CuGenDBv2

Gene ID	Lsi09G016390
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	nuclear pore complex protein NUP62
Genome location	chr09:24692733..24718313
RNA-Seq Expression	Lsi09G016390
Synteny	Lsi09G016390
Gene Ontology terms	GO:0006405 - RNA export from nucleus (biological process) GO:0006606 - protein import into nucleus (biological process) GO:0044613 - nuclear pore central transport channel (cellular component) GO:0005543 - phospholipid binding (molecular function) GO:0017056 - structural constituent of nuclear pore (molecular function)
InterPro domains	IPR007758 - Nucleoporin, NSP1-like, C-terminal IPR025574 - Nucleoporin FG repeat IPR026010 - Nucleoporin NSP1/NUP62

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6575234.1 Nuclear pore complex protein NUP62, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.9e-270

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         PSSG+S +PSFGA P              SSGSSS+P FGAAPSAG SAPSLFGGVSS ATTSSAPLFGTSA T SPGS++FGAS AA+ +SSS     
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XP_008459731.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo]

9.9e-271

84.9

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            SSSVS SNLFASS SS   SPFQ+SLSSSSSQNL+SSSPFAA S SGFSF T++LSKTT++T    ++SSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSS
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        FGFSINNAASTGGSSAPS+TATKPTSLS S +VAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAA SAPSA+SSG VSSFTGFGVTS+
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        ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAE
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XP_022959228.1 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata]

1.1e-272

83.08

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        GASS S  S SSLF  SSSSGGL+SFGFG SSSSG SSA  FGAA +SGSS  P FGAAS+SG+S APLFG+A SSGSS               APLFG+
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        FSI+NAASTGGSSAP +TA KPTSLSFST+VAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAA S PS +SSGA SSFTGFGVTSTA+
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        QERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYI
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XP_023548092.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

8.9e-272

82.38

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        G SS S  S SSLF  SSSSGGL+SFGFG SSSSG SSA  FGAA +SGSS  P FGAAS+SG+S APLFG+A SSGSS               APLFG+
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         PSSG+S +PSFGA P              SSGSSS+P FGAAPSAGASAPSLFGGVSS ATTSSAPLFGTSA T SPGS++FGASAAA+ +SSS     
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        KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEA
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XP_038874708.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida]

1.4e-272

83.87

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        MSG   GSSSSQ SSSSSPFSS+TGFSFGSTSAFSFGS   SS+PLSLSSSSS NPTSSSSPFSNQT NPASSSS GFGSSSFPSS SSPF FSL     
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                                                             P+FG+A SSG+SSAPLFG+ASSSGSS AP FG   SSG+SLVPSFGA
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        LPSSGSSS PLFGA PSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFG TSAST SPGSALFGAS  AAS SSS LFGTST+SGS+GS LFGSSPFGASSS+S SNL
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        FASSSSSTSTSPFQNS SSSSSQNL+SSS FAA   SSSSGFSFST SLSKTT++TTA SSSSLT+ASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSI+NAASTGG
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        SSAPS+TATKPTSLS S++VAPLFSTVTTTS STPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAA S PSASSSGAVSSFTGFGVTS ASSSSAIGSLSLP
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Query:  TKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA
        TKTSTAASSSQAP SFGFPSL S+ T ATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSS TTSTV+ATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KA27 Nsp1_C domain-containing protein

9.7e-240

68.78

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        MSGF FGSS+SQ  SSSPFSS TGFSFGST+ FSFGSS +  S LS SSSSS NPTSSSSPF N TSNP SSSSFGFGSSSF +STSSPF FSL +ASTG
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        ASSSS     ATSASSLFGVSSSS G  SFGFGASSSS N              SSAP+FGAASSSG+SS  LFGA    GS  AP FGA PSSG+S+ P
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        SFGAL SS G+SS PLFGAAPSAGA SAPSLFGG SSATTSSAPLFGTSAS  S GS LFGAS AAAS S   LFGT +TSSGS GS LFGSSPFGAS  
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Query:  ---SSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVT------------------------------------
           SS S SNLFA   SS STSPFQ++LSSSSSQNL+SSSPF A S SGFSF T SLSKTT++T                                    
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Query:  ----------------------------------------------------------------------------------------------------
                                                                                                            
Subjt:  ----------------------------------------------------------------------------------------------------

Query:  ---------------------------TASSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTT
                                   ++SSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSINNAASTGGSSAPS+TATKPTSL                
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Query:  SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATT
        SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAA SAPSA+SSGAVSSFTGFGVTS+ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP SFGFPSLAS+STAATT
Subjt:  SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATT

Query:  TSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVET
        TSGFSASSQSQTSS LVVASSSS TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVET
Subjt:  TSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVET

Query:  QAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRI
        QAELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRI
Subjt:  QAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRI

Query:  LNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
        LNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Subjt:  LNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS

A0A1S3CAD4 nuclear pore complex protein NUP62

4.8e-271

84.9

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Query:  MSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSL-SSSSSLNPTSSSSPFSNQTSN-PASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAAS
        MSGF FGSS+SQSSSSSPFSS TGFSFGST+ FSFGS   S+SPLSL SSSSS NPTSSSSPF N TSN P+SSSSFGFGSSSF SSTSSPF FSL +AS
Subjt:  MSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSL-SSSSSLNPTSSSSPFSNQTSN-PASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAAS

Query:  TGAS-----SSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSSAPLFGATPSSGTSL
        TGAS     SSSA SASSLFGVSSSS G  SFGFGASSSS N              SSAP+FGAASSSG+SSA LFGA    GSS AP FGA PSSG+S+
Subjt:  TGAS-----SSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSSAPLFGATPSSGTSL

Query:  VPSFGALPSS-GSSSTPLFGAAPSAGA-SAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTST-SSGSAGSTLFGSSPFGA-
         PSFGAL SS G+SS PLFGAAPSAGA SAPSLFGG SSATTSSAPLFGT+AS  S GSALFGAS A AS S + LFGTS  SSGS GS LFGSSPFGA 
Subjt:  VPSFGALPSS-GSSSTPLFGAAPSAGA-SAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTST-SSGSAGSTLFGSSPFGA-

Query:  ----SSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVT----TASSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSS
            SSSVS SNLFASS SS   SPFQ+SLSSSSSQNL+SSSPFAA S SGFSF T++LSKTT++T    ++SSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSS
Subjt:  ----SSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVT----TASSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSS

Query:  FGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTST
        FGFSINNAASTGGSSAPS+TATKPTSLS S +VAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAA SAPSA+SSG VSSFTGFGVTS+
Subjt:  FGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTST

Query:  ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA
        ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP SFGFPSLAS+STAATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSS TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA
Subjt:  ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA

Query:  ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAE
        ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAE
Subjt:  ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAE

Query:  YIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
        YIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
Subjt:  YIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS

A0A6J1DSI7 nuclear pore complex protein NUP62

9.8e-216

83.39

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Query:  FGAASSSGSSSAPLFGATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLF
        FGAA ++GSSS  +FGA PS  ++         S+GSSS  LFGAAPSAGASAPSLFGGVSSAT+SS PLFG+SA T +PGSAL GAS AA    S  LF
Subjt:  FGAASSSGSSSAPLFGATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLF

Query:  GTSTSSGSAGSTLFG----SSPFGASS-SVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSS--LTSA
        GT++SSGSAGS LFG    ++ FG+++   S+S LFASS SS STS FQNS SSSSSQ+LSSSSPFAASSSSGFSF TTSLSKTTN  TASSSS  LTSA
Subjt:  GTSTSSGSAGSTLFG----SSPFGASS-SVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSS--LTSA

Query:  STSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSA
        STSSSSFSFGTPASSASQSSFGFS +NAAST  S+AP +TATKPTSLSFST+VAPLFSTVTTTSASTP A+STTQPSFSVPAFS SSSAATT+S AA S 
Subjt:  STSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSA

Query:  PSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTP
        PSA+SSGA SSFTGFGVT+TASSSS I SLSLPTKT TAASSSQ P SFGFPSL S+STAATT+SGFSA SQSQTSSTLVVASSSS TTSTVSA VS+TP
Subjt:  PSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTP

Query:  KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDER
        KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE+KLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDER
Subjt:  KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDER

Query:  GLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL
        GLLLDDEAASTRD MYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+AAT+GPAADREL
Subjt:  GLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL

Query:  LGQKFWMS
        LGQKFWMS
Subjt:  LGQKFWMS

A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1

5.1e-273

83.08

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Query:  MSGFAFGSSSSQ-SSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSSPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAAST
        MSGF+FGSSSSQ SSSSSPFSS TGFSFGSTSAFSFG     SSPLSLSSSSS NP+SSSS FSNQTSNP SS+ FGF SSSFPSS SSPF FSLPAAST
Subjt:  MSGFAFGSSSSQ-SSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSSPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAAST

Query:  GASSSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSS--------------APLFGA
        GASS S  S SSLF  SSSSGGL+SFGFG SSSSG SSA  FGAA +SGSS  P FGAAS+SG+S APLFG+A SSGSS               APLFG+
Subjt:  GASSSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSS--------------APLFGA

Query:  TPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSS-ATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFGS
         PSSG+S +PSFGA PS+GSSS+P FGAAPSAG SAPSLFGGVSS ATTSSAPLFGTSA T SPGS++FGAS AA+ +SSS               LFGS
Subjt:  TPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSS-ATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFGS

Query:  SPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTA-SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFG
        +PF +SSSVS SNLF SSSSS ST+PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGFSFSTTSLSKTT++T A SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFG
Subjt:  SPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTA-SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFG

Query:  FSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTAS
        FSI+NAASTGGSSAP +TA KPTSLSFST+VAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAA S PS +SSGA SSFTGFGVTSTA+
Subjt:  FSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTAS

Query:  SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAEL
        SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAP SFGF SLA +STAATTTSG +ASSQSQTSSTLV+ASSSS TTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAEL
Subjt:  SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAEL

Query:  QERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYI
        QERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD MYEQAEYI
Subjt:  QERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYI

Query:  ERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
        ERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLGQKFWMS
Subjt:  ERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS

A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP62

1.4e-267

81.62

Show/hide

Query:  MSGFAFGSSSSQ-SSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSSPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAAST
        MSGF+FGSSSSQ SSSSSPFSS TGFSFGSTSAFSFG     SSPLSLSSSSS NP+SSSS FSNQTSNP SS+ FGF SSSFPSS SSPF FSLPAAST
Subjt:  MSGFAFGSSSSQ-SSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSSPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAAST

Query:  GASSSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSS--------------APLFGA
        GA  SS  S S+LF  SSSSGGL+SFGFG SSSSG SSA  FGAA +SGSS  P FGAAS+SG+S APLFG+A SSGSS               APLFG+
Subjt:  GASSSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSS--------------APLFGA

Query:  TPSSGTSLVPSFGALP--------------SSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSS-ATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGT
         PSSG+S +PSFGA P              SSGSSS+P FGAAPS G SAPSLFGGVSS ATTSSAPLFGTSA T SPGS++FGAS AAAS SSS LFG+
Subjt:  TPSSGTSLVPSFGALP--------------SSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSS-ATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGT

Query:  STSSGSAGSTLFGSSPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTA-SSSSLTSASTSSSSFS
        ++         F SS  G  SSVS SNLF SSSSS ST+PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGFSFSTTSLSKTT++T A SSSSLTSASTSSSSFS
Subjt:  STSSGSAGSTLFGSSPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTA-SSSSLTSASTSSSSFS

Query:  FGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGA
        FGTPASSASQSSFGF+I+NAAS  GSSAP +TA KPTSLSFST+VAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAA SAPSA+SSGA
Subjt:  FGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGA

Query:  VSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITG
         SSFTGFG+TSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAP SFGF SLAS+S AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSS TTSTVSATVS+TPKLPSEITG
Subjt:  VSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITG

Query:  KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEA
        KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEA
Subjt:  KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEA

Query:  ASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
        ASTRD MYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLGQKFWMS
Subjt:  ASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

G0SBQ3 Nucleoporin NSP1

2.3e-12

30.98

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Query:  SFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSSAPLF-GATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAP
        SF FG  S+SG S  S    A +SG       G   S+  SS P F   ++SG+ S  LF GAT    TSL  +  +   +G+ +T LFG + S+ +S P
Subjt:  SFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSSAPLF-GATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAP

Query:  SLFGGVS------------SATTSSAP-----LFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFGSSPFGASSSVSASNLF------
        SLFG  S            SA  SS P     LFG+  +TTS G++   ++  AA+A S  LFG++T++    ST   +  FG SS+ S S LF      
Subjt:  SLFGGVS------------SATTSSAP-----LFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFGSSPFGASSSVSASNLF------

Query:  ASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSSLTSAST--SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSA
        A+ +S + T+P +    S  S   + + P  A+ ++G  F   S   TT  +T +    TSA+T   SS+  FG   +  S ++      + A+T  +SA
Subjt:  ASSSSSTSTSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSSLTSAST--SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSA

Query:  PSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTT-SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATT------LSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGF--GVTSTASSSSAI
        P+ST       +  T+ AP  ST T+T +ASTPAA   T+P F   A +S+  ++TT       S    +  +A SS A S+  G     T+ A++SS  
Subjt:  PSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTT-SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATT------LSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGF--GVTSTASSSSAI

Query:  GSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLA---SSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSA-TVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ
         + S P+   +  +S+ AP S G P+     +S++A  TT+    S  S T+ST      +  TT+ + A TV    +LP  +  KT++EII  W  +L 
Subjt:  GSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLA---SSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSA-TVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ

Query:  ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRDGMYEQAE
        +   +F++QA  + EWDR +++N + + +L     +      E+E++L  +E+ Q+E+   L   E + + +Y  + G    ++AA     R+  Y+ AE
Subjt:  ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRDGMYEQAE

Query:  YIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATEG
         +  +L++M + +  +I+ +N      ++G + D      PL  +VR+LN  L+ L WID  A    +++   QK A + G
Subjt:  YIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATEG

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP62

1.9e-115

51.75

Show/hide

Query:  MSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSSPF-SNQTSNPASSS--SFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAA
        MSGF FG S          +S  GFSFGS+SA +  S+S+++SPLS S + S NP+S+   F S+ +S PASS+  SFGFG+SS PS     F F   A+
Subjt:  MSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSSPF-SNQTSNPASSS--SFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAA

Query:  STGASSSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAP-------VFGAASSSGSSSAPLFGA-ASSSGSSSAPLFGATPSS
        S+  S    +SAS      + +    SFGFG ++SS   + SLFG++ ++ SS+AP       V  +ASS+ + S+ LFGA ASS+ + S+  FGA P+S
Subjt:  STGASSSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAP-------VFGAASSSGSSSAPLFGA-ASSSGSSSAPLFGATPSS

Query:  GTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASAS-------SSPLFGTSTSSGSAGSTLF
        G++  P FG+ PS       LF A  SA AS  SLFG  SSA TS++PLFG  +S T    +   AS+A  S+S       SSP F  ++S+  +  ++F
Subjt:  GTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASAS-------SSPLFGTSTSSGSAGSTLF

Query:  ---GSSPFGASSSVSAS--NLFASSSSSTST---SPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSSLTSASTSSSSFSFGTP
           GSSPF  SSS + S  +LFASSSS  +T   SPF  ++ +SSS+ N S++S    S+S+GFSF  ++ S TT+ TT S+   T  ++SSSSFSFGT 
Subjt:  ---GSSPFGASSSVSAS--NLFASSSSSTST---SPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSSLTSASTSSSSFSFGTP

Query:  ASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSF
        A+S      GF++    STG S+AP+S +T     S +TT        TTTS+STPAA  T+ P+ S PA + +  +    S A  + P  +SS A  S 
Subjt:  ASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSF

Query:  TGFGVTSTASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKT
        TGFG+ S+  ++ +  S +     KTST ASSSQ   +   P+ + S  ++T+T+  + SS + T +TLVV SSS   TST  A V+ +PKLPSEITGKT
Subjt:  TGFGVTSTASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKT

Query:  VEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAS
        VEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKALQS+EE+AERIY DER  LLDDEAAS
Subjt:  VEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAS

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        TRD MYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A +G   DREL+  K WMS
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore

1.3e-116

51.75

Show/hide

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        MSGF FG S          +S  GFSFGS+SA +  S+S+++SPLS S + S NP+S+   F S+ +S PASS+  SFGFG+SS PS     F F   A+
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Query:  STGASSSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAP-------VFGAASSSGSSSAPLFGA-ASSSGSSSAPLFGATPSS
        S+  S    +SAS      + +    SFGFG ++SS   + SLFG++ ++ SS+AP       V  +ASS+ + S+ LFGA ASS+ + S+  FGA P+S
Subjt:  STGASSSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAP-------VFGAASSSGSSSAPLFGA-ASSSGSSSAPLFGATPSS

Query:  GTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASAS-------SSPLFGTSTSSGSAGSTLF
        G++  P FG+ PS       LF A  SA AS  SLFG  SSA TS++PLFG  +S T    +   AS+A  S+S       SSP F  ++S+  +  ++F
Subjt:  GTSLVPSFGALPSSGSSSTPLFGAAPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASAS-------SSPLFGTSTSSGSAGSTLF

Query:  ---GSSPFGASSSVSAS--NLFASSSSSTST---SPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSSLTSASTSSSSFSFGTP
           GSSPF  SSS + S  +LFASSSS  +T   SPF  ++ +SSS+ N S++S    S+S+GFSF  ++ S TT+ TT S+   T  ++SSSSFSFGT 
Subjt:  ---GSSPFGASSSVSAS--NLFASSSSSTST---SPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSSLTSASTSSSSFSFGTP

Query:  ASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSF
        A+S      GF++    STG S+AP+S +T     S +TT        TTTS+STPAA  T+ P+ S PA + +  +    S A  + P  +SS A  S 
Subjt:  ASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSF

Query:  TGFGVTSTASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKT
        TGFG+ S+  ++ +  S +     KTST ASSSQ   +   P+ + S  ++T+T+  + SS + T +TLVV SSS   TST  A V+ +PKLPSEITGKT
Subjt:  TGFGVTSTASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKT

Query:  VEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAS
        VEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKALQS+EE+AERIY DER  LLDDEAAS
Subjt:  VEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAS

Query:  TRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
        TRD MYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A +G   DREL+  K WMS
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Sequences

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CDS sequence

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ATGAATCTCTTCCGCCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGCCTTCGGATCGTCCTCCTCCCAATCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCAGCCACTGGTTTCTCATT
CGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTTCGGATCATCATCAGCATCATCATCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCTTCCTCCTTAAACCCTACCTCCTCTTCCTCTCCATTTTCCA
ATCAAACCTCCAATCCCGCTTCTTCCTCTTCTTTCGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCCTTCCCTTTCTCCCTCCCCGCCGCTTCCACTGGG
GCTTCTTCCTCTTCAGCAACTTCAGCTTCTTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAGGTGGATTGACTTCTTTCGGATTTGGGGCTTCATCTTCATCAGGGAACTCGTC
TGCGTCCTTGTTTGGGGCTGCTCTATCCTCTGGGAGCTCGTCTGCGCCCGTGTTTGGGGCGGCTTCGTCCTCTGGGAGCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGAGCGGCTTCGT
CCTCTGGGAGCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTACTCCCTCTTCTGGGACCTCACTTGTGCCCTCGTTTGGGGCTCTTCCGTCCTCTGGGAGCTCATCTACGCCCTTG
TTTGGGGCTGCTCCATCTGCCGGGGCCTCGGCTCCGTCCTTGTTTGGTGGGGTATCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCATCCACTACAAG
TCCGGGATCAGCGTTGTTTGGCGCTTCTGCTGCCGCGGCTTCTGCTTCTAGCTCCCCCCTGTTTGGGACATCTACATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAACTTTGTTTGGGT
CTAGTCCCTTCGGTGCATCTTCTTCGGTTTCCGCTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTCATCATCTACATCGACTTCTCCATTCCAGAACTCTCTTTCTTCGAGTTCTTCC
CAGAATTTGAGTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTTCATTTTCGACCACATCTTTGTCCAAAACTACTAATGTTACCACTGCATCTTCTTCTTC
TCTTACATCAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGCACACCTGCTTCGTCGGCATCTCAATCTTCTTTTGGGTTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAG
GGTCTTCTGCTCCGAGCAGTACAGCTACGAAGCCTACTTCTCTATCGTTTTCAACTACTGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCT
GCAAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCACCCTCCGCTCCCTCGGCTTCTTCTTC
GGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTCGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCAT
CCCAAGCACCAGGCTCTTTCGGTTTCCCTTCTCTGGCTTCCTCTTCCACTGCTGCTACCACTACGTCTGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAAACTTCATCAACTCTT
GTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGCTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTGTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATAAA
GGAATGGAATGCGGAGCTTCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGGAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATCCTCCTTAGAC
TTGAGATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGCTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCAAAGTGTGGAA
GAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAAGCTGCATCTACGAGGGATGGAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAACT
AGAGCAGATGACGGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAACCAGGGAGGAGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGTTAGATGCAGTTGTTCGAA
TTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCTGCTGCAGATCGTGAA
TTGTTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTGA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MNLFRRRSIEMSGFAFGSSSSQSSSSSPFSSATGFSFGSTSAFSFGSSSASSSPLSLSSSSSLNPTSSSSPFSNQTSNPASSSSFGFGSSSFPSSTSSPFPFSLPAASTG
ASSSSATSASSLFGVSSSSGGLTSFGFGASSSSGNSSASLFGAALSSGSSSAPVFGAASSSGSSSAPLFGAASSSGSSSAPLFGATPSSGTSLVPSFGALPSSGSSSTPL
FGAAPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTSASTTSPGSALFGASAAAASASSSPLFGTSTSSGSAGSTLFGSSPFGASSSVSASNLFASSSSSTSTSPFQNSLSSSSS
QNLSSSSPFAASSSSGFSFSTTSLSKTTNVTTASSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSINNAASTGGSSAPSSTATKPTSLSFSTTVAPLFSTVTTTSASTPA
ANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAAPSAPSASSSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPGSFGFPSLASSSTAATTTSGFSASSQSQTSSTL
VVASSSSATTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVE
EDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDGMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRE
LLGQKFWMS

Lsi09G016390 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome