CuGenDBv2

Gene ID	Lsi11G015610
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Microtubule-associated protein 6, putative
Genome location	chr11:23919924..23920646
RNA-Seq Expression	Lsi11G015610
Synteny	Lsi11G015610
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004136827.1 uncharacterized protein LOC101207471 [Cucumis sativus]

9.6e-108

86.67

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYY+DVK NDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLR EREKVAKKKLKA+KLDSAPKRS+ D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD

Query:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDE
         GADA RQ  K RSV+PPPAPIATKRRRLMVLFEDEDD+G++K E  VVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKR+QLKGLKDRSSEINGV+ESVMKIVEEIN+E
Subjt:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDE

Query:  NTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKRGLN
        NTK KK N ERKGK GG +ES SVS +R+SPRLANKR LN
Subjt:  NTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKRGLN

XP_008455314.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495510 [Cucumis melo]

4.3e-108

88.61

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKA+KLDSAPKRS+ D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD

Query:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDE
         GADA RQ  K RSV+PPPAP+ATKRRRLMVLFEDEDDVG+DK E  VVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEIN V+ESVMKIVEEIN+E
Subjt:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDE

Query:  NTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKR
        NTK K++N E+KGK  GK+ES SVS TRTSPRLANKR
Subjt:  NTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKR

XP_022148022.1 uncharacterized protein LOC111016810 [Momordica charantia]

1.1e-95

80.91

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD
        MVV LGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLL WANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGN+ KLRVEREK+AKKK KA+K DSA KRS+ D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD

Query:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVD-KVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEIND
         GAD  R+  K +SVSPPPAPIATKRRRL+ LF+DEDD G + K E  VVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLK  +DR S ++G+ ESVMKIVEEIN 
Subjt:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVD-KVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEIND

Query:  ENTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKRGLN
         +T+GKKMNSERKGKN GK ESGSVS TRTSPRLANKRG N
Subjt:  ENTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKRGLN

XP_023554607.1 uncharacterized protein LOC111811804 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

6.0e-94

80.85

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLN+ER+DPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLR EREKV        KLDSAPKRS  D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD

Query:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLF-EDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEIND
          A  DRQF K +SVSPPPAP+A KRRR M LF +D+DDVGV K ET VVKRRLVKKLGDDFDRVAAESK NQLK  +DRSSEINGV ESVMKIVEEIND
Subjt:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLF-EDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEIND

Query:  ENTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLA
        ENT+G+K+N+ERK K+GG++E+GSVS TRTSPRLA
Subjt:  ENTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLA

XP_038888811.1 uncharacterized protein LOC120078599 [Benincasa hispida]

1.1e-108

87.97

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLR EREKVAK+KL+AKKLDSAPKRS+ D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD

Query:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDE-DDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEIND
         GA+A+RQ  K +SVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDE DDVG+DK    VVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKG +DRSSEI+GV ESVMKIVEEIND
Subjt:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDE-DDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEIND

Query:  ENTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKRGLN
        EN KGKK  S  KGKNGGK+ESGSVS+TRTSPRLANKRGLN
Subjt:  ENTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKRGLN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K3S4 Uncharacterized protein

4.6e-108

86.67

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYY+DVK NDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLR EREKVAKKKLKA+KLDSAPKRS+ D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD

Query:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDE
         GADA RQ  K RSV+PPPAPIATKRRRLMVLFEDEDD+G++K E  VVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKR+QLKGLKDRSSEINGV+ESVMKIVEEIN+E
Subjt:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDE

Query:  NTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKRGLN
        NTK KK N ERKGK GG +ES SVS +R+SPRLANKR LN
Subjt:  NTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKRGLN

A0A1S3C0M4 uncharacterized protein LOC103495510

2.1e-108

88.61

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKA+KLDSAPKRS+ D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD

Query:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDE
         GADA RQ  K RSV+PPPAP+ATKRRRLMVLFEDEDDVG+DK E  VVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEIN V+ESVMKIVEEIN+E
Subjt:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDE

Query:  NTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKR
        NTK K++N E+KGK  GK+ES SVS TRTSPRLANKR
Subjt:  NTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKR

A0A5A7SPW2 Uncharacterized protein

2.1e-108

88.61

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKA+KLDSAPKRS+ D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD

Query:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDE
         GADA RQ  K RSV+PPPAP+ATKRRRLMVLFEDEDDVG+DK E  VVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEIN V+ESVMKIVEEIN+E
Subjt:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDE

Query:  NTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKR
        NTK K++N E+KGK  GK+ES SVS TRTSPRLANKR
Subjt:  NTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKR

A0A6J1D3X9 uncharacterized protein LOC111016810

5.3e-96

80.91

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD
        MVV LGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLL WANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGN+ KLRVEREK+AKKK KA+K DSA KRS+ D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD

Query:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVD-KVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEIND
         GAD  R+  K +SVSPPPAPIATKRRRL+ LF+DEDD G + K E  VVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLK  +DR S ++G+ ESVMKIVEEIN 
Subjt:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVD-KVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEIND

Query:  ENTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKRGLN
         +T+GKKMNSERKGKN GK ESGSVS TRTSPRLANKRG N
Subjt:  ENTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANKRGLN

A0A6J1I0F4 uncharacterized protein LOC111468305

2.1e-92

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYY DVKLN+ER+DPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLR EREKV        KLDSAPKRS  D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESD

Query:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLF-EDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEIND
          A  DRQF K  S+SPPPAP+A KRRR M LF +D+DDVGV K ET VVKRRLVKKLGDDFDRVAAESK NQLK  +D+SSEINGV ESVMKIVEEIND
Subjt:  TGADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLF-EDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEIND

Query:  ENTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLA
        ENT+GKK+N+ERK K+ GK+E+GSVS TRTSPRLA
Subjt:  ENTKGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLA

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G52270.1 unknown protein

4.4e-10

28.72

Show/hide

Query:  PGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESDTGADAD
        P  FY + LPRPR++ + + N  RVD P  VLDPLLSWA                                                             
Subjt:  PGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESDTGADAD

Query:  RQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIV
         Q  K    S P API  KRRR +    D++++G + V    ++R    KL DDFDRVA ESK   ++  + +  E +  +E + KIV
Subjt:  RQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIV

AT4G28310.1 unknown protein

6.1e-36

44.02

Show/hide

Query:  VPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESDTG
        + + P  FYG+ LPRPR++ + K ND RVDPP  VLDPLLSWA +AHWSMGGL+F RLRLQGRIEGNV+KLR + EK    KL++ +     KRS S+  
Subjt:  VPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESDTG

Query:  ADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDENT
                     SPP API  KRRR + L  D DD  V   +  VV  R+ +KL DDFDRVA ESK                      K+V E N ++ 
Subjt:  ADADRQFNKVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDENT

Query:  KGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANK
        K + +  +R  +    ++    SSTR+SPRLA +
Subjt:  KGKKMNSERKGKNGGKLESGSVSSTRTSPRLANK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTTGTTCCTCTCGGCCCCGGCAAGTTCTACGGCAGCAGCCTACCTCGTCCCCGCTACTACACCGACGTCAAGCTCAACGATGAGCGTGTTGATCCACCGACGCCGGT
CCTTGATCCACTCCTCTCATGGGCGAACGAGGCTCATTGGTCAATGGGTGGCCTCAGCTTCAATCGCCTCAGGCTTCAAGGTCGAATCGAAGGCAATGTCCACAAGCTTC
GAGTCGAGCGCGAGAAGGTGGCCAAGAAGAAGCTTAAAGCCAAGAAACTGGACTCTGCGCCAAAGAGATCTGAATCAGATACTGGAGCTGATGCCGATCGCCAATTCAAT
AAGGTGAGATCTGTATCTCCACCGCCGGCACCAATTGCAACCAAGAGACGGCGATTGATGGTTCTGTTTGAAGATGAGGATGATGTTGGCGTGGATAAAGTAGAGACTAG
GGTTGTGAAGAGGAGGTTGGTGAAGAAGTTGGGAGATGATTTTGATCGAGTGGCTGCAGAGAGTAAGAGGAATCAATTGAAGGGTTTGAAGGATAGAAGCTCGGAGATCA
ATGGGGTTGATGAATCTGTAATGAAGATCGTTGAAGAGATTAATGATGAAAATACTAAAGGGAAAAAGATGAACAGTGAAAGAAAGGGGAAGAATGGTGGAAAACTGGAG
TCTGGTTCTGTTTCTTCTACAAGAACTTCTCCTAGATTGGCTAATAAGCGTGGATTAAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKLNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRVEREKVAKKKLKAKKLDSAPKRSESDTGADADRQFN
KVRSVSPPPAPIATKRRRLMVLFEDEDDVGVDKVETRVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKRNQLKGLKDRSSEINGVDESVMKIVEEINDENTKGKKMNSERKGKNGGKLE
SGSVSSTRTSPRLANKRGLN

Lsi11G015610 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome