CuGenDBv2

Gene ID	Lsi11G002410
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein
Genome location	chr11:2453957..2458019
RNA-Seq Expression	Lsi11G002410
Synteny	Lsi11G002410
Gene Ontology terms	GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0061537.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold41G00980 [Cucumis melo var. makuwa]

3.0e-73

73.09

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        VSEGSSSS+    AAS+SR+                  A+  +  LMLPLY LQFVQKLA CSLR+CFSCI+CVEL LYNI+ RIRKTLLGSS+DIGWLQ
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        TTPGMPPVVDGTARFLELLS+IR
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KAG6599467.1 hypothetical protein SDJN03_09245, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.5e-77

64.5

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        +LHSF MT  F+SNRF    A             E+EDWMGD  TQNELYEIASA             AHGDTLQ+FSIVSP+D+I THLLAL SYITR 
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Query:  FIRFIEDLIARDVDRFLTDHIIVPLGVCSSYSGQNRQRSVSEGSSSSMHCTAAASDSRN------------------ATFSWCRLMLPLYSLQFVQKLAL
        F+ FIEDL+ARDVDR LTDHII+PLG C + SGQNRQRSVSEGSSS + C A ASDSRN                  A+  +  LMLPLY LQFVQKLAL
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Query:  CSLRHCFSCIQCVELRLYNIISRIRKTLLGSSHDIGWLQTTPGMPPVVDGTARFLELLSEIR
        C LR CFSCIQ VELRL N+I RIRKTL+GSS DIGWLQ TPGMPPVVDGT RFLELLSEIR
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XP_008458641.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497980 isoform X1 [Cucumis melo]

4.6e-74

73.54

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        MGDAQTQNE YEIAS              AH DTLQIFSIVSPMDEILTHLLALTSYITRRF+RFIEDLIARDVDRFLTDHIIVP  VCSSYSGQNRQRS
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        VSEGSSSS+    AAS+SR+                  A+  +  LMLPLY LQFVQKLA CSLR+CFSCI+CVEL LYNI+ RIRKTLLGSS+DIGWLQ
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        TTPGMPPVVDGTARFLELLS+IR
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XP_011648641.1 uncharacterized protein LOC101211085 isoform X1 [Cucumis sativus]

4.9e-76

73.99

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        VSEGSSSS+     ASDSRN                  A+  +  LMLPLY LQFVQKLA CSLR+CFSCIQCVEL LYNI+ RIRKTLLGSS+DIGWLQ
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        TTPGMPPVVDGTARFLELLS+IR
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XP_038891210.1 uncharacterized protein LOC120080572 [Benincasa hispida]

1.2e-77

73.99

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        MGDAQT+NELYEIAS              AHGDTLQIF+IVSPMDEILTHLLALT YI RRF+RFIEDLIARDV+RFLTD IIVPL VCSSYS QNRQRS
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        VSEGSSSS  CT AA +SRN                  A+  +  LMLPLY LQFVQ+LALCSLRHCFSCI+C EL LYNIISRIRKTLLGSS DIGWLQ
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Query:  TTPGMPPVVDGTARFLELLSEIR
        TTPGMPPVVDGTARFLELLSEIR
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LHW4 Uncharacterized protein

2.4e-76

73.99

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        MGDAQTQN+ YEIAS              AHGDTLQIFSIVSPMDEILTHLLALTSY+TRRF+RFIEDLIARDVDRFLT+HIIVP GVCSSYSGQNRQRS
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        VSEGSSSS+     ASDSRN                  A+  +  LMLPLY LQFVQKLA CSLR+CFSCIQCVEL LYNI+ RIRKTLLGSS+DIGWLQ
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        TTPGMPPVVDGTARFLELLS+IR
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A0A1S3C7V6 uncharacterized protein LOC103497980 isoform X1

2.2e-74

73.54

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        MGDAQTQNE YEIAS              AH DTLQIFSIVSPMDEILTHLLALTSYITRRF+RFIEDLIARDVDRFLTDHIIVP  VCSSYSGQNRQRS
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        VSEGSSSS+    AAS+SR+                  A+  +  LMLPLY LQFVQKLA CSLR+CFSCI+CVEL LYNI+ RIRKTLLGSS+DIGWLQ
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A0A5A7V3T9 Uncharacterized protein

1.4e-73

73.09

Show/hide

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        MGDAQTQNE YEIAS              AH DTLQIFSIVSPMDEILTHLLALTSYITRRF+RFIEDLIARDVDRFLTDHIIVP  VCSSYSG NRQRS
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Query:  VSEGSSSSMHCTAAASDSRN------------------ATFSWCRLMLPLYSLQFVQKLALCSLRHCFSCIQCVELRLYNIISRIRKTLLGSSHDIGWLQ
        VSEGSSSS+    AAS+SR+                  A+  +  LMLPLY LQFVQKLA CSLR+CFSCI+CVEL LYNI+ RIRKTLLGSS+DIGWLQ
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        TTPGMPPVVDGTARFLELLS+IR
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A0A5D3CJY7 Uncharacterized protein

2.2e-74

73.54

Show/hide

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        VSEGSSSS+    AAS+SR+                  A+  +  LMLPLY LQFVQKLA CSLR+CFSCI+CVEL LYNI+ RIRKTLLGSS+DIGWLQ
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        TTPGMPPVVDGTARFLELLS+IR
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A0A6J1KAX9 uncharacterized protein LOC111493819 isoform X1

6.6e-71

69.51

Show/hide

Query:  MGDAQTQNELYEIASAVSANFAIQFQVRRAHGDTLQIFSIVSPMDEILTHLLALTSYITRRFIRFIEDLIARDVDRFLTDHIIVPLGVCSSYSGQNRQRS
        MGD  TQNELYEIASA             AHGD LQIFSIVSP+DEI THLLAL SYITRRF+ FIED++ARDVDRFLTDHII+PL VC + SGQNRQRS
Subjt:  MGDAQTQNELYEIASAVSANFAIQFQVRRAHGDTLQIFSIVSPMDEILTHLLALTSYITRRFIRFIEDLIARDVDRFLTDHIIVPLGVCSSYSGQNRQRS

Query:  VSEGSSSSMHCTAAASDSRN------------------ATFSWCRLMLPLYSLQFVQKLALCSLRHCFSCIQCVELRLYNIISRIRKTLLGSSHDIGWLQ
        VSEGSSS + C A ASDSRN                  A+  +  LMLPLY LQFVQKLALC LR CFSCIQ VELRL NII RI+KTL+GSS DIGWLQ
Subjt:  VSEGSSSSMHCTAAASDSRN------------------ATFSWCRLMLPLYSLQFVQKLALCSLRHCFSCIQCVELRLYNIISRIRKTLLGSSHDIGWLQ

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         TPGMPPVVDGT RFLELLSEIR
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G44970.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein

5.1e-07

26.37

Show/hide

Query:  QIFSIVSPMDEILTHLLALTSYITRRFIRFIEDLIARDVDRFLTDHIIV----------PLGVCSSYS---GQNRQRSVSEGSSSSMHCTAAASDSRNAT
        Q+F+ +  ++E  +++   TSY+   F  +  +   +D       H ++          P+ VC S       + + S S+ +S S   T     + NA 
Subjt:  QIFSIVSPMDEILTHLLALTSYITRRFIRFIEDLIARDVDRFLTDHIIV----------PLGVCSSYS---GQNRQRSVSEGSSSSMHCTAAASDSRNAT

Query:  FSWCRLMLPLYSLQFVQKLALCSLRHCFSCIQCVELRLYNIISRIRKTLLGSSHDIGWLQTTPGMPPVVDGTARFLELLSEI
         +  RL L   S+                           +I R R+T+ GS+ DIGWLQ  P MPPV DGT RF ++L +I
Subjt:  FSWCRLMLPLYSLQFVQKLALCSLRHCFSCIQCVELRLYNIISRIRKTLLGSSHDIGWLQTTPGMPPVVDGTARFLELLSEI

AT2G44970.2 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein

1.8e-07

27.37

Show/hide

Query:  QIFSIVSPMDEILTHLLALTSYITRRFIRFIE----DLIARDVDRFLTDHII---VPLGVCSSYS---GQNRQRSVSEGSSSSMHCTAAASDSRNATFSW
        Q+F+ +  ++E  +++   TSY+   F  + E    D I+   +   +   +    P+ VC S       + + S S+ +S S   T     + NA  + 
Subjt:  QIFSIVSPMDEILTHLLALTSYITRRFIRFIE----DLIARDVDRFLTDHII---VPLGVCSSYS---GQNRQRSVSEGSSSSMHCTAAASDSRNATFSW

Query:  CRLMLPLYSLQFVQKLALCSLRHCFSCIQCVELRLYNIISRIRKTLLGSSHDIGWLQTTPGMPPVVDGTARFLELLSEI
         RL L   S+                           +I R R+T+ GS+ DIGWLQ  P MPPV DGT RF ++L +I
Subjt:  CRLMLPLYSLQFVQKLALCSLRHCFSCIQCVELRLYNIISRIRKTLLGSSHDIGWLQTTPGMPPVVDGTARFLELLSEI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCTTCGATGCAAAGCTTTTGTGGGGCCAACGATGATTCGAAATTAAAGCTACTGGATAAAGATCATCCAATTCTTCATTCCTTCTTCATGACTCCTTTCTTTCTATC
GAATCGCTTCCCTTGTAAGTGCGCCCTTCTTGTGAGGATTTTATTGCTTAGTTTGTATGAACTCGAACTTGAAGATTGGATGGGAGATGCACAAACTCAGAATGAATTGT
ACGAGATTGCTTCCGCGGTGAGTGCTAATTTTGCAATTCAGTTTCAAGTTCGTAGAGCACATGGTGATACTCTTCAAATCTTCAGTATTGTATCACCAATGGATGAGATT
CTTACTCATCTCTTGGCATTGACTAGTTACATAACTCGTCGATTCATCAGATTTATCGAGGATCTTATAGCCAGAGATGTCGACAGATTTCTCACCGACCATATCATCGT
TCCATTGGGAGTTTGTTCGAGTTATTCTGGTCAGAATAGGCAAAGGTCTGTTTCGGAAGGTTCATCATCGTCCATGCACTGCACTGCTGCGGCCTCTGATTCGAGGAATG
CTACTTTTTCTTGGTGTAGGTTGATGCTCCCATTATACAGTTTACAGTTTGTTCAAAAATTAGCGTTATGCTCCTTGCGACATTGTTTCTCGTGCATTCAATGTGTCGAA
CTCCGCCTTTACAATATAATATCTAGAATTAGAAAAACCTTGCTCGGTTCATCGCATGATATTGGATGGCTGCAAACCACTCCGGGCATGCCTCCTGTTGTTGATGGAAC
AGCAAGATTCTTGGAATTGCTCTCTGAGATAAGGTTATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAAGAAATCTCCTCTCAGTCAAAAATCTCCACCTGTAACCTCCAGACGCCTCGCCACACAAAAGCAGGGCTATAAGACACCACACCATTATCCAAATTAATTAATTAATT
CTTACATTTCATTCTCCATCTTCATCTTCTCATCATCATTTAATCAAATCCAAAATCTGGGTTTTCCTAATTAACTCAAAATCAACAAAGCCCATCTCTTCAAATTTGCA
GATTCGTCCAAATTTTTTGGAATTTTATGCGAATTTCACTTGCCCACATCCCATTGGATGCCTTCGATGCAAAGCTTTTGTGGGGCCAACGATGATTCGAAATTAAAGCT
ACTGGATAAAGATCATCCAATTCTTCATTCCTTCTTCATGACTCCTTTCTTTCTATCGAATCGCTTCCCTTGTAAGTGCGCCCTTCTTGTGAGGATTTTATTGCTTAGTT
TGTATGAACTCGAACTTGAAGATTGGATGGGAGATGCACAAACTCAGAATGAATTGTACGAGATTGCTTCCGCGGTGAGTGCTAATTTTGCAATTCAGTTTCAAGTTCGT
AGAGCACATGGTGATACTCTTCAAATCTTCAGTATTGTATCACCAATGGATGAGATTCTTACTCATCTCTTGGCATTGACTAGTTACATAACTCGTCGATTCATCAGATT
TATCGAGGATCTTATAGCCAGAGATGTCGACAGATTTCTCACCGACCATATCATCGTTCCATTGGGAGTTTGTTCGAGTTATTCTGGTCAGAATAGGCAAAGGTCTGTTT
CGGAAGGTTCATCATCGTCCATGCACTGCACTGCTGCGGCCTCTGATTCGAGGAATGCTACTTTTTCTTGGTGTAGGTTGATGCTCCCATTATACAGTTTACAGTTTGTT
CAAAAATTAGCGTTATGCTCCTTGCGACATTGTTTCTCGTGCATTCAATGTGTCGAACTCCGCCTTTACAATATAATATCTAGAATTAGAAAAACCTTGCTCGGTTCATC
