; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G011950 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G011950
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptioncysteine-rich repeat secretory protein 3-like
Genome locationchr09:19196585..19198527
RNA-Seq ExpressionLsi09G011950
SyntenyLsi09G011950
Gene Ontology termsGO:0010497 - plasmodesmata-mediated intercellular transport (biological process)
GO:0046739 - transport of virus in multicellular host (biological process)
GO:0009506 - plasmodesma (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR002902 - Gnk2-homologous domain
IPR038408 - Gnk2-homologous domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7013463.1 Cysteine-rich repeat secretory protein 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.3e-14990.23Show/hide
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KAG7026146.1 Cysteine-rich repeat secretory protein 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.3e-14990.82Show/hide
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XP_011649128.1 plasmodesmata-located protein 2 [Cucumis sativus]2.5e-15794.46Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLG0 Uncharacterized protein1.2e-15794.46Show/hide
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A0A1S3CD12 cysteine-rich repeat secretory protein 3-like2.7e-15794.46Show/hide
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A0A5A7SL80 Cysteine-rich repeat secretory protein 3-like2.7e-15794.46Show/hide
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A0A6J1H3X1 cysteine-rich repeat secretory protein 3-like2.1e-14989.9Show/hide
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A0A6J1KWT1 cysteine-rich repeat secretory protein 3-like1.6e-14990.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22784 Plasmodesmata-located protein 31.7e-10866.02Show/hide
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Q6E263 Plasmodesmata-located protein 43.5e-4536.45Show/hide
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         CV  L E++   CG   +AR+ L GC+L+Y+F     PG  Q++       FE     +++K C GAT     GFEE R   L+  E GVV GHGFY  
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        A + F+ I  +F+++L+KK D
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Q6NKQ9 Plasmodesmata-located protein 88.1e-2630.17Show/hide
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        F FS L    Y +    S S+    +Y GC+ + ++ PN  +         S+V+ S+  S   F     ++S ++ +A+ GL+QCR DL +SDC  C+ 
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          C+  +V K +  CGS+++ +VYL +C+  Y                    S    +SS P+  G + GK++A+I+G  AG   LV+ L   RN
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Q6NM73 Plasmodesmata-located protein 27.1e-11571.1Show/hide
Query:  SFFFFFFSFLLFISYLACLVESG-SDYTTLVYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGTTQTAITGLFQCRGDLSNSDCYNCVS
        SF        L    L  +V+S  ++YTTL+YKGCA+Q FSDP+G+YSQAL+A+FGSLVSQS K ++F+KTT+GT+ T ITGLFQCRGDLSN DCYNCVS
Subjt:  SFFFFFFSFLLFISYLACLVESG-SDYTTLVYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGTTQTAITGLFQCRGDLSNSDCYNCVS

Query:  KLPELADSLCGRTIAARVQLSGCYLLYEFPGFVQISGFEMLYKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLAQCEGDLGDSDCG
        +LP L+D LCG+TIA+RVQLSGCYLLYE  GF QISG EML+KTCG  NIAG+GFEERRDT   V++NGVVSGHGFY T Y+S+YVL QCEGD+GD+DC 
Subjt:  KLPELADSLCGRTIAARVQLSGCYLLYEFPGFVQISGFEMLYKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLAQCEGDLGDSDCG

Query:  ECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRNL-KKKH
         CVK+A++KAQVECGSSISGQ+YLHKCFI+YSYYPNGVP+RSSS SSSSSSSSS S +S PS     TGKTVA+I+GGAAGVGFLVICLLF +NL +KKH
Subjt:  ECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRNL-KKKH

Query:  D
        D
Subjt:  D

Q8GXV7 Plasmodesmata-located protein 13.5e-6946.82Show/hide
Query:  FFSFLLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGT-TQTAITGLFQCRGDLSNSDCYNCVSKLPEL
        FF F  F+ + A  +    DY  L++KGCA Q   DP GV+SQ L  LF SLVSQS++ S F   TSGT   TA+ G+FQCRGDL N+ CY+CVSK+P+L
Subjt:  FFSFLLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGT-TQTAITGLFQCRGDLSNSDCYNCVSKLPEL

Query:  ADSLC------GRTIAARVQLSGCYLLYEFPGFVQISGFEMLYKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGH--------GFYTTNYQSLYVLAQCE
           LC      G  +AARV L+GCY+ YE  GF Q SG EML++ CG  +    GF  +R+T   + ENGV +G         GFY   Y+S+YVL QCE
Subjt:  ADSLC------GRTIAARVQLSGCYLLYEFPGFVQISGFEMLYKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGH--------GFYTTNYQSLYVLAQCE

Query:  GDLGDSDCGECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLF
        G LG+SDCGECVK   +KA+ ECG S SGQVYL KCF+SYSYY +GVP  +  P S                  Q+T +T+A+ +GG   +GF+++CLL 
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Query:  IRNLKKKHDGMLDS
        +R+  KK     D+
Subjt:  IRNLKKKHDGMLDS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04520.1 plasmodesmata-located protein 25.1e-11671.1Show/hide
Query:  SFFFFFFSFLLFISYLACLVESG-SDYTTLVYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGTTQTAITGLFQCRGDLSNSDCYNCVS
        SF        L    L  +V+S  ++YTTL+YKGCA+Q FSDP+G+YSQAL+A+FGSLVSQS K ++F+KTT+GT+ T ITGLFQCRGDLSN DCYNCVS
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Query:  KLPELADSLCGRTIAARVQLSGCYLLYEFPGFVQISGFEMLYKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLAQCEGDLGDSDCG
        +LP L+D LCG+TIA+RVQLSGCYLLYE  GF QISG EML+KTCG  NIAG+GFEERRDT   V++NGVVSGHGFY T Y+S+YVL QCEGD+GD+DC 
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Query:  ECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRNL-KKKH
         CVK+A++KAQVECGSSISGQ+YLHKCFI+YSYYPNGVP+RSSS SSSSSSSSS S +S PS     TGKTVA+I+GGAAGVGFLVICLLF +NL +KKH
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Query:  D
        D
Subjt:  D

AT2G33330.1 plasmodesmata-located protein 31.2e-10966.02Show/hide
Query:  MGFHSKPFSFFFFFFSFLLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGTT-QTAITGLFQCRGDLSN
        MGF+S       +     LF S L     S  +YT L+YKGCA+Q  SDP+G+YSQAL+A++G LV+QS K ++F+KTT+GTT QT++TGLFQCRGDLSN
Subjt:  MGFHSKPFSFFFFFFSFLLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGTT-QTAITGLFQCRGDLSN

Query:  SDCYNCVSKLPELADSLCGRTIAARVQLSGCYLLYEFPGFVQISGFEMLYKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLAQCEG
        +DCYNCVS+LP L+  LCG+TIAARVQLSGCYLLYE  GF QISG E+L+KTCG  N+AG+GFE+RRDT   V++NGVV GHGFY T Y+S+YVL QCEG
Subjt:  SDCYNCVSKLPELADSLCGRTIAARVQLSGCYLLYEFPGFVQISGFEMLYKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLAQCEG

Query:  DLGDSDCGECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFI
        D+GDSDC  C+K+A+Q+AQVECGSSISGQ+YLHKCF+ YS+YPNGVPKRSS   SS SS SSSS SSS +     TGKTVA+I+GG AGVGFLVICLLF+
Subjt:  DLGDSDCGECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFI

Query:  RNL-KKKHD
        +NL KKK+D
Subjt:  RNL-KKKHD

AT3G04370.1 plasmodesmata-located protein 42.5e-4636.45Show/hide
Query:  LLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGC--------AKQGFSDPN------GVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGTTQTAITGLFQCRGDLSNSDCY
        L+ +S  + +  S  DY TLV+K C         K     PN       + +QAL++    L S+S++ SKF KT  G  + A++G FQCR D  +  C+
Subjt:  LLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGC--------AKQGFSDPN------GVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGTTQTAITGLFQCRGDLSNSDCY

Query:  NCVSKLPELADSLCGRTIAARVQLSGCYLLYEF-----PGFVQISG------FE-----MLYKTC-GATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTT
         CV  L E++   CG   +AR+ L GC+L+Y+F     PG  Q++       FE     +++K C GAT     GFEE R   L+  E GVV GHGFY  
Subjt:  NCVSKLPELADSLCGRTIAARVQLSGCYLLYEF-----PGFVQISG------FE-----MLYKTC-GATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTT

Query:  NYQSLYVLAQCEGDLGDSDCGECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGA
        +Y+ L+V+AQC+G +   DCGEC+  A   A  EC  SI+GQ+YL  C + Y+Y+P+ +P              + SY     G   NTGK++A+++GG 
Subjt:  NYQSLYVLAQCEGDLGDSDCGECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGA

Query:  AGVGFLVICLLFIRNLKKKHD
        A + F+ I  +F+++L+KK D
Subjt:  AGVGFLVICLLFIRNLKKKHD

AT3G04370.2 plasmodesmata-located protein 43.2e-4636.36Show/hide
Query:  LLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGC--------AKQGFSDPN------GVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGTTQTAITGLFQCRGDLSNSDCY
        L+ +S  + +  S  DY TLV+K C         K     PN       + +QAL++    L S+S++ SKF KT  G  + A++G FQCR D  +  C+
Subjt:  LLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGC--------AKQGFSDPN------GVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGTTQTAITGLFQCRGDLSNSDCY

Query:  NCVSKLPELADSLCGRTIAARVQLSGCYLLYEF-----PGFV----QISGFE-----MLYKTC-GATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNY
         CV  L E++   CG   +AR+ L GC+L+Y+F     PG +    +   FE     +++K C GAT     GFEE R   L+  E GVV GHGFY  +Y
Subjt:  NCVSKLPELADSLCGRTIAARVQLSGCYLLYEF-----PGFV----QISGFE-----MLYKTC-GATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNY

Query:  QSLYVLAQCEGDLGDSDCGECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAG
        + L+V+AQC+G +   DCGEC+  A   A  EC  SI+GQ+YL  C + Y+Y+P+ +P              + SY     G   NTGK++A+++GG A 
Subjt:  QSLYVLAQCEGDLGDSDCGECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAG

Query:  VGFLVICLLFIRNLKKKHD
        + F+ I  +F+++L+KK D
Subjt:  VGFLVICLLFIRNLKKKHD

AT5G43980.1 plasmodesmata-located protein 12.5e-7046.82Show/hide
Query:  FFSFLLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGT-TQTAITGLFQCRGDLSNSDCYNCVSKLPEL
        FF F  F+ + A  +    DY  L++KGCA Q   DP GV+SQ L  LF SLVSQS++ S F   TSGT   TA+ G+FQCRGDL N+ CY+CVSK+P+L
Subjt:  FFSFLLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGT-TQTAITGLFQCRGDLSNSDCYNCVSKLPEL

Query:  ADSLC------GRTIAARVQLSGCYLLYEFPGFVQISGFEMLYKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGH--------GFYTTNYQSLYVLAQCE
           LC      G  +AARV L+GCY+ YE  GF Q SG EML++ CG  +    GF  +R+T   + ENGV +G         GFY   Y+S+YVL QCE
Subjt:  ADSLC------GRTIAARVQLSGCYLLYEFPGFVQISGFEMLYKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGH--------GFYTTNYQSLYVLAQCE

