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MC01g1533 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC01g1533
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationMC01:19602157..19603085
RNA-Seq ExpressionMC01g1533
SyntenyMC01g1533
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3AZW8 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic8.53e-18795.85Show/hide
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A0A6J1CKT5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.10e-18797.74Show/hide
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A0A6M3WGX2 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic4.23e-18796.6Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07370 Chlorophyll a-b binding protein 1B, chloroplastic6.1e-14290.94Show/hide
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P08221 Chlorophyll a-b binding protein of LHCII type I, chloroplastic (Fragment)9.4e-14394.9Show/hide
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P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic5.9e-14595.45Show/hide
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P27493 Chlorophyll a-b binding protein 21, chloroplastic4.5e-14592.45Show/hide
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P27495 Chlorophyll a-b binding protein 40, chloroplastic1.6e-14291.76Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29910.1 chlorophyll A/B binding protein 32.1e-13788.39Show/hide
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        MAASTMALSSP+ AGKAV LSP+A E+ G+GRV+MRK+V+KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
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Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
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Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
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AT1G29920.1 chlorophyll A/B-binding protein 22.1e-13788.39Show/hide
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        MAASTMALSSP+ AGKAV LSP+A E+ G+GRV+MRK+V+KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
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Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
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Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
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AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 15.5e-13888.76Show/hide
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        MAASTMALSSP+ AGKAVKLSP+A E+ G+GRV+MRK+V+KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
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Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
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Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B25.1e-13688.01Show/hide
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        MA+STMALSSP+ AGKAVK  P+A ++ G+GRV+MRK+V+KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLSPSAPELQGNGRVSMRKSVSKPVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B11.6e-13788.35Show/hide
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        MAASTMALSSP+L GKAVKLSP+A E+ G GR++MRK+      SGSPWYG DRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLSPSAPELQGNGRVSMRKSVSKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLGL
        HSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLGL
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        A DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AGATATAGATACCAATGGATAAGAATCTATTGCCTCTGCCCACCATTTAAACTCCCCAAACCCACACTTCTTTCCCACCACAGAAACCAACAGCCCATTCAAAATCACAA
CTTTCTCTCTGCCCCACCAATGGCTGCTTCCACCATGGCTCTCTCCTCCCCATCCCTCGCCGGCAAGGCCGTGAAGCTCTCCCCCTCCGCCCCTGAGCTTCAGGGCAATG
GAAGAGTCAGCATGAGGAAATCCGTCTCCAAGCCAGTTTCCTCCGGCAGCCCCTGGTACGGCCCCGACCGTGTCAAGTACTTGGGCCCATTCTCCGGCGAGCCCCCGTCC
TACCTCACTGGAGAATTCCCCGGTGACTACGGCTGGGACACTGCTGGCCTTTCAGCCGACCCCGAGACCTTCGCCAAGAACCGTGAGCTCGAGGTGATCCACTCTAGATG
GGCCATGCTTGGGGCTCTTGGTTGTGTCTTCCCTGAGCTTCTGTCCCGCAATGGGGTGAAGTTTGGCGAGGCCGTGTGGTTCAAGGCCGGATCTCAGATCTTCAGCGAGG
GTGGGCTCGACTATTTGGGTAACCCTAGCTTGATCCACGCACAGAGCATTTTGGCCATCTGGGCATCTCAGGTTGTGTTGATGGGCGCCGTCGAGGGCTACCGTATTGCC
GGTGGTCCCCTCGGTGAGGTGACCGACCCGATCTACCCAGGTGGAAGCTTTGACCCATTGGGTTTGGCTGATGACCCAGAGGCATTTGCTGAATTGAAAGTGAAGGAGCT
CAAGAACGGAAGGTTGGCCATGTTCTCCATGTTTGGGTTCTTCGTTCAGGCCATTGTGACTGGAAAGGGTCCATTGGAGAACTTGGCAGACCATCTTGCAGACCCAGTTA
ACAACAACGCCTGGGCCTACGCCACAAACTTTGTTCCCGGAAAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CAAGAACGGAAGGTTGGCCATGTTCTCCATGTTTGGGTTCTTCGTTCAGGCCATTGTGACTGGAAAGGGTCCATTGGAGAACTTGGCAGACCATCTTGCAGACCCAGTTA
ACAACAACGCCTGGGCCTACGCCACAAACTTTGTTCCCGGAAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
RYRYQWIRIYCLCPPFKLPKPTLLSHHRNQQPIQNHNFLSAPPMAASTMALSSPSLAGKAVKLSPSAPELQGNGRVSMRKSVSKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPS
YLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIA
GGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK