; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G003710 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G003710
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionPPR containing protein
Genome locationchr09:3860092..3862047
RNA-Seq ExpressionLsi09G003710
SyntenyLsi09G003710
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR040358 - Uncharacterized protein At4g22758-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042842.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold44G003530 [Cucumis melo var. makuwa]3.6e-10581.4Show/hide
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XP_004147570.1 uncharacterized protein At4g22758 [Cucumis sativus]3.8e-10783.01Show/hide
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XP_008437158.1 PREDICTED: uncharacterized protein At4g22758 [Cucumis melo]8.8e-10480.23Show/hide
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XP_022969839.1 uncharacterized protein At4g22758 [Cucurbita maxima]7.3e-9878.6Show/hide
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XP_038875217.1 uncharacterized protein At4g22758 [Benincasa hispida]1.6e-12191.47Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KKG9 Uncharacterized protein1.9e-10783.01Show/hide
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A0A1S3ATX7 uncharacterized protein At4g227584.3e-10480.23Show/hide
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A0A5A7THG0 Uncharacterized protein1.7e-10581.4Show/hide
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A0A6J1E662 uncharacterized protein At4g227581.7e-9777.82Show/hide
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A0A6J1I3T9 uncharacterized protein At4g227583.5e-9878.6Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q56XJ7 Uncharacterized protein At4g227581.3e-3641.76Show/hide
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Query:  SPLLI-----PSPAPF-LEGYKKDA-KVVINVTVEGSPGPVRAMVKLGSSVDDTIKLVVAKYGEEGRTPKLEPTDSPSSFELHHSYFSLHSLDRREIIGE
        SP L+      S +P   EG  K+A KV+I+V VEGSPGPVRAMVKL  +V++TIK+VV KY +EGRTPKL   D  S+FELH S+FS+  L++REIIGE
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Query:  IGSRSFYLRKTHSSHGKNGGESSTASTQGSTKEIRDVALPIPPGFLLSSFIARKMGKIVRRTRKLWNFIVCLK
        +GSRSFY+RK     G +    S A T             IP   L+ S IA+ +GKI+RRTR++WN +VC++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70780.1 unknown protein2.2e-0429.57Show/hide
Query:  KDAKVVINVTVEGSPGPVRAMVKLGSSVDDTIKLVVAKYGEEGRTPKLEPTDSPSSFELHHSYFSLHSLDRREIIGEIGSRSFYL------RKTHSSHGK
        K  +++I+VTV GS GP+R +      V   I   +  Y  EGR P L      + F L+       +L   + IG +G+R+F L      +K   S+G+
Subjt:  KDAKVVINVTVEGSPGPVRAMVKLGSSVDDTIKLVVAKYGEEGRTPKLEPTDSPSSFELHHSYFSLHSLDRREIIGEIGSRSFYL------RKTHSSHGK

Query:  NGGESSTASTQGSTK
        +    + A   GS K
Subjt:  NGGESSTASTQGSTK

AT2G27830.1 unknown protein3.8e-1235.21Show/hide
Query:  RPHTFSEAFASSPLLIPSPAPFLEGYKKDAKVVINVTVEGSPGPVRAMVKLGSSVDDTIKLVVAKYGEEGRTPKLEPTDSPSSFELHHSYFSLHSLDRRE
        RP T  E F++   +       L    +  K+++NVTV+GS G V+ ++   S+V D I   V +Y +E R P L P   PS F+LH+S FSL S+ R E
Subjt:  RPHTFSEAFASSPLLIPSPAPFLEGYKKDAKVVINVTVEGSPGPVRAMVKLGSSVDDTIKLVVAKYGEEGRTPKLEPTDSPSSFELHHSYFSLHSLDRRE

Query:  IIGEIGSRSFYLRKTHSSHGKNGGESSTASTQGSTKEIRDVA
         +  +GSR+F+L     + G  G      S++  +KE   VA
Subjt:  IIGEIGSRSFYLRKTHSSHGKNGGESSTASTQGSTKEIRDVA

AT4G22758.1 unknown protein9.0e-3841.76Show/hide
Query:  MSSSSFRRRI--PAISSTKNNKTRHNLSPSPHRRTPPTNRAPSKPSIFTRCSSEP-----------NLWTTAANRTVSSEKEGEEVVIFRPHTFSEAFAS
        MS S  RR++  P  +  ++++TR     +    +   NR+ S   +F R  SEP           +L   +  R +  E+E + +V + P   SE FAS
Subjt:  MSSSSFRRRI--PAISSTKNNKTRHNLSPSPHRRTPPTNRAPSKPSIFTRCSSEP-----------NLWTTAANRTVSSEKEGEEVVIFRPHTFSEAFAS

Query:  SPLLI-----PSPAPF-LEGYKKDA-KVVINVTVEGSPGPVRAMVKLGSSVDDTIKLVVAKYGEEGRTPKLEPTDSPSSFELHHSYFSLHSLDRREIIGE
        SP L+      S +P   EG  K+A KV+I+V VEGSPGPVRAMVKL  +V++TIK+VV KY +EGRTPKL   D  S+FELH S+FS+  L++REIIGE
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Query:  IGSRSFYLRKTHSSHGKNGGESSTASTQGSTKEIRDVALPIPPGFLLSSFIARKMGKIVRRTRKLWNFIVCLK
        +GSRSFY+RK     G +    S A T             IP   L+ S IA+ +GKI+RRTR++WN +VC++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGAGCAGCAGTTTCCGGCGAAGGATTCCGGCAATTTCCAGTACAAAAAACAACAAGACTCGCCACAATCTCTCTCCATCTCCTCACCGGAGAACTCCCCCGACGAA
TCGCGCTCCTTCCAAGCCCTCCATCTTTACCAGATGCTCCTCGGAGCCCAACCTTTGGACCACCGCCGCTAATCGCACTGTGTCATCGGAGAAGGAAGGGGAAGAGGTTG
TTATTTTCCGTCCCCATACGTTTTCAGAAGCCTTTGCTTCATCCCCTCTCTTGATTCCTTCCCCCGCTCCATTCCTCGAGGGCTACAAGAAAGATGCTAAAGTAGTGATT
AATGTGACTGTTGAAGGGAGCCCAGGGCCAGTACGAGCCATGGTTAAACTAGGATCAAGTGTGGACGACACAATTAAGCTTGTTGTTGCTAAATATGGTGAAGAAGGAAG
AACTCCAAAGCTTGAACCAACTGATTCACCATCTTCCTTTGAATTGCATCACTCATATTTCAGCCTCCACAGTCTTGACAGGAGAGAAATAATTGGGGAAATTGGTAGCA
GAAGCTTCTATCTTAGAAAGACCCATAGCTCTCATGGAAAAAATGGTGGAGAATCATCTACTGCTTCCACTCAAGGAAGTACCAAAGAAATCAGAGATGTTGCTTTACCA
ATTCCTCCTGGCTTCTTGCTTTCTAGCTTCATTGCTAGGAAAATGGGCAAAATTGTAAGAAGAACAAGAAAGCTCTGGAATTTCATTGTCTGCTTGAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTACCGAGGAAAACGACCATAAAACAATCCCCCGCGGAAAAGCCAAGTTTCCTCAACTCCCACGCTAAAACTGTCAACTACCCTTTCCCCAATCACTTTCCCTTCCG
TTCCCCTTCCCTCCACAAACACCCCATTTATGTCGAGCAGCAGTTTCCGGCGAAGGATTCCGGCAATTTCCAGTACAAAAAACAACAAGACTCGCCACAATCTCTCTCCA
TCTCCTCACCGGAGAACTCCCCCGACGAATCGCGCTCCTTCCAAGCCCTCCATCTTTACCAGATGCTCCTCGGAGCCCAACCTTTGGACCACCGCCGCTAATCGCACTGT
GTCATCGGAGAAGGAAGGGGAAGAGGTTGTTATTTTCCGTCCCCATACGTTTTCAGAAGCCTTTGCTTCATCCCCTCTCTTGATTCCTTCCCCCGCTCCATTCCTCGAGG
GCTACAAGAAAGATGCTAAAGTAGTGATTAATGTGACTGTTGAAGGGAGCCCAGGGCCAGTACGAGCCATGGTTAAACTAGGATCAAGTGTGGACGACACAATTAAGCTT
GTTGTTGCTAAATATGGTGAAGAAGGAAGAACTCCAAAGCTTGAACCAACTGATTCACCATCTTCCTTTGAATTGCATCACTCATATTTCAGCCTCCACAGTCTTGACAG
GAGAGAAATAATTGGGGAAATTGGTAGCAGAAGCTTCTATCTTAGAAAGACCCATAGCTCTCATGGAAAAAATGGTGGAGAATCATCTACTGCTTCCACTCAAGGAAGTA
CCAAAGAAATCAGAGATGTTGCTTTACCAATTCCTCCTGGCTTCTTGCTTTCTAGCTTCATTGCTAGGAAAATGGGCAAAATTGTAAGAAGAACAAGAAAGCTCTGGAAT
TTCATTGTCTGCTTGAAGTAAGAGTATGAATCTAACCAAAAATTAGAAACTAAGAGTAACACAGCATATTATATATGTTACTCTTTAACATTAATGTCCCATTTTCTTTG
TTTTTGGGTATATTGTCCTCTCATTATATTTATAGGAGGGGAATTCTCAGGCTTATGAGTTGAAGAAATACCATTTGAGTTAGGCTCAAATGGACTAAATAAACTGTATA
TAGAACATATTGTTATTTATAGACACTGTATTGTTACAAGATTGTAATGGTAAATAGAGAGAATTCAATACCAAAACTTTTATTCAGATTCTCCACTATGTGGTGGTTTC
CAATTGCTAAATCATCTCCTTTAGCTATATGCACTTTACTCTTCTTAAAAGAATCAATCCTTTTCTTTCAAGAGTGAACCATCTACGTTTTTCTTTCTTTTTATGTCATT
GATTTGTCACATTTGGTTGAATTAGTCTATGTTTACTTCACAAGTATGTCACATCATTATCAGAAATTTTGTATTATATTTCAACGGCAATGTTATATTTAAAAATACAC
ATCATATATTGTTTTTTTTATTTCTACAATTTCACGAGCTTTTTAGTGAATCTAGTAGTCACAATTGGGTTACATACTTAATATACCATATGAACACTATATGAGCTATA
TAAATTTCTCAAAATAACTTGGCCCAGTATATATGATGAATACTATGAAAACAGTAACAAGAAGACGGAATTGACATAGCGAAATGAGAGTTGTCAATGTAAATATACCA
TATATTTTTTAATTTATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSSSFRRRIPAISSTKNNKTRHNLSPSPHRRTPPTNRAPSKPSIFTRCSSEPNLWTTAANRTVSSEKEGEEVVIFRPHTFSEAFASSPLLIPSPAPFLEGYKKDAKVVI
NVTVEGSPGPVRAMVKLGSSVDDTIKLVVAKYGEEGRTPKLEPTDSPSSFELHHSYFSLHSLDRREIIGEIGSRSFYLRKTHSSHGKNGGESSTASTQGSTKEIRDVALP
IPPGFLLSSFIARKMGKIVRRTRKLWNFIVCLK