CuGenDBv2

Gene ID	Lsi08G011930
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	transcription factor HY5-like
Genome location	chr08:20510407..20511034
RNA-Seq Expression	Lsi08G011930
Synteny	Lsi08G011930
Gene Ontology terms	GO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function) GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR044280 - Transcriptional activator Hac1/HY5

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAF3447136.1 hypothetical protein FNV43_RR12316 [Rhamnella rubrinervis]

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KAG6598576.1 Transcription factor HY5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7029514.1 Transcription factor HY5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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NP_001284656.1 Transcription factor HY5-like [Cucumis melo]

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XP_022996780.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita maxima]

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A0A0A0LPK1 BZIP domain-containing protein

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A0A5A7VGC0 Transcription factor HY5

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A0A6J1BRS2 transcription factor HY5-like

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A0A6J1K7Q9 transcription factor HY5-like

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F1DQG1 BZIP2

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SwissProt top hits

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O24646 Transcription factor HY5

1.5e-24

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Q9SM50 Transcription factor HY5

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78.49

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Arabidopsis top hits

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AT5G11260.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein

1.1e-25

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Sequences

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CDS sequence

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ATGCAGGAGCAAGCGACGAGTTCAGCCGCCGCTAGTTCTTTGCCTTCGAGCAGTGAAAGATCCTCTAGCTCTGCGCTTCATCTCGAAGTTAAAGAAGGAATGGAGAGCGA
TGAGGAGATCCGGAGAGTGCCGGAGATAGGCGGTGAATCGGCCGGTACATCGGCTTCCGGGAGGGATACTGGTTCGGTCGCCGGTCCGGACCGGGTTCAAGTTTCTCGGG
AGGGTCAAAGGAAAAGAGGGAGAAGTCCGGCTGATAAAGAAAGCAAGAGACTGAAG

mRNA sequence

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CTTTTATGTCCCGCTCTTTCTTTCTTCCTTTTTTTTCTCTCTCTCTTCTCTTCTAGAAAATATCTGAAGAAAAAAATTAAAAAAAGAAAAAAGTATTTTGTCTAGCTGTG
ACTCTGTTTGTTCAAAGCTTTTTTTTTGGTTGACGGAGAAATGCAGGAGCAAGCGACGAGTTCAGCCGCCGCTAGTTCTTTGCCTTCGAGCAGTGAAAGATCCTCTAGCT
CTGCGCTTCATCTCGAAGTTAAAGAAGGAATGGAGAGCGATGAGGAGATCCGGAGAGTGCCGGAGATAGGCGGTGAATCGGCCGGTACATCGGCTTCCGGGAGGGATACT
GGTTCGGTCGCCGGTCCGGACCGGGTTCAAGTTTCTCGGGAGGGTCAAAGGAAAAGAGGGAGAAGTCCGGCTGATAAAGAAAGCAAGAGACTGAAG

Protein sequence

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MQEQATSSAAASSLPSSSERSSSSALHLEVKEGMESDEEIRRVPEIGGESAGTSASGRDTGSVAGPDRVQVSREGQRKRGRSPADKESKRLK

Lsi08G011930 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome