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MC01g0108 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC01g0108
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionProtein TIC 214
Genome locationMC01:5897902..5898115
RNA-Seq ExpressionMC01g0108
SyntenyMC01g0108
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008896 - Protein TIC214


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AEK71575.1 hypothetical chloroplast RF1, partial [Spiraea tomentosa]7.30e-2478.08Show/hide
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GFP89679.1 protein tic 214 [Phtheirospermum japonicum]1.00e-2383.87Show/hide
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GFP97092.1 protein tic 214 [Phtheirospermum japonicum]3.75e-2475.34Show/hide
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OWK25800.1 hypothetical protein AJ87_01050 [Rhizobium yanglingense]3.33e-2578.08Show/hide
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WP_131796261.1 hypothetical protein, partial [Candidatus Frankia datiscae]1.63e-2375.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A023I0G9 Protein TIC 214 (Fragment)1.60e-2376.71Show/hide
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A0A245ZAB5 Uncharacterized protein1.61e-2578.08Show/hide
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A0A4Y5RDI6 Protein TIC 2141.57e-2372.6Show/hide
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A0A5K6W7Y8 Protein TIC 2149.88e-2473.97Show/hide
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G0YD98 Hypothetical chloroplast RF1 (Fragment)3.53e-2478.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A393 Protein TIC 2148.7e-2075.34Show/hide
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A6MM95 Protein TIC 2143.3e-1973.97Show/hide
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A6MMQ5 Protein TIC 2148.7e-2075.34Show/hide
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Q3C1P6 Protein TIC 2145.6e-1973.97Show/hide
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Q8S8U2 Protein TIC 2144.3e-1973.97Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07739.1 Ycf1 protein5.8e-1971.05Show/hide
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ATCG01000.1 Ycf1 protein2.0e-1972.37Show/hide
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ATCG01130.1 Ycf1 protein2.0e-1972.37Show/hide
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ATMG00370.1 Ycf1 protein9.8e-1971.05Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTTTTAAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATGCATTAAGATAATAAATTCGGTCATTGTGGTCGGACTCTGTTATGGATTTCTGACGACATTCTCCGG
TCCTCTTTATCTCTTCCTTCTCCGGGCTCGAGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATTAGCAGCATATATCTCCAATCGAGTGAAGGCATTCATT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATTTTTAAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATGCATTAAGATAATAAATTCGGTCATTGTGGTCGGACTCTGTTATGGATTTCTGACGACATTCTCCGG
TCCTCTTTATCTCTTCCTTCTCCGGGCTCGAGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATTAGCAGCATATATCTCCAATCGAGTGAAGGCATTCATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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