; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi10G006340 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi10G006340
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionprotein RALF-like 34
Genome locationchr10:8847234..8847602
RNA-Seq ExpressionLsi10G006340
SyntenyLsi10G006340
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571407.1 Protein RALF-like 34, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-4782.26Show/hide
Query:  MASKFLFLLFTI--LLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTH
        MASK LF  FTI  LL +S++SAHL VDTSLKLMADALEWPTT S+ +   D D D  DL QDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTH
Subjt:  MASKFLFLLFTI--LLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTH

Query:  NCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        NCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  NCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

XP_004148071.1 protein RALF-like 34 [Cucumis sativus]7.1e-5185.6Show/hide
Query:  MASK-FLFLLFT-ILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYT
        MASK  LF LFT +LLF+SSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLI++  + D DD++DLQQDPRRSLFW RVHYYISYGAL+ANRIPCPPRSGRPYYT
Subjt:  MASK-FLFLLFT-ILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYT

Query:  HNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        HNCYKARGPVNPY+RGCSAITRCRR
Subjt:  HNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

XP_008457868.1 PREDICTED: protein RALF-like 34 [Cucumis melo]1.7e-5288Show/hide
Query:  MASK-FLFLLFT-ILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYT
        MASK  LFLLFT +LLF+SSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLI++  D D DD++DLQQDPRRSLFW RVHYYISYGAL+ANRIPCPPRSGRPYYT
Subjt:  MASK-FLFLLFT-ILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYT

Query:  HNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        HNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  HNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

XP_023513191.1 protein RALF-like 34 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.7e-4882.93Show/hide
Query:  MASKFLFLLFTI-LLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHN
        MASK LF  FTI LL +S++SAHL VDTSLKLMADALEWPTT S+ +   D D D  DL QDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHN
Subjt:  MASKFLFLLFTI-LLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHN

Query:  CYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        CYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  CYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

XP_038900702.1 protein RALF-like 34 [Benincasa hispida]1.0e-5793.55Show/hide
Query:  MASKFLFLLFTILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEA--AADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTH
        MASKFL LLFTILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIE+  A DIDDDE+DL+QDPRRSLFW RVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTH
Subjt:  MASKFLFLLFTILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEA--AADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTH

Query:  NCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        NCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  NCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMS2 Uncharacterized protein3.5e-5185.6Show/hide
Query:  MASK-FLFLLFT-ILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYT
        MASK  LF LFT +LLF+SSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLI++  + D DD++DLQQDPRRSLFW RVHYYISYGAL+ANRIPCPPRSGRPYYT
Subjt:  MASK-FLFLLFT-ILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYT

Query:  HNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        HNCYKARGPVNPY+RGCSAITRCRR
Subjt:  HNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

A0A151TIM7 Uncharacterized protein1.5e-3371.43Show/hide
Query:  DTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQD-PRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        +T+L LM+DAL+WPTT SL +   D D +E D++    RRSLFW R+ YYISYGAL+ANRIPCPPRSGR YYTHNCYKARGPV+PYSRGCS ITRCRR
Subjt:  DTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQD-PRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

A0A1S3C7S7 protein RALF-like 348.2e-5388Show/hide
Query:  MASK-FLFLLFT-ILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYT
        MASK  LFLLFT +LLF+SSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLI++  D D DD++DLQQDPRRSLFW RVHYYISYGAL+ANRIPCPPRSGRPYYT
Subjt:  MASK-FLFLLFT-ILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADID-DDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYT

Query:  HNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        HNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  HNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

A0A6J1EJN3 protein RALF-like 342.3e-4780.31Show/hide
Query:  MASKFLFLLFTI-LLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEA----AADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPY
        MASK LF  FTI LL +S++SAHL VDTSLKLMADALEWPTT S+ +       D D D  DL QDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPY
Subjt:  MASKFLFLLFTI-LLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEA----AADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPY

Query:  YTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        YTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  YTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

A0A6P4A840 protein RALF-like 341.9e-3366.67Show/hide
Query:  FTILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQ-QDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVN
        F ILL + S S     DTSLKLM+DALEWPTT S  +   + D++E D+     RRSLFW R+ YYISYGAL+ANRIPCPPRSGR YYTHNC+KARGPV+
Subjt:  FTILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQ-QDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVN

Query:  PYSRGCSAITRCRR
        PY+RGCS ITRCRR
Subjt:  PYSRGCSAITRCRR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 332.0e-0842.5Show/hide
Query:  SLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        ++ E +    ++E ++  +  R +       YISYGAL  N +PC  R G  YY  NC +     NPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  SLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

Q945T0 Rapid alkalinization factor1.2e-0848.57Show/hide
Query:  DDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCR
        +++E +L  +  R +  ++   YISYGAL  N +PC  R G  YY  NC K     NPYSRGCSAITRCR
Subjt:  DDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCR

Q9FHA6 Protein RALF-like 342.5e-3055.74Show/hide
Query:  LFLLFTILLFIS-SSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTS----LIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNC
        L L+ ++L FIS   S  LS + SL L+ D  +WP + S    +I+     +  E D     RRSL+W R  YYISYGAL+ANR+PCPPRSGR YYTHNC
Subjt:  LFLLFTILLFIS-SSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTS----LIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNC

Query:  YKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        ++ARGPV+PYSRGCS+ITRCRR
Subjt:  YKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.2e-0850.72Show/hide
Query:  DEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        +E ++  +  R +  +R   YISYGAL  N IPC  R G  YY  NC +     NPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  DEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

Q9MA62 Protein RALF-like 221.6e-0843.9Show/hide
Query:  TTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        T S+ E  A  +++E++   D  R +   +   YISYGA+  N +PC  R G  YY  NC +     NPYSRGCS ITRCRR
Subjt:  TTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G33775.1 ralf-like 196.1e-0838.1Show/hide
Query:  MASKFLFLLFTILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADI-DDDEVDLQQDP---RRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYY
        M  K L +L  + L + + SA+ +             W  T S +     I +D E+D   D    RR L   R   YISYGAL  N +PC  R GR YY
Subjt:  MASKFLFLLFTILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADI-DDDEVDLQQDP---RRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYY

Query:  THNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
          +C K R   NPY RGCS IT C R
Subjt:  THNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

AT3G05490.1 ralf-like 221.1e-0943.9Show/hide
Query:  TTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        T S+ E  A  +++E++   D  R +   +   YISYGA+  N +PC  R G  YY  NC +     NPYSRGCS ITRCRR
Subjt:  TTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 238.5e-1050.72Show/hide
Query:  DEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        +E ++  +  R +  +R   YISYGAL  N IPC  R G  YY  NC +     NPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  DEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

AT4G15800.1 ralf-like 331.5e-0942.5Show/hide
Query:  SLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        ++ E +    ++E ++  +  R +       YISYGAL  N +PC  R G  YY  NC +     NPYSRGCSAITRCRR
Subjt:  SLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPYSRGCSAITRCRR

AT5G67070.1 ralf-like 341.8e-3155.74Show/hide
Query:  LFLLFTILLFIS-SSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTS----LIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNC
        L L+ ++L FIS   S  LS + SL L+ D  +WP + S    +I+     +  E D     RRSL+W R  YYISYGAL+ANR+PCPPRSGR YYTHNC
Subjt:  LFLLFTILLFIS-SSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTS----LIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNC

Query:  YKARGPVNPYSRGCSAITRCRR
        ++ARGPV+PYSRGCS+ITRCRR
Subjt:  YKARGPVNPYSRGCSAITRCRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCAAATTCCTCTTCCTCCTCTTCACTATCCTCCTCTTCATTTCTTCCTCTTCAGCCCACCTCTCCGTCGACACCTCCCTCAAGCTCATGGCCGACGCCCTCGA
ATGGCCCACCACCACCTCCCTCATCGAAGCCGCCGCCGACATCGACGATGATGAAGTCGACCTACAACAAGACCCCCGCAGATCTCTCTTCTGGAGCCGAGTCCACTACT
ACATTTCTTACGGCGCCCTCGCCGCCAACCGGATCCCTTGCCCGCCCCGCTCCGGCCGCCCTTACTACACTCACAACTGCTACAAAGCTCGTGGCCCTGTCAATCCTTAC
TCCCGCGGCTGCTCCGCCATCACTCGCTGCCGCCGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCAAATTCCTCTTCCTCCTCTTCACTATCCTCCTCTTCATTTCTTCCTCTTCAGCCCACCTCTCCGTCGACACCTCCCTCAAGCTCATGGCCGACGCCCTCGA
ATGGCCCACCACCACCTCCCTCATCGAAGCCGCCGCCGACATCGACGATGATGAAGTCGACCTACAACAAGACCCCCGCAGATCTCTCTTCTGGAGCCGAGTCCACTACT
ACATTTCTTACGGCGCCCTCGCCGCCAACCGGATCCCTTGCCCGCCCCGCTCCGGCCGCCCTTACTACACTCACAACTGCTACAAAGCTCGTGGCCCTGTCAATCCTTAC
TCCCGCGGCTGCTCCGCCATCACTCGCTGCCGCCGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASKFLFLLFTILLFISSSSAHLSVDTSLKLMADALEWPTTTSLIEAAADIDDDEVDLQQDPRRSLFWSRVHYYISYGALAANRIPCPPRSGRPYYTHNCYKARGPVNPY
SRGCSAITRCRR