; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC01g0759 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC01g0759
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionribosomal protein L16
Genome locationMC01:13720293..13720697
RNA-Seq ExpressionMC01g0759
SyntenyMC01g0759
Gene Ontology termsGO:0032543 - mitochondrial translation (biological process)
GO:0005762 - mitochondrial large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000114 - Ribosomal protein L16
IPR016180 - Ribosomal protein L10e/L16
IPR020798 - Ribosomal protein L16, conserved site
IPR036920 - Ribosomal protein L10e/L16 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QEX95844.1 ribosomal protein L16 [Cercis canadensis]3.13e-9199.26Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFR+NGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

WP_131747059.1 50S ribosomal protein L16 [Candidatus Frankia meridionalis]1.56e-9199.26Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRA IGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

YP_009913655.1 ribosomal protein L16 [Luffa acutangula]3.62e-9199.26Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGT+SCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

YP_009941482.1 ribosomal protein L16, partial [Fagus sylvatica]1.56e-9199.26Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        S GQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

YP_010021234.1 ribosomal protein L16 [Malania oleifera]2.69e-92100Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5J6NIR7 Ribosomal protein L161.51e-9199.26Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFR+NGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

A0A7D6C0E5 Ribosomal protein L161.75e-9199.26Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGT+SCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

A0A7L7TAZ3 Ribosomal protein L167.55e-9299.26Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        S GQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

A0A7L9QAD0 Ribosomal protein L161.30e-92100Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

G3EU15 Ribosomal protein L162.17e-9198.52Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGT+SCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNG+IWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P27927 60S ribosomal protein L16, mitochondrial1.2e-6592.59Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKY K RCSRG +PDGTQLGFGRYGTKS RAGRLSYRAIEAARRA IGQF RAMSGQFRRN KIWVRVLADLPITGKP EVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSLSNARQAA LAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

P46801 60S ribosomal protein L16, mitochondrial3.9e-6994.81Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKY K RCSRGC+PDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRA IGQFHRAMSGQFRRN KIWVRVLADLPITGKP EVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSLSNARQAA LAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

P49389 60S ribosomal protein L16, mitochondrial7.7e-6591.11Show/hide
Query:  KYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIG-QFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        K +KY KGRCSRGCKPDGT+LGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRA IG  F RAMSGQFRRN KIWVRVLADLPITGKP EVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  KYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIG-QFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSL+NARQAA LAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

Q04715 60S ribosomal protein L16, mitochondrial1.2e-6296.67Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIG FHRAMSGQFRRNGKIWVRVLAD+PITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQA
        S GQI FEMDGVSLSNARQA
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQA

Q95747 60S ribosomal protein L16, mitochondrial2.2e-6792.59Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGT+LGFGRYG KSC+AG LSYRAIEAARRAIIG FHRAMSGQFRRNGKIWVRV ADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQI FEMDGVSL+NARQAATLAAHK C STKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G28830.1 PLANT U-BOX 127.2e-1837.78Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TK+ K+ +GR ++G    G      RY  ++     ++ R IEA RRA+     R ++        + V + AD P+T +P E RMGRGKG P  W+A V
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
          G+I +EM GVS   AR+A ++AA K  + TKF+
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

ATCG00790.1 ribosomal protein L161.8e-2140.74Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        T++ K  +GR  +G    G ++ FGRY  ++     ++ R IEA R        RAM+   RR GKIWVR+  D P+T +P E RMG GKG+P  W+A V
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
          G+I +EM GV  + AR+A ++AA K    T+F+
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV

ATMG00080.1 ribosomal protein L163.5e-7396.3Show/hide
Query:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
        TKYSKYRKGRCSRGCKPDGT+LGFGRYGTKSC+AGRLSYRAIEAARRAIIG FHRAMSGQFRRNGKIWVRV ADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV
Subjt:  TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARV

Query:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV
        STGQIPFEMDGVSL+NARQAATLAAHKPCSSTKFV
Subjt:  STGQIPFEMDGVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ACGAAATATAGTAAATATCGTAAAGGCAGATGTAGTAGGGGTTGCAAACCGGACGGTACACAACTTGGTTTTGGAAGATATGGCACTAAAAGTTGTAGAGCTGGTCGTCT
TTCATATCGAGCCATTGAAGCAGCGCGTCGGGCTATAATCGGACAATTCCATCGTGCTATGAGCGGACAATTCCGAAGAAATGGTAAAATATGGGTAAGAGTTCTCGCAG
ATCTCCCTATTACCGGGAAACCTACAGAAGTAAGAATGGGAAGAGGAAAAGGAAATCCTACGGGTTGGATTGCTCGTGTGTCCACGGGACAAATCCCATTTGAAATGGAT
GGTGTGAGTTTGTCAAATGCTCGACAAGCCGCTACATTAGCGGCGCATAAACCATGTTCGTCAACCAAGTTTGTT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACGAAATATAGTAAATATCGTAAAGGCAGATGTAGTAGGGGTTGCAAACCGGACGGTACACAACTTGGTTTTGGAAGATATGGCACTAAAAGTTGTAGAGCTGGTCGTCT
TTCATATCGAGCCATTGAAGCAGCGCGTCGGGCTATAATCGGACAATTCCATCGTGCTATGAGCGGACAATTCCGAAGAAATGGTAAAATATGGGTAAGAGTTCTCGCAG
ATCTCCCTATTACCGGGAAACCTACAGAAGTAAGAATGGGAAGAGGAAAAGGAAATCCTACGGGTTGGATTGCTCGTGTGTCCACGGGACAAATCCCATTTGAAATGGAT
GGTGTGAGTTTGTCAAATGCTCGACAAGCCGCTACATTAGCGGCGCATAAACCATGTTCGTCAACCAAGTTTGTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
TKYSKYRKGRCSRGCKPDGTQLGFGRYGTKSCRAGRLSYRAIEAARRAIIGQFHRAMSGQFRRNGKIWVRVLADLPITGKPTEVRMGRGKGNPTGWIARVSTGQIPFEMD
GVSLSNARQAATLAAHKPCSSTKFV