; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G003210 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G003210
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionagamous-like MADS-box protein AGL19
Genome locationchr09:3331222..3338153
RNA-Seq ExpressionLsi09G003210
SyntenyLsi09G003210
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038906882.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Benincasa hispida]2.7e-10496.8Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AT26 agamous-like MADS-box protein AGL199.2e-10395.79Show/hide
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A0A6J1DRG2 agamous-like MADS-box protein AGL191.2e-9188.02Show/hide
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A0A6J1E382 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X22.9e-8887.1Show/hide
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A0A6J1E6F6 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X11.1e-9087.56Show/hide
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A0A6J1I258 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X11.2e-8987.1Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64645 MADS-box protein SOC11.1e-5258.77Show/hide
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O82743 Agamous-like MADS-box protein AGL192.3e-5860.93Show/hide
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Q38838 Agamous-like MADS-box protein AGL149.0e-5558.99Show/hide
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Q9FIS1 MADS-box protein AGL424.8e-4855.02Show/hide
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Q9XJ60 MADS-box transcription factor 503.9e-5057.21Show/hide
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        KLE LE  KRKLLG+ LD CSI+EL  LE +LERSL  IR RK ++L+E++ KL+E+E  L ++N  L+ K + +         R+E  N         +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45660.1 AGAMOUS-like 207.8e-5458.77Show/hide
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        K+E LE  KRKLLG+G+  CSI+ELQQ+E+QLE+S+  IR+RK Q+ KE+I +LK++EK L  EN  L  K  +      S+K QES  R +  +     
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AT4G11880.1 AGAMOUS-like 146.4e-5658.99Show/hide
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AT4G22950.1 AGAMOUS-like 191.6e-5960.93Show/hide
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