CuGenDBv2

Gene ID	Lsi09G011720
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Transmembrane protein
Genome location	chr09:18974188..18975825
RNA-Seq Expression	Lsi09G011720
Synteny	Lsi09G011720
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7026129.1 hypothetical protein SDJN02_12628 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

5.4e-108

Show/hide

Query:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSS-TLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE
        MKAL   P T+   S   PWR IFP   SS FRFSS T HYRP DSNAE+F S  FRRR+E     DE+  QQGFDPGIRF  T+RK RRRWWSDEP PE
Subjt:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSS-TLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE

Query:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE
        F+++PSG+LD+VIDSVWIFKVFKSYGW LPPII SLLLNSGPKAFLMALA PLGQSIISLALEKLWG PER+PKRRTR++TRKRPFYS    RV+EEEEE
Subjt:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE

Query:  EEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSW
        EEEA+GNG G  KMGYGYQSWEVG N GEVRKE RSGT+FGGWEDLDGV S  + K     K  SS+SME GKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSW
Subjt:  EEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSW

Query:  TRML
        TRML
Subjt:  TRML

XP_004147177.1 uncharacterized protein LOC101211925 [Cucumis sativus]

2.2e-125

82.3

Show/hide

Query:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSST-LHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE
        MKALFP PS       PFPWR    FPSSS FRF+ST LHYRPPD NAETF+SHNFRRR ++SE D EDD Q GFDPGIRF    RKNRRRWWSD+P PE
Subjt:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSST-LHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE

Query:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE
        FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPII SLLLNSGPKAFLMALALPLGQSII+LALEKLWGTPERKPKRRTRS+TRKRPFYS  TSRVQEEE++
Subjt:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE

Query:  EEE-ARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
        EEE ARGN EGN KMGYGYQSWE+G N GEVR EGR+G SFGGWEDLDGVG+ERK K  VR KKQSST+MEKGKL+WREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
Subjt:  EEE-ARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS

Query:  WTRML
        WT+ML
Subjt:  WTRML

XP_008460715.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499480 [Cucumis melo]

2.2e-125

82.3

Show/hide

Query:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSST-LHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE
        MKALFP PS       P PWR  FP  SSS FRF+ST LHYRPPD NAETF SHNFRRR ++SE D EDD QQGFDPGIRF    RKNRRRWWSD+P P+
Subjt:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSST-LHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE

Query:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE
        FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPII SLLLNSGPKAFLMALALPLGQSII+LALEKLWG PERKPKRRTRS+TRKRPFYS  TSRVQEEE++
Subjt:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE

Query:  EEE-ARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
        EEE ARGNGEGN KMGYGYQSWEVG N GEVR  GR+G SFGGWEDLDGVG+ERK K  VR KKQSST+MEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
Subjt:  EEE-ARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS

Query:  WTRML
        WT+ML
Subjt:  WTRML

XP_023514400.1 uncharacterized protein LOC111778674 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.2e-108

74.75

Show/hide

Query:  MKA-LFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSS-TLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEP
        MKA L  P S +   S   PWR IFP   SS FRFSS T HYRP DSNAE+F S  FRRR+E     DE+  QQGFDPGIRF  T+RK RRRWWSDEP P
Subjt:  MKA-LFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSS-TLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEP

Query:  EFEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEE
        EF+++PSG+LD+VIDSVWIFKVFKSYGW LPPII SLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWG PER+PKRRTR++TRKRPFY+    RV+EEEE
Subjt:  EFEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEE

Query:  EEEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
        EEEEA+GNG G  KMGYGYQSWEVG N GEVRKE RSGT+FGGWEDLDGV S  + K     K  SS+SME GKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
Subjt:  EEEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS

Query:  WTRML
        WTRML
Subjt:  WTRML

XP_038907133.1 uncharacterized protein LOC120092944 [Benincasa hispida]

3.7e-149

91.48

Show/hide

Query:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSSTLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEAD--DEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEP
        MKALFP PS+TLLPSHPFPWRP+F FPSSSPFRFS TLHYRPPDSNAETF+SHNFRRR+EHSE D  D+DD QQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEP P
Subjt:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSSTLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEAD--DEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEP

Query:  EFEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEE
        +FEDQPSGILD+VIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRS+TRKRPFYS GTSRVQ   E
Subjt:  EFEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEE

Query:  EEEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
        EEEEARGNGEGN KMGYGYQSWEVG N GEVRKEGR+GTSFGGWEDLDGVGSERKAK  VRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
Subjt:  EEEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS

Query:  WTRML
        WTRML
Subjt:  WTRML

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LKI3 Uncharacterized protein

1.1e-125

82.3

Show/hide

Query:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSST-LHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE
        MKALFP PS       PFPWR    FPSSS FRF+ST LHYRPPD NAETF+SHNFRRR ++SE D EDD Q GFDPGIRF    RKNRRRWWSD+P PE
Subjt:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSST-LHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE

Query:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE
        FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPII SLLLNSGPKAFLMALALPLGQSII+LALEKLWGTPERKPKRRTRS+TRKRPFYS  TSRVQEEE++
Subjt:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE

Query:  EEE-ARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
        EEE ARGN EGN KMGYGYQSWE+G N GEVR EGR+G SFGGWEDLDGVG+ERK K  VR KKQSST+MEKGKL+WREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
Subjt:  EEE-ARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS

Query:  WTRML
        WT+ML
Subjt:  WTRML

A0A1S3CD27 uncharacterized protein LOC103499480

1.1e-125

82.3

Show/hide

Query:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSST-LHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE
        MKALFP PS       P PWR  FP  SSS FRF+ST LHYRPPD NAETF SHNFRRR ++SE D EDD QQGFDPGIRF    RKNRRRWWSD+P P+
Subjt:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSST-LHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE

Query:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE
        FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPII SLLLNSGPKAFLMALALPLGQSII+LALEKLWG PERKPKRRTRS+TRKRPFYS  TSRVQEEE++
Subjt:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE

Query:  EEE-ARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
        EEE ARGNGEGN KMGYGYQSWEVG N GEVR  GR+G SFGGWEDLDGVG+ERK K  VR KKQSST+MEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
Subjt:  EEE-ARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS

Query:  WTRML
        WT+ML
Subjt:  WTRML

A0A5A7SNV9 Uncharacterized protein

1.1e-125

82.3

Show/hide

Query:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSST-LHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE
        MKALFP PS       P PWR  FP  SSS FRF+ST LHYRPPD NAETF SHNFRRR ++SE D EDD QQGFDPGIRF    RKNRRRWWSD+P P+
Subjt:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSST-LHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE

Query:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE
        FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPII SLLLNSGPKAFLMALALPLGQSII+LALEKLWG PERKPKRRTRS+TRKRPFYS  TSRVQEEE++
Subjt:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEE

Query:  EEE-ARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
        EEE ARGNGEGN KMGYGYQSWEVG N GEVR  GR+G SFGGWEDLDGVG+ERK K  VR KKQSST+MEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
Subjt:  EEE-ARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS

Query:  WTRML
        WT+ML
Subjt:  WTRML

A0A6J1HKD0 uncharacterized protein LOC111464344

1.4e-106

74.18

Show/hide

Query:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSS-TLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE
        MKAL   P++    S   PWR IFP   SS FRFSS T HYRP DSNAE+F S  FRRR+E     DE+  QQGFDPGIRF  T+RK RRRWWSDEP PE
Subjt:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSS-TLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE

Query:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSR--VQEEE
        F+++PSG+LD+VIDSVWIFKVFKSYGW LPPII SLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWG PERKPKRRTR++TRKRPFYS    R   +EEE
Subjt:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSR--VQEEE

Query:  EEEEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLG
        EEEEEA+GNG G  KMGYGYQSWEVG N GEVRKE RSGT+FGGWEDLDGV S  + K     K  SS+SME GKLSWREKKSDTPLLLRLLI+VFPFLG
Subjt:  EEEEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLG

Query:  SWTRML
        SWTRML
Subjt:  SWTRML

A0A6J1KDX0 uncharacterized protein LOC111494773

1.4e-106

74.75

Show/hide

Query:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSS-TLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE
        MKAL   P+     S   PWR IFP   SS FRFSS T HYRP DSNAE+F S  FRRR+E     DE+  QQGFDPGIRF  T+RK RRRWWSDEP PE
Subjt:  MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSS-TLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPE

Query:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEE-
        F+++ SGILD+VIDSVWIFKVFKSYGW LPPII SLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWG PER+PKRRTR++TRKRPFYS    RV+EEEE 
Subjt:  FEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEE-

Query:  EEEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
        EEEEA+GNG G  KMGYGYQSWEVG N GEVRKE RSGT+FGGWEDLDGV S  + K     K  SS+SME+GKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS
Subjt:  EEEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGN-GEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGS

Query:  WTRML
        WTRML
Subjt:  WTRML

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G33250.1 unknown protein

1.6e-20

33.13

Show/hide

Query:  PPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSSTLHYRPPDSNAETFSSHNF-RRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTR----KNRRRWWSDEPEPEF
        P  ST L  S+   WR  F  P S P   S  L +    S   +       RRR  +      DD       G  +R T R    + RR  W +  E   
Subjt:  PPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSSTLHYRPPDSNAETFSSHNF-RRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTR----KNRRRWWSDEPEPEF

Query:  EDQPS----------------GILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRP
        ED                    IL+E++D+VWI K FKSYG+ LP II SL  ++GPKAFL++LA+ +G S++  A +KL G  +R+             
Subjt:  EDQPS----------------GILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRP

Query:  FYSAGTSRVQE---EEEEEEEARGNGEGNRKMGYGYQSW--EVGGNGEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKS
            GTS   +   EEEEEE  R +     ++ Y   +    V G G  R      + FGGW++LDG+G+    +     KK+    + K K   REK +
Subjt:  FYSAGTSRVQE---EEEEEEEARGNGEGNRKMGYGYQSW--EVGGNGEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKS

Query:  DTPLLLRLLIAVFPFLGSWTRML
        + PLLLRLL+++FPFL ++T ML
Subjt:  DTPLLLRLLIAVFPFLGSWTRML

AT3G04310.1 unknown protein

8.0e-25

36.73

Show/hide

Query:  FRTTTRKNRRRWWSDEPEPEFEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSR
        F    RK +R WW D+ + + +D    + +E  D   +F+VF++  W L PI  SLLL +   A +MALA+PL QS++SL + K+W  P  +  +R+R  
Subjt:  FRTTTRKNRRRWWSDEPEPEFEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSR

Query:  TRKRPFYSAGTSRVQEEEEEEEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGNGEVRKEGRSGTSFGGWEDLD---GVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWRE
        T  R      ++ V      +    GN  G    G GY+SW VG +         GT +GGW+DLD    + ++      VR K+Q      K    WR 
Subjt:  TRKRPFYSAGTSRVQEEEEEEEEARGNGEGNRKMGYGYQSWEVGGNGEVRKEGRSGTSFGGWEDLD---GVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWRE

Query:  KKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTRML
        K  + PLLLR+LIA FPFLGSWT++L
Subjt:  KKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTRML

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAAGGCCCTGTTTCCTCCTCCCTCCACTACTCTTCTTCCTTCTCATCCATTTCCATGGCGGCCCATTTTCCCCTTTCCCTCTTCTTCTCCCTTCCGCTTCTCCTCTAC
ACTCCACTACCGTCCTCCCGACTCCAATGCCGAAACCTTCAGCTCCCACAATTTCAGACGCAGACATGAACACTCTGAAGCCGACGACGAAGACGACCACCAACAAGGCT
TCGATCCCGGCATTCGCTTCCGAACCACCACCCGGAAGAATCGGCGGCGTTGGTGGTCCGATGAGCCGGAGCCGGAATTCGAAGACCAACCTTCTGGGATCTTGGATGAA
GTAATCGATAGTGTCTGGATTTTCAAGGTATTCAAATCCTACGGCTGGACACTTCCACCCATAATCTTCTCATTGCTGTTAAACTCAGGACCAAAAGCTTTTTTAATGGC
GTTAGCCCTTCCACTAGGCCAATCAATCATATCTCTGGCATTAGAGAAGTTGTGGGGAACACCAGAAAGGAAGCCAAAGCGCAGAACTAGAAGCAGGACCAGGAAGAGGC
CATTTTACAGCGCTGGGACGAGTAGGGTTCAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAAGAGGAAATGGGGAAGGTAATAGAAAGATGGGCTATGGATATCAGTCATGG
GAAGTTGGTGGCAATGGTGAAGTTAGAAAAGAGGGCAGAAGTGGAACCAGTTTTGGTGGATGGGAGGATCTTGATGGAGTTGGATCTGAGAGAAAGGCAAAATCTAGGGT
TAGAGGCAAAAAACAAAGCAGCACATCAATGGAGAAGGGTAAGTTGAGTTGGAGAGAAAAGAAAAGCGATACTCCCTTGTTGTTGAGATTGTTAATTGCTGTTTTCCCAT
TTTTGGGTTCATGGACTAGGATGCTTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AATAACGGCACGTAGAAGAAGATGGAAGAAGGTTTTAACAGAGAAGAAGAGAGTGAGAGAGACAAAAACAAAAGGGATAACGTGGCGTAATGAAGGCCCTGTTTCCTCCT
CCCTCCACTACTCTTCTTCCTTCTCATCCATTTCCATGGCGGCCCATTTTCCCCTTTCCCTCTTCTTCTCCCTTCCGCTTCTCCTCTACACTCCACTACCGTCCTCCCGA
CTCCAATGCCGAAACCTTCAGCTCCCACAATTTCAGACGCAGACATGAACACTCTGAAGCCGACGACGAAGACGACCACCAACAAGGCTTCGATCCCGGCATTCGCTTCC
GAACCACCACCCGGAAGAATCGGCGGCGTTGGTGGTCCGATGAGCCGGAGCCGGAATTCGAAGACCAACCTTCTGGGATCTTGGATGAAGTAATCGATAGTGTCTGGATT
TTCAAGGTATTCAAATCCTACGGCTGGACACTTCCACCCATAATCTTCTCATTGCTGTTAAACTCAGGACCAAAAGCTTTTTTAATGGCGTTAGCCCTTCCACTAGGCCA
ATCAATCATATCTCTGGCATTAGAGAAGTTGTGGGGAACACCAGAAAGGAAGCCAAAGCGCAGAACTAGAAGCAGGACCAGGAAGAGGCCATTTTACAGCGCTGGGACGA
GTAGGGTTCAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAAGAGGAAATGGGGAAGGTAATAGAAAGATGGGCTATGGATATCAGTCATGGGAAGTTGGTGGCAATGGTGAA
GTTAGAAAAGAGGGCAGAAGTGGAACCAGTTTTGGTGGATGGGAGGATCTTGATGGAGTTGGATCTGAGAGAAAGGCAAAATCTAGGGTTAGAGGCAAAAAACAAAGCAG
CACATCAATGGAGAAGGGTAAGTTGAGTTGGAGAGAAAAGAAAAGCGATACTCCCTTGTTGTTGAGATTGTTAATTGCTGTTTTCCCATTTTTGGGTTCATGGACTAGGA
TGCTTTAGATGAATACTCATCTAGTTCTAGTCTTCTATAATTAATCAAATTTTTACTCACTATTTTGGTTATTTAAAACCTCAACAAATTGCTCTCTTGTTGAGGATAGA
ATAAGAAGTTCAAAACTGTTCTTATGTACAGTGTAAGCAGGATCTGTCTTGAGAACCACCTCGGGTTCCCAAATTGTCCTTAATTGATCTCTTGGATTTTCGATC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MKALFPPPSTTLLPSHPFPWRPIFPFPSSSPFRFSSTLHYRPPDSNAETFSSHNFRRRHEHSEADDEDDHQQGFDPGIRFRTTTRKNRRRWWSDEPEPEFEDQPSGILDE
VIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIFSLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIISLALEKLWGTPERKPKRRTRSRTRKRPFYSAGTSRVQEEEEEEEEARGNGEGNRKMGYGYQSW
EVGGNGEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKAKSRVRGKKQSSTSMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTRML

Lsi09G011720 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome