; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G008670 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G008670
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionPSI subunit V
Genome locationchr11:11145491..11147064
RNA-Seq ExpressionLsi11G008670
SyntenyLsi11G008670
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0009538 - photosystem I reaction center (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003757 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI
IPR022980 - Photosystem I, reaction centre subunit XI
IPR036592 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001267647.1 photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic [Cucumis sativus]1.2e-11297.7Show/hide
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Q39654.1 RecName: Full=Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic; Short=PSI-L; AltName: Full=PSI subunit V; Flags: Precursor [Cucumis sativus]4.4e-11297.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHJ8 PSI subunit V5.7e-11397.7Show/hide
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A0A1S3B555 PSI subunit V1.5e-11398.62Show/hide
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A0A6J1D7U0 PSI subunit V1.6e-11297.24Show/hide
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A0A6J1FBZ4 PSI subunit V4.1e-11195.85Show/hide
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A0A6J1HKH3 PSI subunit V6.3e-11296.31Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P23993 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic3.9e-7970.18Show/hide
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Q39654 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic5.8e-11597.24Show/hide
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Q41385 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic7.7e-9177.17Show/hide
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Q6B8P4 Photosystem I reaction center subunit XI2.5e-3350Show/hide
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Q9SUI4 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic1.8e-9279Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G12800.1 photosystem I subunit l1.3e-9379Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATCCCTACAAGAACACACTCCTTCACCATCAGAGCCGTCCAAGCTGATAAGCCAACTTACCAAGTGATCCAGCCAATCAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTTGAGA
CTCCAGTCACCTCAAGCCCACTGATAGCATGGTATCTATCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTCAGCCCATTGCTGAGGGGAATTGAAGTGGGCCTGGCCCACGGT
TTTTTTCTGGTCGGTCCATTTGTCAAAGCTGGCCCTCTAAGGAACACAGCCTACGCCGGAGGAGCCGGCTCACTGGCTGCCGGTGGTCTCATTGTCATTTTAAGCATCTG
CTTGACAATGTATGGTGCTGCATCCTTCAATGAAGGAGAGCCATCCACTGCACCGTCGTTGACCTTGACTGGCCGGAAGAAGACCCCTGATCAGCTGCAAACAGCCGATG
GGTGGGCAAAATTCTCCGGCGGGTTCTTCTTTGGGGGGATCTCTGGTGTTATCTGGGCATACTTCCTCCTCTATGTCTTGGACCTCCCTTACTACGTCAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGATAAGGTTATGTGGCAAGTTTCATCCAATGAGAAGAGAGAGGTTTGATCAACCACAGCCTCCCACAAATTTCCATGGCCAATGACCACCAACAACAAAAACTTAAAC
TAACCCCCAAAACCAAATCTAAAAATCTCACCTCATTTTTCTTCTCTGCCACTGATCCTTTCACAAGCCGAAGGCAGCAGAAGCAAAAGCAGCAGCCATGGCCACTGCAA
CCTCCCCCATTGCCAGCCAGCTCAGTTCAAGCTTCGCTTCATCCAACACCAGAGCTTTGATCTCTCCCAAAGGCCTCTCCGCTTCGCCGCTCCGACGCATCCCTACAAGA
ACACACTCCTTCACCATCAGAGCCGTCCAAGCTGATAAGCCAACTTACCAAGTGATCCAGCCAATCAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTTGAGACTCCAGTCACCTC
AAGCCCACTGATAGCATGGTATCTATCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTCAGCCCATTGCTGAGGGGAATTGAAGTGGGCCTGGCCCACGGTTTTTTTCTGGTCG
GTCCATTTGTCAAAGCTGGCCCTCTAAGGAACACAGCCTACGCCGGAGGAGCCGGCTCACTGGCTGCCGGTGGTCTCATTGTCATTTTAAGCATCTGCTTGACAATGTAT
GGTGCTGCATCCTTCAATGAAGGAGAGCCATCCACTGCACCGTCGTTGACCTTGACTGGCCGGAAGAAGACCCCTGATCAGCTGCAAACAGCCGATGGGTGGGCAAAATT
CTCCGGCGGGTTCTTCTTTGGGGGGATCTCTGGTGTTATCTGGGCATACTTCCTCCTCTATGTCTTGGACCTCCCTTACTACGTCAAGTAGATTTTGTATCATTTTCTGT
TTCTGCAATGCAACTTCCATGTCTGTGTTAAGGAAACATAAAATTGTATATTTTCTGCCAAACCTCTTTGTTAGATCCTTTGTGATTGCATATTGATTTCCCTTTTGGAA
CTGTTATGTATGTACCCTCCTTCCATTTGCTTCTTCACAAACAATAGCTTCTGTGACACTGCATTATAAATTGGTAGGAGAAGAATATCAACAATACTTTGATACTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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