; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G010610 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G010610
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionBapA prefix-like domain-containing protein
Genome locationchr09:16231415..16232249
RNA-Seq ExpressionLsi09G010610
SyntenyLsi09G010610
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QKS06974.1 hypothetical protein HT745_07275 [Sulfitobacter pseudonitzschiae]1.6e-2840.71Show/hide
Query:  LPSGILGMGGELADGIEDNEGMLGILTDGILGMRGDLADGIEGNEGMLGILTDGILGMGGKLADGIEDNEGMLGILMG-------GILGMGGILTGGILR
        L  G+LG  G L DG+  ++G++G    G+LG  G L DG+ G++G++G    G+LG  G L DG+  ++G++G L+G       G++G  GI+ GG+L 
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Query:  MRDELSDGIEVNEGMVGILTSGILGMGGKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILG
            L DG+  ++G+VG    G+LG  G L DG+ G++G    L GG+LG  G L DG+ G++G    L GG+LG  G L DG+ G++G    L GG+LG
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Query:  MGGKLADGIEGNEGILGILRGGILEMGGKLTDGIEGNEGMV-GILTMDGILLE
          G L DG+ G++G++G L GG     G L DG+ G++G+V G+L  DG LL+
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SOD24205.1 hypothetical protein SAMN05518800_1280 [Variovorax sp. YR752]2.1e-2838.3Show/hide
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        L  G+LG  G L  G+  ++G+LG +  G+ G  G L  GI G++G+LG +  G+ G  G L  GI  ++G+LG ++GG+ G  G L GGIL        
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Query:  GIEVNEGMVGILTSGILGMGGKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLAD
            ++G++G +  G+ G  G L  GI G++G+L  + GG+ G  G L  GI G++G+LG + GG+ G  G L  GI G++G+LG + GG+ G  G L  
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Query:  GIEGNEGILGILRGGILEMGGKLTDGIEGNEGMVG
        GI G++G+LG + GG+    G +  GI G++G++G
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WP_097200690.1 hypothetical protein [Variovorax sp. YR752]2.1e-2838.3Show/hide
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        L  G+LG  G L  G+  ++G+LG +  G+ G  G L  GI G++G+LG +  G+ G  G L  GI  ++G+LG ++GG+ G  G L GGIL        
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Query:  GIEVNEGMVGILTSGILGMGGKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLAD
            ++G++G +  G+ G  G L  GI G++G+L  + GG+ G  G L  GI G++G+LG + GG+ G  G L  GI G++G+LG + GG+ G  G L  
Subjt:  GIEVNEGMVGILTSGILGMGGKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLAD

Query:  GIEGNEGILGILRGGILEMGGKLTDGIEGNEGMVG
        GI G++G+LG + GG+    G +  GI G++G++G
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WP_125966597.1 hypothetical protein [Variovorax beijingensis]9.2e-2940.13Show/hide
Query:  MVGILPSG-ILG---MGGELADGIEDNEGMLGILTDG-ILG---MRGDLADGIEGNEGMLGILTDG-ILG---MGGKLADGIEDNEGMLGILMGG-ILG-
        +VG L  G +LG   +GG+L DG+   +G+LG L  G +LG   + GDL DG+ G +G+LG L  G +LG   +GG L DG+   +G+LG L+GG +LG 
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Query:  --MGGILTGGIL--------RMRDELSDGIEVNEGMVGILTSG-ILG---MGGKLADGIEGNEGMLDILTGG-ILG---MGGKLADGIEGNEGMLGILTG
          +GG L GG+L         +  +L DG+   +G+VG L  G +LG   +GG L DG+ G +G++  L GG +LG   +GG L  G+ G +G++  L G
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Query:  GILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGG-ILG---MGGKLADGIEGNEGILGILRGGIL----EMGGKLTDGIEGNEGMVGIL---------TMDGILLEE
        G L +GG L DG+ G +G++G L GG +LG   +GG L DG+ G +G++G L GG L     +GG L DG+ G +G++G L          +DG+L E+
Subjt:  GILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGG-ILG---MGGKLADGIEGNEGILGILRGGIL----EMGGKLTDGIEGNEGMVGIL---------TMDGILLEE

WP_174861654.1 BapA prefix-like domain-containing protein [Sulfitobacter pseudonitzschiae]1.6e-2840.71Show/hide
Query:  LPSGILGMGGELADGIEDNEGMLGILTDGILGMRGDLADGIEGNEGMLGILTDGILGMGGKLADGIEDNEGMLGILMG-------GILGMGGILTGGILR
        L  G+LG  G L DG+  ++G++G    G+LG  G L DG+ G++G++G    G+LG  G L DG+  ++G++G L+G       G++G  GI+ GG+L 
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Query:  MRDELSDGIEVNEGMVGILTSGILGMGGKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILG
            L DG+  ++G+VG    G+LG  G L DG+ G++G    L GG+LG  G L DG+ G++G    L GG+LG  G L DG+ G++G    L GG+LG
Subjt:  MRDELSDGIEVNEGMVGILTSGILGMGGKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILG

Query:  MGGKLADGIEGNEGILGILRGGILEMGGKLTDGIEGNEGMV-GILTMDGILLE
          G L DG+ G++G++G L GG     G L DG+ G++G+V G+L  DG LL+
Subjt:  MGGKLADGIEGNEGILGILRGGILEMGGKLTDGIEGNEGMV-GILTMDGILLE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A286AQL9 Uncharacterized protein1.0e-2838.3Show/hide
Query:  LPSGILGMGGELADGIEDNEGMLGILTDGILGMRGDLADGIEGNEGMLGILTDGILGMGGKLADGIEDNEGMLGILMGGILGMGGILTGGILRMRDELSD
        L  G+LG  G L  G+  ++G+LG +  G+ G  G L  GI G++G+LG +  G+ G  G L  GI  ++G+LG ++GG+ G  G L GGIL        
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Query:  GIEVNEGMVGILTSGILGMGGKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLAD
            ++G++G +  G+ G  G L  GI G++G+L  + GG+ G  G L  GI G++G+LG + GG+ G  G L  GI G++G+LG + GG+ G  G L  
Subjt:  GIEVNEGMVGILTSGILGMGGKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLAD

Query:  GIEGNEGILGILRGGILEMGGKLTDGIEGNEGMVG
        GI G++G+LG + GG+    G +  GI G++G++G
Subjt:  GIEGNEGILGILRGGILEMGGKLTDGIEGNEGMVG

A0A2W7GYA3 Uncharacterized protein5.6e-3241.41Show/hide
Query:  MVGILPSGILGMG-GELADGIEDNEGMLGILTDGIL-GMRGDLADGIEGNEGMLGILTDGILGMG-GKLADGIEDNEGMLGILMGGILGMGGILTGGILR
        +VG L  G+ G G G L DG+  ++G++G L  G+  G  G L DG+ G++G++G L  G+ G G G L +G+  ++G++G L+GG+ G G    GG+L 
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Query:  MRDELSDGIEVNEGMVGILTSGILGMG-GKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMG-GKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMG-GKLADGIEGNEGMLGILTGG
              +G+  ++G+VG L  G+ G G G L DG+ GN+G++  L GG+ G G G L +G+ G++G++G L GG+ G G G L DG+ GN+G++G L GG
Subjt:  MRDELSDGIEVNEGMVGILTSGILGMG-GKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMG-GKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMG-GKLADGIEGNEGMLGILTGG

Query:  ILGMG-GKLADGIEGNEGILGILRGGILEMG-GKLTDGIEGNEGMVG-ILTMDGIL
        + G G G L DG+ G++G++G L GG+   G G L DG+ GN+G+VG +L  DG++
Subjt:  ILGMG-GKLADGIEGNEGILGILRGGILEMG-GKLTDGIEGNEGMVG-ILTMDGIL

A0A3P3E592 Uncharacterized protein1.3e-2841.22Show/hide
Query:  MVGILPSG-ILG---MGGELADGIEDNEGMLGILTDG-ILG---MRGDLADGIEGNEGMLGILTDG-ILG---MGGKLADGIEDNEGMLGILMGG-ILG-
        +VG L  G +LG   +GG+L DG+   +G+LG L  G +LG   + GDL DG+ G +G++G L  G +LG   +GG L DG+   +G+LG L+GG +LG 
Subjt:  MVGILPSG-ILG---MGGELADGIEDNEGMLGILTDG-ILG---MRGDLADGIEGNEGMLGILTDG-ILG---MGGKLADGIEDNEGMLGILMGG-ILG-

Query:  --MGGILTGGIL--------RMRDELSDGIEVNEGMVGILTSG-ILG---MGGKLADGIEGNEGMLDILTGG-ILG---MGGKLADGIEGNEGMLGILTG
          +GG L GG+L         +  +L DG+   +G+VG L  G +LG   +GG L DG+ G +G++  L GG +LG   +GG L  G+ G +G++  L G
Subjt:  --MGGILTGGIL--------RMRDELSDGIEVNEGMVGILTSG-ILG---MGGKLADGIEGNEGMLDILTGG-ILG---MGGKLADGIEGNEGMLGILTG

Query:  GILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGG-ILG---MGGKLADGIEGNEGILGILRGGIL----EMGGKLTDGIEGNEGMVG
        G L +GG L DG+ G +G++G L GG +LG   +GG L DG+ G +G++G L GG L     +GG L DG+ G +G+VG
Subjt:  GILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGG-ILG---MGGKLADGIEGNEGILGILRGGIL----EMGGKLTDGIEGNEGMVG

A0A679JQE2 Uncharacterized protein4.9e-2840.08Show/hide
Query:  GILPSGILGMGGELADGIEDNEGMLGILTDGILGMRGDLADGIEGNEGMLGILTDGIL-GMGGKLADGIEDNEGMLGILMGGILGMGGILTGGILRMRDE
        G+L  G+LG  G L  G+  ++G+LG    G+LG  G L  G+ G++G+LG +  G+  G  G L DG+  ++G+LG ++GG+ G G    GG+L     
Subjt:  GILPSGILGMGGELADGIEDNEGMLGILTDGILGMRGDLADGIEGNEGMLGILTDGIL-GMGGKLADGIEDNEGMLGILMGGILGMGGILTGGILRMRDE

Query:  LSDGIEVNEGMVGILTSGILGMG-GKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMG-GKLADGIEGNEGMLGILTGGIL-GMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGM
          DG+  + G++G +  G+ G G G L DG+ G++G+L  + GG+ G G G L DG+ G+ G+LG + GG+  G  G L DG+ G++G+LG + GG+ G 
Subjt:  LSDGIEVNEGMVGILTSGILGMG-GKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMG-GKLADGIEGNEGMLGILTGGIL-GMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGM

Query:  G-GKLADGIEGNEGILGILRGGILEMG-GKLTDGIEGNEGMVG-ILTMDGIL
        G G L DG+ G+ G+LG + GG+   G G L DG+ GN+G+VG +L  DG++
Subjt:  G-GKLADGIEGNEGILGILRGGILEMG-GKLTDGIEGNEGMVG-ILTMDGIL

A0A7U2KIP9 BapA prefix-like domain-containing protein2.5e-2740.71Show/hide
Query:  LPSGILGMGGELADGIEDNEGMLGILTDGILGMRGDLADGIEGNEGMLGILTDGILGMGGKLADGIEDNEGMLGILMG-------GILGMGGILTGGILR
        L  G+LG  G L DG+  ++G++G    G+LG  G L DG+ G++G++G    G+LG  G L DG+  ++G++G L+G       G++G  G L GG+L 
Subjt:  LPSGILGMGGELADGIEDNEGMLGILTDGILGMRGDLADGIEGNEGMLGILTDGILGMGGKLADGIEDNEGMLGILMG-------GILGMGGILTGGILR

Query:  MRDELSDGIEVNEGMVGILTSGILGMGGKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILG
            L DG+  ++G+VG    G+LG  G L DG+ G++G    L GG+ G  G L DG+ G++G    L GG+LG  G L DG+ G++G    L GG+LG
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Query:  MGGKLADGIEGNEGILGILRGGILEMGGKLTDGIEGNEGMV-GILTMDGILLE
          G L DG+ G++GI+G L GG     G L DG+ G++G+V G+L  DG LL+
Subjt:  MGGKLADGIEGNEGILGILRGGILEMGGKLTDGIEGNEGMV-GILTMDGILLE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTAGGGATACTACCAAGTGGGATATTAGGGATGGGAGGTGAACTAGCGGATGGAATAGAAGACAATGAAGGAATGTTAGGAATACTAACGGATGGGATATTAGGGAT
GAGAGGCGACCTAGCGGATGGAATAGAAGGCAATGAAGGAATGTTAGGAATACTAACGGATGGGATATTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCAGATGGAATAGAAGACAATG
AAGGAATGTTAGGGATACTGATGGGTGGGATATTAGGGATGGGAGGGATACTGACGGGTGGGATATTAAGGATGAGAGACGAACTATCGGATGGAATAGAAGTCAATGAA
GGAATGGTAGGGATACTAACAAGTGGGATATTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCAGATGGAATAGAAGGCAATGAAGGAATGTTAGACATACTAACGGGTGGGATATTAGG
GATGGGAGGCAAACTAGCGGATGGAATAGAAGGCAATGAAGGAATGTTAGGCATACTAACGGGTGGGATATTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCGGATGGAATAGAAGGCA
ATGAAGGAATGTTAGGCATACTAACGGGTGGGATATTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCGGATGGAATAGAAGGCAATGAGGGAATATTAGGGATACTAAGAGGTGGGATA
TTAGAGATGGGAGGCAAATTAACAGATGGAATAGAAGGTAATGAAGGAATGGTCGGGATATTAACAATGGATGGAATATTATTGGAGGAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAACGGATAATAGTATTTGGTGGATGCTACGGAGATGAAGGAATGGTAGGGATACTACCAAGTGGGATATTAGGGATGGGAGGTGAACTAGCGGATGGAATAGAAGACA
ATGAAGGAATGTTAGGAATACTAACGGATGGGATATTAGGGATGAGAGGCGACCTAGCGGATGGAATAGAAGGCAATGAAGGAATGTTAGGAATACTAACGGATGGGATA
TTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCAGATGGAATAGAAGACAATGAAGGAATGTTAGGGATACTGATGGGTGGGATATTAGGGATGGGAGGGATACTGACGGGTGGGATATT
AAGGATGAGAGACGAACTATCGGATGGAATAGAAGTCAATGAAGGAATGGTAGGGATACTAACAAGTGGGATATTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCAGATGGAATAGAAG
GCAATGAAGGAATGTTAGACATACTAACGGGTGGGATATTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCGGATGGAATAGAAGGCAATGAAGGAATGTTAGGCATACTAACGGGTGGG
ATATTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCGGATGGAATAGAAGGCAATGAAGGAATGTTAGGCATACTAACGGGTGGGATATTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCGGATGGAAT
AGAAGGCAATGAGGGAATATTAGGGATACTAAGAGGTGGGATATTAGAGATGGGAGGCAAATTAACAGATGGAATAGAAGGTAATGAAGGAATGGTCGGGATATTAACAA
TGGATGGAATATTATTGGAGGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVGILPSGILGMGGELADGIEDNEGMLGILTDGILGMRGDLADGIEGNEGMLGILTDGILGMGGKLADGIEDNEGMLGILMGGILGMGGILTGGILRMRDELSDGIEVNE
GMVGILTSGILGMGGKLADGIEGNEGMLDILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGMLGILTGGILGMGGKLADGIEGNEGILGILRGGI
LEMGGKLTDGIEGNEGMVGILTMDGILLEE