; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC01g1045 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC01g1045
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionRab family
Genome locationMC01:15960171..15963396
RNA-Seq ExpressionMC01g1045
SyntenyMC01g1045
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143465.1 ras-related protein RABH1e [Cucumis sativus]1.56e-14098.55Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQ+EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022132839.1 ras-related protein RABH1e [Momordica charantia]3.27e-142100Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022950086.1 ras-related protein RABH1e [Cucurbita moschata]2.21e-14098.55Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQ EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022962792.1 ras-related protein RABH1e-like [Cucurbita moschata]1.28e-13998.07Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS  EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_023003400.1 ras-related protein RABH1e [Cucurbita maxima]3.66e-13997.58Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS  EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGR9 Uncharacterized protein7.53e-14198.55Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQ+EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A1S3B1I2 ras-related protein RABH1e7.53e-14198.55Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQ+EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1BU83 ras-related protein RABH1e1.58e-142100Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1GDU2 ras-related protein RABH1e1.07e-14098.55Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQ EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1IN20 ras-related protein RABH1e-like6.19e-14098.07Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS  EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b1.2e-9686.54Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV++RQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSQAE
         KWI+EVRTERGSDV++VLVGNKTDLV+KRQVSIEE +AK+RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK +  N+S A+
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSQAE

Query:  QQGGGCAC
        QQ GGC+C
Subjt:  QQGGGCAC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e8.3e-10390.34Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        +KWIE+VRTERGSDV+IVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGD K+R++GV+FIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK + NS+Q EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QGGGCAC

Q9LV79 Ras-related protein RABH1a4.0e-8177.39Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTNKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFDT+YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAV+VYDV+++QSF+NT+KWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTNKWIEEVRT

Query:  ERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQA-EQQGGGCAC
        ERGS V+IVLVGNKTDLV KRQVSIEEG+ K+REFG +F+ETSAKAGFNIKPLF KI +AL G E +S T+QED+VDVNLKP + SSQA  QQ   C+C
Subjt:  ERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQA-EQQGGGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d7.8e-10188.89Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        +KWIEEVR ER  DV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGD+K RE+GVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGME+ S+T+ EDMVDVNLKP  NSSQ +Q
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGG C+C
Subjt:  QGGGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c2.1e-9080.84Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA+VVYDVSNRQ+FLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERG-SDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSQA
        +KWIE+V  ERG S+V+IVLVGNKTDLVEKRQVSI EG+ K +E+GVMFIETSAK  FNIK LFRKIAAALPG+++ S +T+ +DMVDVNLK   NSSQ 
Subjt:  NKWIEEVRTERG-SDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSQA

Query:  EQQ-----GGGCAC
        EQQ     GGGC+C
Subjt:  EQQ-----GGGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D5.5e-10288.89Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        +KWIEEVR ER  DV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGD+K RE+GVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGME+ S+T+ EDMVDVNLKP  NSSQ +Q
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGG C+C
Subjt:  QGGGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein8.3e-9886.54Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV++RQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSQAE
         KWI+EVRTERGSDV++VLVGNKTDLV+KRQVSIEE +AK+RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK +  N+S A+
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSQAE

Query:  QQGGGCAC
        QQ GGC+C
Subjt:  QQGGGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C1.5e-9180.84Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA+VVYDVSNRQ+FLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERG-SDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSQA
        +KWIE+V  ERG S+V+IVLVGNKTDLVEKRQVSI EG+ K +E+GVMFIETSAK  FNIK LFRKIAAALPG+++ S +T+ +DMVDVNLK   NSSQ 
Subjt:  NKWIEEVRTERG-SDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSQA

Query:  EQQ-----GGGCAC
        EQQ     GGGC+C
Subjt:  EQQ-----GGGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E5.9e-10490.34Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        +KWIE+VRTERGSDV+IVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGD K+R++GV+FIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK + NS+Q EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QGGGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A2.9e-8277.39Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTNKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFDT+YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAV+VYDV+++QSF+NT+KWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTNKWIEEVRT

Query:  ERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQA-EQQGGGCAC
        ERGS V+IVLVGNKTDLV KRQVSIEEG+ K+REFG +F+ETSAKAGFNIKPLF KI +AL G E +S T+QED+VDVNLKP + SSQA  QQ   C+C
Subjt:  ERGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQA-EQQGGGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGACGGTTTCTCCTCTCGCCAAGTACAAGCTCGTCTTCCTCGGCGATCAATCGGTTGGCAAAACCAGCATTATCACCCGCTTCATGTACGACAAGTTTGATACCAC
CTATCAGGCTACAATTGGAATTGACTTCTTGTCCAAAACAATGTACCTTGAAGATCGAACAATTCGATTGCAGCTTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGATTTAGAAGTC
TCATTCCAAGTTACATAAGAGATTCTTCTGTCGCAGTAGTAGTCTATGATGTATCTAATAGACAATCATTCTTGAACACTAATAAGTGGATTGAGGAGGTACGAACGGAA
CGGGGCAGTGATGTGCTAATTGTTCTTGTTGGGAACAAAACTGATCTTGTTGAGAAAAGGCAAGTTTCAATCGAAGAAGGTGATGCCAAATCTCGTGAGTTTGGAGTCAT
GTTTATAGAAACTAGTGCCAAAGCTGGATTCAACATCAAGCCTCTCTTTCGTAAGATTGCTGCAGCGCTGCCGGGGATGGAAACTCTGTCTTCTACAAGGCAGGAGGACA
TGGTTGACGTAAATTTGAAGCCTGCAGTGAATTCATCCCAGGCGGAACAGCAAGGAGGAGGTTGTGCATGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTCAACGGACCGAGGCCGAAAGGGAAGGATGAGGATCAAGTTTGGCGCGTCGAGGGAGTGCAAAGCAAGGAGGATAAAAACGTGCAGGTTCGGCACCCGGAGAGAAAAC
GAACTTTTAAAAACCTGTAGGCGATACCCAATCCTGATTTTTCTTTCGCCGTTCATTTTCCTTTTCTGAGGTTTCGATCTATTTTCTTGCGCCATCTCCCATTGAATATT
CATCATCGCTAGACTCGTATAGCCTTGATGGCGACGGTTTCTCCTCTCGCCAAGTACAAGCTCGTCTTCCTCGGCGATCAATCGGTTGGCAAAACCAGCATTATCACCCG
CTTCATGTACGACAAGTTTGATACCACCTATCAGGCTACAATTGGAATTGACTTCTTGTCCAAAACAATGTACCTTGAAGATCGAACAATTCGATTGCAGCTTTGGGATA
CTGCTGGACAAGAAAGATTTAGAAGTCTCATTCCAAGTTACATAAGAGATTCTTCTGTCGCAGTAGTAGTCTATGATGTATCTAATAGACAATCATTCTTGAACACTAAT
AAGTGGATTGAGGAGGTACGAACGGAACGGGGCAGTGATGTGCTAATTGTTCTTGTTGGGAACAAAACTGATCTTGTTGAGAAAAGGCAAGTTTCAATCGAAGAAGGTGA
TGCCAAATCTCGTGAGTTTGGAGTCATGTTTATAGAAACTAGTGCCAAAGCTGGATTCAACATCAAGCCTCTCTTTCGTAAGATTGCTGCAGCGCTGCCGGGGATGGAAA
CTCTGTCTTCTACAAGGCAGGAGGACATGGTTGACGTAAATTTGAAGCCTGCAGTGAATTCATCCCAGGCGGAACAGCAAGGAGGAGGTTGTGCATGCTAGAGGATATGT
AAGTTCAATACATAAAAAATGCTGCAGAATTGAAATAGTAAACGCAATCATTCGCGGAACAAATCAAGCATCATTTTGTCCTCCCACATGTTGAGATTTGCATTTTGGAT
TTGTGATGGGTTTCTACAAGTTGACCAACTATATCTAATTTCAGAGTACTTTAAACTGTTCCATTGTTTATAATTTTCAATATTATTCAGAAGAATTCTCTTTGGCTAGG
CTGTTCACGTTTCAAATGTTCAGCTGTTGTGACAACAATCCATTGAATCACCACCTACTGTATTCGATGCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTNKWIEEVRTE
RGSDVLIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQQGGGCAC