| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6571679.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.25e-157 | 87.42 | Show/hide |
Query: NPNPNLHLQLPLPPNMSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGR
NPNPNLH P NMSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGR
Subjt: NPNPNLHLQLPLPPNMSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGR
Query: EITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKG
EITVQFAKYGPNAERIHKGK+SE+F K RYRSRSRSPRRR+RDD+RDRDYRRRSRSRSRSRSLDR D DRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKG
Subjt: EITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKG
Query: RGRGRYDDERRSRSRSCSRSQS--------RGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDV
RGRGRY DERRSRSRS SRS S RG+ RSVDSASPGR+S SPR S SPQRSPSPRGESP RNGDGGR+PT RSVSPRGQPADSRSPS NSDV
Subjt: RGRGRYDDERRSRSRSCSRSQS--------RGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDV
Query: DK
DK
Subjt: DK
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 2.71e-156 | 90.81 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRS------LSPQRSPSPRGESPVRNGDGG-RTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
SRS+SRG+SRSVDS SPGRRS SPRRS LSP+RSPSPR ESP RNG+GG R+PT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRS------LSPQRSPSPRGESPVRNGDGG-RTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_022141921.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Momordica charantia] | 1.46e-180 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 4.52e-155 | 86.87 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
I KGKISE F K R+RSRSRSPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRS RSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRS------------------PSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S SRS RG+SRSV+SASPGRRS SPRRSLSP+RS PSPRGESP RNGDGGR+PTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRS------------------PSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 2.74e-159 | 90.21 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAF K RY+SRSRSPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRSRSRS DRSDRDRRGRE+ERER+YRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGR------RSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGG-RTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S SRS+SRG+SRSVDS SPGR RS SPRRSLSP+RSPSPRG SP RNG+GG R+PT RSVSPRG+P DSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGR------RSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGG-RTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 1.31e-156 | 90.81 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRS------LSPQRSPSPRGESPVRNGDGG-RTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
SRS+SRG+SRSVDS SPGRRS SPRRS LSP+RSPSPR ESP RNG+GG R+PT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRS------LSPQRSPSPRGESPVRNGDGG-RTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 7.06e-181 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 2.19e-155 | 86.87 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
I KGKISE F K R+RSRSRSPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRS RSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRS------------------PSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S SRS RG+SRSV+SASPGRRS SPRRSLSP+RS PSPRGESP RNGDGGR+PTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRS------------------PSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| A0A6J1HFC7 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 4.87e-155 | 88.5 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGK+SE+F K RYRSRSRSPRRR+RDD+RDRDYRRRSRSRSRSRSLDR D DRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSQS--------RGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S SRS+S RG+ RSVDSASPGR+S SPR S SP RSPSPRGESP RNGDGGR+PT RSVSPRGQPADSRSPS NSDVDK
Subjt: SCSRSQS--------RGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| A0A6J1HVK2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 3.08e-155 | 89.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGK+SE+F K R RSRSRSPRRR+RDD+RDRDYRRRSRSRSRSRSLDR D DRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSQS----RGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S S S S RG+ RSVDSASPGR+S SPRRS SPQRSPSPRGES RNGDGGR+PT RSVSPRGQPADSRSPS NSDVDK
Subjt: SCSRSQS----RGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.4e-27 | 45.61 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: CSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
SRS+SR +SRS S R S S RS SP +SP G
Subjt: CSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.4e-27 | 45.61 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: CSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
SRS+SR +SRS S R S S RS SP +SP G
Subjt: CSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q06A98 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 8.4e-28 | 46.03 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: CSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
SRS+SR +SRS AS R S S RS SP +SP G
Subjt: CSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.4e-27 | 45.61 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: CSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
SRS+SR +SRS S R S S RS SP +SP G
Subjt: CSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 9.2e-67 | 60.06 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG++ E K PR RS RSRSPRRR RDD R++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSQSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSP
SPD K R RGRYD+E RS SRS S S +R +S S SP R RS SPRRSLSP RSP SP E R+P+P S +P
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSQSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSP
Query: -RGQPADSRSPSP
R A SRS SP
Subjt: -RGQPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 1.2e-13 | 37.1 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYR
Query: SRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR------------PSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
+ R R R R RD RRR+ R SRS RS RRGR R R DY R RSISPR P+ D S+GR + RS
Subjt: SRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR------------PSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
Query: SRSCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSL--SPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S S RS SR RS + RS SPRRS+ SP+RS SPR + RS +P +PA SRS SP D+
Subjt: SRSCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSL--SPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 3.0e-12 | 36.15 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KISEAFTKP-RYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR------------PSPDYSKG
E KP R+R R R+RD RRR+ R SRS RS RRGR R R DY R RSISPR P+ D S+G
Subjt: KISEAFTKP-RYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR------------PSPDYSKG
Query: RGRGRYDDERRSRSRSCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSL--SPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
R + RS S S RS SR RS + RS SPRRS+ SP+RS SPR + RS +P +PA SRS SP D+
Subjt: RGRGRYDDERRSRSRSCSRSQSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSL--SPQRSPSPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 2.1e-13 | 37.24 | Show/hide |
Query: PPNMSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPN
P FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+
Subjt: PPNMSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPN
Query: AERIHKGKISEAFTKP-RYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG-RERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRG
E KP R+R R R NR +D RRRS R RS RRG R R R R Y R +SRS+SP+
Subjt: AERIHKGKISEAFTKP-RYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG-RERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRG
Query: RYDDERRSRSRSCSRSQSRGQSRSVDSASPGR---RSASPRRSLSPQRSPS-----PRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPS
D R + RS SRS SR V S SPGR S SPRRS+SP+++ S R +SPV R+PTP PRG RSPS
Subjt: RYDDERRSRSRSCSRSQSRGQSRSVDSASPGR---RSASPRRSLSPQRSPS-----PRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSPRGQPADSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 6.5e-68 | 60.06 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG++ E K PR RS RSRSPRRR RDD R++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSQSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSP
SPD K R RGRYD+E RS SRS S S +R +S S SP R RS SPRRSLSP RSP SP E R+P+P S +P
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSQSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSP
Query: -RGQPADSRSPSP
R A SRS SP
Subjt: -RGQPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 6.5e-68 | 60.06 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG++ E K PR RS RSRSPRRR RDD R++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSQSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSP
SPD K R RGRYD+E RS SRS S S +R +S S SP R RS SPRRSLSP RSP SP E R+P+P S +P
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSQSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRTPTPRSVSP
Query: -RGQPADSRSPSP
R A SRS SP
Subjt: -RGQPADSRSPSP
|
|
