; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G004360 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G004360
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionPrefoldin subunit 4
Genome locationchr11:4575052..4576409
RNA-Seq ExpressionLsi11G004360
SyntenyLsi11G004360
Gene Ontology termsGO:0006457 - protein folding (biological process)
GO:0016272 - prefoldin complex (cellular component)
GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002777 - Prefoldin beta-like
IPR016661 - Prefoldin, subunit 4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599316.1 putative prefoldin subunit 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-5388.64Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAK    +       EDASNELIL DED+IRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEEE+DSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

KAG7030312.1 putative prefoldin subunit 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.8e-5388.64Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAK    +       EDASNELIL DED+IRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEEE+DSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

XP_022946140.1 probable prefoldin subunit 4 [Cucurbita moschata]2.8e-5388.64Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAK    +       EDASNELIL DED+IRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEEE+DSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

XP_022999107.1 probable prefoldin subunit 4 [Cucurbita maxima]2.8e-5388.64Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAK    +       EDASNELIL DEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEEE+DSIVAQMAELK+ILYGKFKDSINLEDD
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

XP_023521156.1 probable prefoldin subunit 4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-5389.39Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAK    +       EDASNELIL DEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEEE+DSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFH2 Prefoldin subunit 46.4e-5184.09Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAK    +       EDASNELIL D+DVIRF IGEVFAH+P+EEVEGRLE+MKEENV+NLEK
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        L+EE+DSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

A0A1S3C216 Prefoldin subunit 42.4e-5083.33Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAK    +       EDASNELIL D+DVIRF IGEVFAH+P+EEVEGRLE+MKEENV++L+K
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEEE+DSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

A0A5D3D4H6 Prefoldin subunit 42.4e-5083.33Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAK    +       EDASNELIL D+DVIRF IGEVFAH+P+EEVEGRLE+MKEENV++L+K
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEEE+DSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

A0A6J1G2Y9 Prefoldin subunit 41.4e-5388.64Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAK    +       EDASNELIL DED+IRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEEE+DSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

A0A6J1K9X7 Prefoldin subunit 41.4e-5388.64Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAK    +       EDASNELIL DEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEEE+DSIVAQMAELK+ILYGKFKDSINLEDD
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2TBR6 Prefoldin subunit 46.0e-1438.06Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDED--VIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNL
        M++    +  VT+EDQQ INKF+R  +R  EL++EI   K  + +       EDA  +++L D+D  +I + IG+VF    +EE +  LEE K+   + +
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDED--VIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNL

Query:  EKLEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        + LE   +SI   +A+LK  LY KF  +INLE D
Subjt:  EKLEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

Q54TB7 Probable prefoldin subunit 42.1e-1135.2Show/hide
Query:  ESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDED-VIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEKLEEERD
        E+EV   DQ+ IN F RLNNR HEL  E +  + ++        + D+ ++L + D+D   ++ +GE F  V +E+ E  +E+   +  ++++K++ + +
Subjt:  ESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDED-VIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEKLEEERD

Query:  SIVAQMAELKKILYGKFKDSINLED
         I  +  ELK ILY KFK+SINLE+
Subjt:  SIVAQMAELKKILYGKFKDSINLED

Q9M4B5 Probable prefoldin subunit 48.3e-4065.19Show/hide
Query:  MQQGG---GSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKN
        MQQ G   GSE EVTWEDQQNIN FSRLNNR H+L+D+I++AK    +       EDA NELIL DE+++RF IGEVFAHVPR++VE ++EEMKE   K+
Subjt:  MQQGG---GSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKN

Query:  LEKLEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEKLE+E++SIV QMA LKK+LY KFKDSINLE+D
Subjt:  LEKLEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

Q9M4C4 Probable prefoldin subunit 41.1e-4470.45Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK
        MQQG G+E++VTWEDQQNIN+F RLNNRFHEL DEIR AK    +       EDA NELILCDEDV+RF IGEVFAH+P ++VE RLE+MKE+  K LE+
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEK

Query:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEEE++SI+AQMAELKKILYGKFKD+INLE+D
Subjt:  LEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

Q9NQP4 Prefoldin subunit 44.6e-1438.06Show/hide
Query:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDED--VIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNL
        M++    +  VT+EDQQ INKF+R  +R  EL++EI   K  + +       EDA ++++L D+D  +I + IG+VF    +EE +  LEE K+   + +
Subjt:  MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDED--VIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNL

Query:  EKLEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        + LE   +SI   +A+LK  LY KF  +INLE D
Subjt:  EKLEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G08780.1 ABI3-interacting protein 35.9e-4165.19Show/hide
Query:  MQQGG---GSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKN
        MQQ G   GSE EVTWEDQQNIN FSRLNNR H+L+D+I++AK    +       EDA NELIL DE+++RF IGEVFAHVPR++VE ++EEMKE   K+
Subjt:  MQQGG---GSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKN

Query:  LEKLEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD
        LEKLE+E++SIV QMA LKK+LY KFKDSINLE+D
Subjt:  LEKLEEERDSIVAQMAELKKILYGKFKDSINLEDD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGCAGGGCGGAGGATCTGAATCGGAGGTCACATGGGAAGACCAGCAGAATATTAACAAATTTAGTAGGTTAAACAATCGGTTCCACGAGCTTGAAGATGAGATTAG
AACCGCCAAGCACAATGTATCTTCTTTTTCAGCTTTACTTTTTAGTGAGGATGCGAGTAATGAGTTGATTCTCTGTGATGAAGACGTGATTCGTTTCCATATTGGGGAAG
TTTTTGCCCATGTACCAAGGGAAGAAGTAGAAGGCAGGTTGGAAGAAATGAAAGAGGAAAATGTTAAGAACTTGGAGAAACTTGAGGAAGAAAGGGATTCTATCGTGGCC
CAGATGGCTGAGTTGAAGAAAATTCTGTACGGGAAGTTCAAAGATTCCATTAATCTAGAAGATGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCTCGATCCATCCGTGGGACCCATAATAGGGTCACTTTCGTCATTTCAATCAGGGATCCAAGTGACTAGTTCCATTTCTCTCTAACCAAGAGTTTTCTTTCTTATTTTTC
ACTACGAGCGATCGACTGTTCGAACATGCAGCAGGGCGGAGGATCTGAATCGGAGGTCACATGGGAAGACCAGCAGAATATTAACAAATTTAGTAGGTTAAACAATCGGT
TCCACGAGCTTGAAGATGAGATTAGAACCGCCAAGCACAATGTATCTTCTTTTTCAGCTTTACTTTTTAGTGAGGATGCGAGTAATGAGTTGATTCTCTGTGATGAAGAC
GTGATTCGTTTCCATATTGGGGAAGTTTTTGCCCATGTACCAAGGGAAGAAGTAGAAGGCAGGTTGGAAGAAATGAAAGAGGAAAATGTTAAGAACTTGGAGAAACTTGA
GGAAGAAAGGGATTCTATCGTGGCCCAGATGGCTGAGTTGAAGAAAATTCTGTACGGGAAGTTCAAAGATTCCATTAATCTAGAAGATGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQQGGGSESEVTWEDQQNINKFSRLNNRFHELEDEIRTAKHNVSSFSALLFSEDASNELILCDEDVIRFHIGEVFAHVPREEVEGRLEEMKEENVKNLEKLEEERDSIVA
QMAELKKILYGKFKDSINLEDD