; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi08G011540 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi08G011540
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionprotein TIFY 8
Genome locationchr08:20174907..20179040
RNA-Seq ExpressionLsi08G011540
SyntenyLsi08G011540
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
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InterPro domainsIPR010399 - Tify domain
IPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0064971.1 protein TIFY 8-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]3.9e-21988.08Show/hide
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A0A1S3BBZ1 protein TIFY 8-like isoform X13.4e-22188.5Show/hide
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A0A5A7VGV4 Protein TIFY 8-like isoform X11.9e-21988.08Show/hide
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A0A6J1EV71 protein TIFY 8-like isoform X13.9e-20182.52Show/hide
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A0A6J1K9J5 protein TIFY 8-like isoform X11.2e-19481.39Show/hide
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        SGTNIV+ E+C+PSSRRGLTS NRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSNGGSWSTNYATK TARPINENQ+PSGELDI          AKEA G
Subjt:  SGTNIVEHEACIPSSRRGLTSANRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSNGGSWSTNYATKLTARPINENQIPSGELDIGMTSNTTSMFAKEARG

Query:  KLCVAGSSLPLAGSVERISTTSAGAPHGSSGGKGGRDQVQATDSNM
        KLCVAGSS+PL GSVE+IST++AG PHGSS GKGGRDQ QATDS++
Subjt:  KLCVAGSSLPLAGSVERISTTSAGAPHGSSGGKGGRDQVQATDSNM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q84MB2 Protein TIFY 89.1e-4637.03Show/hide
Query:  IFHDFLGMKNPDTTPLVFAPRTAADLRSSEPSPAASASRGP-----SSSGGRGPISTTSDLASDRQ-VGSHLEGVPFYGPRGDISTTEIHSRIIGSKRSI
        +FHDFLG KNP       A  + AD R    + AA A+  P     SS+GG G +S+TSDL       G+HL+G+  +GPR D+S + + +R  G+KRS 
Subjt:  IFHDFLGMKNPDTTPLVFAPRTAADLRSSEPSPAASASRGP-----SSSGGRGPISTTSDLASDRQ-VGSHLEGVPFYGPRGDISTTEIHSRIIGSKRSI

Query:  SDSAFMGSYRDGVPHMPSESHHNSLHLMKTLRNGAGGERNRRSNDDEVTLGMQHPMRPNSASLIFQSHIGSGSRLDADGTKWERSTLMNIGPSPAVQCSP
        SDS           H  ++ H  +LH  K LRNG G                                                S  MN+ P        
Subjt:  SDSAFMGSYRDGVPHMPSESHHNSLHLMKTLRNGAGGERNRRSNDDEVTLGMQHPMRPNSASLIFQSHIGSGSRLDADGTKWERSTLMNIGPSPAVQCSP

Query:  RGTLVPFPPQLPTNRFRDANVIPPNISQSAADEGSRTGMKGPGILSSSHPGGVTSERNSSILLPSCSLQKSGTNIVEHEACIPSSRRGLTSANRQMTIFY
         G +     QL T+RF+D NV P  I+Q+AADEGSRTGMKGPGILSS       +  NSS L    S   S T           +R+ L S+ +QMTIFY
Subjt:  RGTLVPFPPQLPTNRFRDANVIPPNISQSAADEGSRTGMKGPGILSSSHPGGVTSERNSSILLPSCSLQKSGTNIVEHEACIPSSRRGLTSANRQMTIFY

Query:  GGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSNGGSWSTNYATKLTARPINENQIPSGELDIGM-----TSNTTSMFAKEARGKLCVAGSSLPLAGSVERISTTSAGA
        GGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGS+GGSWST     L+ +P ++N    G   +G      +S  T     E R +     S  P + +  RI T     
Subjt:  GGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSNGGSWSTNYATKLTARPINENQIPSGELDIGM-----TSNTTSMFAKEARGKLCVAGSSLPLAGSVERISTTSAGA

