; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G000990 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G000990
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionsurvival of motor neuron-related-splicing factor 30
Genome locationchr11:1048043..1057296
RNA-Seq ExpressionLsi11G000990
SyntenyLsi11G000990
Gene Ontology termsGO:0006397 - mRNA processing (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002999 - Tudor domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032438.1 Survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-13884.31Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEE------------KHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
        MQGGEDVS+EELA NLSTYKDQLQQVR+LLDDDP NSEYIDMEKELEE              WTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
Subjt:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEE------------KHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS

Query:  ASISFQQPKENEMFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKR
        ASISFQQ K N+M A +          +GTK    ++S     YDATIEAHTVNGFYVS+DGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKR
Subjt:  ASISFQQPKENEMFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKR

Query:  KIAQAASVDFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGS
        KIAQAASVDFQSRNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGS
Subjt:  KIAQAASVDFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGS

Query:  GKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        GKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMDD
Subjt:  GKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

XP_004142808.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X1 [Cucumis sativus]6.5e-13384.66Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE
        MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQL QVRQLLDDDP NSEYIDMEKELEE            VIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDSASI FQQ KENE
Subjt:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE

Query:  MFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS
        M A + +        +GTK    ++S     YDATIEAHTVNGFYVS+DGWGNKEEVDPANVRTIQLEVN LLEAER+AEATKQAIKRKIAQAASVDFQS
Subjt:  MFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS

Query:  RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK
        RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAWQQFQ+AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK
Subjt:  RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK

Query:  HLHLKGATVEMDD
        HLHLKGATVEMD+
Subjt:  HLHLKGATVEMDD

XP_022155149.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Momordica charantia]1.5e-12982.97Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE
        MQGGEDVSIEELA+NLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEE            VI+LTEELL+TAKQNEISGSNVETGD+SASISF Q KE +
Subjt:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE

Query:  MFARTSTSLTLALQH----VGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASV
        M A      +L+  H    +G+K    ++S     YDATIEAHTVNGFYVS+D WGNKEEVDPANVR IQ EVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASV
Subjt:  MFARTSTSLTLALQH----VGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASV

Query:  DFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQ
        DFQSRNLP KLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQ
Subjt:  DFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQ

Query:  KREKHLHLKGATVEMDD
        KREKHLHLKGATVEMDD
Subjt:  KREKHLHLKGATVEMDD

XP_022933076.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Cucurbita moschata]2.5e-13284.35Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE
        MQGGEDVS+EELA NLSTYKDQLQQVR+LLDDDP NSEYIDMEKELEE            VIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQ K N+
Subjt:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE

Query:  MFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS
        M A + +        +GTK    ++S     YDATIEAHTVNGFYVS+DGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS
Subjt:  MFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS

Query:  RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK
        RNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK
Subjt:  RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK

Query:  HLHLKGATVEMDD
        HLHLKGA+VEMDD
Subjt:  HLHLKGATVEMDD

XP_038876515.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Benincasa hispida]1.0e-13385.3Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE
        MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDP NSEYIDMEKELEE            VIALTEELLSTAKQNEI GSNVETGDDSASISF QPKENE
Subjt:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE

Query:  MFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS
        M A + +        +G+K    ++S     YDATIEAHTVNGFYVS+DGWGNKEEVDPANVR IQLEVNALLEAER+AEATKQAIKRKIAQAASVDFQS
Subjt:  MFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS

Query:  RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK
        RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK
Subjt:  RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK

Query:  HLHLKGATVEMDD
        HLHLKGATVEMD+
Subjt:  HLHLKGATVEMDD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CD96 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X13.1e-12088.68Show/hide
Query:  KHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSF
        KHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDSASI FQQPKENEM A + +        +GTK    ++S     YDATIEAHTVNGFYVS+
Subjt:  KHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSF

Query:  DGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAW
        DGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAW
Subjt:  DGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAW

Query:  QQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        QQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMD+
Subjt:  QQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

A0A1S3CE07 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X22.3e-11286.49Show/hide
Query:  KVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNK
        K  + +VIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDSASI FQQPKENEM A + +        +GTK    ++S     YDATIEAHTVNGFYVS+DGWGNK
Subjt:  KVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNK

Query:  EEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSA
        EEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAWQQFQSA
Subjt:  EEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSA

Query:  KGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        KGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMD+
Subjt:  KGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

A0A6J1DPE2 survival of motor neuron-related-splicing factor 307.3e-13082.97Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE
        MQGGEDVSIEELA+NLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEE            VI+LTEELL+TAKQNEISGSNVETGD+SASISF Q KE +
Subjt:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE

Query:  MFARTSTSLTLALQH----VGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASV
        M A      +L+  H    +G+K    ++S     YDATIEAHTVNGFYVS+D WGNKEEVDPANVR IQ EVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASV
Subjt:  MFARTSTSLTLALQH----VGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASV

Query:  DFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQ
        DFQSRNLP KLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQ
Subjt:  DFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQ

Query:  KREKHLHLKGATVEMDD
        KREKHLHLKGATVEMDD
Subjt:  KREKHLHLKGATVEMDD

A0A6J1EY48 survival of motor neuron-related-splicing factor 301.2e-13284.35Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE
        MQGGEDVS+EELA NLSTYKDQLQQVR+LLDDDP NSEYIDMEKELEE            VIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQ K N+
Subjt:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE

Query:  MFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS
        M A + +        +GTK    ++S     YDATIEAHTVNGFYVS+DGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS
Subjt:  MFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS

Query:  RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK
        RNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK
Subjt:  RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK

Query:  HLHLKGATVEMDD
        HLHLKGA+VEMDD
Subjt:  HLHLKGATVEMDD

A0A6J1K7R2 survival of motor neuron-related-splicing factor 301.2e-13284.35Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE
        MQGGEDVS+EELA NLSTYKDQLQQVR+LLDDDP NSEYIDMEKELEE            VIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQ K N+
Subjt:  MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENE

Query:  MFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS
        M A + +        +GTK    ++S     YDATIEAHTVNGFYVS+DGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS
Subjt:  MFARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQS

Query:  RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK
        RNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK
Subjt:  RNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREK

Query:  HLHLKGATVEMDD
        HLHLKGA+VEMDD
Subjt:  HLHLKGATVEMDD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O75940 Survival of motor neuron-related-splicing factor 307.5e-0727.85Show/hide
Query:  EELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSL
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+E            VI LT++LLST     ++ S+        S +  QP  +          
Subjt:  EELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSL

Query:  TLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATI-EAHTVNG-FYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKL
              VG K    ++S     Y+A I E    NG   ++F G+GN              EV  LL  + + E  K          A  D  ++ +  K 
Subjt:  TLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATI-EAHTVNG-FYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKL

Query:  RIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
         I        +  + KK  A K   R+++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ + SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  RIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q3T045 Survival of motor neuron-related-splicing factor 301.7e-0628.86Show/hide
Query:  EELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSL
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+E            VI LT++LLST     ++ S     D+ AS    QP  +          
Subjt:  EELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSL

Query:  TLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATI-EAHTVNG-FYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKL
              VG K    I+S     Y+A I E    NG   ++F G+GN              EV  LL  + + E  K          A  D  ++ +  K 
Subjt:  TLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATI-EAHTVNG-FYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKL

Query:  RIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
         I        +  + KK  A K   R+++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ + SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  RIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q5R591 Survival of motor neuron-related-splicing factor 305.7e-0728.19Show/hide
Query:  EELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSL
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+E            VI LT++LLST     ++ S+        S +  QP  +          
Subjt:  EELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSL

Query:  TLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATI-EAHTVNG-FYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKL
              VG K    I+S     Y+A I E    NG   ++F G+GN              EV  LL  + + E  K          A  D  ++ +  K 
Subjt:  TLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATI-EAHTVNG-FYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKL

Query:  RIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
         I        +  + KK  A K   R+++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ + SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  RIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q6DEY1 Survival of motor neuron-related-splicing factor 302.6e-0728.04Show/hide
Query:  EELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSL
        E+LA  L+ YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+E            VI LT++LLS+           ET DD+          ++M A  S S 
Subjt:  EELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSL

Query:  TLALQHVGTKETHRIFSSRYDATI-EAHTVNG-FYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKLRIE
         +  + +            Y+A I E    NG   ++F G+GN E     N+R ++       E  +  E                   S NLP   +  
Subjt:  TLALQHVGTKETHRIFSSRYDATI-EAHTVNG-FYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKLRIE

Query:  PDDPEDVKATKR-KKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
            E + A +  KK  A K   R+++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ + SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  PDDPEDVKATKR-KKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q7ZV80 Survival of motor neuron-related-splicing factor 302.6e-0726.33Show/hide
Query:  EELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSL
        EEL   LS YK QLQQV   L  DP N + + ++K+L+E            VI LT++LL++                       QP E      T +S 
Subjt:  EELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSL

Query:  TLALQHVGTKETHRIFSSRYDATI------EAHTVNG-FYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPS
        T+A  H      H + +   D  +      E    NG   ++F G+GN                         AE     + +K+ +    D       S
Subjt:  TLALQHVGTKETHRIFSSRYDATI------EAHTVNG-FYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPS

Query:  KLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
        K  ++ +  E  K   +KK+       R+++LE  +  +++ WQQF + A  K+KK     G+ + SIF SP+  NGKVGV   G   K +T++    K+
Subjt:  KLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G02570.1 nucleic acid binding;RNA binding1.0e-9160.45Show/hide
Query:  GGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMF
        G E++SIE+LA+++STYK+QL+QVRQLL +DP NSEY DMEKEL+E            VIALTEE+L+TAKQNEIS S+     ++   S       E  
Subjt:  GGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMF

Query:  ARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRN
           +  +      VGTK    +FS     YDATIEAHT NG++V++D WGNKEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ 
Subjt:  ARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRN

Query:  LPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHL
        LP+KL+I+P+DPEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRK+ESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHL
Subjt:  LPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHL

Query:  HLKGATVEMDD
        HLK    E  D
Subjt:  HLKGATVEMDD

AT2G02570.2 nucleic acid binding;RNA binding1.0e-9160.45Show/hide
Query:  GGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMF
        G E++SIE+LA+++STYK+QL+QVRQLL +DP NSEY DMEKEL+E            VIALTEE+L+TAKQNEIS S+     ++   S       E  
Subjt:  GGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMF

Query:  ARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRN
           +  +      VGTK    +FS     YDATIEAHT NG++V++D WGNKEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ 
Subjt:  ARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRN

Query:  LPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHL
        LP+KL+I+P+DPEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRK+ESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHL
Subjt:  LPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHL

Query:  HLKGATVEMDD
        HLK    E  D
Subjt:  HLKGATVEMDD

AT2G02570.3 nucleic acid binding;RNA binding4.6e-8457.23Show/hide
Query:  GGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMF
        G E++SIE+LA+++STYK+QL+QVRQLL +DP NSEY DMEKEL+E            VIALTEE+L+TAKQNEIS S+     ++   S       E  
Subjt:  GGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMF

Query:  ARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRN
           +  +      VGTK    +FS     YDATIEAHT NG++V++D WGNKEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ 
Subjt:  ARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRN

Query:  LPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHL
        LP+KL+I+P+DPEDVK  KRKKIH            V QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRK+ESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHL
Subjt:  LPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHL

Query:  HLKGATVEMDD
        HLK    E  D
Subjt:  HLKGATVEMDD

AT2G02570.4 nucleic acid binding;RNA binding1.0e-9160.45Show/hide
Query:  GGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMF
        G E++SIE+LA+++STYK+QL+QVRQLL +DP NSEY DMEKEL+E            VIALTEE+L+TAKQNEIS S+     ++   S       E  
Subjt:  GGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMF

Query:  ARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRN
           +  +      VGTK    +FS     YDATIEAHT NG++V++D WGNKEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ 
Subjt:  ARTSTSLTLALQHVGTKETHRIFSSR---YDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRN

Query:  LPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHL
        LP+KL+I+P+DPEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRK+ESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHL
Subjt:  LPSKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHL

Query:  HLKGATVEMDD
        HLK    E  D
Subjt:  HLKGATVEMDD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGGAGGAGAAGATGTAAGCATTGAAGAGTTGGCTAATAATCTCTCCACCTACAAAGACCAGCTTCAGCAGGTCAGACAGCTGTTAGATGATGATCCTAGCAACTC
TGAATACATCGATATGGAAAAGGAGCTTGAAGAGAAACATTGGACTTGGGCTAAAGTTGCAGTAATGCAGGTTATCGCTTTGACGGAAGAACTTCTTTCAACAGCAAAGC
AAAATGAGATTTCTGGATCAAATGTAGAAACAGGTGATGACAGCGCATCAATTAGTTTCCAGCAGCCTAAAGAAAATGAGATGTTTGCGCGCACCTCGACTAGTCTCACC
CTCGCTCTTCAACATGTTGGCACCAAGGAAACTCATAGGATATTTAGTTCTAGGTACGATGCTACAATTGAAGCCCACACTGTAAATGGTTTCTATGTTAGTTTTGATGG
TTGGGGAAACAAGGAAGAGGTGGACCCTGCAAATGTAAGAACAATCCAACTGGAAGTTAATGCTTTGCTTGAAGCAGAAAGAATGGCTGAAGCTACAAAGCAGGCTATCA
AGCGCAAGATTGCTCAAGCTGCTTCTGTTGACTTCCAATCACGAAATTTACCATCAAAGCTTCGAATTGAACCTGATGATCCTGAGGACGTAAAAGCCACCAAACGCAAG
AAAATACATGCTTTCAAGTCAAAGATGCGGGTAGAACAGCTTGAAGTTACCCAAAATAAACGGCAGAATGCTTGGCAGCAGTTTCAATCAGCAAAAGGCAAGTCTAAGAA
GATTGGTTTCTTCTCTGGGCGAAAGAGGGAGAGCATTTTCAAGTCTCCGGATGATCCGAATGGCAAGGTTGGTGTGACTGGAAGTGGGAAGGGTTTAACCGAGTTTCAGA
AGAGGGAAAAACACTTGCATCTCAAGGGTGCAACCGTGGAGATGGATGACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAGTTGTAGGCTTATAGCCCCCCTCCCTAGTCCCCTACTTTGGGCCGACCCAGATTCCATAGCCCGAACACTGAGCCTCAAAAAGGGCTGCGTTCTTAATCGCGGGGAAG
GTGGCGTTGTGTGTGCCTTCTCCATCATCCTCTGATTCTCGTTCTGATTTTTCCAATTTTACGCTCTTTTTCTTCCTTCTCCTCCTCTGTTCATCCTTCCAAGATATTCT
CCCACATAATTCTGTAGTTTCAACTTTTGAATTCATCTTCTGCCAAAATGCAAGGAGGAGAAGATGTAAGCATTGAAGAGTTGGCTAATAATCTCTCCACCTACAAAGAC
CAGCTTCAGCAGGTCAGACAGCTGTTAGATGATGATCCTAGCAACTCTGAATACATCGATATGGAAAAGGAGCTTGAAGAGAAACATTGGACTTGGGCTAAAGTTGCAGT
AATGCAGGTTATCGCTTTGACGGAAGAACTTCTTTCAACAGCAAAGCAAAATGAGATTTCTGGATCAAATGTAGAAACAGGTGATGACAGCGCATCAATTAGTTTCCAGC
AGCCTAAAGAAAATGAGATGTTTGCGCGCACCTCGACTAGTCTCACCCTCGCTCTTCAACATGTTGGCACCAAGGAAACTCATAGGATATTTAGTTCTAGGTACGATGCT
ACAATTGAAGCCCACACTGTAAATGGTTTCTATGTTAGTTTTGATGGTTGGGGAAACAAGGAAGAGGTGGACCCTGCAAATGTAAGAACAATCCAACTGGAAGTTAATGC
TTTGCTTGAAGCAGAAAGAATGGCTGAAGCTACAAAGCAGGCTATCAAGCGCAAGATTGCTCAAGCTGCTTCTGTTGACTTCCAATCACGAAATTTACCATCAAAGCTTC
GAATTGAACCTGATGATCCTGAGGACGTAAAAGCCACCAAACGCAAGAAAATACATGCTTTCAAGTCAAAGATGCGGGTAGAACAGCTTGAAGTTACCCAAAATAAACGG
CAGAATGCTTGGCAGCAGTTTCAATCAGCAAAAGGCAAGTCTAAGAAGATTGGTTTCTTCTCTGGGCGAAAGAGGGAGAGCATTTTCAAGTCTCCGGATGATCCGAATGG
CAAGGTTGGTGTGACTGGAAGTGGGAAGGGTTTAACCGAGTTTCAGAAGAGGGAAAAACACTTGCATCTCAAGGGTGCAACCGTGGAGATGGATGACTAAAGTGAGGTTA
GATTTTGTAGGTTGCTGCTTTCTTTGTATGTAACTTCATTTAGTATCCAATCCATTTGATGCATCTGTGTGGTTAGATTCATATAAATGTGGTTTATACCCGTACTAAAA
GTGTAGGTGGGGGGATTCCCTCCCGGTAACATAGTGTTTTCTTATGAGAATGGTTACGAAACCTAGCCATGACAGGATCATATTTTTTTTTTCCTTTGACGTTTTTATGT
TTACTTGTTCTATTTCCTTAAAAGTAATGGGATGTGCACATTTATGTGAAAAAACCAATCGATTTTGTTCGAATTTCTACTCCCACTCCCACTCCCACTCCCACTACCAA
CTTTCTTTAGGAATGATCCTAGGTTGTTTAAGGGAGCTTACTTTATAATATAGCATGTGGAGGGGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQGGEDVSIEELANNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEKHWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQPKENEMFARTSTSLT
LALQHVGTKETHRIFSSRYDATIEAHTVNGFYVSFDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSKLRIEPDDPEDVKATKRK
KIHAFKSKMRVEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD