; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G012500 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G012500
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionexpansin-like A1
Genome locationchr11:21125285..21126207
RNA-Seq ExpressionLsi11G012500
SyntenyLsi11G012500
Gene Ontology termsGO:0019953 - sexual reproduction (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR007117 - Expansin, cellulose-binding-like domain
IPR036749 - Expansin, cellulose-binding-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A5D3DJD5 Expansin-like A19.2e-6790.77Show/hide
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A0A6J1C2U1 expansin-like A27.3e-6486.92Show/hide
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A0A6J1C745 expansin-like A21.8e-5476.92Show/hide
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A0A6J1C7A7 expansin-like A11.1e-5172.31Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10S70 Expansin-like A12.9e-3348.85Show/hide
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Q9LZT5 Expansin-like A39.6e-3755.04Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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AT5G39310.1 expansin A244.5e-0533.64Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATTCAACCACATGCTTTCACATTCCAACATTTTCTTTGGTTGCATGTTAGGGTTCCATGTGGATACAAAAACAAAAATTTGTTGGTGAGAATAGAAGAATGGAGCAA
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ATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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