; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G002770 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G002770
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionProtein LURP-one-related 4
Genome locationchr09:2909797..2910773
RNA-Seq ExpressionLsi09G002770
SyntenyLsi09G002770
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007612 - LURP-one-related
IPR025659 - Tubby-like, C-terminal
IPR038595 - LURP-one-related superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042775.1 protein LURP-one-related 4 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-7492.99Show/hide
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XP_008437245.1 PREDICTED: protein LURP-one-related 4 [Cucumis melo]1.4e-7392.45Show/hide
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XP_038875221.1 protein LURP-one-related 4 isoform X1 [Benincasa hispida]1.6e-7491.98Show/hide
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XP_038875222.1 protein LURP-one-related 4 isoform X2 [Benincasa hispida]1.0e-7391.88Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNY3 Uncharacterized protein3.2e-7391.41Show/hide
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A0A1S3AT73 protein LURP-one-related 46.5e-7492.45Show/hide
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A0A5A7TMZ0 Protein LURP-one-related 47.7e-7592.99Show/hide
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A0A6J1ELI2 protein LURP-one-related 4-like8.5e-7489.38Show/hide
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A0A6J1HYX0 protein LURP-one-related 4-like2.5e-7389.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q67XV7 Protein LURP-one-related 31.8e-2038.75Show/hide
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             S    F ++K+++   R+ + S  ++ +G     +V  D +  ++I+N  G V A
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Q8LG32 Protein LURP-one-related 21.8e-2038.75Show/hide
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        M K+YP  A               L +E E FTIWMKSL++++ GCTVFDS G+++YRVDNYD K  S EV+ MDL GK+LFT+R+KK      WEG+  
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             S    F ++K+++   R+ + S  ++ +G     +V  D +  ++I+N  G V A
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Q9LUM1 Protein LURP-one-related 114.1e-2542.86Show/hide
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        M K++P  T       +SS  L +E E+FTIWMKSL+++TNGCTVFDS G+I+YRVDNY+ K  REV+LMDL G VLFT+R++KF +   WEG+R     
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Query:  -----WIESERSQNPSFGVKKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFERYSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEV
              +E  R +N  F V     S S + N   C  +  +  Y +V     LA  I +  G+++AEV
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Q9SH27 Protein LURP-one-related 46.8e-2846.2Show/hide
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        MA+V+PQ A       SS  + +E ETFT+WMKSL+Y TNG TV++SNG+I YRV+NYD KCS EV +MDL G +LFTIRKKK  + G W  +R   S  
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Query:  SQNPSFGVKKLYRSGSRKRNQSV-CEINVGFERYSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEV
        S        ++ RS  R  +  V  E N   E + +++ D K AF+II+I+G ++A+V
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Q9ZVI6 Protein LURP-one-related 88.4e-1036.04Show/hide
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        M KV+P+    PS+   S          T+W KSL+++ +G TV+++NG++V+RVDNY   C R+ + LMD  G  L +IR+KK S+   W  +   + E
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Query:  RSQNPSFGVKK
          ++P F  +K
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G53870.2 Protein of unknown function (DUF567)1.3e-2138.75Show/hide
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        M K+YP  A               L +E E FTIWMKSL++++ GCTVFDS G+++YRVDNYD K  S EV+ MDL GK+LFT+R+KK      WEG+  
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Query:  IESERSQNPSFGVKKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFERYSLVKMDGKLAFRIININGEVVA
             S    F ++K+++   R+ + S  ++ +G     +V  D +  ++I+N  G V A
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AT1G53880.1 Eukaryotic translation initiation factor 2B (eIF-2B) family protein8.9e-2338.27Show/hide
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        M K++P  A     S     +S  L +E E+FTIWM+SL++H+ GCTVFDS G+++YRVDNY+ K   EV+LMDL GK+LFT+R+KK  +   W+G+   
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Query:  ESERSQNPSFGVKKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFER-YSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEV
         +      +F +     S S K       ++   +  Y +VK   K  F I + +G ++AEV
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AT1G53900.1 Eukaryotic translation initiation factor 2B (eIF-2B) family protein8.9e-2338.27Show/hide
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        M K++P  A     S     +S  L +E E+FTIWM+SL++H+ GCTVFDS G+++YRVDNY+ K   EV+LMDL GK+LFT+R+KK  +   W+G+   
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Query:  ESERSQNPSFGVKKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFER-YSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEV
         +      +F +     S S K       ++   +  Y +VK   K  F I + +G ++AEV
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AT1G63410.1 Protein of unknown function (DUF567)4.9e-2946.2Show/hide
Query:  MAKVYPQTAPSPSSSSSSSSLCSETETFTIWMKSLIYHTNGCTVFDSNGDIVYRVDNYDRKCSREVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGFRWIESER
        MA+V+PQ A       SS  + +E ETFT+WMKSL+Y TNG TV++SNG+I YRV+NYD KCS EV +MDL G +LFTIRKKK  + G W  +R   S  
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Query:  SQNPSFGVKKLYRSGSRKRNQSV-CEINVGFERYSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEV
        S        ++ RS  R  +  V  E N   E + +++ D K AF+II+I+G ++A+V
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AT3G14260.1 Protein of unknown function (DUF567)2.9e-2642.86Show/hide
Query:  MAKVYPQ-TAPSPSSSSSSSSLCSETETFTIWMKSLIYHTNGCTVFDSNGDIVYRVDNYDRKCSREVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGFR-----
        M K++P  T       +SS  L +E E+FTIWMKSL+++TNGCTVFDS G+I+YRVDNY+ K  REV+LMDL G VLFT+R++KF +   WEG+R     
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Query:  -----WIESERSQNPSFGVKKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFERYSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEV
              +E  R +N  F V     S S + N   C  +  +  Y +V     LA  I +  G+++AEV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAAAGTGTACCCTCAAACAGCGCCGTCGCCGTCGTCATCTTCGTCGTCTTCGTCGCTCTGTTCCGAAACCGAAACCTTCACCATTTGGATGAAATCTCTAATTTA
CCACACAAACGGCTGCACCGTCTTCGATTCCAATGGCGACATCGTCTACAGAGTCGATAACTACGACAGAAAATGCAGTCGCGAAGTATTTCTCATGGATCTCAGAGGAA
AAGTTCTCTTCACCATCAGAAAAAAGAAATTCTCGATTCTTGGAGGATGGGAAGGATTTCGATGGATCGAATCGGAGAGAAGTCAGAACCCTAGTTTTGGAGTGAAGAAA
TTGTACAGATCAGGATCGAGGAAGAGAAATCAATCGGTATGTGAAATTAATGTGGGATTTGAGAGATATTCCTTGGTGAAAATGGATGGGAAATTGGCTTTCAGGATAAT
CAACATCAATGGAGAAGTAGTTGCAGAGGTAATTGAATCTGAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
NAAAAAAAAAAAAAAAACCTCCCTATAAATTACCCTTATCTCCGTTCTACCTTCCTCATCAAACTTTCAAAGCTTATTCTCTCTCTTCCATCTCAATGGCCAAAGTGTAC
CCTCAAACAGCGCCGTCGCCGTCGTCATCTTCGTCGTCTTCGTCGCTCTGTTCCGAAACCGAAACCTTCACCATTTGGATGAAATCTCTAATTTACCACACAAACGGCTG
CACCGTCTTCGATTCCAATGGCGACATCGTCTACAGAGTCGATAACTACGACAGAAAATGCAGTCGCGAAGTATTTCTCATGGATCTCAGAGGAAAAGTTCTCTTCACCA
TCAGAAAAAAGAAATTCTCGATTCTTGGAGGATGGGAAGGATTTCGATGGATCGAATCGGAGAGAAGTCAGAACCCTAGTTTTGGAGTGAAGAAATTGTACAGATCAGGA
TCGAGGAAGAGAAATCAATCGGTATGTGAAATTAATGTGGGATTTGAGAGATATTCCTTGGTGAAAATGGATGGGAAATTGGCTTTCAGGATAATCAACATCAATGGAGA
AGTAGTTGCAGAGGTAATTGAATCTGAATAATCTGAATAATCTGAATCTGAATTTGGTTGGGAATTTTAGAAACGGATTCTAACAATTTTGAAATGATTTTGATTGTGTT
GTTGCAGGCGAAAAGAAAAGTTTCATGGAATGGAATATTGTTGGGAGATGATGTGTTGAGTTTAAATGCAAATTCTCAGATTGAAAGATCTTTGATTATGGCTTTGGTCA
CTGTTTATGGCTTAATCCGTCGCCAAATGTAAAATTAAATTAAATTAAACACACAGAGAGAAAGAGTTTATACAGACTTTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKVYPQTAPSPSSSSSSSSLCSETETFTIWMKSLIYHTNGCTVFDSNGDIVYRVDNYDRKCSREVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGFRWIESERSQNPSFGVKK
LYRSGSRKRNQSVCEINVGFERYSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEVIESE