+KQETTFGNLSGIPPSD SAVKVSSTGSSV
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Query:  FQFGAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSAN
        FQFGAAST SDSNKRP NSTF PSNVP FGA  SP SSGLASSTQSTPVLQF+SSSTSFGLTGNTGLASG SLFGSSAPASNLF +G TFGLASSSSS N
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Query:  NSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANND
        NS+SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPT GFSFGLSSSSAASNSAP+LFGSSSTG+ TPSMFSFTSAATATT QPAFGNSNHGFTFGSTPPANND
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Query:  QASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQ-NPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKY
        QA+MEDSMAEDTVQTV SPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP PLGA+PFQFGGSQQNVPTPQ NPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+
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        VKVKSKSRKK
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K9E4 Uncharacterized protein

0.0e+00

84.93

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        MATERE+V+YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLS LVDPA KLI S+AH LFS+VFRKRLPPPPPS PLSREANDE+E+RNQEEVA
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        ADP GTQEGTN+ FVPSINSNNT G+SDLEKIL EKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVP GVESRKFEQ PSTPV S+G Q+GSPK P QSQDGVSPHM  
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        THV +ANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMA            GNP KSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
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        PSIKNS+AT DAYR+TT SSSQSAW QGRLLGS QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIRR RQKSNHLF   L LPSSSTSI  SGIG E+A+HLQSTKVHPF
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        SS GGK LYS+EI+RN SKM++ES+NAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
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Query:  ENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL
        ENVEGIRSNDA DLTSQK DKFEESS  KF VPNDKSISTGDGVGSSV TK+  SGSG+QVS+VGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S 
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Query:  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTP
        E + K  DSLV+VSKP NTE +TVDK +ASIEAKP   S MNK+NDQGKSDVP TTEKSPIFSFPTAS PSITANV G ES+LRPEK+AS E+PKAAT P
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Query:  IFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKV
        IFGFGEK PSQKEA S  PTFAFG+K TT+ NEQN I VVTSE NVEPT+QAS PTTFKFGDKA+FPIPANAATENGNK+AGSLFKFASPLVNEKEGA V
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Query:  GGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNIT
        GGSASVFKAE+SSSSI SFGVPKES+SEK+GDKSS  GL  GTSGN   SSVSTSTSTPTPSLFSFS+PSTNSNLNNGSLVSTTPST PTPATTFSNN+T
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Query:  NQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQF
        +QNSS+KPSF+AATSNSEPV++TS P SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPS VGS+ETK+K ETTFGNLSG P SDTSAVKV+STG+SVFQF
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Query:  GAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSI
        GAASTTSD+NK P NSTF  +N+PAFGAPVS +SSGLA STQSTP LQFSSSSTSFGLT NTGLASG SLFGSSAPASN FT+G TFGLASSSSSA+NS+
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Query:  SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NNDQA
        SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+ GFSFGLSSSS+ASNSAPM+FGSSSTGA + SMFSFTSAA+ATT QPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
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Query:  SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKV
        SMEDSMAEDT+QT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQF GSQQN+  PQNPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKV
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Query:  KSKSRKK
        KSKSRKK
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A0A1S3C4Z3 nuclear pore complex protein NUP1-like

0.0e+00

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        MATEREEV+YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  LSREAN+E+E+RNQEEVA
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        ADP GTQEGTNV FVPSINS+NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQ PSTPV S+G Q+GSPKFP QSQDGVSPHM P
Subjt:  ADPPGTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGSPKFPAQSQDGVSPHMVP

Query:  THVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
        THV +ANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMA            GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
Subjt:  THVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT

Query:  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPF
        PSIKNS+ATTDAYRATTSSSSQSAW QG LLGS QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIRR RQKSNHLF  GLSLPSSSTSIP SGI  E+A+HLQSTKVHPF
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Query:  SSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
        SS GGK LYSSE +RN SK S+ES+NAMTPSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYL
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Query:  ENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL
        ENVEGI+SNDA D TSQK DKFEESS  K  VPNDKSIST DGVGSSVPTK+  SGSG+QVS+VGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S 
Subjt:  ENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL

Query:  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTP
        E REK  DSLV+VSKP NTEA+TV K + SIEAKP   S MNK+NDQGKSDVP TTEKSPIFSFPT S PS TANV GPES+LRPEK+AS E+PKAAT P
Subjt:  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTP

Query:  IFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKV
        IFGFGEK PSQKE +S  PTFAFG+K TT+ NEQNAIPVVTSE N EPT+ AS PTTFKFGDKA+F IPANAATENGNK+AGSLFKF SPLVNEKEGA V
Subjt:  IFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKV

Query:  GGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNIT
        GGSASVFKAE+SSSSI SFGVPKESMSEK+GDKSS  GL  GTSGNL  SS STSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVS TPST PTPATTFSNN+T
Subjt:  GGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNIT

Query:  NQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQF
        +QNSSIKPS  AATSNSEPVT+TS PMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA ALSAPSGVGS+E K+K ETTFGNLSG+PPSDT+AVKV+STGSSVFQF
Subjt:  NQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQF

Query:  GAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSI
        GAASTTSD+NK P NSTF  +N+PAFGAPVS +SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASG SLFGSSAPASN FT+G TFGLASSSSSANNS+
Subjt:  GAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSI

Query:  SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NNDQA
        SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+ GFSFGLSSSS+ASNSAPM+FGSSSTGAS  SMFSFTSAA+ATT QPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
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Query:  SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKV
        SMEDSMAEDTVQT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV  PQNPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKV
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Query:  KSKSRKK
        KSKSRKK
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A0A5A7SNY9 Nuclear pore complex protein NUP1-like

0.0e+00

85.92

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        MATEREEV+YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  LSREAN+E+E+RNQEEVA
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        ADP GTQEGTNV FVPSINS+NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQ PSTPV S+G Q+GSPKFP QSQDGVSPHM P
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        THV +ANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMA            GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
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Query:  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPF
        PSIKNS+ATTDAYRATTSSSSQSAW QG LLGS QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIRR RQKSNHLF  GLSLPSSSTSIP SGI  E+A+HLQSTKVHPF
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        SS GGK LYSSE +RN SK S+ES+NAMTPSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYL
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Query:  ENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL
        ENVEGI+SNDA D TSQK DKFEESS  K  VPNDKSIST DGVGSSVPTK+  SGSG+QVS+VGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S 
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        E REK  DSLV+VSKP NTEA+TV K + SIEAKP   S MNK+NDQGKSDVP TTEKSPIFSFPT S PS TANV GPES+LRPEK+AS E+PKAAT P
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Query:  IFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKV
        IFGFGEK PSQKE +S  PTFAFG+K TT+ NEQNAIPVVTSE N EPT+ AS PTTFKFGDKA+F IPANAATENGNK+AGSLFKF SPLVNEKEGA V
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Query:  GGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNIT
        GGSASVFKAE+SSSSI SFGVPKESMSEK+GDKSS  GL  GTSGNL  SS STSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVS TPST PTPATTFSNN+T
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Query:  NQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQF
        +QNSSIKPS  AATSNSEPVT+TS PMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA ALSAPSGVGS+E K+K ETTFGNLSG+PPSDT+AVKV+STGSSVFQF
Subjt:  NQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQF

Query:  GAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSI
        GAASTTSD+NK P NSTF  +N+PAFGAPVS +SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASG SLFGSSAPASN FT+G TFGLASSSSSANNS+
Subjt:  GAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSI

Query:  SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NNDQA
        SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+ GFSFGLSSSS+ASNSAPM+FGSSSTGAS  SMFSFTSAA+ATT QPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
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Query:  SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKV
        SMEDSMAEDTVQT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV  PQNPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKV
Subjt:  SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKV

Query:  KSKSRKK
        KSKSRKK
Subjt:  KSKSRKK

A0A6J1FF52 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1

0.0e+00

85.02

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Query:  MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVA
        MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLP+SREANDE+E +NQEEVA
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Query:  ADPPGTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGSPKFPAQSQDGVSPHMVP
        ADPPGTQEGTN DFVPSINSNN HGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE   STPVISY  Q+GSPKFPA  Q+GV PHMVP
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Query:  THVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
        THV +ANV DEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSM +HSQKFGD+FA GNPSKSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
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Query:  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPF
        PSIKNSVATTD+YRAT +SSSQSAW QGRLL S+QGALKRRSSVLDDE+GSVGPIRRIR KSN LF KGLSLPSSSTSIPVSGIG E++QHLQSTKVHPF
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Query:  SSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
        SS  GKA YSSE KRNLSKMS+ESEN  TPSSSFPQIPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSELKL SVRNNSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
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Query:  ENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL
        ENVE IRSND  DLTS+KKDKFE+SS LK KVP+DKSISTG GVGSSVP+K+TVS SGLQVS+VGPS  TKCAFQMS  EDFVDMD+E YSNGPV+  S 
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Query:  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTP
        ERREK  DSLVAV KP++TEA+TVDKPQASI+AKP   S M K+NDQ KSDVPVTTEKS IFSFPTASP S TANVI PEST RPEKIASSEVPKAA  P
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Query:  IFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKV
        IFGFGEK PSQK+ V S+PTF FGNKVTTS NEQNA+P VTSEGNV PT QASAPTTFKFGDKATFPIPA+ ATENGN  AGS FKFAS LVNEKEGAK 
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Query:  GGSASVFKAESSSSSI----LSFGVPKESMSEKSGD-KSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTF
         GSASVFK+ESSSSS     LSFGVPKESMSEK+GD KSS AGL+VGTSGNLLLSSVS   STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGSL  +TPSTFP+P+ TF
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Query:  SNNITNQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETT-FGNLSGIPPSDTSAVKVSSTG
         +NITNQNSSIKPS NAATSNSEPVTTTSL  SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+     SAPSGVGS+ETK+KQETT FGN+SGI PSDTSA KV STG
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Query:  SSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSS
        SSVFQFGAASTTSDSNK+PE STF P +VP+FGAPV PASSG+ASSTQSTPV  FSSSSTSFGLTGNTGLASG SL GSSAPASNLFT+G TFG   SSS
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Query:  SANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTG-ASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPP
        SANNS+SS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STPT GFSFGL+SSSAAS+S+PMLFGSS+TG AST SMFSFTSAATA   QPAFG SNHGFTFGSTPP
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Query:  ANNDQASMEDSMAEDTVQTVAS--PMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK
        ANND A+MEDSMAEDTVQTVAS  PMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNP+ FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK
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Query:  SNRKYVKVKSKSRKK
        SNRK+VKVKSKSRKK
Subjt:  SNRKYVKVKSKSRKK

A0A6J1FKS9 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

0.0e+00

85.28

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Query:  MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVA
        MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLP+SREANDE+E +NQEEVA
Subjt:  MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVA

Query:  ADPPGTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGSPKFPAQSQDGVSPHMVP
        ADPPGTQEGTN DFVPSINSNN HGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE   STPVISY  Q+GSPKFPA  Q+GV PHMVP
Subjt:  ADPPGTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGSPKFPAQSQDGVSPHMVP

Query:  THVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
        THV +ANV DEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSM +HSQKFGD+FA GNPSKSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
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Query:  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPF
        PSIKNSVATTD+YRAT +SSSQSAW QGRLL S+QGALKRRSSVLDDE+GSVGPIRRIR KSN LF KGLSLPSSSTSIPVSGIG E++QHLQSTKVHPF
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Query:  SSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
        SS  GKA YSSE KRNLSKMS+ESEN  TPSSSFPQIPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSELKL SVRNNSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
Subjt:  SSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL

Query:  ENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL
        ENVE IRSND  DLTS+KKDKFE+SS LK KVP+DKSISTG GVGSSVP+K+TVS SGLQVS+VGPS  TKCAFQMS  EDFVDMD+E YSNGPV+  S 
Subjt:  ENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL

Query:  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTP
        ERREK  DSLVAV KP++TEA+TVDKPQASI+AKP   S M K+NDQ KSDVPVTTEKS IFSFPTASP S TANVI PEST RPEKIASSEVPKAA  P
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Query:  IFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKV
        IFGFGEK PSQK+ V S+PTF FGNKVTTS NEQNA+P VTSEGNV PT QASAPTTFKFGDKATFPIPA+ ATENGN  AGS FKFAS LVNEKEGAK 
Subjt:  IFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKV

Query:  GGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGD-KSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNI
         GSASVFK+ESSSSS LSFGVPKESMSEK+GD KSS AGL+VGTSGNLLLSSVS   STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGSL  +TPSTFP+P+ TF +NI
Subjt:  GGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGD-KSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNI

Query:  TNQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETT-FGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVF
        TNQNSSIKPS NAATSNSEPVTTTSL  SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+     SAPSGVGS+ETK+KQETT FGN+SGI PSDTSA KV STGSSVF
Subjt:  TNQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETT-FGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVF

Query:  QFGAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANN
        QFGAASTTSDSNK+PE STF P +VP+FGAPV PASSG+ASSTQSTPV  FSSSSTSFGLTGNTGLASG SL GSSAPASNLFT+G TFG   SSSSANN
Subjt:  QFGAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANN

Query:  SISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTG-ASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANND
        S+SS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STPT GFSFGL+SSSAAS+S+PMLFGSS+TG AST SMFSFTSAATA   QPAFG SNHGFTFGSTPPANND
Subjt:  SISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTG-ASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANND

Query:  QASMEDSMAEDTVQTVAS--PMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK
         A+MEDSMAEDTVQTVAS  PMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNP+ FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK
Subjt:  QASMEDSMAEDTVQTVAS--PMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK

Query:  YVKVKSKSRKK
        +VKVKSKSRKK
Subjt:  YVKVKSKSRKK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9CAF4 Nuclear pore complex protein NUP1

2.3e-113

34.59

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Query:  GRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRL---------PPPPPSLPLSREANDEVENRNQ
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RLF S+ RKRL         P     LP  R  N E +  ++
Subjt:  GRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRL---------PPPPPSLPLSREANDEVENRNQ

Query:  EEVA----ADPPGTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGSPKFPAQSQD
        E+V+     +     E TN    P        G +DLEKIL+ KTFTR E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E          G     P  P+  +D
Subjt:  EEVA----ADPPGTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGSPKFPAQSQD

Query:  GVSPH------MVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRG
           P       +V T   S   LDE +ASPA++AKA+MGSRP + TP  +    Q   +     N    P KS T+SLV + P     +ENGFVTPRSRG
Subjt:  GVSPH------MVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRG

Query:  RSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQG---ALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSI
        RSA+YSMAR PYSR +++  I            +   +S S W +    GS QG    LKRRSSVLD+++GSVGP+RRIRQKSN L  + L+LP S + +
Subjt:  RSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQG---ALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSI

Query:  PVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLS
         V   G E   H                          SK S+E      P SSF  +P +SSEMASKIL+QLD            KL+S R  SP+KLS
Subjt:  PVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLS

Query:  PSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKN-TVSGSGLQVSYVGPSLQ----TKCAF
        PSML GPAL+SL++V++ K+L N+   ++N + D + QK++   ES S +    ++K+    DG   +  +K+  + G G+ +     SL+     K +F
Subjt:  PSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKN-TVSGSGLQVSYVGPSLQ----TKCAF

Query:  QMSAHEDFVDMDEE-GYSNGPVADISLERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTAS------
        +MSAHEDF+++D++ G ++ P      E  EK ++   V K + +  +  +KP    EA P  +   N    QG S+  + TE++   +FP  +      
Subjt:  QMSAHEDFVDMDEE-GYSNGPVADISLERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTAS------

Query:  ------------------------------------PPSITANV-IGPEST--LRPEKIASSEVP-KAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVT
                                            P ++  N+   P +T  L     AS+++  +  ++  FG  E +    E+  +    A G + +
Subjt:  ------------------------------------PPSITANV-IGPEST--LRPEKIASSEVP-KAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVT

Query:  TSANE----------QNAIPVVTSEGNVE-----PTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSS
        TSA             NA+    S G++      P   ++ P+    GD  +  + + AAT N +   G L     P  N+        S S   +  SS
Subjt:  TSANE----------QNAIPVVTSEGNVE-----PTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSS

Query:  SSILSFGVP-----KESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNITNQNSSIKP
        +S   FG P       ++SE SG  S +  +   T GN         TST     F F   ++          + +      P   F ++     S++ P
Subjt:  SSILSFGVP-----KESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNITNQNSSIKP

Query:  SFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAV---KVSSTGSSVFQFGAAST
        S  AA++                P  S + IF   SSS P T    +SA S        +   + FG  S    S  S++     +STGSSVF F A S+
Subjt:  SFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAV---KVSSTGSSVFQFGAAST

Query:  TSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSS--SSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSS
         S ++ + + S        A  A      SG  +STQS P  QF S  S+ SFGL+GN+ LAS  S FG S     +FT+ +T  L+S++SSA++S + S
Subjt:  TSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSS--SSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSS

Query:  A---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPS-MFSFTSAATATTPQPA-----------FGNSNHGF
        +   GTS    N  P+S P FS+ F  SSTPT  FSFG SS++  S++   +FG+S+    +PS +F F S    T  QP            FGNS  GF
Subjt:  A---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPS-MFSFTSAATATTPQPA-----------FGNSNHGF

Query:  TFGSTPPA----NNDQASMEDSMAEDTVQTVASPM--PSFGQQPLT-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAG
         FG+        NN Q SMEDSMAEDT Q   + M  P FGQ  ++ P P+  F  G+    P  ANPFQFGG Q    T QN S FQAS SL+F    G
Subjt:  TFGSTPPA----NNDQASMEDSMAEDTVQTVASPM--PSFGQQPLT-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAG

Query:  GSFSLGA-GGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
        GSFSLG+ GGGDKS R+  K K  +RKK
Subjt:  GSFSLGA-GGGDKSNRKYVKVKSKSRKK

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore

4.0e-04

32.2

Show/hide

Query:  LSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASS--GLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSS
        +SG P   +++V         F FG++S T+ S+    +ST  P +  +F    +P+S+  G  SS  STP    SS++ SFG   ++  + G   FGSS
Subjt:  LSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASS--GLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSS

Query:  APASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAP--MLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATA
        A +S   T    FG ++S + A+ + S   GT++S     PS   S +T  SS       FG  +SSA+S + P   LFG+ ++ A+TPS   F  AA A
Subjt:  APASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAP--MLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATA

Query:  TTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQA-SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQP-----LTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLF
        +   P FG+S   F+  S+  A+N        S A  T     +P  + G  P      + P SS  +FG+T  SP  +      GS        +PS+F
Subjt:  TTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQA-SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQP-----LTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLF

Query:  QASGSLDF---NASAGGSFSLGA
         A+GS  F   ++SAG + SL A
Subjt:  QASGSLDF---NASAGGSFSLGA

AT3G10650.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1)

1.6e-114

34.59

Show/hide

Query:  GRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRL---------PPPPPSLPLSREANDEVENRNQ
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RLF S+ RKRL         P     LP  R  N E +  ++
Subjt:  GRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRL---------PPPPPSLPLSREANDEVENRNQ

Query:  EEVA----ADPPGTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGSPKFPAQSQD
        E+V+     +     E TN    P        G +DLEKIL+ KTFTR E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E          G     P  P+  +D
Subjt:  EEVA----ADPPGTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGSPKFPAQSQD

Query:  GVSPH------MVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRG
           P       +V T   S   LDE +ASPA++AKA+MGSRP + TP  +    Q   +     N    P KS T+SLV + P     +ENGFVTPRSRG
Subjt:  GVSPH------MVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRG

Query:  RSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQG---ALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSI
        RSA+YSMAR PYSR +++  I            +   +S S W +    GS QG    LKRRSSVLD+++GSVGP+RRIRQKSN L  + L+LP S + +
Subjt:  RSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQG---ALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSI

Query:  PVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLS
         V   G E   H                          SK S+E      P SSF  +P +SSEMASKIL+QLD            KL+S R  SP+KLS
Subjt:  PVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLS

Query:  PSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKN-TVSGSGLQVSYVGPSLQ----TKCAF
        PSML GPAL+SL++V++ K+L N+   ++N + D + QK++   ES S +    ++K+    DG   +  +K+  + G G+ +     SL+     K +F
Subjt:  PSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKN-TVSGSGLQVSYVGPSLQ----TKCAF

Query:  QMSAHEDFVDMDEE-GYSNGPVADISLERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTAS------
        +MSAHEDF+++D++ G ++ P      E  EK ++   V K + +  +  +KP    EA P  +   N    QG S+  + TE++   +FP  +      
Subjt:  QMSAHEDFVDMDEE-GYSNGPVADISLERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTAS------

Query:  ------------------------------------PPSITANV-IGPEST--LRPEKIASSEVP-KAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVT
                                            P ++  N+   P +T  L     AS+++  +  ++  FG  E +    E+  +    A G + +
Subjt:  ------------------------------------PPSITANV-IGPEST--LRPEKIASSEVP-KAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVT

Query:  TSANE----------QNAIPVVTSEGNVE-----PTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSS
        TSA             NA+    S G++      P   ++ P+    GD  +  + + AAT N +   G L     P  N+        S S   +  SS
Subjt:  TSANE----------QNAIPVVTSEGNVE-----PTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSS

Query:  SSILSFGVP-----KESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNITNQNSSIKP
        +S   FG P       ++SE SG  S +  +   T GN         TST     F F   ++          + +      P   F ++     S++ P
Subjt:  SSILSFGVP-----KESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNITNQNSSIKP

Query:  SFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAV---KVSSTGSSVFQFGAAST
        S  AA++                P  S + IF   SSS P T    +SA S        +   + FG  S    S  S++     +STGSSVF F A S+
Subjt:  SFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAV---KVSSTGSSVFQFGAAST

Query:  TSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSS--SSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSS
         S ++ + + S        A  A      SG  +STQS P  QF S  S+ SFGL+GN+ LAS  S FG S     +FT+ +T  L+S++SSA++S + S
Subjt:  TSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSS--SSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSS

Query:  A---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPS-MFSFTSAATATTPQPA-----------FGNSNHGF
        +   GTS    N  P+S P FS+ F  SSTPT  FSFG SS++  S++   +FG+S+    +PS +F F S    T  QP            FGNS  GF
Subjt:  A---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPS-MFSFTSAATATTPQPA-----------FGNSNHGF

Query:  TFGSTPPA----NNDQASMEDSMAEDTVQTVASPM--PSFGQQPLT-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAG
         FG+        NN Q SMEDSMAEDT Q   + M  P FGQ  ++ P P+  F  G+    P  ANPFQFGG Q    T QN S FQAS SL+F    G
Subjt:  TFGSTPPA----NNDQASMEDSMAEDTVQTVASPM--PSFGQQPLT-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAG

Query:  GSFSLGA-GGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
        GSFSLG+ GGGDKS R+  K K  +RKK
Subjt:  GSFSLGA-GGGDKSNRKYVKVKSKSRKK

AT5G20200.1 nucleoporin-related

1.6e-16

24.4

Show/hide

Query:  GGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPL--SREANDEVENRNQEE-----------
        GG GGK +++  RR   TPY RP         + W+S++VDPA ++I+  A R+    F      P  + P     +   E++N  Q+            
Subjt:  GGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPL--SREANDEVENRNQEE-----------

Query:  -----VAADPPGTQEGTNVDFVPSINS------NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGS----
                 P GT      +F  S         N+   +S+LE++++ KTF++ EIDRL E++ SR  D+P   + ++ E+    P+    K++ S    
Subjt:  -----VAADPPGTQEGTNVDFVPSINS------NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGS----

Query:  PKFPAQSQDGVSP-HMVPTHVASANVLDEDV------ASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQK--FGDSFASGNPSKSSTLSLVPRS-PGNFDVVEN
         K P   +D  S     PT +A + +LD D        SPAE+AKA+MG +   ++     + ++K     S   G  S +S  S      PG     ++
Subjt:  PKFPAQSQDGVSP-HMVPTHVASANVLDEDV------ASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQK--FGDSFASGNPSKSSTLSLVPRS-PGNFDVVEN

Query:  GFVTPRSRGRS-ALYSMARVPYSRVRATPSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDD--EMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGL
        GF TP+SR  S  L +  R PYSR      + NS +     +  +S    +       L S   +++RR   L    + G  GP RR RQ +        
Subjt:  GFVTPRSRGRS-ALYSMARVPYSRVRATPSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDD--EMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGL

Query:  SLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKL---TPPKEKSSELKL
        S PS   S       FE++  ++       SS  G++ Y S  +        E+E           +P  SS++A  IL+ L++    + PK K++ELKL
Subjt:  SLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKL---TPPKEKSSELKL

Query:  LSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPN--DKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVG
         +   +  +  +            +D  SAK  E+++ I S       +Q     +  ++    + N  +K+ S  +G+       ++  G+ LQ  +  
Subjt:  LSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPN--DKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVG

Query:  PSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG-----YS-NGPVADI------SLERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPV
        P    K +   S H++     ++      YS  G  A++      SL   +     ++V+KP    A+             P+ S          SD   
Subjt:  PSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG-----YS-NGPVADI------SLERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPV

Query:  TTEKSPIFSFP-TASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEK------FPS-QKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANEQNAI
        ++E +     P T SPP   A+  G   T   E     E+P+ +       G+K      FPS  +E VS      FG K T  + +   I
Subjt:  TTEKSPIFSFP-TASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEK------FPS-QKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANEQNAI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGACAGAGCGTGAGGAGGTTCGATACGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAGTTCCAGAAAAGACCTGTCAGAAGGTCGCATACGACGCCGTATGATCGACCGCCGACTGC
TCTGAGGAACTCTGCTGGAAAAGGATGGCTTTCTAAGCTTGTCGATCCGGCGCAGAAGCTAATCACCTCTAGTGCGCATAGGTTGTTTTCTAGTGTGTTTCGTAAACGCC
TTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCACTTTCTCGAGAGGCTAATGATGAGGTGGAAAATAGGAACCAGGAAGAAGTTGCAGCTGATCCTCCTGGAACTCAAGAAGGGACT
AATGTTGATTTTGTTCCAAGCATCAATTCTAATAACACACATGGGGTGAGTGACCTTGAGAAAATTTTGAAGGAGAAGACCTTTACAAGATTTGAAATTGATCGCTTGAC
TGAACTTCTGAAATCAAGAGTTGCTGACGTTCCAAGTGGAGTTGAATCGAGGAAATTTGAACAGTTCCCTTCAACCCCAGTTATCAGCTATGGAAAACAGGATGGATCTC
CAAAATTCCCAGCTCAGAGTCAAGATGGAGTTAGTCCTCATATGGTTCCAACTCATGTTGCGAGTGCAAATGTCCTTGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCA
AAAGCGTTCATGGGCAGCAGGCCTCCAAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGCATCCCATAGTCAAAAGTTCGGGGATAGTTTTGCTTCTGGCAATCCTTCAAAATCCTCTAC
TTTATCTCTTGTGCCAAGGTCTCCTGGAAATTTTGATGTTGTTGAAAATGGTTTTGTCACCCCGAGATCTCGTGGTAGATCTGCCCTATATAGTATGGCTCGAGTGCCAT
ATTCCAGAGTCCGTGCAACACCCAGCATAAAGAATAGTGTAGCAACAACAGATGCTTACAGGGCCACAACGTCCTCATCATCTCAGTCAGCATGGGGGCAAGGGAGACTT
TTGGGGTCTGACCAAGGGGCTTTAAAACGTCGAAGCTCAGTTTTAGATGATGAAATGGGATCTGTTGGTCCTATTCGAAGAATTCGTCAGAAATCTAATCACCTTTTCCA
TAAAGGTTTGAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTAAGTGGAATTGGTTTTGAGAGTGCTCAGCATTTGCAGTCTACAAAAGTACATCCATTTTCGTCTACCG
GTGGGAAGGCACTTTATTCAAGTGAGATCAAGCGTAATTTGTCCAAAATGTCTTCAGAGTCCGAAAATGCTATGACACCTAGTTCAAGTTTTCCTCAAATTCCCCTCAGG
TCAAGTGAGATGGCATCAAAAATATTAGAGCAGCTTGATAAATTGACCCCTCCGAAGGAAAAATCTTCCGAACTAAAGCTGCTTAGTGTGAGGAATAACTCACCCACGAA
GTTATCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAAGATGTTGATTCAGCTAAGTATTTGGAAAATGTTGAAGGCATTCGGTCTAACGATGCCCATGATC
TTACTTCTCAAAAGAAGGATAAGTTTGAGGAAAGCAGTTCGTTAAAATTTAAAGTACCCAATGATAAATCTATTTCTACAGGTGATGGTGTAGGTTCTTCAGTGCCTACT
AAGAATACCGTATCTGGTTCTGGTCTGCAAGTTTCATATGTTGGCCCTTCCTTACAAACAAAATGTGCTTTCCAGATGAGTGCACATGAGGATTTTGTGGATATGGATGA
AGAAGGATATTCTAATGGGCCAGTAGCTGATATATCGTTGGAGAGGCGTGAAAAAGCTGACTCATTAGTGGCAGTGAGTAAGCCGAATAATACTGAAGCCCTCACAGTAG
ATAAACCTCAGGCTTCAATTGAGGCTAAACCACCCGCGGCATCTGCAATGAACAAAGTAAATGACCAAGGAAAATCTGATGTTCCTGTGACTACTGAAAAGAGCCCCATT
TTTTCCTTTCCGACAGCTTCTCCACCTAGCATTACAGCCAACGTGATAGGTCCTGAATCAACCTTGAGACCTGAAAAAATTGCTTCTTCTGAAGTACCAAAAGCAGCTAC
TACCCCTATATTTGGCTTTGGAGAAAAGTTTCCATCACAGAAGGAAGCAGTTTCTTCTGCCCCCACCTTTGCATTTGGAAACAAGGTTACTACCTCAGCAAATGAACAAA
ATGCTATTCCTGTCGTAACTTCTGAAGGCAACGTTGAGCCAACTGAACAGGCTTCTGCCCCTACCACATTTAAATTTGGAGATAAAGCTACATTTCCTATTCCAGCAAAT
GCCGCTACAGAAAATGGAAATAAGAATGCAGGGTCTCTGTTTAAGTTTGCATCACCTTTAGTTAACGAAAAAGAAGGTGCTAAAGTAGGCGGCAGTGCTTCAGTTTTTAA
AGCAGAGAGTTCTAGCAGCAGCATCCTGTCATTTGGAGTTCCAAAAGAGTCTATGTCAGAGAAATCTGGCGATAAGAGCTCGGATGCTGGTCTCGCAGTTGGTACATCTG
GGAATTTGTTATTGTCATCTGTCTCAACATCAACATCAACACCAACTCCGAGTTTGTTTTCTTTTAGCTCCCCTAGCACTAATTCAAATCTCAACAACGGATCTCTTGTT
TCTACTACTCCATCTACTTTTCCCACCCCAGCCACCACTTTTTCTAATAATATAACAAATCAGAATTCATCCATCAAACCATCTTTCAATGCTGCCACTAGCAATAGTGA
ACCCGTCACCACTACGAGTCTTCCTATGTCTTCTCCTATGCCATCCTTTTCAGCTGCACCCATTTTCAAATTTGGGAGCTCTAGTGTTCCTTCGACATCCGCTCCAGCTC
TATCAGCACCAAGCGGAGTTGGATCCATTGAAACCAAGTCCAAGCAAGAGACAACATTTGGCAATTTAAGTGGAATTCCTCCAAGCGACACATCTGCTGTTAAAGTATCT
AGTACTGGAAGCAGTGTTTTTCAATTTGGAGCTGCATCTACTACTTCAGATTCTAATAAACGACCAGAAAATTCAACTTTCCCTCCAAGCAACGTTCCTGCATTTGGTGC
TCCGGTTTCGCCTGCTAGTAGTGGGCTTGCATCGTCTACTCAGAGTACACCTGTTTTGCAGTTCAGTTCATCATCTACATCATTTGGTTTGACTGGGAATACGGGTTTGG
CCTCTGGCGGTTCCCTGTTTGGTTCTTCAGCTCCAGCATCTAATCTGTTCACTACAGGCACGACTTTTGGGCTTGCTTCCTCCAGTTCCTCTGCTAATAATTCTATCAGC
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Lsi08G006290 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome