; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G007650 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G007650
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionchitinase 10-like
Genome locationchr09:8733608..8734989
RNA-Seq ExpressionLsi09G007650
SyntenyLsi09G007650
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0006032 - chitin catabolic process (biological process)
GO:0006952 - defense response (biological process)
GO:0016998 - cell wall macromolecule catabolic process (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004568 - chitinase activity (molecular function)
GO:0008061 - chitin binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000726 - Glycoside hydrolase, family 19, catalytic
IPR023346 - Lysozyme-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050263.1 chitinase 10 [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-4891.84Show/hide
Query:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        EDP TAFKT LWFWMT QKPKPSCHDVMVG+YVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECG+ANDARVNDRIGYF+RYA+LFNVDTGPNLDCQNQK F
Subjt:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

XP_008466241.1 PREDICTED: chitinase 10 [Cucumis melo]2.1e-4891.84Show/hide
Query:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        EDP TAFKT LWFWMT QKPKPSCHDVMVG+YVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECG+ANDARVNDRIGYF+RYA+LFNVDTGPNLDCQNQK F
Subjt:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

XP_022993095.1 chitinase 10-like [Cucurbita maxima]1.6e-4890.82Show/hide
Query:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        EDP TAFKT LWFWMT QKPKPSCHDVMVGRY+PTKAD EANRTAGYGLVTNIINGGLECG+ANDARVNDRIG+F+RYA+LFNVDTGPNLDCQNQKPF
Subjt:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

XP_023550747.1 chitinase 10-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.6e-4889.8Show/hide
Query:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        EDP TAFKT LWFWMT QKPKPSCHDVMVGRY+PT+AD EANRTAGYGLVTNIINGGLECG+ANDARVNDRIG+F+RYA+LFNVDTGPNLDCQNQKPF
Subjt:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

XP_038875572.1 chitinase 10-like [Benincasa hispida]1.9e-4993.88Show/hide
Query:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        ED  TAFKT LWFWMT QKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECG+ANDARVNDRIGYF+RYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
Subjt:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CQS5 chitinase 101.0e-4891.84Show/hide
Query:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        EDP TAFKT LWFWMT QKPKPSCHDVMVG+YVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECG+ANDARVNDRIGYF+RYA+LFNVDTGPNLDCQNQK F
Subjt:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

A0A5A7U2X7 Chitinase 101.0e-4891.84Show/hide
Query:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        EDP TAFKT LWFWMT QKPKPSCHDVMVG+YVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECG+ANDARVNDRIGYF+RYA+LFNVDTGPNLDCQNQK F
Subjt:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

A0A6J1FEL0 chitinase 10-like8.5e-4888.78Show/hide
Query:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        EDP TAFKT LWFWMT QKPKPSCH+VMVGRY+PT+AD EANRTAGYGLVTNIINGGLECG+ANDARVNDRIG+F+RYA+LFNVDTGPNLDCQNQKPF
Subjt:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

A0A6J1JXK4 chitinase 10-like7.6e-4990.82Show/hide
Query:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        EDP TAFKT LWFWMT QKPKPSCHDVMVGRY+PTKAD EANRTAGYGLVTNIINGGLECG+ANDARVNDRIG+F+RYA+LFNVDTGPNLDCQNQKPF
Subjt:  EDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

A0A6P6A3R7 chitinase 10-like1.1e-4486.32Show/hide
Query:  ITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        + AFKT LWFWMT QKPKPSCHDVMVG+YVPT+AD+ ANRTAGYGLVTNIINGGLECG+AND RVNDRIGYF+RYAQLFNVDTGPNLDC+NQK F
Subjt:  ITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05315 Endochitinase7.4e-3360.82Show/hide
Query:  DPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        DP+ +FKT LWFWMT Q PKPSCHDV++GR+ P+ AD  ANR  G+G++TNIINGGLECG   D RV DRIG++ RY  +  V  G NLDC NQ+ F
Subjt:  DPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

P21226 Endochitinase A21.9e-3360.82Show/hide
Query:  DPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        DP+ +FKT LWFWMT Q PKPSCHDV+ G + P+ AD  A R  GYG VTNIINGGLECG   D+RV DRIG+++RY  +F +  G NLDC +Q+PF
Subjt:  DPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

