; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

LsiUNG000530 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsiUNG000530
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationchr00:875637..876416
RNA-Seq ExpressionLsiUNG000530
SyntenyLsiUNG000530
Gene Ontology termsGO:0019058 - viral life cycle (biological process)
GO:0022610 - biological adhesion (biological process)
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148508.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucumis sativus]3.8e-11081.34Show/hide
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          P  SSNP+KPS +SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINT SSTLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+PSST++S  FP+ND    RL
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        ETST+S S +          NNGSQ+  LDLELRLGHGPPSSTQ LMEKG+ KIS+ EAACL++RSSD
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XP_008465962.1 PREDICTED: transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucumis melo]2.9e-11081.04Show/hide
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          P  SSNP+KPS +SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINT  STLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+PSST+LS  FP+ND+   RL
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        ETST+S S +          NNGS +   LDLELRLGHGPPSSTQ LMEKG+ K+SN EAACL+KRSSD
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XP_022963778.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucurbita moschata]2.6e-8270.08Show/hide
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        HQ PL SN  KPS SSSS SNSFIIP PDFNGGGLCLLYQFPNPNS+N GIN P            SLFS+S+HSFN+F  S  +S  FPVNDHRL    
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         S FS S QQ    ++SME NG+QELDLELRLGHG P ST+T +E GQKIS        KRSSD
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XP_023511530.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-8270.45Show/hide
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        MA +LELGFQ+SSSLP   ET RDG +  GLNPM TPDVV   DDDDSWEVRAFAEDT NVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL
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        HQ P  SNP KPS SSSS SNSFIIP PDFNGGGLCLLYQFPNPN IN GIN P            SLFSMS+HSFNTF  S  +S   PVNDH    L 
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         S FS S QQ    ++SME NG+QELDLELRLGHG P ST+TL+E GQKIS        KRSSD
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XP_038888762.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Benincasa hispida]3.2e-12592.02Show/hide
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         PP SSNP+KP   SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINTP STLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTF PSST+LSP FPVN DHRLET
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        STFS+S+QQHFSSTS+MENNGSQELDLELRLGHGPPSSTQTLMEKGQKISNLEAACLRKRSSD
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LF36 C2H2-type domain-containing protein1.8e-11081.34Show/hide
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Query:  --PPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGG-LCLLYQFPNPNSINCGINTPSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVND---HRL
          P  SSNP+KPS +SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINT SSTLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+PSST++S  FP+ND    RL
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        ETST+S S +          NNGSQ+  LDLELRLGHGPPSSTQ LMEKG+ KIS+ EAACL++RSSD
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A0A1S3CRJ1 transcriptional regulator SUPERMAN-like1.4e-11081.04Show/hide
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          P  SSNP+KPS +SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINT  STLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+PSST+LS  FP+ND+   RL
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        ETST+S S +          NNGS +   LDLELRLGHGPPSSTQ LMEKG+ K+SN EAACL+KRSSD
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A0A5D3E693 Transcriptional regulator SUPERMAN-like1.4e-11081.04Show/hide
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          P  SSNP+KPS +SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINT  STLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+PSST+LS  FP+ND+   RL
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        ETST+S S +          NNGS +   LDLELRLGHGPPSSTQ LMEKG+ K+SN EAACL+KRSSD
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A0A6J1HIW9 transcriptional regulator SUPERMAN1.2e-8270.08Show/hide
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        MA +LELGFQ+  SLP   ET RDG + NGLNPMQTPDVV   DDDDSWEVRAFAEDT NVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL
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Query:  HQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSINCGINTPSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLE---
        HQ PL SN  KPS SSSS SNSFIIP PDFNGGGLCLLYQFPNPNS+N GIN P            SLFS+S+HSFN+F  S  +S  FPVNDHRL    
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Query:  TSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLGHGPPSSTQTLMEKGQKISNLEAACLRKRSSD
         S FS S QQ    ++SME NG+QELDLELRLGHG P ST+T +E GQKIS        KRSSD
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A0A6J1HW10 transcriptional regulator SUPERMAN8.0e-8274.06Show/hide
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        MA +LELGFQ+SSSLP   ET R+G + NGLNPMQTPDVV   DDDDSWEVRAFAEDT NVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL
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        HQ PL SNP KPS SSSS SNSFIIP PDFNGGGLCLLYQFPNPNSIN GIN P            SLFSMS+HSFN+F  ST +S  FPVNDHR   L 
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Query:  TSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLGHGPPSS
         S FS S QQ    ++SME NG+QELDLELRLGHGP S+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 105.5e-1958.06Show/hide
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        + SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q       P  SS+P  PS   S N +     T  FN
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN7.6e-1335.59Show/hide
Query:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSINCGINT
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA  RL Q P SS+   P   + + S S +  +P  +   L L      P+S       
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Query:  PSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLG
          S      H+P +       S        T    F   D                     + N   Q+LDLELRLG
Subjt:  PSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLG

Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS5.9e-1334.18Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSI
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q  LS +    +     +    ++      G  + +  +   PN  
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Query:  N------CGINTPSSTLNAYIHSPSSL---FSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLGHGPP
               C  N   S++  Y H    +    S+   S    P    L      +  R +T               S  N   +ELDLELRLG  PP
Subjt:  N------CGINTPSSTLNAYIHSPSSL---FSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLGHGPP

Q9SLB8 Zinc finger protein 111.2e-1362.5Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ------PPLSSNPI-KPSPSSSSNSNS
        WPP++YTC++CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q       P    PI  P+P+ SS+S+S
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Q9SR34 Transcriptional regulator TAC11.6e-0762.5Show/hide
Query:  RSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQPPLSSN
        RSY C++C R F +AQALGGHMN+HRRDRA+L Q  +  N
Subjt:  RSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQPPLSSN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 103.9e-2058.06Show/hide
Query:  DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ-------PPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFN
        + SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q       P  SS+P  PS   S N +     T  FN
Subjt:  DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ-------PPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFN

AT2G42410.1 zinc finger protein 118.4e-1562.5Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ------PPLSSNPI-KPSPSSSSNSNS
        WPP++YTC++CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q       P    PI  P+P+ SS+S+S
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AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein5.4e-1435.59Show/hide
Query:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSINCGINT
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA  RL Q P SS+   P   + + S S +  +P  +   L L      P+S       
Subjt:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSINCGINT

Query:  PSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLG
          S      H+P +       S        T    F   D                     + N   Q+LDLELRLG
Subjt:  PSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLG

AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein2.4e-2540.1Show/hide
Query:  DDDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQPPLSSNPIKP--------SPSSSSNSNSFIIPTPDFNG
        DDD+SWEV+AF +DT  N+ GTTWPPRSYTC +CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA  R HQ    +   +         S +    + + II +   N 
Subjt:  DDDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQPPLSSNPIKP--------SPSSSSNSNSFIIPTPDFNG

Query:  GGLCLLYQFPNPNSINCGINTPSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLGHG
         GL   YQ  NP+ I          +N Y    ++ F  S+  F+   S   + P             +S  + +   S          ELDLELRLGH 
Subjt:  GGLCLLYQFPNPNSINCGINTPSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLGHG

Query:  PP
        PP
Subjt:  PP

AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein4.2e-1434.18Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSI
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q  LS +    +     +    ++      G  + +  +   PN  
Subjt:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSI

Query:  N------CGINTPSSTLNAYIHSPSSL---FSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLGHGPP
               C  N   S++  Y H    +    S+   S    P    L      +  R +T               S  N   +ELDLELRLG  PP
Subjt:  N------CGINTPSSTLNAYIHSPSSL---FSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLGHGPP


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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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