; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC01g0194 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC01g0194
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionMADS-box transcription factor 23-like
Genome locationMC01:8244138..8250681
RNA-Seq ExpressionMC01g0194
SyntenyMC01g0194
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004150520.2 MADS-box transcription factor 23 [Cucumis sativus]1.44e-15584.08Show/hide
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XP_022152219.1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X1 [Momordica charantia]1.88e-195100Show/hide
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XP_022152220.1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X2 [Momordica charantia]3.99e-181100Show/hide
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XP_038877479.1 MADS-box transcription factor 23-like [Benincasa hispida]2.55e-14788.08Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C2E6 MADS-box transcription factor 23-like2.97e-15784.43Show/hide
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A0A6J1DDB0 MADS-box transcription factor 23-like isoform X21.93e-181100Show/hide
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A0A6J1DFE2 MADS-box transcription factor 23-like isoform X19.08e-196100Show/hide
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A0A6J1ELA7 MADS-box transcription factor 23-like4.02e-14689.52Show/hide
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A0A6J1HTB2 MADS-box transcription factor 23-like3.29e-14589.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2RVQ5 Agamous-like MADS-box protein AGL166.3e-3240.71Show/hide
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        ++  +  TN  +    + E+   ++S
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Q38847 Agamous-like MADS-box protein AGL154.2e-3640.16Show/hide
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        +++ KL+   LQ++G+ L+ L+F+ELQ+LE QL   +++++++KE LL  QL++ R + +    ENETLR+Q++EL+    + LP  + +  SY      
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        D K    N  +++   +  D S+ +L LG  L G+   +R+ EG     +   V
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Q39295 Agamous-like MADS-box protein AGL152.1e-3541.41Show/hide
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         +  + T       + +N  S+ +L LGL  +    RK        S +  T  TT
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Q6EP49 MADS-box transcription factor 278.2e-3236.12Show/hide
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        +++  L+ +  Q+ G++L GL+ +ELQ+LENQL   + S++ KK+ +L++++ +   +G +V  EN  L K++  ++Q N      +  +++ Y ++  +
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Q9M2K8 Agamous-like MADS-box protein AGL181.7e-4545.91Show/hide
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         +D +++S+ E E + E   +D    SL LGLS  G   KRK+       D +GSQV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G57230.1 AGAMOUS-like 164.4e-3340.71Show/hide
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        MGRG++ IK+I N  SRQVTFSKRRNGL+KKAKEL++LCDAEV +++FSSTGRLY+FSS+SM+  + RY     E     +      ++        +  
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        EE+V  +    QM G+EL GLS   LQNLENQL   +  ++ KK+ +L+E++Q    +G +V  EN  L K++  + Q+N     + S  +    ++  +
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        N  S + E+ +L+L+  +++G+EL+G+SF +L +LENQL E + S+KD+K  +LL Q+++ R Q +  + EN+ LRKQ+E L + +   +    P   S 
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        M R ++ IKKI+NI +RQVTFSKRR G+ KKA ELSVLCDA+VA+++FS+TG+L+EFSS+ M   L RY      ++  K     +T L   + N     
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        D K    N  +++   +  D S+ +L LG  L G+   +R+ EG     +   V
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Sequences Show/hide sequences
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