; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G010900 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G010900
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionProtein Ycf2
Genome locationchr09:17301423..17317588
RNA-Seq ExpressionLsi09G010900
SyntenyLsi09G010900
Gene Ontology termsGO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003593 - AAA+ ATPase domain
IPR003959 - ATPase, AAA-type, core
IPR008543 - Uncharacterised protein family Ycf2
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QIT04093.1 Ycf2 protein [Luffa aegyptiaca]3.6e-129100Show/hide
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QJR53001.1 hypothetical protein RF2 [Herpetospermum pedunculosum]3.6e-129100Show/hide
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YP_009752286.1 Ycf2 protein [Trichosanthes baviensis]3.6e-129100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A6C0U8W2 Protein Ycf21.7e-129100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
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Q14F97 Protein Ycf24.2e-12595.44Show/hide
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Q49KT6 Protein Ycf21.1e-12596.27Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG00860.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core2.9e-12193.36Show/hide
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ATCG01280.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core2.9e-12193.36Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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