; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G009930 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G009930
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionprotein MEI2-like 7
Genome locationchr09:13540912..13542742
RNA-Seq ExpressionLsi09G009930
SyntenyLsi09G009930
Gene Ontology termsGO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007201 - Mei2-like, C-terminal RNA recognition motif
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047507.1 protein MEI2-like 7 [Cucumis melo var. makuwa]3.8e-16483.14Show/hide
Query:  MAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWP
        MA+ HINPL PFP QPIS+SFP S FLFSY+PLMA KPLNP ADPFLS+PP FLPPPPP PH  GYGNF+YPRA+S Y WQLHTYPAISCYNAWPQV+ P
Subjt:  MAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWP

Query:  PYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS-----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDR
        PYQAAVG  G V TDSKN   ADVG+FRREFVVS GPRR+ IKSPPQWVEKKI +     GGDG DPVEK +P S+ITTVMIKNIPNQFKR+DLLQLLD 
Subjt:  PYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS-----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDR

Query:  YCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCC
        YC +MNQQRDSRPDFC +EYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTS AASQFC VY+NYKWDVNVN+KICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWC 
Subjt:  YCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCC

Query:  NDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK
        NDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVG+RIPRLPRKPL K
Subjt:  NDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK

KAG7016518.1 Protein terminal ear1-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.4e-14878.16Show/hide
Query:  LQTLTM--AADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMA----TKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAIS
        LQTLTM     HINP LP PPQPIS S  F  FL+ +N  MA    +KPLNPNADPFLSAPP FLPPP P   V GYGN YYPRATSAY WQ H++PA+S
Subjt:  LQTLTM--AADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMA----TKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAIS

Query:  CYNAWPQVMWPPYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFK
        CYNAWPQV+WP YQ AVG GGGV  DSK           REFVVSSGP RD IK PPQWV+KKISS      D  DPVEK VPCS ITT+MIKNIPNQFK
Subjt:  CYNAWPQVMWPPYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFK

Query:  RRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKN
        RRDLLQLLDRYCQVMNQ+RDSRPDF  SEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTS+AASQFCAVY+NYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKN
Subjt:  RRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKN

Query:  AFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK
        AFKNKIFWC NDQYLPVML PASNGRRRYRRVNVG+RI RLPRKPL K
Subjt:  AFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK

XP_008465820.1 PREDICTED: protein MEI2-like 7 [Cucumis melo]1.1e-16683.38Show/hide
Query:  LQTLTMAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWP
        LQTLTMA+ HINPL PFP QPIS+SFP S FLFSY+PLMA KPLNP ADPFLS+PP FLPPPPP PH  GYGNF+YPRA+S Y WQLHTYPAISCYNAWP
Subjt:  LQTLTMAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWP

Query:  QVMWPPYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS-----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLL
        QV+ PPYQAAVG  G V TDSKN   ADVG+FRREFVVS GPRR+ IKSPPQWVEKKI +     GGDG DPVEK +P S+ITTVMIKNIPNQFKR+DLL
Subjt:  QVMWPPYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS-----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLL

Query:  QLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNK
        QLLD YC +MNQQRDSRPDFC +EYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTS AASQFC VY+NYKWDVNVN+KICEITEARIQGKEALKNAFKNK
Subjt:  QLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNK

Query:  IFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK
        IFWC NDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVG+RIPRLPRKPL K
Subjt:  IFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK

XP_022938871.1 meiosis protein mei2-like [Cucurbita moschata]1.3e-14578.34Show/hide
Query:  HINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMA----TKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWP
        HINP LP PPQPIS S PF  FL+ +N  MA    +KPLNPNADPFLSAPP FLPPP P   V GYGN YYPRATSAY WQ H++PA+SCYNAWPQV+WP
Subjt:  HINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMA----TKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWP

Query:  PYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRY
         YQ AVG GG    DSK           REFVVSSGP RD IK PP+WV+KKISS      D  DPVEK VPCS ITT+MIKNIPNQFKRRDLLQLLDRY
Subjt:  PYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRY

