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Lsi10G005030 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi10G005030
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionDUF1279 domain-containing protein
Genome locationchr10:7183023..7183460
RNA-Seq ExpressionLsi10G005030
SyntenyLsi10G005030
Gene Ontology termsGO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domainsIPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023533856.1 uncharacterized protein LOC111795580 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.2e-6288.82Show/hide
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XP_038902628.1 uncharacterized protein LOC120089278 [Benincasa hispida]5.3e-6998.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJH5 DUF1279 domain-containing protein3.2e-6492.41Show/hide
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A0A1S3C646 uncharacterized protein LOC1034973421.9e-6491.72Show/hide
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A0A5A7TV59 DUF1279 domain-containing protein1.9e-6491.72Show/hide
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A0A6J1G6W3 uncharacterized protein LOC1114513203.0e-6288.82Show/hide
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A0A6J1I2F7 uncharacterized protein LOC1114698888.8e-6288.82Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)4.2e-3255.47Show/hide
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        R +E+++KYGKVA+GVHFSVS  SI+G Y+AIKNNVDVESLL+K  +  F SK+ P   PS      + G +  +          N+T +LA S GGALA
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        LAVLCNKAL PIR+PIT+ALTPPIAR L +R I+++G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTTCTTCACCGGCGGCGGCCGATTCCGCGAGCTTCTTAGGAAGTATGGAAAAGTTGCAATCGGAGTTCATTTCTCAGTGTCGGCGGCTTCGATCACTGGTCTCTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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