; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G007600 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G007600
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionOSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B, putative
Genome locationchr11:8575356..8575916
RNA-Seq ExpressionLsi11G007600
SyntenyLsi11G007600
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7029810.1 hypothetical protein SDJN02_08153, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-6977.2Show/hide
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TYK01355.1 putative OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B [Cucumis melo var. makuwa]7.5e-6879.29Show/hide
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XP_022929606.1 uncharacterized protein LOC111436141 [Cucurbita moschata]5.2e-6976.96Show/hide
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XP_022997465.1 uncharacterized protein LOC111492375 [Cucurbita maxima]6.8e-6976.56Show/hide
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XP_023546389.1 uncharacterized protein LOC111805512 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-6876.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UK88 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B1.4e-6778.79Show/hide
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A0A5D3BQA0 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B3.6e-6879.29Show/hide
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A0A6J1ENL5 uncharacterized protein LOC1114361412.5e-6976.96Show/hide
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A0A6J1FCU1 Uncharacterized protein3.0e-6274.05Show/hide
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         R A+A TIDYSN D F + DKLETFSFLSSDCEFM S R+SM SS S   SSSSSPSSF +SLT+R   R  SC+A QINRILA
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A0A6J1K9Q8 uncharacterized protein LOC1114923753.3e-6976.56Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G25845.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B (TAIR:AT4G25850.2)1.9e-1351.19Show/hide
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        ISR SS+G      Y     EGVPF+WE QPGTP +  P++++PPLSPPPA+LSLG+PKP   IE+PK+     +++LR WK +
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AT4G25850.2 OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B1.9e-1351.19Show/hide
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AT5G01790.1 unknown protein8.7e-0652.94Show/hide
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        S  C S  I YY G A  VPF+WE+ PGTPK P  +   LPPL+PPP+  S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ACCATTCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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