Query:  CQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCN
        CQVMNQ+RDSRPDF  SEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTS+AASQFCAVY+NYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWC N
Subjt:  CQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCN

Query:  DQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK
        DQYLPVML PASNGRRRYRRVNVG+RI RLPRKPL K
Subjt:  DQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK

XP_038875868.1 uncharacterized protein LOC120068227 [Benincasa hispida]3.6e-16784.32Show/hide
Query:  MAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFL--PPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVM
        MA+ HINPLLPFPPQPIS SFPFS F +S+NPLMA+KPLNPNA PFLSAPP FL  PPPPP PH+ GYGNFYYPRATSAYFWQ HTYP++SCYNAWP VM
Subjt:  MAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFL--PPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVM

Query:  WPPYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISSG---GDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDR
        WP YQ AVG  GG  TDSKNI  AD G FRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKI+SG   GDGA+PVEK VPCSEITT+MIKNIPNQ KRRDLLQLLDR
Subjt:  WPPYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISSG---GDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDR

Query:  YCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCC
        YC +MNQQRDS PDFC +EYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFT+S+AA +FCA Y+N KWDVNVNKKICEITEARIQGK+ALKNAFKNKIFWCC
Subjt:  YCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCC

Query:  NDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK
        NDQYLPVMLYPASNGRRRYRR+NVG+RIPRLPRKPL K
Subjt:  NDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CPR7 protein MEI2-like 75.1e-16783.38Show/hide
Query:  LQTLTMAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWP
        LQTLTMA+ HINPL PFP QPIS+SFP S FLFSY+PLMA KPLNP ADPFLS+PP FLPPPPP PH  GYGNF+YPRA+S Y WQLHTYPAISCYNAWP
Subjt:  LQTLTMAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWP

Query:  QVMWPPYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS-----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLL
        QV+ PPYQAAVG  G V TDSKN   ADVG+FRREFVVS GPRR+ IKSPPQWVEKKI +     GGDG DPVEK +P S+ITTVMIKNIPNQFKR+DLL
Subjt:  QVMWPPYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS-----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLL

Query:  QLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNK
        QLLD YC +MNQQRDSRPDFC +EYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTS AASQFC VY+NYKWDVNVN+KICEITEARIQGKEALKNAFKNK
Subjt:  QLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNK

Query:  IFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK
        IFWC NDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVG+RIPRLPRKPL K
Subjt:  IFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK

A0A5D3DSN8 Protein MEI2-like 71.8e-16483.14Show/hide
Query:  MAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWP
        MA+ HINPL PFP QPIS+SFP S FLFSY+PLMA KPLNP ADPFLS+PP FLPPPPP PH  GYGNF+YPRA+S Y WQLHTYPAISCYNAWPQV+ P
Subjt:  MAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWP

Query:  PYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS-----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDR
        PYQAAVG  G V TDSKN   ADVG+FRREFVVS GPRR+ IKSPPQWVEKKI +     GGDG DPVEK +P S+ITTVMIKNIPNQFKR+DLLQLLD 
Subjt:  PYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS-----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDR

Query:  YCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCC
        YC +MNQQRDSRPDFC +EYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTS AASQFC VY+NYKWDVNVN+KICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWC 
Subjt:  YCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCC

Query:  NDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK
        NDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVG+RIPRLPRKPL K
Subjt:  NDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK

A0A6J1FEC5 meiosis protein mei2-like6.5e-14678.34Show/hide
Query:  HINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMA----TKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWP
        HINP LP PPQPIS S PF  FL+ +N  MA    +KPLNPNADPFLSAPP FLPPP P   V GYGN YYPRATSAY WQ H++PA+SCYNAWPQV+WP
Subjt:  HINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMA----TKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWP

Query:  PYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRY
         YQ AVG GG    DSK           REFVVSSGP RD IK PP+WV+KKISS      D  DPVEK VPCS ITT+MIKNIPNQFKRRDLLQLLDRY
Subjt:  PYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS----GGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRY

Query:  CQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCN
        CQVMNQ+RDSRPDF  SEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTS+AASQFCAVY+NYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWC N
Subjt:  CQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCN

Query:  DQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK
        DQYLPVML PASNGRRRYRRVNVG+RI RLPRKPL K
Subjt:  DQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK

A0A6J1JS67 protein terminal ear1-like3.2e-14578.04Show/hide
Query:  HINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMA----TKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWP
        HINP LP PPQPIS S PF  FL+ +N  MA    +KPLNP+ADPFLSAPP FLPPP P   V GYGN YYPRATSAY WQ H++PA+SCYNAWPQV+WP
Subjt:  HINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMA----TKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWP

Query:  PYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKIS----SGGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRY
         YQ AVG GG V  DSK           REFVVSSGP RD IK P QW EKKIS    + GD  DPVEK VPCS ITT+MI+NIPNQFKRRDLLQLLDRY
Subjt:  PYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKIS----SGGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRY

Query:  CQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCN
        CQVMNQ+RDSRPDF  SEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTS+AASQFCAVY+NYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWC N
Subjt:  CQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCN

Query:  DQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK
        DQYLPVML PASNGRRRYRRVNVG+RI RLPRKPL K
Subjt:  DQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK

A0A6J1JV78 protein MEI2-like 65.9e-12368.99Show/hide
Query:  HINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLM--ATKPLNPNADPFLSAPPAFL---PPPPPLPHVGG-----YGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAW
        HINP  PF   PIS         F Y+PLM  A+ PLNPNADPFL  P +FL   PPPPP PHV       Y N Y+P A++ Y+WQ +TYPAI+CYNA 
Subjt:  HINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLM--ATKPLNPNADPFLSAPPAFL---PPPPPLPHVGG-----YGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAW

Query:  PQVMWPPYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS--GGDGADPVEKIVPC----SEITTVMIKNIPNQFKRRD
        P    P    AVG      TDSK++F  +  +F+REFVVS GPRR   KSPP+WVEKKI S  G  G DPVEK   C    S ITTVM+KNIPNQFKRRD
Subjt:  PQVMWPPYQAAVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISS--GGDGADPVEKIVPC----SEITTVMIKNIPNQFKRRD

Query:  LLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFK
        LLQLLDRYCQVMNQ  DSRPDF ASEYDFVYLPMDF RSWYEGKVSNLGYAFVNF+TS+AASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICE+T ARIQGKEALKNAFK
Subjt:  LLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFK

Query:  NKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK
        NKIFWC  DQYLPVML PAS+G RRYR VNVG+RIPR+PRKPL K
Subjt:  NKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WY46 Protein terminal ear1 homolog1.3e-2639.51Show/hide
Query:  SSGGDGADPVEKIVPCSEI-TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCA---SEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAA
        ++G   A    +   C +  TTVMI+NIPN++ ++ LL +LD +C + NQQ ++  +  A   S YDF+YLP+DF          N+GY FVN T+  AA
Subjt:  SSGGDGADPVEKIVPCSEI-TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCA---SEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAA

Query:  SQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGR
         +    ++   W+V  ++KIC++T AR+QG +ALK  FKN  F C +D+YLPV+  P  +G+
Subjt:  SQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGR

O65001 Protein terminal ear12.9e-2640Show/hide
Query:  KISSGGDGADPVEKIVPCSEI---TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQ----QRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFT
        K    G GAD   +  P SE+   TTVMI+NIPN++ ++ LL +LD +C   N+      + +P    S YDFVYLP+DF          N+GY FVN T
Subjt:  KISSGGDGADPVEKIVPCSEI---TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQ----QRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFT

Query:  TSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIP
        +  A  +    ++   W+V  ++KIC++T AR+QG EALK  FKN  F C +D+YLPV   PA +G+     V +  R P
Subjt:  TSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIP

Q0JGS5 Protein terminal ear1 homolog1.3e-2639.51Show/hide
Query:  SSGGDGADPVEKIVPCSEI-TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCA---SEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAA
        ++G   A    +   C +  TTVMI+NIPN++ ++ LL +LD +C + NQQ ++  +  A   S YDF+YLP+DF          N+GY FVN T+  AA
Subjt:  SSGGDGADPVEKIVPCSEI-TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCA---SEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAA

Query:  SQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGR
         +    ++   W+V  ++KIC++T AR+QG +ALK  FKN  F C +D+YLPV+  P  +G+
Subjt:  SQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGR

Q652K6 Protein MEI2-like 69.1e-2029.11Show/hide
Query:  PPAFLPPPPPLPHVGG----------YGNFY-------YPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWPPYQAA---------VGLGGGVTT------DSK
        PP  L PPPPLP V             G F        +P A +         P +  Y    +V+ PP  AA         +  GGGV T      D  
Subjt:  PPAFLPPPPPLPHVGG----------YGNFY-------YPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWPPYQAA---------VGLGGGVTT------DSK

Query:  NIFIADVGQFRREFVVSSG-PR--RDQIKSPPQWVEKKISSGGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSR-----PD
          FI  V   RR    +   P+  R  +  PP               P   +   +  T++MI+NIPN+F +  L+ +LD++C   N +   R       
Subjt:  NIFIADVGQFRREFVVSSG-PR--RDQIKSPPQWVEKKISSGGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSR-----PD

Query:  FCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASN
           SEYDF Y+P+DF   +      N GYAFVN TT+ AA +  A   +++WD  ++ K+C++  A IQG +A    F    F C   ++LPV   P  +
Subjt:  FCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASN

Query:  GRRRYRRVNVGKRIPR
        G ++ +   VG+ + R
Subjt:  GRRRYRRVNVGKRIPR

Q6ET49 Protein MEI2-like 76.3e-2140.79Show/hide
Query:  PVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKW
        P++K+ P    TTVM++NIPN+  R D+++LLD +C   N++R  R     +EYD VY+ MDF     E + SN+GYAFVNFTT+ AA       +  +W
Subjt:  PVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKW

Query:  DVNV--NKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFW-CCNDQYLPVMLYPASNG
          +   + KI +I  ARIQGK+AL   F    ++ C  D+YLP +  P  +G
Subjt:  DVNV--NKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFW-CCNDQYLPVMLYPASNG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G37140.1 MEI2 C-terminal RRM only like 16.6e-3447.27Show/hide
Query:  TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWD-VNVNKKICE
        T+VM+KNIPN   R DLL++LD +C+  N++         S YDF+YLPMDF      GK +NLGYAFVNFT+S+AA +F   + N+ WD +   KKICE
Subjt:  TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWD-VNVNKKICE

Query:  ITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNKKLQ
        IT A+ QGKE L   F+N  F C  D YLPV+L P SNG   Y    +G R+  L     N  L+
Subjt:  ITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIPRLPRKPLNKKLQ

AT1G67770.1 terminal EAR1-like 28.1e-2442.76Show/hide
Query:  TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQ----QRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKW-DVNVNK
        TTVMIKNIPN++ ++ LL++LD +C+  NQ    + +  P    S YDFVYLP+DF         SN+GY FVN T+  A  +    ++N  W D    +
Subjt:  TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQ----QRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKW-DVNVNK

Query:  KICEITEARIQGKEALKNAFKN-KIFWCCNDQYLPVMLYPASNGR
        KICE+T ARIQG E+L+  FKN ++     D+Y+PV+  P  +GR
Subjt:  KICEITEARIQGKEALKNAFKN-KIFWCCNDQYLPVMLYPASNGR

AT3G26120.1 terminal EAR1-like 19.6e-2539.87Show/hide
Query:  TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQ------QRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVN
        TT+MIKNIPN++ ++ LL +LD++C  +N+       +        S YDFVYLPMDF          N+GY FVN T+  AA +F   ++  +W+V  +
Subjt:  TTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQ------QRDSRPDFCASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVN

Query:  KKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNV
         KIC+IT AR+QG E LK  FK+  F C  + YLPV+  P  +G++    V++
Subjt:  KKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNV

AT5G07930.1 MEI2 C-terminal RRM only like 27.6e-2230.13Show/hide
Query:  PFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPP-------AFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAI-SCYNAWPQVMWPPYQAAVGLGGGVT
        P + F F +NP   T         + SAPP        +LPPPP +         YYP       W ++  P +       PQ   P     + L     
Subjt:  PFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPP-------AFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAI-SCYNAWPQVMWPPYQAAVGLGGGVT

Query:  TDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQW---VEKKISSGGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDF
        T S+ +F               G R  ++     W   ++ ++ S GD             ITTVM++NIPN++ R  ++Q +D++C+  N+      +F
Subjt:  TDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQW---VEKKISSGGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDF

Query:  CASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPA-SN
          S YDF+YLP+DF  +       N GYAFVNFT + A S+F A  NN  W    +KK  EIT ARIQ  E +K  F++  +    + Y  V   PA S 
Subjt:  CASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPA-SN

Query:  GRRRYRRVNVGK
        G+   +   VGK
Subjt:  GRRRYRRVNVGK

AT5G07930.3 MEI2 C-terminal RRM only like 27.6e-2230.13Show/hide
Query:  PFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPP-------AFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAI-SCYNAWPQVMWPPYQAAVGLGGGVT
        P + F F +NP   T         + SAPP        +LPPPP +         YYP       W ++  P +       PQ   P     + L     
Subjt:  PFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPP-------AFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAI-SCYNAWPQVMWPPYQAAVGLGGGVT

Query:  TDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQW---VEKKISSGGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDF
        T S+ +F               G R  ++     W   ++ ++ S GD             ITTVM++NIPN++ R  ++Q +D++C+  N+      +F
Subjt:  TDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQW---VEKKISSGGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDF

Query:  CASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPA-SN
          S YDF+YLP+DF  +       N GYAFVNFT + A S+F A  NN  W    +KK  EIT ARIQ  E +K  F++  +    + Y  V   PA S 
Subjt:  CASEYDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPA-SN

Query:  GRRRYRRVNVGK
        G+   +   VGK
Subjt:  GRRRYRRVNVGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ACCCTTCAAACCCTAACCATGGCTGCCGACCATATTAACCCTCTTCTTCCATTTCCTCCTCAACCCATTTCCACGTCCTTCCCCTTCTCCCGTTTTCTTTTCTCTTACAA
CCCTCTCATGGCCACCAAGCCCTTAAATCCCAATGCTGACCCTTTTCTCTCTGCACCGCCGGCGTTTCTTCCGCCGCCTCCTCCTCTACCGCATGTCGGTGGCTATGGAA
ATTTCTATTACCCACGTGCCACTTCCGCTTACTTTTGGCAGCTTCATACTTATCCTGCCATTAGCTGCTACAATGCTTGGCCGCAGGTCATGTGGCCGCCGTATCAGGCG
GCTGTGGGTCTCGGCGGTGGCGTTACGACGGATTCTAAGAACATTTTCATAGCAGACGTTGGTCAGTTCAGACGAGAGTTTGTTGTCTCGAGTGGGCCGCGAAGAGATCA
AATCAAATCTCCCCCGCAATGGGTGGAGAAGAAAATCAGTAGCGGTGGCGACGGTGCAGACCCAGTTGAGAAAATTGTTCCTTGCTCGGAAATCACAACGGTGATGATAA
AAAACATTCCAAATCAGTTCAAGCGCCGAGATCTTCTTCAGTTATTGGACAGATACTGTCAAGTGATGAACCAACAGAGGGATTCCCGACCTGATTTCTGTGCTTCTGAA
TATGATTTCGTGTATTTGCCTATGGATTTCATGAGATCATGGTACGAAGGGAAAGTGTCGAATTTGGGTTATGCATTTGTGAATTTCACTACCTCCATAGCTGCATCTCA
GTTTTGTGCTGTTTATAACAATTACAAATGGGATGTTAATGTGAACAAGAAGATTTGTGAGATAACTGAGGCTAGGATTCAGGGGAAGGAAGCTTTAAAGAATGCATTCA
AGAACAAAATCTTCTGGTGTTGCAACGATCAATATCTGCCTGTGATGTTATATCCGGCAAGCAATGGTCGTCGTCGTTACAGAAGGGTTAATGTTGGAAAGCGTATACCT
CGACTTCCTCGCAAGCCGCTTAATAAGAAGTTACAGTTGTGTCTTGTGTTTTCATTGTCTCCCCGACCACCACAATTTGTTTGGGGAGAATTGAAAACATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACCCTTCAAACCCTAACCATGGCTGCCGACCATATTAACCCTCTTCTTCCATTTCCTCCTCAACCCATTTCCACGTCCTTCCCCTTCTCCCGTTTTCTTTTCTCTTACAA
CCCTCTCATGGCCACCAAGCCCTTAAATCCCAATGCTGACCCTTTTCTCTCTGCACCGCCGGCGTTTCTTCCGCCGCCTCCTCCTCTACCGCATGTCGGTGGCTATGGAA
ATTTCTATTACCCACGTGCCACTTCCGCTTACTTTTGGCAGCTTCATACTTATCCTGCCATTAGCTGCTACAATGCTTGGCCGCAGGTCATGTGGCCGCCGTATCAGGCG
GCTGTGGGTCTCGGCGGTGGCGTTACGACGGATTCTAAGAACATTTTCATAGCAGACGTTGGTCAGTTCAGACGAGAGTTTGTTGTCTCGAGTGGGCCGCGAAGAGATCA
AATCAAATCTCCCCCGCAATGGGTGGAGAAGAAAATCAGTAGCGGTGGCGACGGTGCAGACCCAGTTGAGAAAATTGTTCCTTGCTCGGAAATCACAACGGTGATGATAA
AAAACATTCCAAATCAGTTCAAGCGCCGAGATCTTCTTCAGTTATTGGACAGATACTGTCAAGTGATGAACCAACAGAGGGATTCCCGACCTGATTTCTGTGCTTCTGAA
TATGATTTCGTGTATTTGCCTATGGATTTCATGAGATCATGGTACGAAGGGAAAGTGTCGAATTTGGGTTATGCATTTGTGAATTTCACTACCTCCATAGCTGCATCTCA
GTTTTGTGCTGTTTATAACAATTACAAATGGGATGTTAATGTGAACAAGAAGATTTGTGAGATAACTGAGGCTAGGATTCAGGGGAAGGAAGCTTTAAAGAATGCATTCA
AGAACAAAATCTTCTGGTGTTGCAACGATCAATATCTGCCTGTGATGTTATATCCGGCAAGCAATGGTCGTCGTCGTTACAGAAGGGTTAATGTTGGAAAGCGTATACCT
CGACTTCCTCGCAAGCCGCTTAATAAGAAGTTACAGTTGTGTCTTGTGTTTTCATTGTCTCCCCGACCACCACAATTTGTTTGGGGAGAATTGAAAACATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
TLQTLTMAADHINPLLPFPPQPISTSFPFSRFLFSYNPLMATKPLNPNADPFLSAPPAFLPPPPPLPHVGGYGNFYYPRATSAYFWQLHTYPAISCYNAWPQVMWPPYQA
AVGLGGGVTTDSKNIFIADVGQFRREFVVSSGPRRDQIKSPPQWVEKKISSGGDGADPVEKIVPCSEITTVMIKNIPNQFKRRDLLQLLDRYCQVMNQQRDSRPDFCASE
YDFVYLPMDFMRSWYEGKVSNLGYAFVNFTTSIAASQFCAVYNNYKWDVNVNKKICEITEARIQGKEALKNAFKNKIFWCCNDQYLPVMLYPASNGRRRYRRVNVGKRIP
RLPRKPLNKKLQLCLVFSLSPRPPQFVWGELKT