| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AHM88680.1 RNA polymerase beta [Lagenaria siceraria] | 1.0e-192 | 99.4 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| QJS52313.1 RNA polymerase beta' subunit [Indofevillea khasiana] | 3.9e-192 | 99.11 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNP NRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| QZL38672.1 RNA polymerase beta' subunit [Citrullus ecirrhosus] | 3.0e-192 | 99.11 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIR+TVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| YP_009325980.1 RNA polymerase beta' subunit [Citrullus lanatus] | 3.0e-192 | 99.11 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIR+TVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| YP_009456137.1 RNA polymerase beta' subunit [Lagenaria siceraria] | 1.0e-192 | 99.4 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1P8LE65 DNA-directed RNA polymerase subunit gamma | 1.5e-192 | 99.11 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIR+TVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| A0A1P8LFF8 DNA-directed RNA polymerase subunit gamma | 1.5e-192 | 99.11 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIR+TVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| A0A2I6C061 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 5.0e-193 | 99.4 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| A0A7G9IT28 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 5.0e-193 | 99.4 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| X2F7V3 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 5.0e-193 | 99.4 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B1A926 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 3.1e-184 | 93.45 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQH ASN+GVAKSKIREKEPI+WEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLV KGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLS IGDPISVPTQDML+GLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
G RRGICANRYNP NRKN++NE+I +NNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRW+LDQRVIASREAPIEVHYESLGT+HEIYG YLIV+S+K
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSY T
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| Q09MI7 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 3.6e-180 | 91.37 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNK+YKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLH+CGLPREIAIELFQTF+I GLIRQH ASNIGVAKSKIREK PI+WEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLG+QAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLS TIGDPIS+PTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYN NR+N+ +E+I +N+Y YTKEP FCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQR+IASREAPIEVHYESLGT HEIYG YLIV+S+K
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEIL IYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| Q49L07 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 6.5e-182 | 91.72 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSL LHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQH ASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLV KGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKY--TKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKS
GNRRGIC NRYNP NR+N++NE+ Y+NNYKY KEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQR+IASRE PIE+HYESLGT+HEIYG YLIV+S
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKY--TKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKS
Query: IKKEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
+KKEI+CIYIRTTVGHISL+REIEEAIQGFCRACS+GT
Subjt: IKKEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| Q4VZP2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 6.7e-195 | 99.11 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYG YLIVKSIK
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
| Q68S15 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.5e-181 | 92.28 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQH ASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQP+LVEGRAICLHPLV KGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYT--KEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKS
GNRRGIC NRYNP NR+N++NE+IY+NNYKYT KEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVI+++EAP+EVHYESLGT++EIYG YLIV+S
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYT--KEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKS
Query: IKKEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYG
IKKEIL IYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFC+ACSYG
Subjt: IKKEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYG
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G57660.1 nuclear RNA polymerase A1 | 1.3e-15 | 26.75 | Show/hide |
Query: VIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIEL-------------FQTFLIRGLI----RQHFASNIGVAKSKIREK--EPIVWE
++E KEG FR+ ++GKRV+++ RSVI P ++++ G+P A++L + +I G H++ K EK I +
Subjt: VIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIEL-------------FQTFLIRGLI----RQHFASNIGVAKSKIREK--EPIVWE
Query: IL-----------------------QEVMQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEG-RAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFS
+L + + G VL+NR PTLH+ + A + +++G + + LH C +NADFDGD+M VH P ++AEA ++ +
Subjt: IL-----------------------QEVMQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEG-RAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFS
Query: HMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLT
+ + G+P+ QD ++ +LT
Subjt: HMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLT
|
|
| AT4G35800.1 RNA polymerase II large subunit | 3.3e-19 | 29.63 | Show/hide |
Query: KSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIEL--------FQTFLIRGLI--RQHFASNIGVAKSKIREKE---------
KS ++ KEGR R L+GKRVD+S R+VI P++++ G+P IA+ L + ++ L+ H AK IR+
Subjt: KSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIEL--------FQTFLIRGLI--RQHFASNIGVAKSKIREKE---------
Query: -------PIVWEILQEVMQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDP
+ +++ + + G VL NR P+LH++ I + ++ L+ V +NADFDGD+M +HVP S E +AE LM ++S P
Subjt: -------PIVWEILQEVMQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDP
Query: ISVPTQDMLIGLYVLT
+ QD L+G +T
Subjt: ISVPTQDMLIGLYVLT
|
|
| AT5G60040.1 nuclear RNA polymerase C1 | 6.4e-23 | 31.73 | Show/hide |
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIREKEP
++GK GRFR L GKRV+++GR+VI P+L + G+P +A IE + + G + A N +G + +I ++
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIREKEP
Query: IVWEILQEVMQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDM
I + + + +G VL NR P+LHR+ I + ++ R + + VC +NADFDGD+M +HVP + EA+ EA LM NL + G+ + TQD
Subjt: IVWEILQEVMQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDM
Query: LIGLYVLT
L +++T
Subjt: LIGLYVLT
|
|
| AT5G60040.2 nuclear RNA polymerase C1 | 6.4e-23 | 31.73 | Show/hide |
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIREKEP
++GK GRFR L GKRV+++GR+VI P+L + G+P +A IE + + G + A N +G + +I ++
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIREKEP
Query: IVWEILQEVMQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDM
I + + + +G VL NR P+LHR+ I + ++ R + + VC +NADFDGD+M +HVP + EA+ EA LM NL + G+ + TQD
Subjt: IVWEILQEVMQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDM
Query: LIGLYVLT
L +++T
Subjt: LIGLYVLT
|
|
| ATCG00180.1 DNA-directed RNA polymerase family protein | 2.8e-180 | 90.48 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQH ASNIGVAKS+IREK+PIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIREKEPIVWEILQEV
Query: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQ+FQPILVEGR ICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLS IGDPISVPTQDMLIGLYVLT+
Subjt: MQGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEARLLMFSHMNLLSSTIGDPISVPTQDMLIGLYVLTN
Query: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
G RRGICANRYNP NRKN++NE+IY NYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQK+INLDSPLWLRW+LDQRVIASRE PIEVHYES G +HEIY YLIV+S+K
Subjt: GNRRGICANRYNPSNRKNHKNEKIYNNNYKYTKEPFFCNSYDAIGAYRQKRINLDSPLWLRWRLDQRVIASREAPIEVHYESLGTHHEIYGSYLIVKSIK
Query: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
KE CIYIRTTVGHIS YREIEEAIQGF +ACSY T
Subjt: KEILCIYIRTTVGHISLYREIEEAIQGFCRACSYGT
|
|