P24091 Endochitinase B2.5e-3359.79Show/hide
Query:  DPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        DP+ +FK+ LWFWMT Q PKPSCHDV++GR+ P+ AD  ANR  G+G++TNIINGGLECG   D+RV DRIG++ RY  +  V  G NLDC NQ+ F
Subjt:  DPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

P86473 Endochitinase1.8e-3461.86Show/hide
Query:  DPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        DP  +FKT LWFWMT Q PKPSCHDV+ GR+ P+ AD  A R  G+G++TNIINGGLECG  +D+RV DRIG+++RY Q+F + TG NLDC NQ+ F
Subjt:  DPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

Q5NB11 Chitinase 103.5e-3567.74Show/hide
Query:  AFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        AF+T LWFWMT +  KPSCH VMVG Y P  AD+ ANRTAG+GLVTNI+NGGLEC  A DARVN+RIG++ RY Q+  VD GPNLDC++Q+PF
Subjt:  AFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02360.1 Chitinase family protein1.7e-4070.53Show/hide
Query:  ITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        + AF+T LWFWMT Q PKPSCHDVM+G+Y PT AD+ ANRT G+GL TNIINGGLECG+  D RVNDRIG+F+RY  LF V TGPNLDC+NQ+P+
Subjt:  ITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

AT1G05850.1 Chitinase family protein6.7e-1335.35Show/hide
Query:  AFKTGLWFWMT-TQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNV---DTGPN--LDCQNQKPF
        AF+  +W WMT  ++ +PS HD+ VG + PTK D  + R   +G   N++ G   CG  +   +N+ I ++  +  L  +   D GPN  L C  QKPF
Subjt:  AFKTGLWFWMT-TQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNV---DTGPN--LDCQNQKPF

AT3G12500.1 basic chitinase3.8e-3257.73Show/hide
Query:  DPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        D + AFK  +WFWMT Q PKPSCH V+ G++ P+ AD  A R  GYG++TNIINGGLECG   D RV DRIG+++RY  +F V+ G NLDC NQ+ F
Subjt:  DPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF

AT3G16920.1 chitinase-like protein 22.3e-1339.6Show/hide
Query:  AFKTGLWFWMT-TQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLEC--GVANDARVNDRIGYFERYAQLFNV---DTGPN--LDCQNQKP
        AF+  +W WMT  +K  PS HDV VG++ PTK D  A RT G+G   N++ G   C  G  ND  +N+ + ++  Y  L  V   + GP+  L C +Q+P
Subjt:  AFKTGLWFWMT-TQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLEC--GVANDARVNDRIGYFERYAQLFNV---DTGPN--LDCQNQKP

Query:  F
        F
Subjt:  F

AT4G01700.1 Chitinase family protein1.8e-4276.84Show/hide
Query:  ITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF
        + AFKT LWFWMT Q PKPSCH+VMV RY PTKAD  ANRT GYGLVTNIINGGLECG+  D RV DR+GYF+RYAQLF V TGPNLDC+NQ+PF
Subjt:  ITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGACCCAATAACGGCCTTCAAGACGGGGCTGTGGTTCTGGATGACGACGCAGAAGCCGAAGCCGTCGTGTCACGACGTCATGGTCGGGCGATACGTTCCTACAAA
GGCTGACATAGAAGCCAATCGAACTGCAGGATATGGACTGGTCACCAATATCATCAATGGCGGGCTCGAGTGTGGGGTTGCCAATGATGCTCGAGTCAATGACCGAATTG
GCTACTTCGAAAGATATGCTCAGCTCTTCAATGTCGATACTGGCCCCAACTTGGATTGCCAGAATCAGAAACCCTTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGACCCAATAACGGCCTTCAAGACGGGGCTGTGGTTCTGGATGACGACGCAGAAGCCGAAGCCGTCGTGTCACGACGTCATGGTCGGGCGATACGTTCCTACAAA
GGCTGACATAGAAGCCAATCGAACTGCAGGATATGGACTGGTCACCAATATCATCAATGGCGGGCTCGAGTGTGGGGTTGCCAATGATGCTCGAGTCAATGACCGAATTG
GCTACTTCGAAAGATATGCTCAGCTCTTCAATGTCGATACTGGCCCCAACTTGGATTGCCAGAATCAGAAACCCTTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDPITAFKTGLWFWMTTQKPKPSCHDVMVGRYVPTKADIEANRTAGYGLVTNIINGGLECGVANDARVNDRIGYFERYAQLFNVDTGPNLDCQNQKPF