GCATGATATTGGATGGCTGCAAACCACTCCGGGCATGCCTCCTGTTGTTGATGGAACAGCAAGATTCTTGGAATTGCTCTCTGAGATAAGGTTATAATCTTTCCATACTT
AATATATATAATACATTTGTTTTAATCTGATAGATTCAATTCATACTCTCCACAGTATGTTGATGTATTCCACGGCGGAACAAATTCCCTAATTATTGACTGTCGAGTTA
TTCGTCATGGTGATTGTTTGATGATATTAATTTTGAATCACATTTTCTTGAACTATGATATGTATTCTCATTTTGTATTCAAGGCTTCTCAAACTTGAAAGTTTATTTAT
TAATCCTACTCCGTTCGTTTCAATAATTTAGGAACGGAGAGCATAAACTACCCAACTCATTTGTTTATTTACTGATTCCAGGTCTTTTTAGCAATCATGGTCCCTTGTAT
TTTGTGGGAACCAAGAAATTTTTTTCAAAGATGGGCCTTACTTGCCATATTGCAAAAATTCATAGTGAGGTAATAGATTATCTCCCTTCTGTTGTGCAATGAACGAATGA
GCGAACGGTAGCCTTCTCGCCGGTTGCTTCGTTTTTTTCCTCTCCTTTTCCTGAGTAGGACCCAACAAATGTATACTGGTTTTGCTTCCCAATTATAGTTTTGTTTGAAT
TCCTTTTCCGTGCTTGAAGGCGTCTGTGGAACACAATGCTTGGGAGTTAAAAGAATACGTCGAGGAGCTTTATTGGGGCTCAGGCAAGCGAGTGATGCTGCTCGGCCATA
GCAAGGGTGGGGTTGATGCTGCTGCTGCATTATCAATCTACTGCAATGAGTTGAAAGACAAAGTTGCTGGCTTGGCTCTGGTACAAAGTCCATATGGTGGAACTCCATTG
GCTTCGGATATTCTTCGCGACGGGCAGGTCGCTGACAAAGAGATGCGAAGGATCATGGAGCTATTAATATGCAAGATTATTAAGGTTGCATCTTCTTTTGCCTATTTATA
TGGCAGGATTATTTAGGTTGCATTTTCTTTATTGGAATCCCTGATTTGTTTTTTGTAGGGCGACATTCGAGCATTGGAGGATCTAACGTATGAGAAGCGGAAGGAGTTCA
TCACGAATCACAACCTCCCCGAGAACGTACCAATACTTTCCTTCCACTCTGAAGCACAGGTTGCACCAGGAGTTCTTGCTACAATGACTCATATAGCTCATGCTGAGCTA
CCTTGGCTACCTCTTCCAAGATCATGGACAGAATCCGACACGGTGGTACAGGGTGGGAGGCGTGTTCCCGTGGTGATTCCCCTTTCTGCTGTCATGGCATTGTGTGCTCT
TCACTTGCAGCTTCGGTATGGGGAGAAGAGTGACGGTTTGGTGACATGTTGTGACGCAGAAGTTCCTGGCTCGGTTGTCGTGAGACCAAAGCAGAAGCTCGATCACGCGT
GGATGGTTTACTCTTCCAATAAAAAGAGTGCTAGTGATCCTGATGCTTGTGAGATGTGTGAGGCAATCTTGACACTGCTTGTGGAGCTTGGGATGAGAATGAAACTAGTA
AAATAGGTGGTGGCTTTCTTGTAATTCTTCCCGAAAACCAGCCCCAAATTCATCCATCGGAAAATGTATTGAAATTTTCCCGGGTGCACTTGAAAATTGAAAGCCGACCG
TATTTTTAATACGACGGGTCGGCTGGAGATTTGGATTTCAGAAATCAAATATTCCTTGATTTTGTGGTTTAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPSMQSFCGANDDSKLKLLDKDHPILHSFFMTPFFLSNRFPCKCALLVRILLLSLYELELEDWMGDAQTQNELYEIASAVSANFAIQFQVRRAHGDTLQIFSIVSPMDEI
LTHLLALTSYITRRFIRFIEDLIARDVDRFLTDHIIVPLGVCSSYSGQNRQRSVSEGSSSSMHCTAAASDSRNATFSWCRLMLPLYSLQFVQKLALCSLRHCFSCIQCVE
LRLYNIISRIRKTLLGSSHDIGWLQTTPGMPPVVDGTARFLELLSEIRL

Lsi11G002410 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome