; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G009030 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G009030
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionglutamate decarboxylase
Genome locationchr09:10920892..10921650
RNA-Seq ExpressionLsi09G009030
SyntenyLsi09G009030
Gene Ontology termsGO:0006536 - glutamate metabolic process (biological process)
GO:0004351 - glutamate decarboxylase activity (molecular function)
GO:0030170 - pyridoxal phosphate binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002129 - Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase
IPR010107 - Glutamate decarboxylase
IPR015424 - Pyridoxal phosphate-dependent transferase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAB5516833.1 hypothetical protein DKX38_027481 [Salix brachista]8.2e-3195.77Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVRF
        FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMA+INKNYVDMDEYPVTTELQ  F
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVRF

KAF3550917.1 hypothetical protein DY000_02000715 [Brassica cretica]4.8e-3190.67Show/hide
Query:  DQIGSLFKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQV
        D +   FKMPENSIPKEAA+QIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMA+INKNYVDMDEYPVTTELQV
Subjt:  DQIGSLFKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQV

KAF8015036.1 hypothetical protein BT93_H0737 [Corymbia citriodora subsp. variegata]8.2e-3198.57Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

XP_022938574.1 glutamate decarboxylase 1 [Cucurbita moschata]8.2e-3198.57Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

XP_022993766.1 glutamate decarboxylase 1 [Cucurbita maxima]8.2e-3198.57Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A068U0N0 Uncharacterized protein5.2e-3190.79Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVRFSMSLL
        FKMPENSIPKEAA+QIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQ    + LL
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVRFSMSLL

A0A371EGV3 Glutamate decarboxylase 1 (Fragment)4.0e-3179.07Show/hide
Query:  ISLIADQIGSLFKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVRFSMSL
        IS I   + ++F+MPE SIPK+AA+QII+DELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIM++INKNYVDMDEYPVTTELQ  FS+SL
Subjt:  ISLIADQIGSLFKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVRFSMSL

A0A5N5JH76 Uncharacterized protein4.0e-3195.77Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVRF
        FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMA+INKNYVDMDEYPVTTELQ  F
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVRF

A0A6J1FEG7 Glutamate decarboxylase4.0e-3198.57Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

A0A6J1JX91 Glutamate decarboxylase4.0e-3198.57Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P54767 Glutamate decarboxylase1.5e-3087.14Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMP+ S+PKEAA+QI+NDELMLDGNPRLNLASFV+TWMEPECDKLIM++INKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

Q07346 Glutamate decarboxylase1.3e-3191.43Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMP+NSIPKEAA+QIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKL+M +INKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

Q42521 Glutamate decarboxylase 11.2e-3294.29Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMPENSIPKEAA+QIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIM++INKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

Q9LSH2 Glutamate decarboxylase 57.3e-3084.29Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMP++ +PK+AA+Q+INDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIM ++NKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

Q9ZPS3 Glutamate decarboxylase 41.3e-3191.43Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        F+MPENSIPKEAA+QIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKL+M +INKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G65960.2 glutamate decarboxylase 24.4e-3085.71Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        +++ ENSIPK+AA+QII DELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIM +INKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

AT2G02010.1 glutamate decarboxylase 49.4e-3391.43Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        F+MPENSIPKEAA+QIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKL+M +INKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

AT3G17760.1 glutamate decarboxylase 55.2e-3184.29Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMP++ +PK+AA+Q+INDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIM ++NKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

AT3G17760.2 glutamate decarboxylase 55.2e-3184.29Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMP++ +PK+AA+Q+INDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIM ++NKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR

AT5G17330.1 glutamate decarboxylase8.5e-3494.29Show/hide
Query:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR
        FKMPENSIPKEAA+QIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIM++INKNYVDMDEYPVTTELQ R
Subjt:  FKMPENSIPKEAAFQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CATCAGCCTTCCAAAGCTGACCAAAAATCACTCTATTTAAGCCCCCCTTCTTCTTCATTAACCTCCATTGATCATCTTCTCATTCTTCTCTCTGCAACTAATTTCTTCCT
CTCTTGCTTCCATCTCCATCCGCCATGGTTCTCTCCAAGACTGCTTCTCAGACAGATGTTTCCGTCCACTCCACCTTCGCTTCTCGATATGTGCGAACCTCTCTCCCGAG
GTAATTTCATTTCATTAATCGCGGATCAGATCGGTTCATTATTCAAAATGCCGGAAAATTCGATCCCGAAGGAGGCTGCGTTTCAGATCATTAATGATGAACTCATGCTC
GATGGAAACCCTAGGTTGAATTTAGCCTCCTTCGTCACTACTTGGATGGAGCCTGAGTGTGATAAACTCATCATGGCCGCCATTAACAAGAATTACGTCGATATGGATGA
ATATCCTGTCACTACAGAGCTTCAGGTACGTTTCTCCATGTCTCTGTTAGCTTTAATCGAAAGATTAGATCGATTTTTCGTTCTATCGTTTCTCTCCATCAACGGTTACT
TTCCTCTGGAAATTCTCCTGAACTGCGAATTGCAGCGTTCGGTCGTGGCGAAATTTCTACGACCGAGATTAAAAAAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATCAGCCTTCCAAAGCTGACCAAAAATCACTCTATTTAAGCCCCCCTTCTTCTTCATTAACCTCCATTGATCATCTTCTCATTCTTCTCTCTGCAACTAATTTCTTCCT
CTCTTGCTTCCATCTCCATCCGCCATGGTTCTCTCCAAGACTGCTTCTCAGACAGATGTTTCCGTCCACTCCACCTTCGCTTCTCGATATGTGCGAACCTCTCTCCCGAG
GTAATTTCATTTCATTAATCGCGGATCAGATCGGTTCATTATTCAAAATGCCGGAAAATTCGATCCCGAAGGAGGCTGCGTTTCAGATCATTAATGATGAACTCATGCTC
GATGGAAACCCTAGGTTGAATTTAGCCTCCTTCGTCACTACTTGGATGGAGCCTGAGTGTGATAAACTCATCATGGCCGCCATTAACAAGAATTACGTCGATATGGATGA
ATATCCTGTCACTACAGAGCTTCAGGTACGTTTCTCCATGTCTCTGTTAGCTTTAATCGAAAGATTAGATCGATTTTTCGTTCTATCGTTTCTCTCCATCAACGGTTACT
TTCCTCTGGAAATTCTCCTGAACTGCGAATTGCAGCGTTCGGTCGTGGCGAAATTTCTACGACCGAGATTAAAAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
HQPSKADQKSLYLSPPSSSLTSIDHLLILLSATNFFLSCFHLHPPWFSPRLLLRQMFPSTPPSLLDMCEPLSRGNFISLIADQIGSLFKMPENSIPKEAAFQIINDELML
DGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQVRFSMSLLALIERLDRFFVLSFLSINGYFPLEILLNCELQRSVVAKFLRPRLKN