; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi08G015210 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi08G015210
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionAdenine phosphoribosyltransferase
Genome locationchr08:23263235..23266647
RNA-Seq ExpressionLsi08G015210
SyntenyLsi08G015210
Gene Ontology termsGO:0006166 - purine ribonucleoside salvage (biological process)
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InterPro domainsIPR000836 - Phosphoribosyltransferase domain
IPR005764 - Adenine phosphoribosyl transferase
IPR029057 - Phosphoribosyltransferase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060947.1 adenine phosphoribosyltransferase 1 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.5e-11788.59Show/hide
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KAG6598340.1 Adenine phosphoribosyltransferase 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.0e-11586.87Show/hide
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XP_008444565.1 PREDICTED: adenine phosphoribosyltransferase 1 isoform X1 [Cucumis melo]2.5e-11788.59Show/hide
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XP_038886497.1 adenine phosphoribosyltransferase 3-like [Benincasa hispida]2.8e-12190.8Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LN96 Adenine phosphoribosyltransferase6.3e-11988.17Show/hide
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A0A1S3BAN4 Adenine phosphoribosyltransferase1.2e-11788.59Show/hide
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A0A5A7V262 Adenine phosphoribosyltransferase1.2e-11788.59Show/hide
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A0A6J1HEI1 Adenine phosphoribosyltransferase9.5e-11586.49Show/hide
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A0A6J1KCC0 Adenine phosphoribosyltransferase2.6e-11285.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P31166 Adenine phosphoribosyltransferase 1, chloroplastic1.2e-7974.4Show/hide
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Q43199 Adenine phosphoribosyltransferase 14.3e-7276.57Show/hide
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Q9LFP0 Adenine phosphoribosyltransferase 51.6e-6368.36Show/hide
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Q9SU38 Adenine phosphoribosyltransferase 41.4e-7075Show/hide
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Q9SUW2 Adenine phosphoribosyltransferase 34.3e-7278.86Show/hide
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        E+DPRI  I   IRV+PDFPK GI+FQDITT+LLD KAFKDTIDLFVERYR+K+ISVVAGIEARGF+FGPPIALAIGAKFVP+RKPKKLPGE I EEY L
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        EYG D++EMH+GAVEAG+RALV+DDLIATGGTL AAI LL  RVG EVVECACVIEL  LKGR+RL  +PL +LV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G27450.1 adenine phosphoribosyl transferase 18.9e-8174.4Show/hide
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AT1G27450.2 adenine phosphoribosyl transferase 12.2e-7980.87Show/hide
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AT1G27450.3 adenine phosphoribosyl transferase 11.7e-7671.09Show/hide
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Query:  ------------------------EVISEEYSLEYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLGRRVGVEVVECACVIELDGLKGRERLG
                                +VISEEYSLEYGTD +EMHVGAVE GERA++IDDLIATGGTL AAIRLL  RVGV++VECACVIEL  LKG+E+LG
Subjt:  ------------------------EVISEEYSLEYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLGRRVGVEVVECACVIELDGLKGRERLG

Query:  DRPLFVLVNAA
        +  LFVLV +A
Subjt:  DRPLFVLVNAA

AT4G12440.2 adenine phosphoribosyl transferase 49.8e-7275Show/hide
Query:  MASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYREKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVIS
        M+    +DPRI  I   IRV+PDFPK GI+FQDITTLLLD KAFKDTIDLFVERYR+ +ISVVAGIEARGFIFG PIALAIGAKFVP+RKPKKLPG++I 
Subjt:  MASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYREKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVIS

Query:  EEYSLEYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLGRRVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGDRPLFVLV
        EEY LEYG+D++EMHV AV++G+RALV+DDLIATGGTL AA+ LL +RVG EV+ECACVIEL  LKGRERL  +PL+VLV
Subjt:  EEYSLEYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLGRRVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGDRPLFVLV

AT4G22570.1 adenine phosphoribosyl transferase 33.1e-7378.86Show/hide
Query:  EQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYREKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSL
        E+DPRI  I   IRV+PDFPK GI+FQDITT+LLD KAFKDTIDLFVERYR+K+ISVVAGIEARGF+FGPPIALAIGAKFVP+RKPKKLPGE I EEY L
Subjt:  EQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGILFQDITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYREKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSL

Query:  EYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLGRRVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGDRPLFVLV
        EYG D++EMH+GAVEAG+RALV+DDLIATGGTL AAI LL  RVG EVVECACVIEL  LKGR+RL  +PL +LV
Subjt:  EYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIRLLGRRVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGDRPLFVLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAATCAGTCTCCAATCTCACTTCCTCACTTCCTCTTTCGCCGTCACCGTCACCGTCGCACTGCAGGACCACCGCGGTCTTCACTCCTCGTCGACGGATCGGTTCTTC
GTCAACAGCCGTCGGCGGCGCTTTCTCGTCGTGTCGTAAACATTTGACTCGCTTTCCACAGCATCGATCTTCGTTTTGGCCTCTGCGATGCAATGTGAGGGAGACGGTGC
CGGATCAAGAAATGGCGTCCACCAATGAACAAGACCCACGCATAGCCAAAATCTCCAAGGCCATTCGAGTTATCCCAGATTTTCCTAAACCAGGGATTTTGTTTCAGGAT
ATTACAACTTTGCTTCTTGATACAAAGGCCTTCAAGGATACTATCGATTTGTTCGTGGAGAGGTACAGAGAGAAGGATATCTCTGTCGTCGCTGGAATTGAGGCGAGAGG
GTTCATTTTTGGCCCTCCGATAGCTCTGGCTATTGGTGCAAAATTTGTTCCCATGAGAAAACCGAAGAAGTTGCCTGGTGAAGTCATTTCAGAAGAGTACTCTTTAGAGT
ATGGAACCGATAAAATGGAGATGCATGTAGGAGCTGTTGAAGCTGGAGAACGTGCTCTTGTGATAGATGATCTCATTGCAACTGGGGGAACCTTGCGTGCAGCAATAAGG
CTACTTGGTAGGCGAGTTGGCGTTGAGGTGGTCGAGTGTGCATGTGTGATCGAGCTGGATGGACTAAAGGGCCGTGAACGATTGGGAGACAGACCTCTATTCGTTCTAGT
TAATGCAGCAGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGTGGTTTACACTCGAATGACCCCCAAATTCATCGAACCAAATTGCCCTCCGGAATTCATTAATAATTATTAATTTTTTTTTCTCCTTATTGCGTTTTGGGCTAATTCAG
ATCAGAGCCGGCGATGAAATCAGTCTCCAATCTCACTTCCTCACTTCCTCTTTCGCCGTCACCGTCACCGTCGCACTGCAGGACCACCGCGGTCTTCACTCCTCGTCGAC
GGATCGGTTCTTCGTCAACAGCCGTCGGCGGCGCTTTCTCGTCGTGTCGTAAACATTTGACTCGCTTTCCACAGCATCGATCTTCGTTTTGGCCTCTGCGATGCAATGTG
AGGGAGACGGTGCCGGATCAAGAAATGGCGTCCACCAATGAACAAGACCCACGCATAGCCAAAATCTCCAAGGCCATTCGAGTTATCCCAGATTTTCCTAAACCAGGGAT
TTTGTTTCAGGATATTACAACTTTGCTTCTTGATACAAAGGCCTTCAAGGATACTATCGATTTGTTCGTGGAGAGGTACAGAGAGAAGGATATCTCTGTCGTCGCTGGAA
TTGAGGCGAGAGGGTTCATTTTTGGCCCTCCGATAGCTCTGGCTATTGGTGCAAAATTTGTTCCCATGAGAAAACCGAAGAAGTTGCCTGGTGAAGTCATTTCAGAAGAG
TACTCTTTAGAGTATGGAACCGATAAAATGGAGATGCATGTAGGAGCTGTTGAAGCTGGAGAACGTGCTCTTGTGATAGATGATCTCATTGCAACTGGGGGAACCTTGCG
TGCAGCAATAAGGCTACTTGGTAGGCGAGTTGGCGTTGAGGTGGTCGAGTGTGCATGTGTGATCGAGCTGGATGGACTAAAGGGCCGTGAACGATTGGGAGACAGACCTC
TATTCGTTCTAGTTAATGCAGCAGGATGATTGTAGAGCCTTCATATGCAATATGCTATGTTTGGAAATGGTGGTACTAAGATTGTATCGCTGCTAGAAGTTGAAGTTTCA
AAGTAATGCATAGTTTTGAAGCGGAGAGTCTGGCTAGAAATAAAAGGGTTGGTATTAATTTGAGAGTTGAAGAGATTAAAGAAAAGAAGAAAAAAGGTCTGTAGAGACTG
TATAAGCTTTTGATTATTCTGGTGTAATGTATTTGTTCTTTGTTAATTGTTTTGCTGTCTCTTTTCTGCCTGGCTGTTGAAGATGGGGAGGAGAAAGAGAAGTGGTTGGT
GTTAATTTTGAATATCTGCATAAACTTCTTTATTTTGCAGTTAATTAGTTTTTATCAAATAAAAATGCCTACTACCCCCTTCCCAATAAAATATTAGTTTTTGTATGCCT
TTTCTGAAAGTGCCTTATTTTAGTTGTGTTATATATATATATATATATATTCTTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKSVSNLTSSLPLSPSPSPSHCRTTAVFTPRRRIGSSSTAVGGAFSSCRKHLTRFPQHRSSFWPLRCNVRETVPDQEMASTNEQDPRIAKISKAIRVIPDFPKPGILFQD
ITTLLLDTKAFKDTIDLFVERYREKDISVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKMEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLRAAIR
LLGRRVGVEVVECACVIELDGLKGRERLGDRPLFVLVNAAG