; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G013070 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G013070
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionAAI domain-containing protein
Genome locationchr09:20935322..20937242
RNA-Seq ExpressionLsi09G013070
SyntenyLsi09G013070
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR016140 - Bifunctional inhibitor/plant lipid transfer protein/seed storage helical domain
IPR036312 - Bifunctional inhibitor/plant lipid transfer protein/seed storage helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646089.1 hypothetical protein Csa_016891 [Cucumis sativus]6.0e-7282.86Show/hide
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XP_004139815.1 uncharacterized protein LOC101210174 [Cucumis sativus]1.1e-7682.01Show/hide
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XP_008447162.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489679 [Cucumis melo]1.8e-7683.07Show/hide
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XP_022959376.1 uncharacterized protein LOC111460365 [Cucurbita moschata]6.0e-7272.52Show/hide
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         CPL+  +G + E NSSLDS+C+AS++LPPLQSS+IP IQEPDS PA+EN TP P    PPS  V+P     PADE PPSPSSATAK FS  +DCIG F 
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        +GSLFL +    LE F   LCI
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XP_038874252.1 non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 25 [Benincasa hispida]4.9e-9084.68Show/hide
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        SLFL +I SILEQ F  LCIAV
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7D4 AAI domain-containing protein7.9e-7084.43Show/hide
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A0A1S3BHM9 uncharacterized protein LOC1034896798.7e-7783.07Show/hide
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        MAVV MSPP GCTTRELLLLSPCLPFISAPPNNLSDTVPS CC+AFSSAY +GGGICLCYFLREPQILGFPLNRTKLIALSSFCP N ENGMY EKNSSL
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A0A5D3D2B0 Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 2-like8.7e-7783.07Show/hide
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A0A6J1CD91 uncharacterized protein LOC1110096742.4e-6673.43Show/hide
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        MAAII VV       +SLIAFLT SM+VV M   SP TGCTTRELLLLSPCLPFISAPPNNLSDTVPSACC+AFSSAY S GGICLCYFLREPQILGFPL
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        N +KLIALSS CPL   +G+  E +SSL+S+CAASQ+LPPLQS++IP I+EPDSP  D++ TP+P TGL  PPSA V+PSAPADE PPSPSSATAK    
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Query:  GKDCIGF
         KDCIGF
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A0A6J1H4P5 uncharacterized protein LOC1114603652.9e-7272.52Show/hide
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        MA  ISV+ SLIA LT SMA+V MSPPTGCTTRELLLLSPCLPFISAPPNNLSD+VPS+CCEAFSSAYGSGGGICLCYFLR+PQILGFPLN TKLIALSS
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Query:  FCPLNGENGMYFEKNSSLDSVCAASQSLPPLQSSRIPRIQEPDSPPADENSTPSPDTGLPPSATVTP---SAPADESPPSPSSATAKRFSFGKDCIGFFF
         CPL+  +G + E NSSLDS+C+AS++LPPLQSS+IP IQEPDS PA+EN TP P    PPS  V+P     PADE PPSPSSATAK FS  +DCIG F 
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Query:  SGSLFLFYILSILEQFFYTLCI
        +GSLFL +    LE F   LCI
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JIG1 Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 252.2e-2135.91Show/hide
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        I+++  S  + +T +    + SPP    T EL++ SPCLP++S+PPNN+S+T    CC  F+S+  S  G CLCY LR+P ILGFPL+R++LI+LS  C 
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Query:  LNGENGMYFEKNS--SLDSVCAASQS--LPPLQSSRIPR--------IQEPDSPPADENSTPSPDTGLPPSATVTPSAPADESPPSPSSATAKRFSFGKD
                 ++NS  S +S+C+ S+S  LPPLQS +              P S       +PS D   P +AT+ P       PP P     + FS    
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Query:  CI-GFFFSGSLFLFYILSIL
         I  F+F  ++ + +  SIL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G14805.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein1.6e-2235.91Show/hide
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        I+++  S  + +T +    + SPP    T EL++ SPCLP++S+PPNN+S+T    CC  F+S+  S  G CLCY LR+P ILGFPL+R++LI+LS  C 
Subjt:  IISVVISLIAFLTPSMAVVTMSPPTGCTTRELLLLSPCLPFISAPPNNLSDTVPSACCEAFSSAYGSGGGICLCYFLREPQILGFPLNRTKLIALSSFCP

Query:  LNGENGMYFEKNS--SLDSVCAASQS--LPPLQSSRIPR--------IQEPDSPPADENSTPSPDTGLPPSATVTPSAPADESPPSPSSATAKRFSFGKD
                 ++NS  S +S+C+ S+S  LPPLQS +              P S       +PS D   P +AT+ P       PP P     + FS    
Subjt:  LNGENGMYFEKNS--SLDSVCAASQS--LPPLQSSRIPR--------IQEPDSPPADENSTPSPDTGLPPSATVTPSAPADESPPSPSSATAKRFSFGKD

Query:  CI-GFFFSGSLFLFYILSIL
         I  F+F  ++ + +  SIL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCGATAATTAGCGTCGTCATATCGTTAATCGCATTTCTCACGCCGTCGATGGCGGTGGTTACGATGTCGCCGCCAACGGGATGCACCACCAGAGAGCTGCTCTT
GCTCTCGCCATGTCTGCCTTTCATCTCTGCTCCGCCGAACAATCTTTCCGATACAGTTCCCTCGGCGTGTTGTGAGGCGTTCTCCTCCGCTTACGGTTCCGGCGGCGGGA
TTTGCCTCTGTTATTTTCTTCGTGAGCCTCAGATTTTGGGCTTTCCGTTGAATCGTACGAAGCTGATCGCTCTGTCTTCGTTTTGTCCTCTCAATGGTGAAAATGGAATG
TATTTCGAGAAGAATAGTTCTCTTGATTCTGTCTGTGCTGCTTCACAATCTCTGCCTCCTCTTCAAAGCTCGAGGATTCCCAGAATCCAAGAGCCGGATAGTCCTCCCGC
TGACGAGAATAGTACACCATCTCCTGATACGGGCTTACCACCATCTGCAACCGTAACACCATCAGCACCTGCAGATGAATCGCCGCCGTCTCCATCATCTGCTACAGCTA
AACGCTTTTCATTCGGCAAAGATTGTATTGGTTTTTTCTTTTCAGGTTCACTCTTCCTTTTCTACATTTTGTCCATTTTGGAGCAGTTTTTTTATACCCTTTGTATCGCA
GTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIISVVISLIAFLTPSMAVVTMSPPTGCTTRELLLLSPCLPFISAPPNNLSDTVPSACCEAFSSAYGSGGGICLCYFLREPQILGFPLNRTKLIALSSFCPLNGENGM
YFEKNSSLDSVCAASQSLPPLQSSRIPRIQEPDSPPADENSTPSPDTGLPPSATVTPSAPADESPPSPSSATAKRFSFGKDCIGFFFSGSLFLFYILSILEQFFYTLCIA
V