CuGenDBv2

Gene ID	MC00g0028
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	Tropomyosin-like
Genome location	scaffold31:473295..477358
RNA-Seq Expression	MC00g0028
Synteny	MC00g0028
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022142007.1 uncharacterized protein LOC111012242 [Momordica charantia]

4.29e-88

100

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

XP_022963475.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata]

3.38e-85

95.86

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

XP_022963476.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X2 [Cucurbita moschata]

3.16e-85

95.86

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

XP_022967635.1 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X2 [Cucurbita maxima]

3.69e-84

95.17

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

XP_038886855.1 uncharacterized protein LOC120077075 isoform X1 [Benincasa hispida]

1.68e-85

96.55

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFA+ASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELR KQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1CLE5 uncharacterized protein LOC111012242

2.08e-88

100

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

A0A6J1HG82 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X2

1.53e-85

95.86

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

A0A6J1HI40 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1

1.64e-85

95.86

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

A0A6J1HV17 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X2

1.79e-84

95.17

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

A0A6J1HXA5 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X1

1.91e-84

95.17

Show/hide

Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G64180.1 unknown protein

3.7e-52

75.34

Show/hide

Query:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV
        ME++  G+D RW G++ N+TEMASNL+SLQKLLLKKAV+V+++TF++ASL SEQARTIKVLEQRV+TLERELDAAITAAAHARSEKRQAE++QKAAE   
Subjt:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV

Query:  KEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG
        ++VT+ELENTTKVF+LHM+ELR  QE+I KRD +IKLLEAIIQTLG
Subjt:  KEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGACAAGGGTAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCTGTAGCCAATCTCACAGAGATGGCTTCCAATTTGGAATCACTCCAGAAGCTTCTACTGAAGAAAGCCGT
ATATGTGGACGACGAGACGTTTGCCAAAGCTTCGTTGTGCTCCGAACAAGCAAGAACGATCAAGGTTCTCGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTTGATGCTG
CCATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCTCAAAAGGCTGCTGAACTACATGTGAAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACCACA
AAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGGGCAAAGCAAGAGGAAATTGACAAACGTGATAAGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAGACTCTTGGT

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVKEVTRELENTT
KVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG

MC00g0028 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome