; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G017500 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G017500
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionPollen Ole e 1 allergen and extensin family protein
Genome locationchr09:26161387..26163332
RNA-Seq ExpressionLsi09G017500
SyntenyLsi09G017500
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039837.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-19292.09Show/hide
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XP_004140544.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus]5.2e-19691.71Show/hide
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XP_008459888.1 PREDICTED: extensin [Cucumis melo]1.6e-19292.09Show/hide
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XP_023515622.1 formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-18283.73Show/hide
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XP_038906532.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida]3.4e-19594.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein2.5e-19691.71Show/hide
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A0A1S3CB81 extensin7.6e-19392.09Show/hide
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A0A5D3DMB9 Extensin7.6e-19392.09Show/hide
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A0A6J1GPH0 formin-2-like2.7e-18283.73Show/hide
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A0A6J1JLM5 extensin-like9.9e-17782.45Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 31.4e-0537.9Show/hide
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         P P PP PP++    PSPP PPPP   PPPPP     P  + P  PP   SPPPP SP P  +   R   P  PP   PPPP F P  P  +    PP 
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          S PP   P  P +  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein3.8e-3547.52Show/hide
Query:  ITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSTVCNVP
        IT++G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E + FS NRTT+++G+Y++ I S+D   C D  ++ S CQASLIG    S + CN+P
Subjt:  ITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSTVCNVP

Query:  GLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNK
        G RTT++++  KS+Q N C++  NAL++RP K++ +LCG K
Subjt:  GLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNK

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein9.7e-0737.9Show/hide
Query:  LSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLP----------PFPSFPLPPL---PPLPPLPPIPYFPLPTCP--------NPPS
        LS  P+      CG      P  +T         PP SLP P PP P          P P  P PP+   PP PP PP  Y P P  P        +PP 
Subjt:  LSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLP----------PFPSFPLPPL---PPLPPLPPIPYFPLPTCP--------NPPS

Query:  LPFPFPPLPPLF----PSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPF
         P P PP PP++    PSPP PPPP   PPPPP     P  + P  PP   SPPPP SP P  +   R   P  PP   PPPP F P  P  +    PP 
Subjt:  LPFPFPPLPPLF----PSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPF

Query:  SPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPP
          S PP   P  P +  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
Subjt:  SPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein3.9e-4844.48Show/hide
Query:  ISLLLLLFLTSFFTNFF-------GLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI
        + LL LLFL S  T+              +L   +RITVVG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE++  SVNRTT++ GVY+LEI
Subjt:  ISLLLLLFLTSFFTNFF-------GLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI

Query:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSST---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGN-------KKEKIPDPLTSSKFFLP
        P VDGI+CVDG+ + S C A ++ +SS     C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCGN       K EK+      SKFF P
Subjt:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSST---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGN-------KKEKIPDPLTSSKFFLP

Query:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPP
        +  PY  P+P+           P LPPLP LPP P FP       PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+P F P    P
Subjt:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPIPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein9.0e-3744.58Show/hide
Query:  LLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCV
        ++LLL L     N   L   +     +ITV+G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E + FS NRTT++ G+Y+L+I S++G+ C 
Subjt:  LLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCV

Query:  DGM---TMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG
              ++ + CQASLIG S   CNVPG RTT+E++  KSK  NLC++   AL++RP++KN  LCG
Subjt:  DGM---TMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTTTTTTAACATCTTTCTTCACTAACTTCTTTGGCCTAACAGCTGAAGCCCTAGCATCGGTCACTCGGAT
CACGGTAGTGGGTGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTATTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAG
TTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGAT
GGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATTGGAAGCTCATCTACAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAA
GCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGTGGGAATAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCATTGACCT
CCTCAAAGTTTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCTCCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTTCCTCCACTGCCTCCA
TTACCCCCTATTCCATATTTTCCTCTCCCTACTTGCCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCATTATTTCCTTCACCTCCAAGTCCACCTCC
GCCATCTGCACCACCTCCGCCGCCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTCCTCCATTTTCTCCTTCCCCGCCTCCACCATCGTCGCCACCTC
CATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATC
CCTCCATTTTCTCCCTCCCTACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCTGCATTCGACCTTAG
AGACCCCAGAACATGGATACCTCATTTCCCCCCATCCCCTCCACAGGGCCCTCAAAATCAAAAGCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGGGCACATTATATGCAAACAGTATATAGCAAACAAACGCTTGAAAATTTCAAGGCCTTACCCATTGATGCTTCTCTCACAACCTTCTCTTCTTCATTGAATGTTTCTTA
TGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTTTTTTAACATCTTTCTTCACTAACTTCTTTGGCCTAACAGCTGAAGCCCTAGCATCGGTCACTCGGATCACGGTAGTG
GGTGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTATTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAGTTGCTCCCAA
AATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACAA
TGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATTGGAAGCTCATCTACAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAAT
CTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGTGGGAATAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCATTGACCTCCTCAAAGTT
TTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCTCCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTTCCTCCACTGCCTCCATTACCCCCTA
TTCCATATTTTCCTCTCCCTACTTGCCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCATTATTTCCTTCACCTCCAAGTCCACCTCCGCCATCTGCA
CCACCTCCGCCGCCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTCCTCCATTTTCTCCTTCCCCGCCTCCACCATCGTCGCCACCTCCATTCAGTCT
CAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATCCCTCCATTTT
CTCCCTCCCTACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCTGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGA
ACATGGATACCTCATTTCCCCCCATCCCCTCCACAGGGCCCTCAAAATCAAAAGCCCTAATATTATGCTTTGTCTTCCCTCTTCTTTACCTCTACAAACTTCCTTTCAAT
ATCATATTGTTTGATGTGTGCTTATGTATTTTTCCGGTGCCCTGTCCATTCAGGCAAAACAACAAACACCTTGTGCGCCAAAATGTTGTTTCTAGCAAAAACCACTATAA
TTCATGTACAGAAAACAAAAGGGGATTTGTCTGTTTATATGATAAATCAAGAAGCTGGATATCATAAATGTATTATTTCATTAATCTTCAGATTTGTAAGAAAGTTTAGA
TTCTCAAGTCTTTAGTGAATGATGCGAAAAGGAAAAGAGAACAAGTAAAAGAAAGAAACCCTTAAGACTGTCCGTACCTTGCGCTTCCAGATAATACCACCGCAACGAAC
CAACGCCAAAGGAAAAAAAATGAGAGAAGGAATTGAATTGCCTTCTTCATTACAGAGTACCTTTTCTACCTAATTTGGACGGTGGCAATGGCGAATAATATCATTCACTT
CCCGTGTTTTTTTCTTTTCCTTCTTTTTCTGATTCTGATGCTTTTTTTTATGTGATGATTATAAGAAGAATCCAACATCCCAAACTAAATTCCCTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVD
GMTMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPP
LPPIPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHI
PPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP