; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G014840 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G014840
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionouter envelope pore protein 16-2, chloroplastic
Genome locationchr09:22893224..22895675
RNA-Seq ExpressionLsi09G014840
SyntenyLsi09G014840
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK02947.1 outer envelope pore protein 16-2 [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-5782.05Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWG-----------------------LAAGVYSGLTYGL
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSN+V PPELSSIRK+RFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWG                       LAAGVYSGLTYGL
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWG-----------------------LAAGVYSGLTYGL

Query:  KEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        KEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTS+ESSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  KEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

XP_008458360.1 PREDICTED: outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic [Cucumis melo]1.2e-6196.24Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSN+V PPELSSIRK+RFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV

Query:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        ALTS+ESSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

XP_011657265.1 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic [Cucumis sativus]1.5e-5993.23Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSN   PPELSS+RK+RFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV

Query:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        ALT+++SSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

XP_023514075.1 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.8e-5588.72Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
        IGALQSVSREAYFTVAGS+DS+N  PPELSS RK+  PGLKGETNKESLEAMVKSVG+ESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV

Query:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        AL S++SSHE IVQ AITGAAVS AANIFAGIF
Subjt:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

XP_038875334.1 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic [Benincasa hispida]2.7e-6195.49Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSN+V PPEL+SIRK+RFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGA+TGVAV
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV

Query:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        ALTS+ESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
Subjt:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCC7 Uncharacterized protein7.1e-6093.23Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSN   PPELSS+RK+RFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV

Query:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        ALT+++SSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

A0A1S3C7N2 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic5.8e-6296.24Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSN+V PPELSSIRK+RFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV

Query:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        ALTS+ESSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

A0A5D3BTY5 Outer envelope pore protein 16-25.1e-5882.05Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWG-----------------------LAAGVYSGLTYGL
        IGALQSVSREAYFTVAGSVDSN+V PPELSSIRK+RFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWG                       LAAGVYSGLTYGL
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWG-----------------------LAAGVYSGLTYGL

Query:  KEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        KEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTS+ESSHEHIVQYAITGAA+STAANIFAGIF
Subjt:  KEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

A0A6J1EQH2 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic-like isoform X12.9e-5386.47Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
        IGALQSVSREAYFTVAGS+DS+N   PEL   RK+  PGLKGETNKESLEAMVKSVG+ESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV

Query:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        AL S++SSHE IVQ AITGAAVS AANIFAGIF
Subjt:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

A0A6J1KKF2 outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic-like isoform X13.4e-5487.97Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
        IGALQSVSREAYFTVAGS+DS+N  P ELSS RK+  PGLKGETNKESLEAMVKSVG+ESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAV

Query:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        AL S++SSHE IVQ AITGAAVS AANIFAGIF
Subjt:  ALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0WMZ5 Outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic4.6e-4063.04Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTV--AGSVDSNNVAPP-ELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVT
        +GALQ+VSREAYFTV      DSNNV PP E++  +K RFP L+GE++K SL+A+VK+ GKES+QWGLAAG+YSG+TYG+ E R GAHDW+NSA+AGA+T
Subjt:  IGALQSVSREAYFTV--AGSVDSNNVAPP-ELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVT

Query:  GVAVAL-TSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        G A+A+ TSE +SHE +VQ A+TGAA+STAAN+ + +F
Subjt:  GVAVAL-TSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

Q41050 Outer envelope pore protein 16, chloroplastic1.2e-1144.19Show/hide
Query:  KGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAA
        KG  +    E  +K + KE   WG  AGVY G+ YG++  RG  DWKN+   GAVTG  V+  S  +  + I   AITGAA++TAA
Subjt:  KGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAA

Q9LZH8 Outer envelope pore protein 16-4, chloroplastic1.4e-0436.84Show/hide
Query:  MVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAAN
        + KS+G+   Q GL +GV++    GL+  RG +DW N+ + GAV G AVA+++   +   +V  A   +A S  AN
Subjt:  MVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAAN

Q9ZV24 Outer envelope pore protein 16-1, chloroplastic2.0e-1141.86Show/hide
Query:  KGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAA
        KG  +K +LE  +K + KE + WG A GVY G  YG++  RG+ DWKN+ +AGA TG  ++   ++   + IV  AI G A++TA+
Subjt:  KGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G28900.1 outer plastid envelope protein 16-11.4e-1241.86Show/hide
Query:  KGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAA
        KG  +K +LE  +K + KE + WG A GVY G  YG++  RG+ DWKN+ +AGA TG  ++   ++   + IV  AI G A++TA+
Subjt:  KGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAA

AT3G62880.1 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein9.9e-0636.84Show/hide
Query:  MVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAAN
        + KS+G+   Q GL +GV++    GL+  RG +DW N+ + GAV G AVA+++   +   +V  A   +A S  AN
Subjt:  MVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAAN

AT3G62880.2 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein9.9e-0636.84Show/hide
Query:  MVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAAN
        + KS+G+   Q GL +GV++    GL+  RG +DW N+ + GAV G AVA+++   +   +V  A   +A S  AN
Subjt:  MVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAAN

AT4G16160.1 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein1.3e-4263.97Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPP-ELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVTGV
        +GALQ+VSREAYFTV    DSNNV PP E++  +K RFP L+GE++K SL+A+VK+ GKES+QWGLAAG+YSG+TYG+ E R GAHDW+NSA+AGA+TG 
Subjt:  IGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPP-ELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVTGV

Query:  AVAL-TSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        A+A+ TSE +SHE +VQ A+TGAA+STAAN+ + +F
Subjt:  AVAL-TSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF

AT4G16160.2 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein3.3e-4163.04Show/hide
Query:  IGALQSVSREAYFTV--AGSVDSNNVAPP-ELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVT
        +GALQ+VSREAYFTV      DSNNV PP E++  +K RFP L+GE++K SL+A+VK+ GKES+QWGLAAG+YSG+TYG+ E R GAHDW+NSA+AGA+T
Subjt:  IGALQSVSREAYFTV--AGSVDSNNVAPP-ELSSIRKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEAR-GAHDWKNSAIAGAVT

Query:  GVAVAL-TSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF
        G A+A+ TSE +SHE +VQ A+TGAA+STAAN+ + +F
Subjt:  GVAVAL-TSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGAACGTTATTTCTCACTGACTTTAGCAATCAAATAGACTGCACTGCAGATTTCGGAGTTCATTCTCTGATTCCATACAGGATCTCGAAGAAGAAATGGGCAGTAGA
AGCCTTGAGAATCGTTCATTGGTTGATGAAATCCGATGCTCCCATGGCGGAAGCTTCTTGTACGACCTTGGCCATCCTCTTCTCAATCGCGTTGCTGATAGCTTCGTCAA
GGCCGCTGGGGTTCATAGGTGCATTGCAATCTGTGTCTCGCGAGGCTTATTTTACGGTTGCAGGAAGTGTTGATTCGAACAATGTCGCACCGCCTGAATTATCGAGTATT
AGAAAGAAACGTTTTCCAGGTCTTAAAGGTGAAACCAACAAAGAGTCTCTTGAAGCCATGGTGAAGAGTGTGGGGAAAGAATCTATCCAGTGGGGATTAGCTGCTGGTGT
TTACTCTGGCCTCACGTACGGTTTAAAGGAGGCTCGTGGAGCACATGACTGGAAGAATAGTGCAATTGCAGGTGCCGTGACAGGCGTAGCTGTGGCGCTTACATCGGAAG
AGTCTTCTCACGAGCATATCGTACAATATGCCATCACCGGTGCTGCTGTGTCGACGGCTGCAAATATTTTTGCTGGCATATTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGAACGTTATTTCTCACTGACTTTAGCAATCAAATAGACTGCACTGCAGATTTCGGAGTTCATTCTCTGATTCCATACAGGATCTCGAAGAAGAAATGGGCAGTAGA
AGCCTTGAGAATCGTTCATTGGTTGATGAAATCCGATGCTCCCATGGCGGAAGCTTCTTGTACGACCTTGGCCATCCTCTTCTCAATCGCGTTGCTGATAGCTTCGTCAA
GGCCGCTGGGGTTCATAGGTGCATTGCAATCTGTGTCTCGCGAGGCTTATTTTACGGTTGCAGGAAGTGTTGATTCGAACAATGTCGCACCGCCTGAATTATCGAGTATT
AGAAAGAAACGTTTTCCAGGTCTTAAAGGTGAAACCAACAAAGAGTCTCTTGAAGCCATGGTGAAGAGTGTGGGGAAAGAATCTATCCAGTGGGGATTAGCTGCTGGTGT
TTACTCTGGCCTCACGTACGGTTTAAAGGAGGCTCGTGGAGCACATGACTGGAAGAATAGTGCAATTGCAGGTGCCGTGACAGGCGTAGCTGTGGCGCTTACATCGGAAG
AGTCTTCTCACGAGCATATCGTACAATATGCCATCACCGGTGCTGCTGTGTCGACGGCTGCAAATATTTTTGCTGGCATATTTTAGGCTCACCAGTATTAGGAGAGGTAT
GTGTATGGCCACAGTAGCCATTTCACAAAATCCGGGATGTTCGTCTTCTTATGTTCATTCTGTCTTTAATTAAGATGACTATGATGCTTCCTTCTCTTTTGGATTTTTTG
TTTAATATTAAGTTGTTCCTCTGATGCTTCATTCCCGTGCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRTLFLTDFSNQIDCTADFGVHSLIPYRISKKKWAVEALRIVHWLMKSDAPMAEASCTTLAILFSIALLIASSRPLGFIGALQSVSREAYFTVAGSVDSNNVAPPELSSI
RKKRFPGLKGETNKESLEAMVKSVGKESIQWGLAAGVYSGLTYGLKEARGAHDWKNSAIAGAVTGVAVALTSEESSHEHIVQYAITGAAVSTAANIFAGIF