; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi08G015840 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi08G015840
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationchr08:23868870..23870061
RNA-Seq ExpressionLsi08G015840
SyntenyLsi08G015840
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061000.1 LOB domain-containing protein 22-like [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-6876.22Show/hide
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XP_008444461.1 PREDICTED: LOB domain-containing protein 22-like [Cucumis melo]8.5e-6875.68Show/hide
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XP_011650178.1 LOB domain-containing protein 22 [Cucumis sativus]5.3e-6272.53Show/hide
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        MNI  DC+ T  A+ + V D     TTQA ACAACKF RRKCS +CPLAPYFPANRLQDF+NVRKLFGVKNVLKTLA L+   RFKA ECMIFEANCRA 
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        DL GGC +II +LQ+EI LLE QHR +LRQL++ RQ TAAAISQ GAI SEFD DCK GLT LLLDCDYSEDWIRKE+C+ N
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XP_022962555.1 LOB domain-containing protein 22-like [Cucurbita moschata]5.5e-5162.96Show/hide
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        GGCYKIIAK+Q EITLLE QHRLVLRQLR  RQT A       AIRSEFDFD               ED IRKE C+ N  +   E+GV
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XP_038886742.1 LOB domain-containing protein 22-like [Benincasa hispida]4.2e-7583.33Show/hide
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        ITLLE QHR VLRQLR  RQTTAAAISQRG+I SE DFDCKPGLT+LLLDCDY  D         NMMENEVSFPKALT+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNK6 LOB domain-containing protein2.6e-6272.53Show/hide
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        MNI  DC+ T  A+ + V D     TTQA ACAACKF RRKCS +CPLAPYFPANRLQDF+NVRKLFGVKNVLKTLA L+   RFKA ECMIFEANCRA 
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A0A1S3B9X0 LOB domain-containing protein 22-like4.1e-6875.68Show/hide
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A0A5A7V0Z4 LOB domain-containing protein 22-like4.9e-6976.22Show/hide
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A0A6J1HFG0 LOB domain-containing protein 22-like2.7e-5162.96Show/hide
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        MNI  D SG     ++  K+    T  ACAACKFQRRKC+ADCPLAPYFPA R ++F+NVRKLFGVKNVLKTL DLEP KR  AV+C+IFEANCRASDLA
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        GGCYKIIAK+Q EITLLE QHRLVLRQLR  RQT A       AIRSEFDFD               ED IRKE C+ N  +   E+GV
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A0A6J1K5C4 LOB domain-containing protein 22-like1.3e-5062.96Show/hide
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        GGCYKIIAK+Q EITLLE QHRLVLRQLR  RQT A       AIRSEFDF           D D+ ED IRKE C+ N  +   E+GV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 22.4e-1744.79Show/hide
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        ++T + CAACKF RRKC  +C  APYFP ++ Q F NV K+FG  NV K L +L P +R  AV  + +EA+ R  D   GC  +I+ LQ ++  L+
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Q9LRW1 LOB domain-containing protein 226.6e-2344.54Show/hide
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        ++  S   +N+T  ACAACK+QRRKC+ DC LAPYFP +R + F N  KLFGV N+ K +  L P ++  A+  ++F+++ RA+D   GCY II KLQ +
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Query:  ITLLETQHRLVLRQLRLCR
        I     +  +VL+QL + R
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Q9SHE9 LOB domain-containing protein 44.2e-1746.74Show/hide
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        CAACK  RR+C+ DC  +PYFPA+  Q F NV ++FG  NV K L +L   +R  AV  M++EAN R  D   GC   I+ LQ +I +L+ Q
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Q9SSM9 LOB domain-containing protein 71.3e-1842.61Show/hide
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        ACAACK QR+KC  +C LA YFP +    F N  KLFGV N+ K L  +E  +R  A+E +I+ AN RA D  GG Y+ I  L+ +I  ++T+  L  +Q
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Query:  LRLCRQTTAAAISQR
        + +CR        QR
Subjt:  LRLCRQTTAAAISQR

Q9STS6 LOB domain-containing protein 275.8e-1944.44Show/hide
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        T  ACAACK+QRR+C+ADCPLAPYFPA + + FQNV +LFGV++++K L  L+  ++ +A++ +IF++  R      GC  +  +LQ  I   E + + V
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Query:  LRQLRLCR
          QL+L R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G65620.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.7e-1844.79Show/hide
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        ++T + CAACKF RRKC  +C  APYFP ++ Q F NV K+FG  NV K L +L P +R  AV  + +EA+ R  D   GC  +I+ LQ ++  L+
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AT1G65620.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.7e-1844.79Show/hide
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        ++T + CAACKF RRKC  +C  APYFP ++ Q F NV K+FG  NV K L +L P +R  AV  + +EA+ R  D   GC  +I+ LQ ++  L+
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AT1G72980.1 LOB domain-containing protein 79.2e-2042.61Show/hide
Query:  ACAACKFQRRKCSADCPLAPYFPANRLQDFQNVRKLFGVKNVLKTLADLEPDKRFKAVECMIFEANCRASDLAGGCYKIIAKLQSEITLLETQHRLVLRQ
        ACAACK QR+KC  +C LA YFP +    F N  KLFGV N+ K L  +E  +R  A+E +I+ AN RA D  GG Y+ I  L+ +I  ++T+  L  +Q
Subjt:  ACAACKFQRRKCSADCPLAPYFPANRLQDFQNVRKLFGVKNVLKTLADLEPDKRFKAVECMIFEANCRASDLAGGCYKIIAKLQSEITLLETQHRLVLRQ

Query:  LRLCRQTTAAAISQR
        + +CR        QR
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AT3G13850.1 LOB domain-containing protein 224.7e-2444.54Show/hide
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        ++  S   +N+T  ACAACK+QRRKC+ DC LAPYFP +R + F N  KLFGV N+ K +  L P ++  A+  ++F+++ RA+D   GCY II KLQ +
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Query:  ITLLETQHRLVLRQLRLCR
        I     +  +VL+QL + R
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AT3G47870.1 LOB domain-containing protein 274.1e-2044.44Show/hide
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        T  ACAACK+QRR+C+ADCPLAPYFPA + + FQNV +LFGV++++K L  L+  ++ +A++ +IF++  R      GC  +  +LQ  I   E + + V
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Query:  LRQLRLCR
          QL+L R
Subjt:  LRQLRLCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATATTCGCGGAGATTGCAGCGGAACCGCCACCGCCGAGGAAAGCGGAGTCAAGGATAACACGACTCAGGCGGCTTGTGCTGCCTGCAAATTTCAGAGAAGAAAATG
CTCTGCCGATTGTCCTTTGGCTCCGTATTTTCCTGCAAATCGTCTTCAAGATTTTCAAAACGTCCGCAAATTGTTCGGCGTAAAGAACGTCCTCAAAACCCTAGCCGATT
TGGAGCCTGACAAGAGATTTAAAGCGGTCGAGTGTATGATTTTCGAAGCCAATTGTCGCGCCAGTGATCTCGCCGGTGGTTGTTACAAAATCATTGCTAAATTGCAGAGT
GAAATTACACTTCTCGAGACACAGCATCGTCTTGTCCTCCGTCAGCTCCGACTTTGCCGACAGACAACGGCGGCGGCGATTTCGCAACGCGGTGCGATTCGTTCGGAATT
TGATTTTGATTGTAAGCCAGGACTTACTGCTCTTTTGCTTGATTGCGATTATTCTGAAGATTGGATAAGAAAAGAATACTGCAATTTCAATATGATGGAGAATGAAGAAA
GCGGAGTCAAGGATAACACGACTCAGGCGGCTTGTGCTGCCTGCAAATTTCAGAGAAGAAAATGCTCTGCCGATTGTCCTTTGGCTCCGTATTTTCCTGCAAATCGTCTT
CAAGATTTTCAAAACGTCCGCAAATTGTTCGGCGTAAAGAACGTCCTCAAAACCCTAGCCGATTTGGAGCCTGACAAGAGATTTAAAGCGGTCGAGTGTATGATTTTCGA
AGCCAATTGTCGCGCCAGTGATCTCGCCGGTGGTTGTTACAAAATCATTGCTAAATTGCAGAGTGAAATTACACTTCTCGAGACACAGCATCGTCTTGTCCTCCGTCAGC
TCCGACTTTGCCGACAGACAACGGCGGCGGCGATTTCGCAACGCGGTGCGATTCGTTCGGAATTTGATTTTGATTGTAAGCCAGGACTTACTGCTCTTTTGCTTGATTGC
GATTATTCTGAAGATTGGATAAGAAAAGAATACTGCAATTTCAATATGATGGAGAATGAAGTTTCTTTTCCCAAAGCCCTAACCCATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATATTCGCGGAGATTGCAGCGGAACCGCCACCGCCGAGGAAAGCGGAGTCAAGGATAACACGACTCAGGCGGCTTGTGCTGCCTGCAAATTTCAGAGAAGAAAATG
CTCTGCCGATTGTCCTTTGGCTCCGTATTTTCCTGCAAATCGTCTTCAAGATTTTCAAAACGTCCGCAAATTGTTCGGCGTAAAGAACGTCCTCAAAACCCTAGCCGATT
TGGAGCCTGACAAGAGATTTAAAGCGGTCGAGTGTATGATTTTCGAAGCCAATTGTCGCGCCAGTGATCTCGCCGGTGGTTGTTACAAAATCATTGCTAAATTGCAGAGT
GAAATTACACTTCTCGAGACACAGCATCGTCTTGTCCTCCGTCAGCTCCGACTTTGCCGACAGACAACGGCGGCGGCGATTTCGCAACGCGGTGCGATTCGTTCGGAATT
TGATTTTGATTGTAAGCCAGGACTTACTGCTCTTTTGCTTGATTGCGATTATTCTGAAGATTGGATAAGAAAAGAATACTGCAATTTCAATATGATGGAGAATGAAGAAA
GCGGAGTCAAGGATAACACGACTCAGGCGGCTTGTGCTGCCTGCAAATTTCAGAGAAGAAAATGCTCTGCCGATTGTCCTTTGGCTCCGTATTTTCCTGCAAATCGTCTT
CAAGATTTTCAAAACGTCCGCAAATTGTTCGGCGTAAAGAACGTCCTCAAAACCCTAGCCGATTTGGAGCCTGACAAGAGATTTAAAGCGGTCGAGTGTATGATTTTCGA
AGCCAATTGTCGCGCCAGTGATCTCGCCGGTGGTTGTTACAAAATCATTGCTAAATTGCAGAGTGAAATTACACTTCTCGAGACACAGCATCGTCTTGTCCTCCGTCAGC
TCCGACTTTGCCGACAGACAACGGCGGCGGCGATTTCGCAACGCGGTGCGATTCGTTCGGAATTTGATTTTGATTGTAAGCCAGGACTTACTGCTCTTTTGCTTGATTGC
GATTATTCTGAAGATTGGATAAGAAAAGAATACTGCAATTTCAATATGATGGAGAATGAAGTTTCTTTTCCCAAAGCCCTAACCCATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNIRGDCSGTATAEESGVKDNTTQAACAACKFQRRKCSADCPLAPYFPANRLQDFQNVRKLFGVKNVLKTLADLEPDKRFKAVECMIFEANCRASDLAGGCYKIIAKLQS
EITLLETQHRLVLRQLRLCRQTTAAAISQRGAIRSEFDFDCKPGLTALLLDCDYSEDWIRKEYCNFNMMENEESGVKDNTTQAACAACKFQRRKCSADCPLAPYFPANRL
QDFQNVRKLFGVKNVLKTLADLEPDKRFKAVECMIFEANCRASDLAGGCYKIIAKLQSEITLLETQHRLVLRQLRLCRQTTAAAISQRGAIRSEFDFDCKPGLTALLLDC
DYSEDWIRKEYCNFNMMENEVSFPKALTH