; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G010690 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G010690
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationchr11:18680659..18684699
RNA-Seq ExpressionLsi11G010690
SyntenyLsi11G010690
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036519.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-10198.36Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTF FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_004148299.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 isoform X2 [Cucumis sativus]8.6e-10197.27Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTF FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_008447054.1 PREDICTED: NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucumis melo]1.3e-10198.36Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTF FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_022136196.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Momordica charantia]3.0e-10197.27Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA NANGKPPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTF FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPK+FESNVRRAMAGGYVGQT+FTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]4.1e-10399.45Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTF FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K481 UBC core domain-containing protein4.2e-10197.27Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTF FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like6.5e-10298.36Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTF FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like6.5e-10298.36Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTF FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.4e-10197.27Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA NANGKPPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTF FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPK+FESNVRRAMAGGYVGQT+FTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like9.3e-10196.72Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA NA+GKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKD+LMNFEVTIHPDEGYYLGGTF FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVG T+FTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc124.7e-6563.39Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E  +    K   KK +A +LR+QKDI+ELNLPKTC ISF +  DDL+NF++ I PDEG+Y  G F FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G TYF RC+
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.7e-6563.39Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E  +    K   KK +A +LR+QKDI+ELNLPKTC I F +  DDL+NF++ I PDEG+Y GG F FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G TYF RC+
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.7e-6563.39Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E  +    K   KK +A +LR+QKDI+ELNLPKTC I F +  DDL+NF++ I PDEG+Y GG F FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G TYF RC+
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc126.7e-8884.24Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A NA  G   VKKQ+AGELRL KDISELNLP +CSISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVGQT+F RC+
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like6.9e-8582.16Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT
        MI LFKVKEKQRE + + NG+    VKKQ+AGELRL KDISELNLPK+C ISFPNGK+DLMNFEVTI PDEGYYL G F FSFQVS +YPHE PKVKCKT
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT

Query:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN+EDPLNH+AAAVLRDNPK FE NVRRAM GG VGQT F RCM
Subjt:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein4.9e-8682.16Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT
        MI LFKVKEKQRE + + NG+    VKKQ+AGELRL KDISELNLPK+C ISFPNGK+DLMNFEVTI PDEGYYL G F FSFQVS +YPHE PKVKCKT
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT

Query:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN+EDPLNH+AAAVLRDNPK FE NVRRAM GG VGQT F RCM
Subjt:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 119.1e-2437.78Show/hide
Query:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY
        R+ K++ +L      + S     +D+ +++ TI  P E  Y GG F  S    P YP +PPKV  KTKVYHPNI+  G++CL+IL+E W P L I+ ++ 
Subjt:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY

Query:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR
         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
Subjt:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR

AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 119.1e-2437.78Show/hide
Query:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY
        R+ K++ +L      + S     +D+ +++ TI  P E  Y GG F  S    P YP +PPKV  KTKVYHPNI+  G++CL+IL+E W P L I+ ++ 
Subjt:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY

Query:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR
         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
Subjt:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR

AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 14.7e-8984.24Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A NA  G   VKKQ+AGELRL KDISELNLP +CSISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVGQT+F RC+
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 14.7e-8984.24Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A NA  G   VKKQ+AGELRL KDISELNLP +CSISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVGQT+F RC+
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGCGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGTCAAGAAGCAAACTGCTGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGA
TATCAGTGAATTGAACCTACCAAAAACGTGTAGTATATCGTTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATACTATCTAG
GCGGTACATTTTTCTTCTCTTTCCAAGTTTCTCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACCTGGAAGGAAAT
GTTTGTCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTGTTTCATCTTTTCACGCAACCGAATCATGAAGACCCCCTCAA
CCATGATGCTGCTGCTGTTTTGAGAGATAACCCGAAGATGTTCGAATCCAACGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGCTATGTAGGACAAACTTACTTCACTCGTTGCATGT
AG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATAGCTTCCGCATCTCTGGTCCGTCCCGTCTCTCCTTCACAGAAACGGGACAGAGGCGCAGTAAGTCGACCGAGCTGTCACTCACAGAGCCCACGTGGCAGTTTCTGAT
TGGTTCCTAAGAATGAAGGTGAAGTAAGTTTTTTTTGATGTGGGTGACGCCGGTCCTCAGTCGAAGCTCGAAAGCGAAGGGATCCGAATTTGGGCCTGCAGAACGTACGA
CGATAATTTTCACTGAGAGAAAGAAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTTTGATTCTGAATCAATCAACCCCACCTCACTCTTTCTTTCTCTCTT
CATCTCCATCTTTATCCTTTCAAAAATTTGTTTCTAACTCCTTCAAATCCACAGGCAACCCTCCGTTTCTTCTCTCTGTACTCTGCAGGAACGATGATTAAGCTTTTTAA
AGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGCGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGTCAAGAAGCAAACTGCTGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGATATCAGTGAATTGAACC
TACCAAAAACGTGTAGTATATCGTTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATACTATCTAGGCGGTACATTTTTCTTC
TCTTTCCAAGTTTCTCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACCTGGAAGGAAATGTTTGTCTCAATATTTT
AAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTGTTTCATCTTTTCACGCAACCGAATCATGAAGACCCCCTCAACCATGATGCTGCTGCTG
TTTTGAGAGATAACCCGAAGATGTTCGAATCCAACGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGCTATGTAGGACAAACTTACTTCACTCGTTGCATGTAGATTCTACATGAATTG
TAAAGCACCAGATATATTATTTGAAGCATGGGCTCTGCGAGGTCGTTGAACTTCTCTGGTAAGGTAATGTCTAATGTGTTGAGGACTGTCTGATCACCGATGCAACACGA
AGTCCTTTGTTGATGGAGGTAGAACTTTGTTGTGTGTTTGAAGTATTGGTTTCAAATGAAAGTTGGACTGGAAACTGAAACTCTTATCTGTGTATGTATTTCCTCTAATT
TATCTTGAAAAGACAGGTTGCTCTTTTGCTATCAGTTGAAAGTATAAGGTATGTTTTTGGAGCCTCCCTTCTTTTCTTTATCAGAGTCTACTACTTACTATGGATGTAAA
TTTACTGAATTGTTGAATCACAATGATTTATTTCCTTATATATTTCAAGTTTGTAAAAATCTCTGTTAGTTTCACATTTTGTCATCATCACAAGATTCGAAAAGTTTTTA
TCATTTTCATCTCTACTTGCTCATACCCTTTATCTCAATGGCCATTCTGACTGTGTTGCTTCAATGATTGTGTAATTGAAAAGCTTTTTGGGCTAAGTGACAGAAATCTC
AAGAAGCAATTTTGTTGAGTGGTATGTAACATGGCTTTCAAATACTAGAGAGAGAAAACAGATTTTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFFFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGN
VCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM