; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G002480 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G002480
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionprotein SPEAR1
Genome locationchr11:2521413..2524715
RNA-Seq ExpressionLsi11G002480
SyntenyLsi11G002480
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR040356 - SPEAR family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023522169.1 protein SPEAR1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-7779.23Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFV0 SPOROCYTELESS-like EAR-containing protein 12.2e-8785.99Show/hide
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A0A1S3C7M3 protein SPEAR11.4e-8987.86Show/hide
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A0A6J1G472 protein SPEAR1-like2.7e-6974.76Show/hide
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A0A6J1HQB1 protein SPEAR1-like5.7e-6772.41Show/hide
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A0A6J1KB48 protein SPEAR3-like isoform X17.0e-7377.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6IDB0 Protein SPEAR36.0e-2943.06Show/hide
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Q84X40 Protein SPEAR11.6e-2644.33Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20080.1 unknown protein1.2e-2744.33Show/hide
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AT2G20080.2 unknown protein4.4e-1936.45Show/hide
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AT4G28840.1 unknown protein4.2e-3043.06Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAGTGGTTATTTTGGGGAGATGAATATGGGGAATAATAATATTGATAAGAGAAGAAGTGGGTCGCCGGCGACGGCGGCAGCGACGGGGAGGAGAGGGAGGAAAGG
AGGCGGCGGAGAGAAACCGAAGCAGCCGCAGAGAGGGTTGGGAGTTGCTCAGTTGGAGAAGATCAGATTGCATGGAGAAATGGGTTGTGCTGCTTATGGCCACTTGTATC
CAAATCTCTCCGCCGGAGATGATATGAGAATGCAAACAACAGCTTCTTTTTCCTACTCCTCAACTCAATCATCTTCTTCATCTCCTAATCCCTATGCTTTCCACCAAAAC
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ACATTTTGGGCAACCAAACATGACTGGACACCTTTTCAGTCCTCATGTACAGGATTCAATTCACAAGAACATGAATACAAAATATGGGAGTGATTCAATGGGCTCAAGCA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGAAGTTCTCAAAACAAAAGGAGAGAAAGAAAAAAAAAAAGCATAAAATCTAAGTATAAATAACATAAAAATCCTAGAGAAAATCTGATCCAGCGATGCAATAATTGTTG
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TTCTTTTTCTTTTTTTTTAAAAAATAAAAATTTCTTTTTTCTGAAGATCCTATGGGGAGTGGTTATTTTGGGGAGATGAATATGGGGAATAATAATATTGATAAGAGAAG
AAGTGGGTCGCCGGCGACGGCGGCAGCGACGGGGAGGAGAGGGAGGAAAGGAGGCGGCGGAGAGAAACCGAAGCAGCCGCAGAGAGGGTTGGGAGTTGCTCAGTTGGAGA
AGATCAGATTGCATGGAGAAATGGGTTGTGCTGCTTATGGCCACTTGTATCCAAATCTCTCCGCCGGAGATGATATGAGAATGCAAACAACAGCTTCTTTTTCCTACTCC
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TAATTAATAAAAAAAGTGGGGTTAATTACAAAATATATAATCAGTCAAATTTCCTATCATTATATAATTAATCCACAATTATAAACTTTCATTAATCAGTCAAATTACCT
ATTTTATTAATCATGCTCTCATGTTTTAGAAATGGGTTTCAAACATCTCTTTAGTTTGTACATTTTCAAATCATACCCTTTTGTCAACTTAAGTGTAATAGGGTTGATAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FLGMGEHERGNFRYGDSQPTTTSSLRWDPSNTFLETQHFGQPNMTGHLFSPHVQDSIHKNMNTKYGSDSMGSSSQNSESSETQELDLELRLSI