; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi11G015500 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi11G015500
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionPhospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase, putative
Genome locationchr11:23847485..23848126
RNA-Seq ExpressionLsi11G015500
SyntenyLsi11G015500
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031576.1 hypothetical protein E6C27_scaffold139G003430 [Cucumis melo var. makuwa]3.0e-2687.5Show/hide
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KGN43613.1 hypothetical protein Csa_020428 [Cucumis sativus]1.2e-2788.61Show/hide
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XP_022952670.1 uncharacterized protein LOC111455296 [Cucurbita moschata]9.7e-2584.81Show/hide
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XP_038888462.1 uncharacterized protein LOC120078298 [Benincasa hispida]1.3e-2991.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K2C1 Uncharacterized protein5.9e-2888.61Show/hide
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A0A5D3C7A0 Uncharacterized protein1.5e-2687.5Show/hide
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A0A6J1GMF4 uncharacterized protein LOC1114552964.7e-2584.81Show/hide
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A0A6J1I0M0 uncharacterized protein LOC1114683571.4e-2483.54Show/hide
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E0CTD2 Uncharacterized protein5.0e-1158.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G28290.1 unknown protein2.7e-0949.4Show/hide
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AT5G42110.1 unknown protein7.0e-0590.48Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAAAACAGGGCTGTTCGCCGCCTCCGTCGCCGCCGCCTCCGCCACCGCCCTGTCTGCTCCGCCGTCCTCCGCCGGCCTCCTCAAAACCACCTTTTCCCATCAGGA
AAAACTCACCAGAGATGAAGAAATTACTACTCCGTCGAGAAGATCGCCGCCGTCAACGACGGTGGATCAATTTGCTCCGAGATTCGATGGGTTAAGATTCATTGAAACTC
TGGTCACTGCTCATAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGAAAATTTACTAAAACACGGGGATTAAATAGAGACTACCAAATATAATATAGGGGTATAACCGTAAATCCAACCTATTAGACAGGTATAGTTGCCGCGTAAAACTTTG
TCGTGACGTCATCACTAAACCGTGGCTTTTTCACATTGCTATATAAATTACCCGTCTTAGCCCTTCCATTAATTTCCTCTCAATTTCCCTTCCAACGAAAAACAAAAGAA
AGGGCCACCACATTTCCCATGAAGAAAACAGGGCTGTTCGCCGCCTCCGTCGCCGCCGCCTCCGCCACCGCCCTGTCTGCTCCGCCGTCCTCCGCCGGCCTCCTCAAAAC
CACCTTTTCCCATCAGGAAAAACTCACCAGAGATGAAGAAATTACTACTCCGTCGAGAAGATCGCCGCCGTCAACGACGGTGGATCAATTTGCTCCGAGATTCGATGGGT
TAAGATTCATTGAAACTCTGGTCACTGCTCATAGATGATAAGCTTTGGATTTGGCAATAAAATGGCCCTCCATCTTTTTTTTTTTTCCTTTTCTTTTTCTGTCTTATTAT
AC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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