; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G011460 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G011460
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionPolyprenol reductase
Genome locationchr11:19992854..19998015
RNA-Seq ExpressionLsi11G011460
SyntenyLsi11G011460
Gene Ontology termsGO:0006488 - dolichol-linked oligosaccharide biosynthetic process (biological process)
GO:0016095 - polyprenol catabolic process (biological process)
GO:0019408 - dolichol biosynthetic process (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0003865 - 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001104 - 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, C-terminal
IPR039698 - Polyprenol reductase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022255.1 Polyprenol reductase 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-13968.43Show/hide
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XP_004148545.1 polyprenol reductase 2 [Cucumis sativus]2.1e-14871.72Show/hide
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XP_008444886.1 PREDICTED: polyprenol reductase 2 [Cucumis melo]2.3e-14771.21Show/hide
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XP_022971054.1 polyprenol reductase 2-like [Cucurbita maxima]3.1e-13968.43Show/hide
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XP_038888381.1 polyprenol reductase 2 isoform X2 [Benincasa hispida]8.6e-15072.47Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5R7 Polyprenol reductase1.0e-14871.72Show/hide
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A0A1S3BBF0 Polyprenol reductase1.1e-14771.21Show/hide
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A0A6J1C196 Polyprenol reductase9.7e-13166.41Show/hide
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A0A6J1F6C0 Polyprenol reductase4.3e-13968.43Show/hide
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A0A6J1I5R2 Polyprenol reductase1.5e-13968.43Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XWN6 Polyprenol reductase 11.4e-7843.78Show/hide
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        LL  AWIA  LPIIVA LP       +  R +L  F+ RGKT++          SS  KFTVPQK+F HFYV+ V+ TT+LL   W YAY+  TP + E 
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         ++  I S L  GS+SFS+ +  S    H++ VW+ VF+LLLME+QVLRRLYET ++F+YSPSARMHI GYLTGLF+Y A PLSL S+CIPE   ++   
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        +A+FIV+G+ +MPD  ++    + PL  LGW QWIG  +F WG +HQ RCH IL                  L+++K + +          ++  C   F
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        N                R  C +    L       VIY G++VASGGED  +W LF FV+T          NL+FAA ETHKWY +KF++YPR R+AIIP
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        ++
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B8B6G5 Polyprenol reductase 23.6e-7442.54Show/hide
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        LL  AWIA  LPII A LP  T    +  R +L  F+ RGKT++          SS  KFTVPQK+F HFYV+ V+ TT+LL   W YAY+  TP + E 
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         ++  I S L  GS+SFS+ + +S    H++ VW+ VF LLLMEVQVLRRLYET ++F+YSP ARMHI GYLTGLF+Y A PLSL S+CIPE   +    
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        + +F+V+G+ +MPD  ++    + PL  LGW QWIG  +F WG +HQ RCH I        L SL  H      +Y      C   V C ++L E     
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                                          +VIY G++VASG ED  +W LF F++T          NL+FAA ET+ WY +KF++YPR R+AIIP
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        ++
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Q7XUH5 Polyprenol reductase 11.4e-7843.78Show/hide
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        LL  AWIA  LPIIVA LP       +  R +L  F+ RGKT++          SS  KFTVPQK+F HFYV+ V+ TT+LL   W YAY+  TP + E 
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         ++  I S L  GS+SFS+ +  S    H++ VW+ VF+LLLME+QVLRRLYET ++F+YSPSARMHI GYLTGLF+Y A PLSL S+CIPE   ++   
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        +A+FIV+G+ +MPD  ++    + PL  LGW QWIG  +F WG +HQ RCH IL                  L+++K + +          ++  C   F
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        N                R  C +    L       VIY G++VASGGED  +W LF FV+T          NL+FAA ETHKWY +KF++YPR R+AIIP
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        ++
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Q9CAH5 Polyprenol reductase 11.2e-8045Show/hide
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        ME+ IVWL++AA    WI  +LP+++A +P S LN FR ++L FA RGK L  SS+KFTVPQKFF HFYV+ V+WTTLLL  TW+YA             
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             ++ GGS  FS+  +     EHRF V +AVFLLLLME+ VLRR+ E+ Y+F YS SARMHI  Y+  LF+Y A PLSLCSN  PEV  FV S +A+
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        FI  GK    D   NLL ++ PL  LG LQWIG A+F WGWIHQRRCH IL      SL       ++ +  Y    +M    V C +FL E        
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                                       +V+Y GL+++SGG D +IWLLFGFV            NL +AA ETH+WY +KF+NYP  R AI P++Y
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Q9SI62 Polyprenol reductase 24.5e-9348.5Show/hide
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        +EL IVWL+R A    WI  +LP+++A +P S LN FR ++L FA RGK L  SS+KFT+PQK F HFYV+ V+WTTLLL  TW+YA    P  SE F  
Subjt:  MELGIVWLLRAA----WIAGMLPIIVAFLPFSTLNWFRGILLGFAKRGKTLQSSSRKFTVPQKFFCHFYVLAVIWTTLLLGTTWIYAYVSTPEISEPFNF

Query:  PAITSQLTGGSSSFSWQKSQSSRREHRFLVWKAVFLLLLMEVQVLRRLYETIYIFNYSPSARMHIFGYLTGLFFYTAGPLSLCSNCIPEVYHFVASGLAQ
          I S+L GGS  FS  KS  +  EHRF VW+AVFLLLLME+ VLRRL E+ Y+F YSPSARMHI GY  GLFFY   PLSLCSN  PEV  FV + +A+
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        FI  GK      E NLL ++ PL  LG LQWIG A+F WGWIHQRRCH IL      SL       ++ +  Y     M    V   +FL E        
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                                       +V+Y GL++ASGG D TIWLLFGFV            NL +AA ETH+WY RKF+NYP +R AI PY+Y
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72590.1 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein8.2e-8245Show/hide
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        ME+ IVWL++AA    WI  +LP+++A +P S LN FR ++L FA RGK L  SS+KFTVPQKFF HFYV+ V+WTTLLL  TW+YA             
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             ++ GGS  FS+  +     EHRF V +AVFLLLLME+ VLRR+ E+ Y+F YS SARMHI  Y+  LF+Y A PLSLCSN  PEV  FV S +A+
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        FI  GK    D   NLL ++ PL  LG LQWIG A+F WGWIHQRRCH IL      SL       ++ +  Y    +M    V C +FL E        
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                                       +V+Y GL+++SGG D +IWLLFGFV            NL +AA ETH+WY +KF+NYP  R AI P++Y
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AT2G16530.1 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein3.2e-9448.5Show/hide
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        +EL IVWL+R A    WI  +LP+++A +P S LN FR ++L FA RGK L  SS+KFT+PQK F HFYV+ V+WTTLLL  TW+YA    P  SE F  
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          I S+L GGS  FS  KS  +  EHRF VW+AVFLLLLME+ VLRRL E+ Y+F YSPSARMHI GY  GLFFY   PLSLCSN  PEV  FV + +A+
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        FI  GK      E NLL ++ PL  LG LQWIG A+F WGWIHQRRCH IL      SL       ++ +  Y     M    V   +FL E        
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                                       +V+Y GL++ASGG D TIWLLFGFV            NL +AA ETH+WY RKF+NYP +R AI PY+Y
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AT2G16530.2 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein3.0e-9248.25Show/hide
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        +EL IVWL+R A    WI  +LP+++A +P S LN FR ++L FA RGK L  SS +FT+PQK F HFYV+ V+WTTLLL  TW+YA    P  SE F  
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Query:  PAITSQLTGGSSSFSWQKSQSSRREHRFLVWKAVFLLLLMEVQVLRRLYETIYIFNYSPSARMHIFGYLTGLFFYTAGPLSLCSNCIPEVYHFVASGLAQ
          I S+L GGS  FS  KS  +  EHRF VW+AVFLLLLME+ VLRRL E+ Y+F YSPSARMHI GY  GLFFY   PLSLCSN  PEV  FV + +A+
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        FI  GK      E NLL ++ PL  LG LQWIG A+F WGWIHQRRCH IL      SL       ++ +  Y     M    V   +FL E        
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Query:  PRLISLIRSEINLFRAHCGYVENNLKSIEFLMVIYGGLVVASGGEDFTIWLLFGFVLTNVELKMEKVVNLAFAAAETHKWYFRKFDNYPRDRFAIIPYIY
                                       +V+Y GL++ASGG D TIWLLFGFV            NL +AA ETH+WY RKF+NYP +R AI PY+Y
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AT3G43840.1 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein3.2e-0953.85Show/hide
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        IWLLFGFV            NL +AA ETH+WY  KF+NYP +R AI PY+Y
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ACAGCAGTCACCATGACGGTGGAAACCGCCGAAACACCTGTGGAACCGGCGGCGATCTTAGCATCTACTTCCGCTAATTCGTCTTTCCGCTGTCCCAATCTGCTTCTATT
CGGTTTTACTTTCATTTCAGACGATCGAACGCTTCATTCCTCCAGAATACTGCGAAAATCAAGCGAAATGGAGCTGGGAATTGTTTGGCTTCTTAGAGCTGCTTGGATTG
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AGGAAATTCACTGTACCTCAGAAATTCTTCTGCCACTTTTATGTTTTGGCTGTTATCTGGACAACCTTGTTGCTAGGAACAACTTGGATCTATGCATATGTATCAACCCC
GGAAATCTCAGAGCCATTTAACTTTCCTGCCATTACCAGCCAGTTGACTGGAGGTTCAAGTTCGTTTTCATGGCAAAAATCTCAATCATCTCGGAGGGAACACAGATTCC
TGGTCTGGAAAGCTGTTTTTCTGCTTTTATTAATGGAAGTTCAAGTTTTGAGACGTCTTTATGAAACAATATACATTTTCAACTATAGTCCCTCGGCTCGGATGCATATC
TTTGGATATTTAACCGGCTTGTTTTTCTATACAGCAGGTCCTCTATCACTTTGTAGCAATTGTATTCCAGAAGTGTATCACTTTGTCGCAAGTGGGCTAGCTCAATTTAT
TGTTCAAGGAAAAAGGCAAATGCCTGATGGTGAAGTCAACCTGTTGGATGCTGTGATTCCTCTATCAAATTTAGGGTGGCTTCAGTGGATTGGTACAGCTTTATTCTTTT
GGGGTTGGATTCATCAGCGTCGTTGCCATCAGATTCTGCTTTATTACCTCGATAGTTCACTATGTTCTCTGATCCTTCATAATCAACAGATTCTTCAACAATACAAAAAG
AATCTAAAAATGTGCTTAATTGGGGTATTATGTTTGAACTTTCTCGGCGAATGCCACCATATTTTCAACTCAAATCCTAGATTGATTTCACTGATACGTAGCGAGATTAA
TTTGTTTAGGGCTCACTGCGGGTACGTAGAGAACAATCTGAAGAGTATAGAATTCCTTATGGTTATATATGGTGGACTTGTAGTTGCTAGTGGAGGAGAAGATTTCACAA
TCTGGCTACTTTTTGGATTTGTGCTTACAAATGTGGAACTAAAGATGGAGAAGGTGGTAAATCTGGCCTTTGCAGCAGCAGAAACACATAAGTGGTATTTTCGTAAATTC
GATAATTATCCGAGAGACCGATTTGCTATTATACCATATATATATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACAGCAGTCACCATGACGGTGGAAACCGCCGAAACACCTGTGGAACCGGCGGCGATCTTAGCATCTACTTCCGCTAATTCGTCTTTCCGCTGTCCCAATCTGCTTCTATT
CGGTTTTACTTTCATTTCAGACGATCGAACGCTTCATTCCTCCAGAATACTGCGAAAATCAAGCGAAATGGAGCTGGGAATTGTTTGGCTTCTTAGAGCTGCTTGGATTG
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AGGAAATTCACTGTACCTCAGAAATTCTTCTGCCACTTTTATGTTTTGGCTGTTATCTGGACAACCTTGTTGCTAGGAACAACTTGGATCTATGCATATGTATCAACCCC
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TGTTCAAGGAAAAAGGCAAATGCCTGATGGTGAAGTCAACCTGTTGGATGCTGTGATTCCTCTATCAAATTTAGGGTGGCTTCAGTGGATTGGTACAGCTTTATTCTTTT
GGGGTTGGATTCATCAGCGTCGTTGCCATCAGATTCTGCTTTATTACCTCGATAGTTCACTATGTTCTCTGATCCTTCATAATCAACAGATTCTTCAACAATACAAAAAG
AATCTAAAAATGTGCTTAATTGGGGTATTATGTTTGAACTTTCTCGGCGAATGCCACCATATTTTCAACTCAAATCCTAGATTGATTTCACTGATACGTAGCGAGATTAA
TTTGTTTAGGGCTCACTGCGGGTACGTAGAGAACAATCTGAAGAGTATAGAATTCCTTATGGTTATATATGGTGGACTTGTAGTTGCTAGTGGAGGAGAAGATTTCACAA
TCTGGCTACTTTTTGGATTTGTGCTTACAAATGTGGAACTAAAGATGGAGAAGGTGGTAAATCTGGCCTTTGCAGCAGCAGAAACACATAAGTGGTATTTTCGTAAATTC
GATAATTATCCGAGAGACCGATTTGCTATTATACCATATATATATTGAACCATATGATATTTTCAACAACACTTGCTAAGTACTTACTGTTTCATCATAATCAGTTAGGT
TGCTTATTTTGAATTCCATAAGGTAATGATAATGATGTTGTATATAGAGTTTATGCCTCATATTTGGTAGGCCTGAAAGCTCTTTCAATTATTAATTTGGTTTGATTTTG
ATGGATTTGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
TAVTMTVETAETPVEPAAILASTSANSSFRCPNLLLFGFTFISDDRTLHSSRILRKSSEMELGIVWLLRAAWIAGMLPIIVAFLPFSTLNWFRGILLGFAKRGKTLQSSS
RKFTVPQKFFCHFYVLAVIWTTLLLGTTWIYAYVSTPEISEPFNFPAITSQLTGGSSSFSWQKSQSSRREHRFLVWKAVFLLLLMEVQVLRRLYETIYIFNYSPSARMHI
FGYLTGLFFYTAGPLSLCSNCIPEVYHFVASGLAQFIVQGKRQMPDGEVNLLDAVIPLSNLGWLQWIGTALFFWGWIHQRRCHQILLYYLDSSLCSLILHNQQILQQYKK
NLKMCLIGVLCLNFLGECHHIFNSNPRLISLIRSEINLFRAHCGYVENNLKSIEFLMVIYGGLVVASGGEDFTIWLLFGFVLTNVELKMEKVVNLAFAAAETHKWYFRKF
DNYPRDRFAIIPYIY