; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G010160 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G010160
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUPF0301 protein
Genome locationchr11:17224365..17228425
RNA-Seq ExpressionLsi11G010160
SyntenyLsi11G010160
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR003774 - Protein of unknown function UPF0301


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004138667.1 uncharacterized protein LOC101222789 [Cucumis sativus]9.6e-18188.95Show/hide
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XP_022939198.1 uncharacterized protein LOC111445188 isoform X2 [Cucurbita moschata]5.5e-17685.99Show/hide
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XP_022993090.1 uncharacterized protein LOC111489210 isoform X2 [Cucurbita maxima]4.2e-17685.99Show/hide
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XP_023550640.1 uncharacterized protein LOC111808722 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.5e-17685.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMD9 Uncharacterized protein4.7e-18188.95Show/hide
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A0A1S3B2S1 uncharacterized protein LOC1034853831.9e-18288.49Show/hide
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A0A5A7T638 UPF0301 protein1.9e-18288.49Show/hide
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A0A6J1FL02 uncharacterized protein LOC111445188 isoform X22.6e-17685.99Show/hide
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A0A6J1JXJ8 uncharacterized protein LOC111489210 isoform X22.0e-17685.99Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1BEV6 UPF0301 protein Cpha266_08859.8e-1928.04Show/hide
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        ++G +L+A+  L     F+RTV+++      H + G  G ++NRP+  K+        +    F +    LH GGP++             + G  E+ P
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        GL +G     ++ + L+  G+++P + RFF+GY+GW   QL EE E   WY+A  S ++I      E +W   ++  GG Y  ++  P+
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B3QMC9 UPF0301 protein Cpar_06622.8e-1828.57Show/hide
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        + G +L+A+  L     F+RTV+L+      H  EG  G ++N+P+  K+        +  + F   D  LH GGP++             +   +EV+P
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        GL +G     ++ + L+  G+++P + RFF+GYAGW   QL++E E   WY A  S+  +      E +W   ++  GG Y  ++  P+
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Q3AQ69 UPF0301 protein Cag_16018.0e-2131.18Show/hide
Query:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKK
        F+RTV+L+      H +EG  G ++NRPL  K++       D+     D  LH GGP++ +           +H  +EV+PG+ +G     DE + L+  
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Query:  GILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGSTSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK
        G++ P + RF++GYAGW   QL  E E   WY A  + ++I      E +W   ++  GG Y  ++  P+
Subjt:  GILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGSTSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK

Q3B561 UPF0301 protein Plut_06371.5e-1929.41Show/hide
Query:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKK
        F+RTV+++      H  +G  G ++NRP+  +++       ++     D  LH GGP++++           + G E+++PGL +G     +E   L+  
Subjt:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKK

Query:  GILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGSTSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK
        G+LKP + RFF+GYAGW   QL  E E   WY A  +  ++  G   E +W   ++  GG Y  ++  P+
Subjt:  GILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGSTSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK

Q8KEM4 UPF0301 protein CT06632.8e-1830.81Show/hide
Query:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFS--DCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLV
        F+RTV+L+      H +EG  G ++N+P+  K+        +  + F   D  LH GGP++     +       + G  EVIPGL +G     ++ + L+
Subjt:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFS--DCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLV

Query:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGSTSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK
          G++K  + RFF+GYAGW   QL  E E   WY A  SS  +      E +W   ++  GG Y  ++  P+
Subjt:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGSTSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33780.1 Protein of unknown function (DUF179)1.4e-11361.45Show/hide
Query:  MDLFPANVKNAAAPSPFSLKHSFPDRPISCTMPKTSRRFSSSHLFGAELLRLLEIRVFKPKLSSPAF---LVRATANKNHHNSPSPENGDHPIPGDDAKS
        MDL+   +K+    +P            S ++P+ S  FS         L  LE R    K+S+  +   +VRAT+ K++ +S S        PGD ++ 
Subjt:  MDLFPANVKNAAAPSPFSLKHSFPDRPISCTMPKTSRRFSSSHLFGAELLRLLEIRVFKPKLSSPAF---LVRATANKNHHNSPSPENGDHPIPGDDAKS

Query:  KNISDDSKSNETSSQKSHHKNLDWREFRANLFAREQAEKVEADVDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRH
           S+ +KS ++++ KS   N DWREFRANLF +EQ EK EA+        HES  +GLKWAHPIP PETGCVLVATEKLDG RTF RTVVLLLR+G+RH
Subjt:  KNISDDSKSNETSSQKSHHKNLDWREFRANLFAREQAEKVEADVDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRH

Query:  PQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYA
        PQEGPFGVVINRPLHK IKHMK T  +LATTFS+CSL+FGGPLEASMFLLKTG+K+K+ GFEEV+PGL FG RN+LDEAAVLVKKG+LKPQ+FRFFVGYA
Subjt:  PQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYA

Query:  GWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGSTSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPKQDM
        GWQLDQLREEIES+YW+VAACSS+LI G S SE LWEEILQLMGG YSELSRKPK D+
Subjt:  GWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGSTSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPKQDM

AT3G19780.1 LOCATED IN: endomembrane system2.2e-1328.96Show/hide
Query:  DDSKSNETSSQKSHHKNLDWREF-RANLFAREQAEK-VEAD-VDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHP
        + +K +++SS   ++K  D  +     L  RE AE+ V  D V+ QS  +H             P  +TG VLVATEKL    TF ++ +L++++G   P
Subjt:  DDSKSNETSSQKSHHKNLDWREF-RANLFAREQAEK-VEAD-VDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHP

Query:  QEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFV
        + G  G++ N+ +  K     P   + A    +  L FGGP+       + L +  + S  H   E+ PG+ F    ++      +K   L P ++ FF+
Subjt:  QEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFV

Query:  GYAGWQLDQLREEIESNYWYV
        GY+ W  +QL +EI    W V
Subjt:  GYAGWQLDQLREEIESNYWYV

AT3G19780.2 LOCATED IN: endomembrane system2.2e-1328.96Show/hide
Query:  DDSKSNETSSQKSHHKNLDWREF-RANLFAREQAEK-VEAD-VDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHP
        + +K +++SS   ++K  D  +     L  RE AE+ V  D V+ QS  +H             P  +TG VLVATEKL    TF ++ +L++++G   P
Subjt:  DDSKSNETSSQKSHHKNLDWREF-RANLFAREQAEK-VEAD-VDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHP

Query:  QEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFV
        + G  G++ N+ +  K     P   + A    +  L FGGP+       + L +  + S  H   E+ PG+ F    ++      +K   L P ++ FF+
Subjt:  QEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFV

Query:  GYAGWQLDQLREEIESNYWYV
        GY+ W  +QL +EI    W V
Subjt:  GYAGWQLDQLREEIESNYWYV

AT3G29240.1 Protein of unknown function (DUF179)1.8e-5242.31Show/hide
Query:  ELLRLLEIRVFK-PKLSSPAFLVRATANKNHHNSPSPENGDHPIPGDDAKSKNISDDSKSNETSSQKSHHKNLDWREFRANLFAREQAEKVEAD------
        EL+  ++ R+F  PK +S  F+ R  A+    N  S  +   P+  DDA   ++  D  +N TS       + DWREFRA L A EQA   E D      
Subjt:  ELLRLLEIRVFK-PKLSSPAFLVRATANKNHHNSPSPENGDHPIPGDDAKSKNISDDSKSNETSSQKSHHKNLDWREFRANLFAREQAEKVEAD------

Query:  ----VDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHF
            VD Q ++    + +G KWAH I  PETGC+L+ATEKLDGV  FE+TV+LLL  G      GP GV++NRP    IK  K T +D+A TFSD  L F
Subjt:  ----VDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHF

Query:  GGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGST--S
        GGPLE  +FL+        E  K   F +V+ GL +G R ++  AA +VK+ ++   + RFF GY GW+ +QL+ EI   YW VAACSS ++  GS   S
Subjt:  GGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGST--S

Query:  EGLWEEILQLMG
         GLW+E+L L+G
Subjt:  EGLWEEILQLMG

AT3G29240.2 Protein of unknown function (DUF179)1.8e-5242.31Show/hide
Query:  ELLRLLEIRVFK-PKLSSPAFLVRATANKNHHNSPSPENGDHPIPGDDAKSKNISDDSKSNETSSQKSHHKNLDWREFRANLFAREQAEKVEAD------
        EL+  ++ R+F  PK +S  F+ R  A+    N  S  +   P+  DDA   ++  D  +N TS       + DWREFRA L A EQA   E D      
Subjt:  ELLRLLEIRVFK-PKLSSPAFLVRATANKNHHNSPSPENGDHPIPGDDAKSKNISDDSKSNETSSQKSHHKNLDWREFRANLFAREQAEKVEAD------

Query:  ----VDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHF
            VD Q ++    + +G KWAH I  PETGC+L+ATEKLDGV  FE+TV+LLL  G      GP GV++NRP    IK  K T +D+A TFSD  L F
Subjt:  ----VDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSDCSLHF

Query:  GGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGST--S
        GGPLE  +FL+        E  K   F +V+ GL +G R ++  AA +VK+ ++   + RFF GY GW+ +QL+ EI   YW VAACSS ++  GS   S
Subjt:  GGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGST--S

Query:  EGLWEEILQLMG
         GLW+E+L L+G
Subjt:  EGLWEEILQLMG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCTCTTTCCTGCCAATGTCAAGAACGCCGCCGCTCCTTCCCCTTTCTCACTCAAACACTCCTTTCCTGATAGACCCATTTCTTGCACTATGCCGAAGACTTCCAG
GAGATTCTCTTCTTCACATCTCTTTGGTGCTGAACTTCTACGCCTGCTTGAGATCCGTGTTTTCAAGCCCAAGCTTTCCTCTCCCGCTTTTCTCGTCAGAGCGACTGCCA
ACAAGAATCACCACAATTCTCCATCTCCTGAAAATGGAGATCATCCAATTCCTGGAGATGATGCTAAATCAAAGAATATTTCTGATGACAGCAAAAGTAATGAAACTTCT
TCCCAGAAATCACATCACAAAAATTTGGACTGGCGAGAATTCAGAGCAAACCTATTTGCTCGTGAGCAGGCAGAAAAGGTTGAAGCTGATGTGGACGTCCAGAGTGCAAA
TGTTCACGAGTCTATGGCTCTCGGGCTGAAGTGGGCGCATCCTATTCCTATACCAGAGACTGGATGTGTCCTTGTTGCCACCGAGAAGTTGGATGGTGTTCGCACTTTTG
AGCGAACAGTCGTCCTTCTCCTCAGATCTGGAAGCAGACATCCTCAGGAGGGACCGTTCGGTGTGGTAATAAATCGCCCACTCCACAAAAAGATCAAGCATATGAAACCA
ACCAATATTGACTTAGCAACTACATTTTCTGATTGCTCTCTACATTTTGGGGGACCTCTTGAGGCAAGCATGTTTTTGCTGAAGACAGGAGAAAAATCGAAACTCCATGG
GTTTGAAGAAGTGATCCCAGGTCTCTGCTTTGGCGCTCGAAACACCCTTGATGAAGCTGCAGTGCTGGTGAAGAAGGGAATCCTTAAACCTCAGGACTTCAGATTCTTTG
TGGGTTATGCTGGTTGGCAACTGGATCAATTGAGGGAGGAGATTGAATCAAATTACTGGTATGTGGCTGCTTGTAGCTCAAATCTAATTGGTGGAGGCAGCACATCAGAG
GGACTGTGGGAGGAGATTTTGCAGTTAATGGGTGGTCACTATTCAGAGTTGAGCAGAAAGCCTAAGCAAGATATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTCTCTCTCTGCCCTTCTTCTCCTTAAACTGTTTAGCTGCTCATCGTTTGCCTTTCAATCTTCAATCCCATTATATATCGCCTTGTTATTCTCCTTTTTCTTCTCTTCC
TTTTTTCCTATCTCTTTTGTTTCTCCCGATTCCTTTGGATTGGATCATCGTCTCCGACGTTTCGGATATGGATCTCTTTCCTGCCAATGTCAAGAACGCCGCCGCTCCTT
CCCCTTTCTCACTCAAACACTCCTTTCCTGATAGACCCATTTCTTGCACTATGCCGAAGACTTCCAGGAGATTCTCTTCTTCACATCTCTTTGGTGCTGAACTTCTACGC
CTGCTTGAGATCCGTGTTTTCAAGCCCAAGCTTTCCTCTCCCGCTTTTCTCGTCAGAGCGACTGCCAACAAGAATCACCACAATTCTCCATCTCCTGAAAATGGAGATCA
TCCAATTCCTGGAGATGATGCTAAATCAAAGAATATTTCTGATGACAGCAAAAGTAATGAAACTTCTTCCCAGAAATCACATCACAAAAATTTGGACTGGCGAGAATTCA
GAGCAAACCTATTTGCTCGTGAGCAGGCAGAAAAGGTTGAAGCTGATGTGGACGTCCAGAGTGCAAATGTTCACGAGTCTATGGCTCTCGGGCTGAAGTGGGCGCATCCT
ATTCCTATACCAGAGACTGGATGTGTCCTTGTTGCCACCGAGAAGTTGGATGGTGTTCGCACTTTTGAGCGAACAGTCGTCCTTCTCCTCAGATCTGGAAGCAGACATCC
TCAGGAGGGACCGTTCGGTGTGGTAATAAATCGCCCACTCCACAAAAAGATCAAGCATATGAAACCAACCAATATTGACTTAGCAACTACATTTTCTGATTGCTCTCTAC
ATTTTGGGGGACCTCTTGAGGCAAGCATGTTTTTGCTGAAGACAGGAGAAAAATCGAAACTCCATGGGTTTGAAGAAGTGATCCCAGGTCTCTGCTTTGGCGCTCGAAAC
ACCCTTGATGAAGCTGCAGTGCTGGTGAAGAAGGGAATCCTTAAACCTCAGGACTTCAGATTCTTTGTGGGTTATGCTGGTTGGCAACTGGATCAATTGAGGGAGGAGAT
TGAATCAAATTACTGGTATGTGGCTGCTTGTAGCTCAAATCTAATTGGTGGAGGCAGCACATCAGAGGGACTGTGGGAGGAGATTTTGCAGTTAATGGGTGGTCACTATT
CAGAGTTGAGCAGAAAGCCTAAGCAAGATATGTAGTTTACTTTACTTTACTTGTGAAGAAACATTGAAAAAATCTGGAGTTAAATGTGTGATCTAGTTAAAGCCATAAAA
ACCTGAAAGCCAAATGTACAGATGTTAGCTGGCTTTTGAAATTTAGCAGACCTCTTCTCTTTCTTTAAGGATATCAACGACCTTTTATAGCTATTTCTAAATGTAATCTA
TGTATGTTCTGTTACACATTTGTTTCATTCAATAGCTTTGGAATCTGCCTACGTCTGCTAATAATAATAACAATTTTCATTAAAAATTTATAGCTGAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLFPANVKNAAAPSPFSLKHSFPDRPISCTMPKTSRRFSSSHLFGAELLRLLEIRVFKPKLSSPAFLVRATANKNHHNSPSPENGDHPIPGDDAKSKNISDDSKSNETS
SQKSHHKNLDWREFRANLFAREQAEKVEADVDVQSANVHESMALGLKWAHPIPIPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKP
TNIDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESNYWYVAACSSNLIGGGSTSE
GLWEEILQLMGGHYSELSRKPKQDM