; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G005880 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G005880
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationchr11:6239926..6240291
RNA-Seq ExpressionLsi11G005880
SyntenyLsi11G005880
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048028.1 Rapid ALkalinization Factor [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-5894.21Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLI AAVF+IFSCSSTAVHAG+GI +SLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

KGN60987.2 hypothetical protein Csa_021272 [Cucumis sativus]1.6e-5895.76Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLICAAVF+IFSCSST VHAGLGI HSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPYSRGC+AITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]3.2e-5994.21Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]3.7e-6095.04Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGIHHSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]4.7e-63100Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein1.1e-6095.87Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLICAAVF+IFSCSST VHAGLGI HSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor5.8e-5994.21Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLI AAVF+IFSCSSTAVHAG+GI +SLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1DA82 protein RALF-like 331.9e-5791.74Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGF+SPT FLICAAVFV+F+CSSTAVH GLGIHHSLAWIP+QS+CKGSIAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPY RGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1FH12 protein RALF-like 331.5e-5994.21Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1HQE4 protein RALF-like 331.8e-6095.04Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGIHHSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 331.9e-3060.33Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
        M G ++    +I A + V F      + A +    S  ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        C+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor9.4e-3059.83Show/hide
Query:  PTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWI-PNQS--TCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGA
        P+  ++C  +   F   + A  +G     +  W+ P +S   CKGSI EC    EEFE DSE NRRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGA
Subjt:  PTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWI-PNQS--TCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGA

Query:  QANPYSRGCSAITRCRS
        QANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QANPYSRGCSAITRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.1e-2968.42Show/hide
Query:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 226.7e-2878.95Show/hide
Query:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITRCR
Subjt:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 18.5e-3163.79Show/hide
Query:  TFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ
        T FL    + V+F  SS  V AG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
Subjt:  TFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ

Query:  ANPYSRGCSAITRCRS
        ANPYSRGCS I RCRS
Subjt:  ANPYSRGCSAITRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 16.0e-3263.79Show/hide
Query:  TFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ
        T FL    + V+F  SS  V AG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
Subjt:  TFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ

Query:  ANPYSRGCSAITRCRS
        ANPYSRGCS I RCRS
Subjt:  ANPYSRGCSAITRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.2e-1655.42Show/hide
Query:  WIPNQSTCKGSIAECFG--GE-EFEFDSEINRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC
        W   +S   G    C G  GE ++  DSE NRR LA  + YISYGALR+N VPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGCS IT C
Subjt:  WIPNQSTCKGSIAECFG--GE-EFEFDSEINRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC

AT3G05490.1 ralf-like 224.8e-2978.95Show/hide
Query:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITRCR
Subjt:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.5e-3068.42Show/hide
Query:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 331.3e-3160.33Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
        M G ++    +I A + V F      + A +    S  ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        C+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTGTTATCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCACGCCGGCCTCGGGATCCACCA
CAGTCTTGCATGGATTCCTAACCAATCGACCTGCAAAGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGCGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATCTTGGCCA
CTAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACGGTGCCGTGCTCGAGACGCGGTGCATCTTACTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTATAGC
CGTGGATGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTGTTATCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCACGCCGGCCTCGGGATCCACCA
CAGTCTTGCATGGATTCCTAACCAATCGACCTGCAAAGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGCGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATCTTGGCCA
CTAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACGGTGCCGTGCTCGAGACGCGGTGCATCTTACTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTATAGC
CGTGGATGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMAGFNSPTFFLICAAVFVIFSCSSTAVHAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS
RGCSAITRCRS