; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi10G013660 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi10G013660
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr10:17816347..17817228
RNA-Seq ExpressionLsi10G013660
SyntenyLsi10G013660
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008448398.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490597 [Cucumis melo]1.9e-13487.03Show/hide
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XP_011657164.1 uncharacterized protein LOC101220684 [Cucumis sativus]2.8e-13387.16Show/hide
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XP_023007066.1 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X1 [Cucurbita maxima]2.1e-12079.41Show/hide
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XP_023532268.1 uncharacterized protein LOC111794467 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.2e-12180.2Show/hide
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         SG
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XP_038902956.1 uncharacterized protein LOC120089527 [Benincasa hispida]9.2e-13788.2Show/hide
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         S HI
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KEA0 Uncharacterized protein1.3e-13387.16Show/hide
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A0A1S3BJ04 uncharacterized protein LOC1034905979.3e-13587.03Show/hide
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A0A5A7V7S7 Uncharacterized protein9.3e-13587.03Show/hide
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A0A6J1D323 uncharacterized protein LOC1110171177.1e-11978.69Show/hide
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Query:  SPSSG
        SP SG
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A0A6J1KZH4 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X19.9e-12179.41Show/hide
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Query:  SSTDLDLNRLLSSPPPKFRFLREAEEKLYRRLMDEAQKKACKNGGSVQNSEIKAISNPTA-------------EEKEDENHHVSQYSSSSSQVLPLVSSP
        SSTD DLNRL+SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLM+E+QKKACKNGGS+QN E  AISNP A             +EKE +NH+VSQYSSSSSQ+LPL SSP
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Query:  SSGHII
         SG  I
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39560.1 Putative membrane lipoprotein7.5e-2840.23Show/hide
Query:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSFTSQVE---DEFTNYAKEFFHLICWNWKRGSSSSSSSLNPNNSRENQRNLEVRTQESDIEIGCS
        M S S +G+ LS+VFGCLL AL+AELYYLLW KKRS T + +   D  T   +E   + C +     SSSS S   ++S  N + ++ + Q       C 
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Query:  KDLLLKSSGGGEDGVELELMRLHNLAGP---PRFLFTIKEETKEDLESED-RSRKGSRTRSLSDLILTVDT-----PFLTPLPSPPLKATTSPLNPL--S
         +          +G E       N+ GP   PRFLFTI EET E++ESED  S KG   +SL+DL L +++     P+LTP  SP L   T PL PL   
Subjt:  KDLLLKSSGGGEDGVELELMRLHNLAGP---PRFLFTIKEETKEDLESED-RSRKGSRTRSLSDLILTVDT-----PFLTPLPSPPLKATTSPLNPL--S

Query:  SFKHHGFNINPLFESSTDLDLNRLL------------SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLMDE
        S       I+ LFESS+D + NRL+            SSP  +F+FLR+AEEKLY++ + E
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AT5G59350.1 unknown protein1.9e-3943.09Show/hide
Query:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLL---WWKKRSFTSQVEDE------FTNYAKEFFHLICWNWKRGSSSSSSSLNPNN-SRENQRNLEVRTQES
        M + SGLGIGLSL+FG LL ALV E+YYLL     KKR  + + E+E         YAKE   L C+           SL  NN  RE + ++       
Subjt:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLL---WWKKRSFTSQVEDE------FTNYAKEFFHLICWNWKRGSSSSSSSLNPNN-SRENQRNLEVRTQES

Query:  DIEIGCSKDLLLKSSGGGEDGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESED--RSRKGSRT--RSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKATTSPLNPLS
        D+E+G     L+K   GG+ G E ELM+LHN     RFLFTI EETK DLESED  +SR GSR+  RSLSD+    +TP  TPL SP   +     +PL 
Subjt:  DIEIGCSKDLLLKSSGGGEDGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESED--RSRKGSRT--RSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKATTSPLNPLS

Query:  SFKHHGFNINPLFESSTDLDLNRLL---SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLMDEAQKKACKNGGSVQNSEIKAISNPTAEEKE------DENHHVSQYSSSS
        S+ HHGF  NPLFES  +L+ N+     SSPPPKF+F+R+AEEKL +RL++EA+++        + S +K ++     EK+      DE    S  SSSS
Subjt:  SFKHHGFNINPLFESSTDLDLNRLL---SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLMDEAQKKACKNGGSVQNSEIKAISNPTAEEKE------DENHHVSQYSSSS

Query:  SQVL
           +
Subjt:  SQVL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTTCTTTCAGTGGATTGGGAATTGGGTTGAGTTTAGTTTTTGGGTGTCTTCTGTTTGCTCTTGTTGCTGAGCTTTACTATTTGCTTTGGTGGAAGAAAAGAAGCTT
CACTTCACAAGTTGAAGATGAATTCACTAATTATGCTAAGGAGTTCTTTCATCTCATTTGTTGGAATTGGAAAAGGGGTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCATTAAATCCCA
ACAATTCTAGAGAAAATCAAAGGAATCTAGAAGTGAGAACTCAAGAATCTGACATTGAAATTGGTTGTAGCAAAGATTTGTTGTTGAAATCATCTGGTGGTGGAGAAGAT
GGAGTTGAGTTAGAGTTGATGAGACTGCATAATCTTGCAGGTCCACCTAGATTTCTTTTCACCATTAAAGAGGAAACTAAAGAAGATTTAGAGTCTGAAGATAGAAGCAG
AAAGGGATCAAGAACAAGAAGTTTAAGTGATCTTATTTTAACTGTTGACACTCCTTTTCTCACTCCTTTGCCTTCTCCTCCATTGAAAGCAACAACATCTCCATTAAATC
CCTTGAGTTCTTTCAAACACCATGGATTCAATATAAACCCTCTCTTTGAATCATCAACAGATTTGGATTTGAATAGGCTTTTATCTTCACCTCCCCCAAAATTTAGGTTC
TTAAGAGAAGCAGAAGAGAAACTGTATAGAAGATTAATGGATGAAGCTCAAAAGAAGGCCTGTAAAAATGGTGGGTCAGTTCAGAATTCTGAAATCAAAGCCATTTCCAA
TCCCACAGCAGAAGAAAAAGAAGATGAAAATCATCATGTTTCACAGTATTCTTCAAGTTCTTCACAGGTTCTTCCTTTAGTTTCTTCTCCTTCTTCAGGGCATATTATAT
AG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACTTCTTTCAGTGGATTGGGAATTGGGTTGAGTTTAGTTTTTGGGTGTCTTCTGTTTGCTCTTGTTGCTGAGCTTTACTATTTGCTTTGGTGGAAGAAAAGAAGCTT
CACTTCACAAGTTGAAGATGAATTCACTAATTATGCTAAGGAGTTCTTTCATCTCATTTGTTGGAATTGGAAAAGGGGTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCATTAAATCCCA
ACAATTCTAGAGAAAATCAAAGGAATCTAGAAGTGAGAACTCAAGAATCTGACATTGAAATTGGTTGTAGCAAAGATTTGTTGTTGAAATCATCTGGTGGTGGAGAAGAT
GGAGTTGAGTTAGAGTTGATGAGACTGCATAATCTTGCAGGTCCACCTAGATTTCTTTTCACCATTAAAGAGGAAACTAAAGAAGATTTAGAGTCTGAAGATAGAAGCAG
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CCTTGAGTTCTTTCAAACACCATGGATTCAATATAAACCCTCTCTTTGAATCATCAACAGATTTGGATTTGAATAGGCTTTTATCTTCACCTCCCCCAAAATTTAGGTTC
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AG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSFTSQVEDEFTNYAKEFFHLICWNWKRGSSSSSSSLNPNNSRENQRNLEVRTQESDIEIGCSKDLLLKSSGGGED
GVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESEDRSRKGSRTRSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKATTSPLNPLSSFKHHGFNINPLFESSTDLDLNRLLSSPPPKFRF
LREAEEKLYRRLMDEAQKKACKNGGSVQNSEIKAISNPTAEEKEDENHHVSQYSSSSSQVLPLVSSPSSGHII