Query:  PHGS--SGGKGGRDQVQATDSNME
          GS  S G+  RD V  +D   E
Subjt:  PHGS--SGGKGGRDQVQATDSNME

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70700.1 TIFY domain/Divergent CCT motif family protein5.2e-0435.23Show/hide
Query:  HEACIPSSRRGLTSANRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSNGGSWSTNYATKLTARPINENQIPSGELDIGMTSNTTSMFA
        H + +P  R   + ++ Q+TIFYGG   VF+D+ P+KA  IM  AG NG    T       ++P+ E +   G+  I  T+ T+S  A
Subjt:  HEACIPSSRRGLTSANRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSNGGSWSTNYATKLTARPINENQIPSGELDIGMTSNTTSMFA

AT1G70700.2 TIFY domain/Divergent CCT motif family protein5.2e-0442.55Show/hide
Query:  HEACIPSSRRGLTSANRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGS
        H + +P  R   + ++ Q+TIFYGG   VF+D+ P+KA  IM  AG+
Subjt:  HEACIPSSRRGLTSANRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGS

AT3G17860.1 jasmonate-zim-domain protein 35.2e-0435.65Show/hide
Query:  PNISQSAADEGSRTGMKGPGILSSSH-PGGVTSERNSS---------ILLPSCSLQKSGTNIVEHEACIPSSRRGLTSANRQMTIFYGGQAHVFDDVHPN
        PN +Q   +E +   M  PG  S  + PGG +   N++         I+ P  S+     +IV     I SS + + S   Q+TIFY G   V+DD+ P 
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Query:  KADVIMALAGSNGGS
        KA  IM LAG NG S
Subjt:  KADVIMALAGSNGGS

AT3G17860.2 jasmonate-zim-domain protein 35.2e-0435.65Show/hide
Query:  PNISQSAADEGSRTGMKGPGILSSSH-PGGVTSERNSS---------ILLPSCSLQKSGTNIVEHEACIPSSRRGLTSANRQMTIFYGGQAHVFDDVHPN
        PN +Q   +E +   M  PG  S  + PGG +   N++         I+ P  S+     +IV     I SS + + S   Q+TIFY G   V+DD+ P 
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Query:  KADVIMALAGSNGGS
        KA  IM LAG NG S
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AT4G32570.1 TIFY domain protein 86.5e-4737.03Show/hide
Query:  IFHDFLGMKNPDTTPLVFAPRTAADLRSSEPSPAASASRGP-----SSSGGRGPISTTSDLASDRQ-VGSHLEGVPFYGPRGDISTTEIHSRIIGSKRSI
        +FHDFLG KNP       A  + AD R    + AA A+  P     SS+GG G +S+TSDL       G+HL+G+  +GPR D+S + + +R  G+KRS 
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Query:  SDSAFMGSYRDGVPHMPSESHHNSLHLMKTLRNGAGGERNRRSNDDEVTLGMQHPMRPNSASLIFQSHIGSGSRLDADGTKWERSTLMNIGPSPAVQCSP
        SDS           H  ++ H  +LH  K LRNG G                                                S  MN+ P        
Subjt:  SDSAFMGSYRDGVPHMPSESHHNSLHLMKTLRNGAGGERNRRSNDDEVTLGMQHPMRPNSASLIFQSHIGSGSRLDADGTKWERSTLMNIGPSPAVQCSP

Query:  RGTLVPFPPQLPTNRFRDANVIPPNISQSAADEGSRTGMKGPGILSSSHPGGVTSERNSSILLPSCSLQKSGTNIVEHEACIPSSRRGLTSANRQMTIFY
         G +     QL T+RF+D NV P  I+Q+AADEGSRTGMKGPGILSS       +  NSS L    S   S T           +R+ L S+ +QMTIFY
Subjt:  RGTLVPFPPQLPTNRFRDANVIPPNISQSAADEGSRTGMKGPGILSSSHPGGVTSERNSSILLPSCSLQKSGTNIVEHEACIPSSRRGLTSANRQMTIFY

Query:  GGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSNGGSWSTNYATKLTARPINENQIPSGELDIGM-----TSNTTSMFAKEARGKLCVAGSSLPLAGSVERISTTSAGA
        GGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGS+GGSWST     L+ +P ++N    G   +G      +S  T     E R +     S  P + +  RI T     
Subjt:  GGQAHVFDDVHPNKADVIMALAGSNGGSWSTNYATKLTARPINENQIPSGELDIGM-----TSNTTSMFAKEARGKLCVAGSSLPLAGSVERISTTSAGA

Query:  PHGS--SGGKGGRDQVQATDSNME
          GS  S G+  RD V  +D   E
Subjt:  PHGS--SGGKGGRDQVQATDSNME


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCAGCACAGTATGCTAACCAATGTCAACAGCGACTCCAACAAAGACTATGTTTGTAAAAATTCCACTGACCCACATCCACAATTACCTGCCAATCCAATCTTCCA
TGATTTTTTAGGCATGAAAAACCCTGATACTACTCCTCTGGTTTTTGCTCCCCGGACGGCGGCGGATTTGCGATCGTCGGAACCCTCTCCGGCTGCCTCCGCCTCCCGTG
GCCCTTCTTCAAGCGGTGGTCGTGGCCCCATCTCTACTACCTCAGATCTTGCTTCTGACCGACAGGTAGGGAGTCATCTTGAAGGCGTTCCGTTCTATGGTCCGAGGGGC
GATATCTCCACGACGGAGATTCATAGTAGGATTATAGGAAGCAAGAGAAGCATATCGGATTCTGCTTTTATGGGATCGTACCGAGATGGAGTTCCACACATGCCTTCCGA
GTCGCATCATAATAGCTTGCATCTAATGAAGACATTACGAAATGGAGCAGGCGGGGAGCGAAACCGAAGATCCAATGATGATGAAGTGACGCTTGGGATGCAGCATCCAA
TGAGGCCGAACTCTGCATCGCTTATATTTCAATCTCATATTGGAAGTGGCAGTAGGCTTGATGCTGATGGTACCAAGTGGGAGAGATCCACGCTTATGAACATCGGTCCT
TCTCCGGCAGTACAGTGCTCTCCCCGGGGGACGTTGGTACCTTTTCCCCCTCAGTTACCTACAAATAGATTCAGAGATGCCAATGTTATTCCCCCAAATATATCTCAATC
AGCTGCAGATGAGGGATCTCGAACTGGAATGAAAGGTCCTGGAATCTTGAGTTCGAGTCATCCCGGTGGTGTAACCTCTGAACGAAACTCATCTATCCTACTCCCAAGTT
GCAGCTTGCAAAAGTCCGGGACTAATATCGTGGAGCATGAAGCCTGTATTCCTTCAAGTCGACGTGGTCTTACATCTGCTAATCGGCAGATGACAATATTTTATGGTGGC
CAAGCTCATGTCTTCGATGACGTTCATCCAAACAAGGCAGATGTTATAATGGCCTTAGCTGGATCGAACGGTGGATCGTGGTCGACTAATTATGCAACAAAGTTAACTGC
TAGGCCAATCAACGAAAACCAAATACCAAGTGGAGAACTCGATATTGGTATGACAAGTAACACCACCTCGATGTTCGCCAAAGAAGCTCGTGGAAAGCTGTGTGTTGCTG
GGAGTTCCCTCCCGCTAGCTGGCTCTGTTGAGAGAATCTCAACAACATCAGCAGGAGCGCCTCATGGCAGCAGTGGTGGTAAGGGTGGTAGAGACCAAGTTCAAGCCACT
GATTCCAATATGGAGAAGAAGAGAGAGGTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGACATCCTCCTCGTATTCCCTATACTGAAGAACCCCAAAAAGAAATATAAAATAAAAATCCAAACTTTGCAACTTCACCGAGAGAGAGAACACAGAGGGCCAGCAGAA
CAGAAGGAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAGCTCCATTAAATTTGCACAGAACACATGCCAACTTTTGCTTTTTATTACCCTCATTTCTCTCTCCAAAAAAGGAGCTT
GATTCTCTCTGCTATAATTTGTTTATTTATTCATTTTTTTTCTCCCTCTTCCCTTTTTCCCCCTTTATAATTGTTTTTCTTTTCACAAATCTTTAATTTCCTTTTTCTTT
TTCTTGTGTTGCCCCTGAAAAATTGAGCTCCCCCCACTTCTTTTTTTGGGTTTTTGCTTTCTCCCCCCACTGTTCCTTCCTCCTCTCTCTCTGTTTTGTGTGATGGGGGC
AGTTTTAATGGAGTGGCTGTACTACTGATAAATGGCTCAGCACAGTATGCTAACCAATGTCAACAGCGACTCCAACAAAGACTATGTTTGTAAAAATTCCACTGACCCAC
ATCCACAATTACCTGCCAATCCAATCTTCCATGATTTTTTAGGCATGAAAAACCCTGATACTACTCCTCTGGTTTTTGCTCCCCGGACGGCGGCGGATTTGCGATCGTCG
GAACCCTCTCCGGCTGCCTCCGCCTCCCGTGGCCCTTCTTCAAGCGGTGGTCGTGGCCCCATCTCTACTACCTCAGATCTTGCTTCTGACCGACAGGTAGGGAGTCATCT
TGAAGGCGTTCCGTTCTATGGTCCGAGGGGCGATATCTCCACGACGGAGATTCATAGTAGGATTATAGGAAGCAAGAGAAGCATATCGGATTCTGCTTTTATGGGATCGT
ACCGAGATGGAGTTCCACACATGCCTTCCGAGTCGCATCATAATAGCTTGCATCTAATGAAGACATTACGAAATGGAGCAGGCGGGGAGCGAAACCGAAGATCCAATGAT
GATGAAGTGACGCTTGGGATGCAGCATCCAATGAGGCCGAACTCTGCATCGCTTATATTTCAATCTCATATTGGAAGTGGCAGTAGGCTTGATGCTGATGGTACCAAGTG
GGAGAGATCCACGCTTATGAACATCGGTCCTTCTCCGGCAGTACAGTGCTCTCCCCGGGGGACGTTGGTACCTTTTCCCCCTCAGTTACCTACAAATAGATTCAGAGATG
CCAATGTTATTCCCCCAAATATATCTCAATCAGCTGCAGATGAGGGATCTCGAACTGGAATGAAAGGTCCTGGAATCTTGAGTTCGAGTCATCCCGGTGGTGTAACCTCT
GAACGAAACTCATCTATCCTACTCCCAAGTTGCAGCTTGCAAAAGTCCGGGACTAATATCGTGGAGCATGAAGCCTGTATTCCTTCAAGTCGACGTGGTCTTACATCTGC
TAATCGGCAGATGACAATATTTTATGGTGGCCAAGCTCATGTCTTCGATGACGTTCATCCAAACAAGGCAGATGTTATAATGGCCTTAGCTGGATCGAACGGTGGATCGT
GGTCGACTAATTATGCAACAAAGTTAACTGCTAGGCCAATCAACGAAAACCAAATACCAAGTGGAGAACTCGATATTGGTATGACAAGTAACACCACCTCGATGTTCGCC
AAAGAAGCTCGTGGAAAGCTGTGTGTTGCTGGGAGTTCCCTCCCGCTAGCTGGCTCTGTTGAGAGAATCTCAACAACATCAGCAGGAGCGCCTCATGGCAGCAGTGGTGG
TAAGGGTGGTAGAGACCAAGTTCAAGCCACTGATTCCAATATGGAGAAGAAGAGAGAGGTGTAGTATTAGTTCTCCAACTCAAACAAATGTTTCTAAATCCATGAAGGCA
GCTGTTTTAAGGAATTCTAGACGTACTCGCCCATATTTCGGTACTATTTAACTTTGATTTTTATTGTATTTTCTTACCTTTTTTCTTCTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAQHSMLTNVNSDSNKDYVCKNSTDPHPQLPANPIFHDFLGMKNPDTTPLVFAPRTAADLRSSEPSPAASASRGPSSSGGRGPISTTSDLASDRQVGSHLEGVPFYGPRG
DISTTEIHSRIIGSKRSISDSAFMGSYRDGVPHMPSESHHNSLHLMKTLRNGAGGERNRRSNDDEVTLGMQHPMRPNSASLIFQSHIGSGSRLDADGTKWERSTLMNIGP
SPAVQCSPRGTLVPFPPQLPTNRFRDANVIPPNISQSAADEGSRTGMKGPGILSSSHPGGVTSERNSSILLPSCSLQKSGTNIVEHEACIPSSRRGLTSANRQMTIFYGG
QAHVFDDVHPNKADVIMALAGSNGGSWSTNYATKLTARPINENQIPSGELDIGMTSNTTSMFAKEARGKLCVAGSSLPLAGSVERISTTSAGAPHGSSGGKGGRDQVQAT
DSNMEKKREV