; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G007370 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G007370
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionprotein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3
Genome locationchr09:8487469..8513066
RNA-Seq ExpressionLsi09G007370
SyntenyLsi09G007370
Gene Ontology termsGO:0009536 - plastid (cellular component)
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InterPro domainsIPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily
IPR045061 - Tubulin-like protein FtsZ/CetZ


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6579164.1 Protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.2e-17268.25Show/hide
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KAG7016680.1 Protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.2e-17268.25Show/hide
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XP_022992937.1 protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 [Cucurbita maxima]9.2e-17268.25Show/hide
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XP_023550462.1 protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-17268.65Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CRX6 protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 isoform X11.4e-17066.87Show/hide
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A0A1S3CS57 protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 3 isoform X31.4e-17066.87Show/hide
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              ILENLKEGKIGFGAGHNFRTSILKSIYDCPFL+VHLKDLKG+VVCIVASSSIIDDNDKSTLLKTFREVT YTGK+ILSII+DLN+EPNFLMTTV
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        LIVG
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A0A6J1FFA3 protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 31.1e-17068.25Show/hide
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        MVPLI ELPVINGFHPLLRSSLC  P  CSSIRSLFF RRKMFL LA YRNSYPFL TTANSSLSNA GR N EKDFWDDYEFVEVIGIGSRKEAVLDFC
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        KHLVGRLKEHTSFLIDIDTDRLLEKDLVTLDEAVRSAN+AVL+AINSISI+KSEML KF+DEPQN VKEL VIDVME                       
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              ILENLKEGKIGFGAGHNFRTS+LKSIYDCPFLSVHLKDLKG V+CIVASSSIIDDNDKSTLLKTFREVTAYTGK+ILSII+DLNLEPNFLMTT+
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        LIVG
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A0A6J1JRB9 protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 34.5e-17268.25Show/hide
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        MVPL+ ELPVINGFHPLLRSSL  CPC+CSSIRSLFF RRKMFL LA YRNSYPFL TTANSSLSNA GR N EKDFWDDYEFVEVIGIGSRKEAVLDFC
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              ILENLKEGKIGFGAGHNFRTS+LKSIYDCPFLSVHLKDLKG V+CIVASSSIIDDNDKSTLLKTFREVTAYTGK+ILSII+DLNLEPNFLMTT+
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Query:  LIVG
        LIVG
Subjt:  LIVG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A5U4H7 Cell division protein FtsZ1.1e-0534Show/hide
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        V +    G G     A  +    R     TV +V +PFSFEGKRR ++ ++ +  L+E    LI I  DRLL+     V+L +A RSA+  +L  +  I+
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P64171 Cell division protein FtsZ1.1e-0534Show/hide
Query:  VILVVSAGYGFDYSAAVDILRTIRSANGFTVTIVLKPFSFEGKRRQDEVKHLVGRLKEHTSFLIDIDTDRLLEKD--LVTLDEAVRSANNAVLLAINSIS
        V +    G G     A  +    R     TV +V +PFSFEGKRR ++ ++ +  L+E    LI I  DRLL+     V+L +A RSA+  +L  +  I+
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P9WN94 Cell division protein FtsZ1.1e-0534Show/hide
Query:  VILVVSAGYGFDYSAAVDILRTIRSANGFTVTIVLKPFSFEGKRRQDEVKHLVGRLKEHTSFLIDIDTDRLLEKD--LVTLDEAVRSANNAVLLAINSIS
        V +    G G     A  +    R     TV +V +PFSFEGKRR ++ ++ +  L+E    LI I  DRLL+     V+L +A RSA+  +L  +  I+
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Q6F6B5 Protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 31.2e-5233.65Show/hide
Query:  EFVEVIGIGSRKEAVLDFCLESALRISSLRFWQIVKHDSLKVQLLQRFIEKDYTPRMIDVPLSLQSCSKTVILVVSAGYGFDYSAAVDILRTIRSANGFT
        EF+EV+ IGSRKE+++D CL+S      LRFW I K  S  + L QR   +D   + ++    LQS  +  ILV SAGYG D   A++IL  +RS     
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Query:  VTIVLKPFSFEGKRRQDEVKHLVGRLKEHTSFLIDIDTDRLLEKDLVTLDEAVRSANNAVLLAINSISIVKSEMLIKFVDEPQNDVKELDVIDVMERSSG
        V ++LKPFSFEG++R +EV  L  +L++HT+F IDID + LL+KDLVTLDEA+R+ANNAV +AIN+ S + S M   F+D    D+KEL+  +V      
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Query:  IQHEPRCLKEMALVLVKEGGANLLSFIWYSLLRMDRDENSPELSPSMIKLNTALNDINSPLIVEQPFTNHPDKGKSKLIPSELAAYSSPLQIPNSPNLME
                                                                                                            
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Query:  NPSIPALVENPSIPILVENPNFPILILENLKEGKIGFGAGHNFRTSILKSIYDCPFLSVHLKDLKGVVVCIVASSSIIDDNDKSTLLKTFREVTAYTGKL
                                 ILE+ KE K+GFG GHN +TSIL++IYDCPF    LKDL   ++CIVASS  +   D  T+L+TFR+   YTG +
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Query:  ILSIIRDLNLEPNFLMTTVLIV
        I+S + + +LEP   +TT  I+
Subjt:  ILSIIRDLNLEPNFLMTTVLIV

Q9CCE4 Cell division protein FtsZ8.3e-0635Show/hide
Query:  VILVVSAGYGFDYSAAVDILRTIRSANGFTVTIVLKPFSFEGKRRQDEVKHLVGRLKEHTSFLIDIDTDRLLE--KDLVTLDEAVRSANNAVLLAINSIS
        V +    G G     A  I    R     TV +V +PFSFEGKRR ++ ++ +  L+E    LI I  DRLL+     V+L +A RSA+  +L  +  I+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G75010.1 GTP binding8.3e-5433.65Show/hide
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        EF+EV+ IGSRKE+++D CL+S      LRFW I K  S  + L QR   +D   + ++    LQS  +  ILV SAGYG D   A++IL  +RS     
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Query:  VTIVLKPFSFEGKRRQDEVKHLVGRLKEHTSFLIDIDTDRLLEKDLVTLDEAVRSANNAVLLAINSISIVKSEMLIKFVDEPQNDVKELDVIDVMERSSG
        V ++LKPFSFEG++R +EV  L  +L++HT+F IDID + LL+KDLVTLDEA+R+ANNAV +AIN+ S + S M   F+D    D+KEL+  +V      
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                                 ILE+ KE K+GFG GHN +TSIL++IYDCPF    LKDL   ++CIVASS  +   D  T+L+TFR+   YTG +
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Query:  ILSIIRDLNLEPNFLMTTVLIV
        I+S + + +LEP   +TT  I+
Subjt:  ILSIIRDLNLEPNFLMTTVLIV

AT5G55280.1 homolog of bacterial cytokinesis Z-ring protein FTSZ 1-16.1e-0429.13Show/hide
Query:  SKTVILVVSAGYGFDYSAAVDILRTIRSANGFTVTIVLKPFSFEGKRRQDEVKHLVGRLKEHTSFLIDIDTDRLLE--KDLVTLDEAVRSANNAVLLAIN
        S  V +    G G    AA  + +  + A   TV +V  PFSFEG++R  +    + +L+++   LI I  DRLL+   +   L +A   A++ +   + 
Subjt:  SKTVILVVSAGYGFDYSAAVDILRTIRSANGFTVTIVLKPFSFEGKRRQDEVKHLVGRLKEHTSFLIDIDTDRLLE--KDLVTLDEAVRSANNAVLLAIN

Query:  SIS
         IS
Subjt:  SIS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCTACCCATTTCTGCATACTACAGCGAACAGTTCTTTATCAAATGCTACTGGAAGGATCAATAACGAGAAGGATTTCTGGGATGATTATGAATTCGTGGAGGTGATTGGC
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GAGGTTAAACATTTGGTAGGAAGGCTAAAGGAACATACGAGCTTCTTAATTGATATTGACACCGATAGACTACTTGAAAAGGACTTGGTGACTCTTGATGAGGCTGTGAG
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TTATAGACGTCATGGAAAGGAGTTCTGGAATCCAGCATGAGCCAAGATGTCTAAAGGAAATGGCACTTGTCTTGGTGAAAGAGGGAGGAGCTAATCTTCTCTCCTTCATA
TGGTATTCCCTCTTGAGAATGGATAGAGATGAGAATTCACCGGAGCTCTCGCCGTCGATGATCAAATTGAATACAGCCTTAAATGACATTAATTCTCCATTAATTGTGGA
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ATCCCAGCATTCCGGCTTTGGTGGAGAATCCCAGCATCCCGATTTTGGTGGAGAATCCCAACTTCCCAATTTTGATTTTGGAGAACCTTAAAGAAGGAAAGATTGGATTT
GGAGCTGGTCACAACTTCCGAACTTCAATCTTAAAGTCAATTTACGACTGCCCTTTCCTCAGTGTGCATTTAAAGGATTTGAAAGGTGTGGTTGTATGCATCGTGGCAAG
CTCAAGTATTATTGATGACAATGATAAAAGTACCCTCTTGAAAACTTTTCGTGAAGTTACCGCATATACAGGAAAATTAATATTATCCATAATTCGGGATCTAAATCTGG
AGCCCAACTTTCTCATGACAACCGTTCTTATCGTTGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GAGHNFRTSILKSIYDCPFLSVHLKDLKGVVVCIVASSSIIDDNDKSTLLKTFREVTAYTGKLILSIIRDLNLEPNFLMTTVLIVG