| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0025132.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.4e-95 | 85.83 | Show/hide |
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MDFDEYDYLEKTVENPEGQKVKETANGGD +MKSG+KH SRSSKYKSDGKDDGEHRSKRSKS+DESRDRDRHRDRTSSRHRSRSRERDRDKHRSSKENRG
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K+DREGN+EER SKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERER RRSRSRSERHRSD+++GIRERSRDNELREREKERESRERGRD G + +
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+D + RRYK+KK+E AEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRA
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| XP_008447936.1 PREDICTED: RNA-binding protein 39 isoform X1 [Cucumis melo] | 1.1e-95 | 84.94 | Show/hide |
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MDFDEYDYLEKTVENPEGQKVKETANGGD +MKSG+KH SRS KYKSDGKDDGEHRSKRSKS+DESRDRDRHRDRTSSRHRSRSRERDRDKHRSSKENRG
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K+DREGN+EER SKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERER RRSRSRSERHRSD+++GIRERSRDNELREREKERESRERGRDG
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RRYK+KK+E AEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKV D
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| XP_008447937.1 PREDICTED: RNA-binding protein 39 isoform X2 [Cucumis melo] | 5.4e-95 | 84.56 | Show/hide |
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MDFDEYDYLEKTVENPEGQKVKETANGGD +MKSG+KH SRS KYKSDGKDDGEHRSKRSKS+DESRDRDRHRDRTSSRHRSRSRERDRDKHRSSKENRG
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K+DREGN+EER SKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERER RRSRSRSERHRSD+++GIRERSRDNELREREKERESRERGRDG
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RYK+KK+E AEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKV D
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| XP_011658601.1 RNA-binding protein 39 isoform X1 [Cucumis sativus] | 1.2e-94 | 84.17 | Show/hide |
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KEDREGN+EER SKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERE+ RRSRSRSERHRSD+++GIRERSRDNELREREKERESRERGRDG
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RRYK+KK+E AEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKV D
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| XP_011658603.1 RNA-binding protein 39 isoform X2 [Cucumis sativus] | 5.9e-94 | 83.78 | Show/hide |
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MDFDEYDYLEKTVENPEGQKVKETANGGD +MKSG+KH SRSSKYKSDGKDDGEHRSK KS+DESRDRDRHRDRTSSRHRSRSRERDRD+HRSSKENRG
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KEDREGN+EER SKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERE+ RRSRSRSERHRSD+++GIRERSRDNELREREKERESRERGRDG
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RYK+KK+E AEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKV D
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K4Q5 Uncharacterized protein | 5.8e-95 | 84.17 | Show/hide |
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MDFDEYDYLEKTVENPEGQKVKETANGGD +MKSG+KH SRSSKYKSDGKDDGEHRSK KS+DESRDRDRHRDRTSSRHRSRSRERDRD+HRSSKENRG
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KEDREGN+EER SKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERE+ RRSRSRSERHRSD+++GIRERSRDNELREREKERESRERGRDG
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RRYK+KK+E AEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKV D
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| A0A1S3BIJ5 RNA-binding protein 39 isoform X1 | 5.2e-96 | 84.94 | Show/hide |
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MDFDEYDYLEKTVENPEGQKVKETANGGD +MKSG+KH SRS KYKSDGKDDGEHRSKRSKS+DESRDRDRHRDRTSSRHRSRSRERDRDKHRSSKENRG
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K+DREGN+EER SKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERER RRSRSRSERHRSD+++GIRERSRDNELREREKERESRERGRDG
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RRYK+KK+E AEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKV D
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| A0A1S3BJ70 RNA-binding protein 39 isoform X2 | 2.6e-95 | 84.56 | Show/hide |
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K+DREGN+EER SKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERER RRSRSRSERHRSD+++GIRERSRDNELREREKERESRERGRDG
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RYK+KK+E AEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKV D
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|
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| A0A5A7SIV7 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 1.2e-95 | 85.83 | Show/hide |
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K+DREGN+EER SKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERER RRSRSRSERHRSD+++GIRERSRDNELREREKERESRERGRD G + +
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+D + RRYK+KK+E AEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRA
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| A0A6J1GM48 RNA-binding protein 39-like | 3.1e-88 | 79.92 | Show/hide |
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MDFDEYDYLEKTVENPEGQKVKETANGGDA+MKSG+KHRSRSSKYK+DGKDDGEHRSKRSKSEDES D DRHRDRTSSRHRSRSR+RDRD+H S KE RG
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KEDRE NQEER SKDRDVDRDKER HD DRRGRDGE++RERER RSRS SERHRSD++E IR+R+RDNE REREKERESRERGRDG
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RR+KEKKE+G EPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDV+EFFSRAGKV D
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| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G16940.1 Splicing factor, CC1-like | 1.1e-37 | 50.96 | Show/hide |
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MDFDEY+YLEKTVENP + E N GGD +KS K RSRSS+ HR + K DE D R R+ S HRSRSR+R+RD+HRSS+E+R
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Query: GKE-DREGNQEERRSKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERERPRRSRSRSERHRSDQNEGIRERSRDNELREREKERESRERGRDGRNAGEGVLITK
++ +++ ++EER KDR+ DRDK DRD +GRD E++R RRSRSRSERHRS + R+ L KERE+++R RD
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RR+K+KKE+ EPEADPERDQRTVFAYQI+L+ATERDVYEFFSRAGKV D
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| AT2G16940.2 Splicing factor, CC1-like | 4.2e-37 | 47.92 | Show/hide |
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MDFDEY+YLEKTVENP + E N GGD +KS K RSRSS+ HR + K DE D R R+ S HRSRSR+R+RD+HRSS+E+R
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Query: GKE-DREGNQEERRSKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERERPRRSRSRSERHRSDQNEGIRERSRDNELREREKERESRERGRDGRNAGEGVL---
++ +++ ++EER KDR+ DRDK DRD +GRD E++R RRSRSRSERHRS + R+ L KERE+++R RD R E V+
Subjt: GKE-DREGNQEERRSKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERERPRRSRSRSERHRSDQNEGIRERSRDNELREREKERESRERGRDGRNAGEGVL---
Query: -----------------------ITKDVSDQCFFPPHR-RYKEKKEEGAEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKVLD
I C + R R+K+KKE+ EPEADPERDQRTVFAYQI+L+ATERDVYEFFSRAGKV D
Subjt: -----------------------ITKDVSDQCFFPPHR-RYKEKKEEGAEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKVLD
|
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| AT2G16940.3 Splicing factor, CC1-like | 9.9e-39 | 47.23 | Show/hide |
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MDFDEY+YLEKTVENP + E N GGD +KS K RSRSS+ HR + K DE D R R+ S HRSRSR+R+RD+HRSS+E+R
Subjt: MDFDEYDYLEKTVENPEGQKVKETAN-GGDADMKSGEKHRSRSSKYKSDGKDDGEHRSKRSKSEDESRDRDRHRDRTSSRHRSRSRERDRDKHRSSKENR
Query: GKE-DREGNQEERRSKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERERPRRSRSRSERHRSDQNEGIRERSRDNELREREKERESRERGRDGR----------
++ +++ ++EER KDR+ DRDK DRD +GRD E++R RRSRSRSERHRS + R+ L KERE+++R RD R
Subjt: GKE-DREGNQEERRSKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERERPRRSRSRSERHRSDQNEGIRERSRDNELREREKERESRERGRDGR----------
Query: ---NAGEGVLITKDVSDQCFFPPHRRYKEKKEEGAEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKVLDNHETYSGVWGKVGFSTRQVRLVSEVI
+G L +D S CF R+K+KKE+ EPEADPERDQRTVFAYQI+L+ATERDVYEFFSRAGKV F R VR++ + I
Subjt: ---NAGEGVLITKDVSDQCFFPPHRRYKEKKEEGAEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKVLDNHETYSGVWGKVGFSTRQVRLVSEVI
Query: ETIGTGI
GI
Subjt: ETIGTGI
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| AT5G09880.1 Splicing factor, CC1-like | 1.9e-18 | 39.85 | Show/hide |
Query: MDFDEYDYLEKTVENPEGQKVKETANGGDADMKSGEKHRSRSSKYKSDGKDDG-EHRSKRSKSEDESRDRDRHRDRTSSRHRSRSRERDRDKHRSSKENR
M+FDEY+YLEKTVE G K+ +G + +S K + + G+++ RSK+S+ + E + RDR RHRS SR++DR++ + + +R
Subjt: MDFDEYDYLEKTVENPEGQKVKETANGGDADMKSGEKHRSRSSKYKSDGKDDG-EHRSKRSKSEDESRDRDRHRDRTSSRHRSRSRERDRDKHRSSKENR
Query: GKE-DREGNQEERRSKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERERPRRSRSRSERHRSDQNEGIRERSRDNELREREKERESRERGRDGRNAGEGVLITK
KE DRE + +ER DRD RD+ER RER +RS SRS R EKE E ERG
Subjt: GKE-DREGNQEERRSKDRDVDRDKERSHDRDRRGRDGERNRERERPRRSRSRSERHRSDQNEGIRERSRDNELREREKERESRERGRDGRNAGEGVLITK
Query: DVSDQCFFPPHRRYKEKKEEGAEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKVLD
RR+++KK+ EPEADPERDQRTVFAYQ+ LKATERDVYEFFS+AGKV D
Subjt: DVSDQCFFPPHRRYKEKKEEGAEPEADPERDQRTVFAYQISLKATERDVYEFFSRAGKVLD
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