Query:  GDLGDSDCGECVKHAVQKAQVECGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLF
        G LG+SDCGECVK   +KA+ ECG S SGQVYL KCF+SYSYY +GVP  +  P S                  Q+T +T+A+ +GG   +GF+++CLL 
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Query:  IRNLKKKHDGMLDS
        +R+  KK     D+
Subjt:  IRNLKKKHDGMLDS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTTTCACTCCAAACCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCCTTCTGTTTATTAGTTATCTCGCTTGTTTGGTTGAATCTGGTTCTGATTACACCACATT
GGTCTACAAAGGTTGCGCCAAACAAGGATTCTCAGATCCAAATGGCGTTTACTCACAAGCCCTGGCTGCCTTGTTTGGCTCTTTAGTTTCACAATCCGCCAAAGGCTCAA
AGTTCTTCAAAACTACCTCCGGCACCACCCAAACCGCCATCACCGGCCTCTTCCAATGCCGAGGGGATCTCAGCAACTCCGATTGCTATAACTGTGTAAGTAAGCTGCCG
GAATTGGCCGATAGTCTGTGTGGCAGAACTATTGCCGCTAGAGTTCAGCTCTCAGGCTGCTATTTGCTGTATGAGTTTCCTGGGTTTGTTCAGATTTCAGGGTTTGAAAT
GCTGTATAAAACTTGTGGGGCTACGAACATTGCTGGAAGTGGGTTTGAGGAGAGGAGAGACACGGGTTTGTCTGTGTTGGAGAATGGAGTGGTGAGTGGCCATGGATTTT
ACACTACTAACTATCAATCTCTGTATGTGTTGGCTCAATGTGAGGGAGATTTAGGGGATTCAGATTGTGGTGAGTGTGTGAAGCATGCTGTGCAGAAAGCTCAGGTTGAA
TGTGGAAGCTCAATTTCAGGGCAAGTTTATTTGCATAAGTGCTTTATCAGCTACAGTTATTACCCAAATGGGGTTCCAAAGAGATCGTCTTCTCCTTCATCTTCTTCATC
TTCTTCTTCATCATCATCATACTCTTCATCACCATCAGGGATGGGGCAAAACACAGGGAAGACAGTGGCTGTGATATTAGGAGGTGCAGCAGGAGTGGGATTTCTGGTCA
TTTGCTTGCTTTTCATTAGAAATTTGAAGAAGAAACATGATGGTATGCTTGATTCAACTTTCTACCATTTTTGTTACCAAAACTTACATTCATTAATTGAGTTCATCTTC
TACCTGCAGATTATTGATACAGGGGAAAGAGTGAATGTTGTTCTATTGAGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGGAAACAAACACTCTTGTCTTTCTACAATTAGATTCCCTTTGCCATTTATTACCATCCAAAATCACAGCTCTTCCTTAATCAAACACCCAAAATTCTGTATTTTAATTC
TACATTTTGTTCTTATTCTCCATGGAGACCTTAAAACTTCATTATTTTAATGGTGGTTGGTTTCACTGTTTCACCATCTCAATAAAAATGGCATTTCCCCCCACTTTTTT
CTTTCCTTCTCCCCAAGTTTCAGTTTCTCAGTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGGTGGGGACTGAAAGTGGAAAAAAGATTCCCCTCTCTCCATCT
GCACATTTTACAGAGAGAGGTAAGCTTTGGAATGAACTAAACCTCCATTTTCACAAGAAACCAAAGTTGTAAACTAACTGCATTCCCATTTTTCATCAGATTAAACCAAA
ACCCATCTCTCAAATCCAATCCAATCGTCCAATGAAATCCAAATCTCCCCATGATTTGAAGCATTAAAGACGAAACCCCAGATGGGTTTTCACTCCAAACCCTTCTCCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCCTTCTGTTTATTAGTTATCTCGCTTGTTTGGTTGAATCTGGTTCTGATTACACCACATTGGTCTACAAAGGTTGCGCCAAACAAGGAT
TCTCAGATCCAAATGGCGTTTACTCACAAGCCCTGGCTGCCTTGTTTGGCTCTTTAGTTTCACAATCCGCCAAAGGCTCAAAGTTCTTCAAAACTACCTCCGGCACCACC
CAAACCGCCATCACCGGCCTCTTCCAATGCCGAGGGGATCTCAGCAACTCCGATTGCTATAACTGTGTAAGTAAGCTGCCGGAATTGGCCGATAGTCTGTGTGGCAGAAC
TATTGCCGCTAGAGTTCAGCTCTCAGGCTGCTATTTGCTGTATGAGTTTCCTGGGTTTGTTCAGATTTCAGGGTTTGAAATGCTGTATAAAACTTGTGGGGCTACGAACA
TTGCTGGAAGTGGGTTTGAGGAGAGGAGAGACACGGGTTTGTCTGTGTTGGAGAATGGAGTGGTGAGTGGCCATGGATTTTACACTACTAACTATCAATCTCTGTATGTG
TTGGCTCAATGTGAGGGAGATTTAGGGGATTCAGATTGTGGTGAGTGTGTGAAGCATGCTGTGCAGAAAGCTCAGGTTGAATGTGGAAGCTCAATTTCAGGGCAAGTTTA
TTTGCATAAGTGCTTTATCAGCTACAGTTATTACCCAAATGGGGTTCCAAAGAGATCGTCTTCTCCTTCATCTTCTTCATCTTCTTCTTCATCATCATCATACTCTTCAT
CACCATCAGGGATGGGGCAAAACACAGGGAAGACAGTGGCTGTGATATTAGGAGGTGCAGCAGGAGTGGGATTTCTGGTCATTTGCTTGCTTTTCATTAGAAATTTGAAG
AAGAAACATGATGGTATGCTTGATTCAACTTTCTACCATTTTTGTTACCAAAACTTACATTCATTAATTGAGTTCATCTTCTACCTGCAGATTATTGATACAGGGGAAAG
AGTGAATGTTGTTCTATTGAGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGFHSKPFSFFFFFFSFLLFISYLACLVESGSDYTTLVYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSKFFKTTSGTTQTAITGLFQCRGDLSNSDCYNCVSKLP
ELADSLCGRTIAARVQLSGCYLLYEFPGFVQISGFEMLYKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLAQCEGDLGDSDCGECVKHAVQKAQVE
CGSSISGQVYLHKCFISYSYYPNGVPKRSSSPSSSSSSSSSSSYSSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRNLKKKHDGMLDSTFYHFCYQNLHSLIEFIF
YLQIIDTGERVNVVLLR