; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi09G017610 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi09G017610
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationchr09:26339501..26341326
RNA-Seq ExpressionLsi09G017610
SyntenyLsi09G017610
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039848.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold122G001230 [Cucumis melo var. makuwa]2.7e-10395.52Show/hide
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KAG6576106.1 hypothetical protein SDJN03_26745, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.2e-8887.13Show/hide
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XP_004140554.1 uncharacterized protein LOC101221916 [Cucumis sativus]5.0e-10295.05Show/hide
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XP_016902460.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103498882 [Cucumis melo]2.8e-10095.92Show/hide
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XP_038906838.1 uncharacterized protein LOC120092736 [Benincasa hispida]4.6e-10396.06Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF89 Uncharacterized protein2.4e-10295.05Show/hide
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A0A1S4E3A8 uncharacterized protein LOC1034988821.3e-10095.92Show/hide
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A0A5A7TA84 Uncharacterized protein1.3e-10395.52Show/hide
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A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557801.7e-8786.63Show/hide
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A0A6J1JMX9 uncharacterized protein LOC1114883503.5e-8585.22Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein4.6e-2945.64Show/hide
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        MA +T+ LE+S +N SL  R               SS       SD+  H+P+      D  LEL+SH S+P   EQCLDLKTGE+YYR+  +GMRVKED
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)9.7e-3547.52Show/hide
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        M++P+M  +T+SLE+S  N SLN R         G             SS +E   P+      D  LELNSH+SLP  WEQCLDLKTGE+YY N + GM
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        RVKEDPR    A+  S D Y    SE++    D +ESSS+  S  S  +       ++   E  EDVLVVAGCK CFMYFMVPK VEDCPKC +++L+HF
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        DR
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AT2G33510.2 unknown protein1.0e-3144.24Show/hide
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        VEDCPKC +++L+HFDR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAGGTCTCCGTCGTCGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCGACGACGAACCTCATCTTCCTCTTCATCAACATAATCGCTTCGACACAATCTTGGAGCTCAACTCTCACA
TCTCCCTCCCTCCTTTCTGGGAACAATGCCTCGATTTGAAGACAGGGGAAGTCTACTACAGAAACTGCCGGACTGGAATGAGAGTAAAGGAAGATCCGAGGACAGCGGAA
GCACACAGCCGAGATTTATACTCGGAAGACGAAGACGACGACGGTGATGAGAGCTCGTCCGACGGCGGAAGTGAGGAGTCGTGTTCTTCGTCGTCGTACGGTGGTAGCAG
ACAGCAATATCCGGCGGAAAACGTGGAGGATGTGTTGGTGGTGGCCGGATGCAAGAGATGCTTCATGTATTTTATGGTGCCGAAACAGGTGGAAGATTGCCCCAAATGCA
GCAGCAGTCGTCTAGTTCATTTCGATCGCTCCGACGACAATAATGGCTTTCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATCCGACGACGATAACACACATTCTTTTCTTCTTCTTATTCTCATTCTTCCTTCCATTTCATCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCATCATCGAGATGAGATC
TCCCGATATGGCGGCGGTTACTGATTCTCTTGAGCAGTCTTTCCGTAACTTCTCCCTCAACCACCGTCTAGCCTCGGCTGCCCCTTCCTCCGCCGGAGTTCGGAGGTCTC
CGTCGTCGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCGACGACGAACCTCATCTTCCTCTTCATCAACATAATCGCTTCGACACAATCTTGGAGCTCAACTCTCACATCTCCCTC
CCTCCTTTCTGGGAACAATGCCTCGATTTGAAGACAGGGGAAGTCTACTACAGAAACTGCCGGACTGGAATGAGAGTAAAGGAAGATCCGAGGACAGCGGAAGCACACAG
CCGAGATTTATACTCGGAAGACGAAGACGACGACGGTGATGAGAGCTCGTCCGACGGCGGAAGTGAGGAGTCGTGTTCTTCGTCGTCGTACGGTGGTAGCAGACAGCAAT
ATCCGGCGGAAAACGTGGAGGATGTGTTGGTGGTGGCCGGATGCAAGAGATGCTTCATGTATTTTATGGTGCCGAAACAGGTGGAAGATTGCCCCAAATGCAGCAGCAGT
CGTCTAGTTCATTTCGATCGCTCCGACGACAATAATGGCTTTCCATGAACCAACGAATGAACGAACCACATTTTTTTGAAAAAAAAAACAAAAGAAGAAATCAAACTGTA
TTTGGGTTAATTGTGACAAAATCATTGATTCTTTTTCTTTGGATTAATTTGGTGAGCAAAGGGAAATGGGGTTTAATTTCTTAGCTCGATCAATGTGTCTATCTCTGTGT
GTGTGACGTTGTCTTATGTGTTCTTATTGGTATGGAGATAATAATTTTAGAAAGTTTGAATTGAAAAGAAAAAGAAAAGGAATCTGAGGGGCTGCCATGGATGCCGGAGA
GCAAGATAGAGAAAATGTGCAGGTATGAATGGGATGGTCAACGACTCAAATGAAGAAGAAGGAATAATATTTTGCTCGTGAAGACAGCGACTTGTTGCTTTCATTATTCC
CTAACCCACACTGATTGAATCGTACGCAATTATTTTTTTTTTTCAATGAACGCAAAATTCAATTCCTCTAGTAATTTTTTATATGAATTATAATCGGATTATGTAATTGA
AATGGAAATGAAAATGGGATAACGTTAGCCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRSPDMAAVTDSLEQSFRNFSLNHRLASAAPSSAGVRRSPSSFSSSSSSSDDEPHLPLHQHNRFDTILELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVKEDPRTAE
AHSRDLYSEDEDDDGDESSSDGGSEESCSSSSYGGSRQQYPAENVEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSDDNNGFP