; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi08G006820 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi08G006820
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionras-related protein RABC2a-like
Genome locationchr08:15149459..15152802
RNA-Seq ExpressionLsi08G006820
SyntenyLsi08G006820
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004150373.1 ras-related protein RABC2a [Cucumis sativus]6.5e-10893.49Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGK+LKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNL++VWAKEVELYLTN ECIKILVGNKVDRGS+RAVTTEEGMEVAK+HKSLFLECSARTRENVDRCF ELSSKM+EVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARK--EANDGGCCH
        +ARK  E ND GCCH
Subjt:  RARK--EANDGGCCH

XP_008456546.1 PREDICTED: ras-related protein RABC2a-like [Cucumis melo]2.9e-10893.49Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNL+++WAKEVELYLTN ECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGME+AKEHKSLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLENGS+VVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARK--EANDGGCCH
        RA K  E ND GCCH
Subjt:  RARK--EANDGGCCH

XP_022952871.1 ras-related protein RABC2a-like [Cucurbita moschata]2.6e-10995.75Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNLMDVWAKEVE+YLTNHECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEANDGGCC
        RARKEANDGGCC
Subjt:  RARKEANDGGCC

XP_022990456.1 ras-related protein RABC2a-like [Cucurbita maxima]1.1e-10794.81Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNLM VWAKEVE+YLTNHECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEANDGGCC
        RA KEANDGGCC
Subjt:  RARKEANDGGCC

XP_038885704.1 ras-related protein RABC2a-like [Benincasa hispida]4.4e-11297.18Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNLMDVWAKEVE+YLTN ECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLENGSVVVKQKILD T
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEANDGGCCH
        RARKEAND GCCH
Subjt:  RARKEANDGGCCH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LN27 Uncharacterized protein3.2e-10893.49Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGK+LKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNL++VWAKEVELYLTN ECIKILVGNKVDRGS+RAVTTEEGMEVAK+HKSLFLECSARTRENVDRCF ELSSKM+EVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARK--EANDGGCCH
        +ARK  E ND GCCH
Subjt:  RARK--EANDGGCCH

A0A1S3C3K9 ras-related protein RABC2a-like1.4e-10893.49Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGRC SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNL+++WAKEVELYLTN ECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGME+AKEHKSLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLENGS+VVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARK--EANDGGCCH
        RA K  E ND GCCH
Subjt:  RARK--EANDGGCCH

A0A6J1BW00 ras-related protein RABC2a-like5.2e-10388.73Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSKGR  SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIK VTVGGKRLKLTIWDTAGQERFG LTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNL+++WAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSER V+TEEGM VA EHKS+FLECSA+TRENVDRCF +L  K+L+VPSLLENGSV +KQ+ILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEANDGGCCH
        RARK A DGGCCH
Subjt:  RARKEANDGGCCH

A0A6J1GLE8 ras-related protein RABC2a-like1.3e-10995.75Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNLMDVWAKEVE+YLTNHECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEANDGGCC
        RARKEANDGGCC
Subjt:  RARKEANDGGCC

A0A6J1JMZ9 ras-related protein RABC2a-like5.4e-10894.81Show/hide
Query:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
        MMGSSSK R SSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFV DLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR
Subjt:  MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRR

Query:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
        ETFTNLM VWAKEVE+YLTNHECIKILVGNKVDRGSERAV+TEEGM VAKEH+SLFLECSARTRENVDRCF ELSSK+LEVPSLLENGSVVVKQKILDKT
Subjt:  ETFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKT

Query:  RARKEANDGGCC
        RA KEANDGGCC
Subjt:  RARKEANDGGCC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23657 Ras-related protein RABC11.1e-7063.98Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+   +DY FK+LLIGDSGVGKSS+LLS+ SN   DLSPTIGVDFK+K +T+G K+LKL IWDTAGQERF TLTSSYYRGA GII+VYDVTRR+
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TFTNL D+WAKE++LY TN +CIK+LVGNKVD+ SERAV+ +EG++ A+E+  LFLECSA+TR NV++CF EL  K+LE PSL   GS   K+ I  +  
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEANDGGCC
        A+  +     C
Subjt:  ARKEANDGGCC

O49841 Ras-related protein RABC2a7.8e-8071.56Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+L+S+IS+ V DL+PTIGVDFKIK +TVGGKRLKLTIWDTAGQERF TLTSSYYRGA GIILVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TFTNL+DVW KE+ELY TN EC+++LVGNKVDR SER V+ EEG+ +AKE   +FLECSARTR+NV++CF EL+ K++EVPSLLE GS  VK+ IL +  
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEANDGGCC
          +     GCC
Subjt:  ARKEANDGGCC

P36862 GTP-binding protein yptV34.9e-5056.67Show/hide
Query:  SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVW
        S+DY+FK+LL+GDSGVGKS IL  + S  F    + TIGVDFK+K +T  GKR KLTIWDTAGQERF TLTSSYYRGA GII VYDVTRR+TF +L   W
Subjt:  SYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVW

Query:  AKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSV
         +E ++Y T    IK++V NKVD  ++R V++EEG + A+ H  LF+E SAR    V + F EL  K+L+ P LLE  +V
Subjt:  AKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSV

Q5ZLG1 Ras-related protein Rab-183.0e-4750.51Show/hide
Query:  SFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEV
        + KIL+IG+SGVGKSS+LL +  + F  +L+ TIGVDFK+K ++V G + KL IWDTAGQERF TLT SYYRGA G+ILVYDVTRR+TF  L D W  E+
Subjt:  SFKILLIGDSGVGKSSILLSYISN-FVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVWAKEV

Query:  ELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC
        E Y T ++ +K+LVGNK+D+   R V   EG++ A++H  LF+E SA+T + V   F EL  K+++ P L E+ S     K+ +K    +E + GG C
Subjt:  ELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCC

Q9SF92 Ras-related protein RABC2b9.9e-7570.14Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTIGVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG+ GIILVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TF NL D+WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL+ K++EVPSLLE GS  VK+K      
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEANDGGCC
            A+ G CC
Subjt:  ARKEANDGGCC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43890.1 RAB GTPASE HOMOLOG B188.0e-7263.98Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+   +DY FK+LLIGDSGVGKSS+LLS+ SN   DLSPTIGVDFK+K +T+G K+LKL IWDTAGQERF TLTSSYYRGA GII+VYDVTRR+
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TFTNL D+WAKE++LY TN +CIK+LVGNKVD+ SERAV+ +EG++ A+E+  LFLECSA+TR NV++CF EL  K+LE PSL   GS   K+ I  +  
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEANDGGCC
        A+  +     C
Subjt:  ARKEANDGGCC

AT3G09910.1 RAB GTPase homolog C2B7.0e-7670.14Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTIGVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG+ GIILVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TF NL D+WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL+ K++EVPSLLE GS  VK+K      
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEANDGGCC
            A+ G CC
Subjt:  ARKEANDGGCC

AT3G09910.2 RAB GTPase homolog C2B7.0e-7670.14Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTIGVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG+ GIILVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TF NL D+WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL+ K++EVPSLLE GS  VK+K      
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEANDGGCC
            A+ G CC
Subjt:  ARKEANDGGCC

AT3G09910.3 RAB GTPase homolog C2B7.0e-7670.14Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTIGVDFKIK + V GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG+ GIILVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TF NL D+WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGM +AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL+ K++EVPSLLE GS  VK+K      
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEANDGGCC
            A+ G CC
Subjt:  ARKEANDGGCC

AT5G03530.1 RAB GTPase homolog C2A5.5e-8171.56Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+L+S+IS+ V DL+PTIGVDFKIK +TVGGKRLKLTIWDTAGQERF TLTSSYYRGA GIILVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TFTNL+DVW KE+ELY TN EC+++LVGNKVDR SER V+ EEG+ +AKE   +FLECSARTR+NV++CF EL+ K++EVPSLLE GS  VK+ IL +  
Subjt:  TFTNLMDVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR

Query:  ARKEANDGGCC
          +     GCC
Subjt:  ARKEANDGGCC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGGTTCTTCTTCAAAAGGAAGATGCAGTAGTTACGATTACTCTTTCAAGATTTTGTTGATTGGGGATTCTGGTGTTGGAAAAAGCAGTATTCTCCTTAGCTACAT
CTCCAATTTTGTTCATGATCTTTCTCCCACCATCGGTGTGGATTTCAAGATCAAGATGGTAACAGTTGGTGGGAAAAGATTGAAGCTAACAATTTGGGACACAGCTGGAC
AAGAGAGATTTGGAACATTGACAAGCTCTTACTACAGAGGTGCACATGGAATCATCCTAGTATACGACGTTACCCGACGGGAGACGTTTACAAACTTGATGGATGTATGG
GCAAAGGAAGTAGAGTTGTATTTAACCAATCATGAGTGCATAAAGATTCTAGTTGGAAATAAAGTCGATCGGGGTAGTGAAAGAGCGGTAACAACAGAAGAAGGCATGGA
AGTTGCCAAGGAGCATAAAAGTTTGTTTCTTGAGTGCAGTGCTAGAACTCGAGAAAATGTCGACAGATGCTTCAGTGAACTCTCTTCAAAGATGCTGGAAGTTCCAAGTC
TACTGGAAAATGGATCTGTTGTTGTGAAACAGAAAATTTTGGACAAGACACGAGCACGCAAAGAAGCGAACGACGGGGGTTGTTGCCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGGGTTCTTCTTCAAAAGGAAGATGCAGTAGTTACGATTACTCTTTCAAGATTTTGTTGATTGGGGATTCTGGTGTTGGAAAAAGCAGTATTCTCCTTAGCTACAT
CTCCAATTTTGTTCATGATCTTTCTCCCACCATCGGTGTGGATTTCAAGATCAAGATGGTAACAGTTGGTGGGAAAAGATTGAAGCTAACAATTTGGGACACAGCTGGAC
AAGAGAGATTTGGAACATTGACAAGCTCTTACTACAGAGGTGCACATGGAATCATCCTAGTATACGACGTTACCCGACGGGAGACGTTTACAAACTTGATGGATGTATGG
GCAAAGGAAGTAGAGTTGTATTTAACCAATCATGAGTGCATAAAGATTCTAGTTGGAAATAAAGTCGATCGGGGTAGTGAAAGAGCGGTAACAACAGAAGAAGGCATGGA
AGTTGCCAAGGAGCATAAAAGTTTGTTTCTTGAGTGCAGTGCTAGAACTCGAGAAAATGTCGACAGATGCTTCAGTGAACTCTCTTCAAAGATGCTGGAAGTTCCAAGTC
TACTGGAAAATGGATCTGTTGTTGTGAAACAGAAAATTTTGGACAAGACACGAGCACGCAAAGAAGCGAACGACGGGGGTTGTTGCCACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTVGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMDVW
AKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMEVAKEHKSLFLECSARTRENVDRCFSELSSKMLEVPSLLENGSVVVKQKILDKTRARKEANDGGCCH